logo

Genes within 1Mb (chr12:94711558:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 2.82e-01 0.107 0.0989 0.173 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 5.40e-01 0.0715 0.116 0.173 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0654 0.0872 0.173 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.73e-01 0.00373 0.11 0.173 B L1
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00324 0.101 0.173 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.46e-01 0.0303 0.066 0.173 B L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0344 0.0834 0.173 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0887 0.101 0.173 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 8.64e-02 -0.0823 0.0478 0.173 B L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0154 0.0822 0.173 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.40e-01 -0.105 0.071 0.173 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0688 0.0793 0.173 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0723 0.108 0.173 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0163 0.0698 0.173 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 5.48e-02 -0.14 0.0725 0.173 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0237 0.0767 0.173 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0199 0.0984 0.173 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 2.07e-03 -0.202 0.0647 0.173 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.66e-01 -0.116 0.0838 0.173 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.107 0.173 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0168 0.0959 0.173 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0182 0.0911 0.173 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0223 0.0851 0.173 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.69e-01 0.00271 0.0697 0.173 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 3.40e-01 -0.111 0.116 0.178 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0622 0.123 0.178 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 4.66e-01 0.089 0.122 0.178 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.45e-01 -0.172 0.118 0.178 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.24e-01 0.0703 0.11 0.178 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00523 0.0982 0.178 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 1.76e-01 0.148 0.109 0.178 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0466 0.092 0.178 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 6.30e-04 0.366 0.106 0.173 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.37e-01 -0.125 0.0839 0.173 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 8.18e-01 0.0199 0.0864 0.173 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.69e-01 0.00404 0.103 0.173 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.02e-01 0.00859 0.0699 0.173 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.67e-01 0.0174 0.103 0.173 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 8.99e-01 0.0117 0.092 0.173 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 4.98e-01 0.0448 0.0661 0.173 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.13e-01 0.071 0.109 0.174 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 2.06e-02 -0.236 0.101 0.174 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.87e-01 -0.113 0.0856 0.174 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 8.52e-01 -0.019 0.102 0.174 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0575 0.0838 0.174 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 2.49e-03 -0.285 0.0932 0.174 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0652 0.0702 0.174 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 7.16e-01 0.0437 0.12 0.173 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.54e-02 -0.181 0.101 0.173 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.03e-01 0.119 0.0928 0.173 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.11e-01 -0.118 0.116 0.173 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.21e-01 0.00941 0.0944 0.173 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.54e-01 -0.151 0.106 0.173 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0594 0.059 0.173 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 9.45e-01 0.00962 0.14 0.166 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.63e-01 -0.036 0.119 0.166 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 3.33e-01 0.141 0.145 0.166 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.52e-01 -0.2 0.139 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 6.45e-02 0.196 0.106 0.166 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.12e-01 0.0124 0.113 0.166 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.72e-01 -0.191 0.139 0.166 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 6.05e-01 0.0511 0.0987 0.166 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00624 0.124 0.166 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 9.76e-01 0.00358 0.118 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.41e-01 0.176 0.119 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 5.97e-01 0.0579 0.109 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 5.68e-01 0.0685 0.12 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 4.38e-01 0.0953 0.123 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0452 0.101 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0841 0.112 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 3.61e-01 -0.1 0.11 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 6.83e-02 -0.165 0.0901 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0704 0.124 0.172 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00181 0.126 0.172 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0246 0.121 0.172 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 7.60e-01 0.0396 0.13 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 2.59e-01 -0.13 0.115 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 2.04e-01 0.124 0.0974 0.172 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 5.38e-01 0.0703 0.114 0.172 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0364 0.115 0.172 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 1.49e-01 -0.133 0.0921 0.172 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.01e-01 0.0799 0.119 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0362 0.12 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 6.92e-01 -0.04 0.101 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.06e-01 -0.199 0.122 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0749 0.121 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.39e-01 0.00775 0.102 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.85e-01 0.002 0.105 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 4.41e-01 0.0889 0.115 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0369 0.0672 0.173 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 2.00e-01 0.165 0.128 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 6.84e-01 0.0478 0.117 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0988 0.119 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 7.06e-02 0.234 0.129 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 9.09e-01 0.0136 0.119 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0428 0.11 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0405 0.116 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 6.00e-01 -0.051 0.0972 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.60e-01 0.0292 0.0955 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 7.71e-02 0.218 0.123 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.61e-01 0.181 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.53e-01 -0.185 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 2.16e-01 -0.127 0.103 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.13e-01 0.0425 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.00e-01 -0.03 0.118 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0304 0.106 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 9.55e-01 0.00533 0.0937 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0904 0.0809 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.17e-01 -0.099 0.0988 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 2.92e-01 -0.12 0.114 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 1.87e-01 -0.102 0.0773 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 5.20e-02 -0.163 0.0833 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0444 0.0721 0.173 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 2.91e-01 0.105 0.0989 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.45e-01 -0.135 0.0924 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.78e-01 -0.146 0.108 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 7.24e-01 0.0444 0.126 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.43e-01 0.0303 0.0925 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.49e-01 0.00635 0.0987 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.11e-01 -0.056 0.0849 0.173 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0958 0.126 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 6.98e-01 0.0435 0.112 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 6.44e-01 0.0548 0.118 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 1.96e-01 0.131 0.101 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.72e-01 -0.155 0.113 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00854 0.103 0.173 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.37e-01 0.0695 0.112 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.42e-02 -0.242 0.0978 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0364 0.113 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.07e-01 -0.127 0.124 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 2.86e-01 -0.127 0.119 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.19e-01 0.0103 0.102 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0353 0.112 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 3.21e-01 0.0875 0.0881 0.173 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00414 0.115 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 9.16e-01 0.00942 0.0896 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.56e-01 -0.118 0.103 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.95e-01 -0.149 0.115 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0448 0.104 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.83e-01 0.0023 0.105 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.87e-01 0.0145 0.101 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.19e-01 0.0086 0.084 0.173 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00825 0.128 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0539 0.0989 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.90e-02 0.303 0.128 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000493 0.131 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 9.22e-01 0.0115 0.118 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 3.52e-01 -0.115 0.124 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.67e-03 -0.327 0.125 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 1.49e-01 0.181 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 6.09e-03 -0.294 0.106 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 7.77e-01 0.0346 0.122 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 7.27e-01 0.045 0.129 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 4.81e-01 0.0753 0.107 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0695 0.121 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 7.80e-01 0.035 0.125 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.56e-01 0.0333 0.107 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 8.84e-01 0.0178 0.122 0.173 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 2.23e-01 -0.126 0.103 0.173 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.83e-02 0.259 0.117 0.173 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.32e-01 0.111 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.64e-01 0.0583 0.101 0.173 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.41e-02 -0.193 0.115 0.173 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0109 0.101 0.173 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0333 0.124 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 5.89e-01 0.0642 0.119 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.69e-01 0.135 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0103 0.128 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 9.88e-01 0.00153 0.105 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 3.36e-02 -0.225 0.105 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.98e-01 0.0538 0.102 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 2.51e-01 -0.139 0.121 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.33e-02 -0.189 0.105 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 7.29e-01 -0.038 0.11 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 3.26e-01 -0.11 0.112 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0792 0.098 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 2.55e-01 -0.129 0.113 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0316 0.0791 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 3.48e-02 0.282 0.133 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 5.42e-05 -0.471 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0304 0.125 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0293 0.132 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 2.53e-01 -0.123 0.107 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.18e-01 0.072 0.111 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 1.19e-01 0.175 0.112 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.09e-01 -0.185 0.115 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.89e-01 -0.121 0.114 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.34e-01 0.177 0.118 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0408 0.102 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 2.01e-02 -0.272 0.116 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 1.84e-01 -0.109 0.0817 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 1.58e-01 0.22 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 8.84e-01 0.0206 0.14 0.156 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 7.35e-01 0.0528 0.155 0.156 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.48e-01 0.00974 0.148 0.156 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 1.77e-01 0.188 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0437 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 6.57e-02 -0.274 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0162 0.124 0.156 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.68e-01 -0.05 0.0872 0.156 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.48e-01 0.0708 0.118 0.174 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.95e-01 -0.136 0.105 0.174 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.09e-01 0.127 0.101 0.174 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0812 0.122 0.174 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.62e-02 -0.219 0.118 0.174 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 6.46e-01 0.0543 0.118 0.174 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 2.44e-01 -0.086 0.0736 0.174 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 3.41e-01 -0.115 0.12 0.173 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0613 0.114 0.173 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 4.37e-01 0.0938 0.12 0.173 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 3.06e-01 0.11 0.108 0.173 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.11e-01 0.0413 0.111 0.173 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 3.26e-01 -0.117 0.119 0.173 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.99e-01 0.0233 0.0913 0.173 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0666 0.12 0.176 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.88e-01 0.035 0.13 0.176 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.41e-02 0.321 0.13 0.176 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 1.22e-01 -0.196 0.126 0.176 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.04e-01 0.0758 0.113 0.176 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 5.11e-01 0.0699 0.106 0.176 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 1.42e-01 0.179 0.121 0.176 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.62e-01 0.0603 0.104 0.176 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 3.71e-02 0.248 0.118 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0856 0.0937 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 1.99e-01 0.132 0.103 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0618 0.109 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0203 0.0828 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 6.71e-01 0.048 0.113 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0153 0.0963 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 8.03e-01 0.0171 0.0683 0.173 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 4.03e-02 0.248 0.12 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 8.07e-01 -0.026 0.106 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0573 0.117 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 4.73e-01 0.0831 0.116 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0526 0.0867 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.95e-01 0.000746 0.123 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0983 0.112 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 1.09e-01 0.128 0.0795 0.173 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0318 0.147 0.194 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0308 0.113 0.194 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.61e-02 0.31 0.138 0.194 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 2.56e-01 -0.17 0.149 0.194 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 8.74e-01 0.0226 0.142 0.194 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.10e-02 -0.35 0.136 0.194 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00648 0.121 0.194 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 1.47e-01 0.187 0.128 0.176 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 2.05e-01 -0.158 0.125 0.176 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00995 0.131 0.176 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 8.55e-01 0.0225 0.123 0.176 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0569 0.105 0.176 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 6.31e-01 0.0611 0.127 0.176 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 7.46e-01 0.037 0.114 0.176 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 7.23e-01 0.0289 0.0814 0.176 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 6.79e-01 0.0504 0.122 0.172 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 3.26e-02 -0.25 0.116 0.172 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 3.34e-01 -0.124 0.128 0.172 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0147 0.127 0.172 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.43e-01 0.0266 0.081 0.172 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.00e+00 -6.38e-05 0.127 0.172 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 9.00e-02 0.204 0.119 0.172 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 8.91e-01 0.0146 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0699 0.132 0.178 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0324 0.128 0.178 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 9.10e-01 0.0152 0.134 0.178 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0167 0.133 0.178 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 3.74e-02 -0.265 0.126 0.178 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 3.21e-02 -0.293 0.135 0.178 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 1.26e-01 -0.176 0.115 0.178 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0174 0.114 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0377 0.12 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 6.75e-01 0.0534 0.127 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 8.37e-01 0.0231 0.112 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 4.30e-01 0.102 0.129 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 2.96e-01 0.125 0.119 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 4.07e-01 0.0638 0.0768 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.99e-01 0.0137 0.107 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 3.30e-01 -0.104 0.107 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 2.60e-02 -0.163 0.0729 0.173 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 2.30e-01 0.136 0.113 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 5.29e-01 0.0724 0.115 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0698 0.0944 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0553 0.123 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -839918 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0317 0.109 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0465 0.0932 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00789 0.0972 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 7.11e-01 0.0445 0.12 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0352 0.0662 0.173 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 1.60e-03 0.343 0.107 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0832 0.0869 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 7.00e-01 0.0363 0.094 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 9.64e-01 0.00461 0.102 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0498 0.0771 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.80e-01 0.0159 0.105 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0188 0.095 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 2.48e-01 0.0753 0.065 0.173 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 8.07e-02 0.217 0.123 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 9.37e-03 -0.298 0.113 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0537 0.114 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 6.44e-01 -0.059 0.127 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0274 0.0735 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0281 0.122 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -505924 sc-eQTL 1.29e-01 0.158 0.104 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 9.30e-01 0.00728 0.0832 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -506188 sc-eQTL 6.40e-01 0.0526 0.112 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 61001 sc-eQTL 1.40e-02 -0.256 0.103 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -761962 sc-eQTL 2.01e-01 -0.115 0.0894 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -362070 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0462 0.102 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 562981 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0671 0.0891 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 251570 sc-eQTL 1.68e-02 -0.239 0.0989 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -292190 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0785 0.0735 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 61001 eQTL 3.13e-06 -0.0812 0.0173 0.0 0.0 0.189
ENSG00000258357 AC023161.2 189689 eQTL 0.00405 -0.122 0.0423 0.00134 0.00158 0.189
ENSG00000258365 AC073655.2 428714 eQTL 0.00936 0.116 0.0445 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 61001 6.57e-06 9.12e-06 1.32e-06 3.92e-06 1.92e-06 2.58e-06 9.6e-06 1.36e-06 5.53e-06 4.13e-06 9.71e-06 3.89e-06 1.15e-05 3.74e-06 1.7e-06 5.31e-06 3.75e-06 3.89e-06 2.24e-06 2.51e-06 3.71e-06 7.64e-06 6.67e-06 2.76e-06 1.11e-05 2.58e-06 3.58e-06 2.73e-06 7.09e-06 7.69e-06 4.13e-06 5.74e-07 8.4e-07 2.79e-06 2.69e-06 2.05e-06 1.61e-06 1.25e-06 1.56e-06 8.66e-07 8.27e-07 1.03e-05 8.15e-07 1.59e-07 7.18e-07 1.01e-06 1.05e-06 7.34e-07 6.14e-07
ENSG00000136014 \N -839918 2.69e-07 1.19e-07 3.88e-08 1.8e-07 9.21e-08 9.61e-08 1.49e-07 5.2e-08 1.44e-07 4.74e-08 1.6e-07 8.36e-08 1.41e-07 6.56e-08 6.17e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.21e-07 5.39e-08 4.04e-08 1.08e-07 1.27e-07 1.39e-07 3.42e-08 1.4e-07 1.14e-07 1.08e-07 9.57e-08 1.08e-07 1.07e-07 9.64e-08 3.65e-08 3.56e-08 8.44e-08 8.76e-08 3.62e-08 4.95e-08 9.22e-08 6.55e-08 3.54e-08 4.64e-08 1.35e-07 4.7e-08 1.13e-08 5.43e-08 1.83e-08 1.24e-07 3.83e-09 4.79e-08