logo

Genes within 1Mb (chr12:94717411:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.27e-01 0.0696 0.143 0.06 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 7.63e-01 0.0507 0.168 0.06 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.126 0.06 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.58e-01 0.0285 0.159 0.06 B L1
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 3.50e-01 -0.136 0.145 0.06 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.50e-01 -0.018 0.0952 0.06 B L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 1.23e-01 0.185 0.12 0.06 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 4.74e-01 0.104 0.145 0.06 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0253 0.0693 0.06 B L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.48e-01 -0.111 0.118 0.06 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 4.60e-01 0.0761 0.103 0.06 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0771 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0979 0.156 0.06 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0127 0.101 0.06 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.23e-01 -0.109 0.11 0.06 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 7.59e-02 -0.252 0.141 0.06 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 4.73e-02 -0.189 0.0949 0.06 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.22e-01 0.0434 0.122 0.06 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.10e-02 -0.302 0.154 0.06 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 9.45e-02 -0.232 0.138 0.06 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 1.26e-02 -0.327 0.13 0.06 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.64e-01 -0.037 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.02e-02 -0.182 0.1 0.06 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0741 0.165 0.061 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.37e-01 0.0138 0.175 0.061 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0997 0.173 0.061 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.43e-01 -0.102 0.168 0.061 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.43e-01 0.0515 0.157 0.061 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 1.17e-01 0.218 0.139 0.061 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 3.88e-01 -0.134 0.155 0.061 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 5.03e-01 0.0877 0.131 0.061 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 2.49e-01 -0.18 0.156 0.06 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 7.74e-02 0.214 0.12 0.06 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.75e-01 0.0196 0.124 0.06 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 9.01e-01 0.0185 0.148 0.06 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.97e-01 -0.013 0.101 0.06 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.37e-01 -0.05 0.149 0.06 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 3.93e-01 -0.113 0.132 0.06 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0014 0.0952 0.06 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0121 0.157 0.06 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00455 0.148 0.06 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.33e-01 0.12 0.124 0.06 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 6.55e-01 0.0657 0.147 0.06 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 9.34e-01 0.00997 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.46e-01 0.0446 0.138 0.06 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0942 0.101 0.06 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 5.53e-01 -0.103 0.173 0.06 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 4.15e-02 -0.3 0.146 0.06 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.50e-02 -0.326 0.133 0.06 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 9.54e-01 0.00977 0.168 0.06 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.23e-02 0.237 0.136 0.06 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.56e-01 0.00842 0.154 0.06 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.57e-01 0.0264 0.0855 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.35e-01 -0.18 0.186 0.066 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.79e-02 -0.263 0.158 0.066 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.59e-01 0.179 0.194 0.066 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 6.04e-01 0.0968 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 6.26e-01 0.0695 0.142 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 2.82e-01 0.162 0.15 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.87e-01 0.0507 0.187 0.066 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 2.17e-01 -0.163 0.131 0.066 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.72e-01 0.147 0.165 0.066 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.91e-01 0.0234 0.171 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 5.51e-01 -0.103 0.173 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.48e-01 0.0508 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 1.81e-01 -0.231 0.172 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 4.19e-01 0.143 0.177 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 6.19e-01 0.0724 0.145 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.24e-01 0.0155 0.161 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00916 0.158 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 9.03e-01 0.016 0.131 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 5.60e-01 0.104 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 5.02e-01 0.122 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.88e-01 -0.149 0.173 0.06 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 7.18e-01 0.0673 0.186 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 9.37e-01 0.0132 0.166 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 2.86e-01 -0.149 0.14 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 1.97e-01 0.211 0.163 0.06 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00714 0.165 0.06 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 4.29e-01 -0.105 0.132 0.06 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0867 0.17 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.31e-02 0.424 0.169 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.41e-01 0.029 0.145 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 4.96e-01 0.12 0.176 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 5.01e-02 -0.34 0.172 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0758 0.146 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.86e-01 0.041 0.151 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 7.75e-01 0.0473 0.165 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0329 0.0963 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.63e-01 0.0801 0.183 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0336 0.168 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 4.55e-01 -0.127 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.65e-01 0.0317 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 5.10e-01 -0.112 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 3.62e-01 0.143 0.157 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 5.91e-01 0.0891 0.165 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 7.12e-01 0.0513 0.139 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.37e-01 0.0281 0.136 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 5.83e-02 -0.338 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.19e-01 0.0428 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 4.74e-01 0.135 0.187 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 9.13e-01 0.0163 0.149 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.61e-01 0.0509 0.167 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 8.89e-01 -0.024 0.171 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.79e-01 0.136 0.154 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 9.24e-01 0.0128 0.135 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.18e-01 0.0422 0.116 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0596 0.142 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0178 0.164 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.83e-01 0.0308 0.112 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.42e-01 0.00881 0.121 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 2.86e-01 -0.111 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 9.57e-02 -0.24 0.144 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.95e-01 0.0352 0.135 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 9.57e-01 0.00996 0.183 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 2.23e-01 0.164 0.134 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 1.59e-01 0.202 0.143 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0478 0.124 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0704 0.184 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0599 0.163 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0981 0.171 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 4.89e-01 -0.119 0.172 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 3.22e-01 -0.145 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 8.07e-02 0.287 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 4.28e-01 -0.118 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 7.40e-02 -0.293 0.163 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 2.65e-02 -0.32 0.143 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.09e-01 0.0614 0.164 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 4.24e-01 0.145 0.182 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 4.38e-02 -0.35 0.173 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 1.53e-01 -0.212 0.148 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 2.33e-01 -0.195 0.163 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 1.18e-01 -0.201 0.128 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0437 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.67e-01 -0.179 0.129 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 9.01e-01 0.0187 0.15 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 2.04e-01 -0.212 0.166 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0703 0.15 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 6.98e-01 0.0591 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 5.62e-01 0.0852 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.60e-01 -0.111 0.121 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.89e-02 -0.369 0.177 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.49e-01 -0.199 0.138 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 4.25e-01 -0.145 0.182 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 1.81e-01 -0.245 0.182 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 4.93e-01 0.113 0.164 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 1.05e-01 -0.28 0.172 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00254 0.178 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 3.55e-02 -0.299 0.141 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 2.14e-01 -0.23 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.159 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00716 0.18 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.83e-01 0.028 0.189 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 3.93e-01 -0.134 0.157 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 6.44e-02 -0.33 0.177 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 5.84e-01 -0.101 0.184 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 4.30e-01 -0.124 0.157 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0764 0.177 0.061 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.27e-01 -0.229 0.149 0.061 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.84e-03 -0.531 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0316 0.167 0.061 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 1.12e-01 0.233 0.146 0.061 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0435 0.168 0.061 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 2.58e-01 -0.167 0.147 0.061 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.32e-01 0.0387 0.183 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.52e-01 -0.25 0.174 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 2.64e-01 -0.2 0.179 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 1.75e-01 0.256 0.188 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 2.37e-01 0.183 0.154 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 3.69e-01 0.141 0.156 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0352 0.15 0.06 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 5.55e-01 0.103 0.173 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 3.08e-01 0.154 0.151 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.45e-02 0.381 0.154 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0495 0.16 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 4.63e-01 -0.103 0.14 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0994 0.162 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0663 0.113 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0308 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.33e-01 -0.014 0.167 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.23e-01 -0.271 0.175 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 3.19e-01 0.185 0.185 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 1.86e-01 0.2 0.151 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 4.23e-01 0.139 0.174 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 1.94e-01 -0.203 0.156 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.48e-01 -0.031 0.161 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 3.57e-01 -0.153 0.165 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.64e-01 -0.149 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 1.58e-01 -0.239 0.169 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.16e-01 0.0342 0.147 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 2.93e-02 0.365 0.167 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0904 0.117 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.78e-01 0.19 0.214 0.052 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 3.70e-01 -0.174 0.193 0.052 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 6.03e-01 -0.112 0.214 0.052 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.39e-01 0.125 0.204 0.052 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 3.88e-01 -0.166 0.191 0.052 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 3.82e-01 -0.174 0.198 0.052 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 5.63e-01 -0.12 0.206 0.052 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 8.40e-01 0.0347 0.172 0.052 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 1.40e-01 -0.178 0.119 0.052 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.92e-01 -0.147 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 4.18e-01 -0.124 0.152 0.061 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.78e-01 -0.198 0.146 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 3.09e-01 0.18 0.177 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 3.08e-01 0.177 0.173 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 4.80e-01 -0.121 0.172 0.061 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00266 0.107 0.061 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 3.25e-01 0.172 0.174 0.06 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 5.62e-01 0.0955 0.165 0.06 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.13e-01 -0.114 0.174 0.06 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 5.51e-01 -0.093 0.156 0.06 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.42e-01 0.032 0.161 0.06 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 4.71e-01 0.124 0.172 0.06 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.74e-01 0.021 0.132 0.06 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0258 0.176 0.061 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0527 0.189 0.061 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 4.65e-01 -0.141 0.192 0.061 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.69e-01 0.0307 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0235 0.165 0.061 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00218 0.155 0.061 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0607 0.178 0.061 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0319 0.152 0.061 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0186 0.172 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 3.70e-02 0.281 0.134 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0861 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0939 0.157 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0775 0.119 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.04e-01 0.0197 0.163 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 6.58e-01 0.0616 0.139 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 6.71e-01 0.0419 0.0985 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 7.45e-02 -0.312 0.174 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.98e-01 0.198 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.80e-01 0.149 0.169 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0986 0.167 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00146 0.125 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 9.21e-02 -0.298 0.176 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 4.43e-01 -0.124 0.162 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0437 0.115 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00747 0.208 0.061 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 4.48e-02 -0.318 0.157 0.061 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.15e-01 0.0724 0.198 0.061 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 3.95e-01 -0.18 0.211 0.061 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 6.50e-01 0.0913 0.201 0.061 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 6.50e-03 0.529 0.191 0.061 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 6.27e-02 0.317 0.169 0.061 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0882 0.19 0.06 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 7.05e-02 0.333 0.183 0.06 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0422 0.194 0.06 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 4.22e-01 0.145 0.181 0.06 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0527 0.156 0.06 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 4.26e-01 0.149 0.187 0.06 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 4.45e-02 -0.337 0.167 0.06 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0411 0.12 0.06 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0983 0.169 0.063 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.84e-01 0.00337 0.163 0.063 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0277 0.177 0.063 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 2.95e-01 0.185 0.176 0.063 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.20e-02 0.202 0.111 0.063 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 2.44e-01 -0.205 0.175 0.063 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 4.89e-01 -0.116 0.167 0.063 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0722 0.148 0.063 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 4.69e-01 -0.145 0.2 0.056 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.85e-01 0.258 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.92e-01 -0.175 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 4.01e-01 -0.169 0.201 0.056 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 8.68e-01 0.0324 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 2.37e-01 0.247 0.208 0.056 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 9.92e-01 0.00174 0.175 0.056 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 6.26e-01 0.0844 0.173 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.26e-01 0.0381 0.173 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000289 0.183 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 9.70e-01 0.006 0.161 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0969 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 7.09e-01 0.0641 0.171 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00194 0.111 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 6.28e-01 0.0748 0.154 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 8.45e-01 -0.03 0.153 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0266 0.106 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0659 0.161 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.69e-01 0.224 0.162 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 7.08e-01 0.0504 0.134 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 9.34e-01 0.0145 0.175 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -834065 sc-eQTL 5.32e-02 -0.299 0.154 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 9.20e-01 0.0133 0.132 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 2.65e-01 0.154 0.138 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 7.89e-01 0.0457 0.17 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0377 0.0941 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 2.32e-01 -0.189 0.158 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 5.85e-02 0.237 0.124 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 8.03e-01 0.0338 0.135 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0427 0.147 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0653 0.111 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0436 0.152 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00475 0.137 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 8.85e-01 0.0136 0.094 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 2.67e-01 -0.2 0.18 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 1.05e-01 0.27 0.166 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 3.84e-01 -0.144 0.165 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 3.03e-01 0.19 0.184 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 4.06e-01 0.0886 0.106 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0319 0.177 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -500071 sc-eQTL 2.23e-02 -0.344 0.149 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0373 0.121 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -500335 sc-eQTL 8.75e-01 0.0256 0.162 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 66854 sc-eQTL 9.36e-01 0.0121 0.151 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -756109 sc-eQTL 1.08e-01 0.207 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -356217 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0187 0.146 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 568834 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0465 0.128 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 257423 sc-eQTL 6.73e-01 0.061 0.144 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -286337 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0877 0.106 0.06 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -500335 eQTL 0.0171 -0.0797 0.0334 0.0 0.0 0.0456
ENSG00000173588 CEP83 257423 eQTL 0.0103 0.151 0.0587 0.0 0.0 0.0456

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina