logo

Genes within 1Mb (chr12:94704012:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.68e-01 0.0603 0.0829 0.235 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.24e-01 0.0962 0.0974 0.235 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 5.48e-01 -0.044 0.073 0.235 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.092 0.235 B L1
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0542 0.0841 0.235 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 8.74e-01 0.00879 0.0553 0.235 B L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0167 0.0698 0.235 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000309 0.0844 0.235 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.86e-03 -0.115 0.0395 0.235 B L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0133 0.0684 0.235 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0828 0.0591 0.235 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0223 0.0661 0.235 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 5.69e-02 -0.171 0.0896 0.235 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 9.12e-01 0.00642 0.0581 0.235 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0415 0.0608 0.235 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0545 0.0637 0.235 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0746 0.0819 0.235 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 4.96e-06 -0.246 0.0525 0.235 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 6.94e-02 -0.127 0.0697 0.235 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 1.14e-02 -0.225 0.088 0.235 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 9.52e-03 -0.206 0.0787 0.235 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0829 0.0758 0.235 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 9.76e-01 0.00214 0.071 0.235 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.58e-01 -0.034 0.058 0.235 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0845 0.0972 0.241 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.241 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.02e-01 0.105 0.102 0.241 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.08e-02 -0.202 0.0979 0.241 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 6.25e-01 0.0451 0.0923 0.241 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 4.76e-01 0.0586 0.0821 0.241 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 9.35e-01 0.00742 0.0915 0.241 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 7.10e-01 0.0287 0.0771 0.241 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 9.81e-02 0.148 0.089 0.235 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00308 0.0696 0.235 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0185 0.0713 0.235 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0337 0.085 0.235 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0292 0.0577 0.235 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0086 0.0853 0.235 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0238 0.0759 0.235 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.75e-01 0.0306 0.0545 0.235 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.02e-01 0.0764 0.0909 0.236 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 2.95e-02 -0.186 0.085 0.236 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0858 0.0718 0.236 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.82e-01 0.035 0.0853 0.236 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0541 0.0702 0.236 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 3.58e-02 -0.167 0.0791 0.236 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0601 0.0588 0.236 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 9.76e-01 0.00305 0.101 0.235 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 6.80e-04 -0.287 0.0833 0.235 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 8.38e-01 0.016 0.0782 0.235 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0975 0.235 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.37e-01 0.117 0.0788 0.235 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0898 0.0889 0.235 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 9.71e-02 -0.0821 0.0493 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0797 0.114 0.227 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 1.66e-01 -0.134 0.0966 0.227 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.18e-02 0.2 0.118 0.227 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.65e-01 0.0194 0.114 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 3.87e-02 0.179 0.0858 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 2.83e-01 0.0984 0.0914 0.227 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0597 0.114 0.227 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0818 0.0802 0.227 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 1.55e-01 -0.143 0.1 0.227 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0322 0.0991 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 9.58e-01 0.00527 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0209 0.0915 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 7.64e-01 0.0302 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 4.33e-01 0.0806 0.103 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.35e-01 -0.126 0.084 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 1.59e-01 -0.131 0.0931 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0905 0.0916 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 1.98e-02 -0.176 0.075 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0242 0.105 0.235 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.87e-01 0.0289 0.107 0.235 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 2.14e-01 -0.127 0.102 0.235 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.28e-01 0.0871 0.11 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 8.13e-02 -0.17 0.0971 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 9.28e-01 0.00752 0.0827 0.235 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 2.22e-01 0.118 0.0961 0.235 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.64e-01 0.0292 0.0973 0.235 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 9.79e-02 -0.129 0.0778 0.235 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.0984 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 1.87e-02 0.233 0.0982 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 5.18e-01 0.0541 0.0836 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.22e-01 -0.023 0.102 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 6.98e-02 -0.182 0.0999 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 4.29e-01 0.0668 0.0844 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0226 0.0873 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 6.08e-01 0.0491 0.0956 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0498 0.0556 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 1.89e-01 0.141 0.107 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 4.25e-01 0.0783 0.0979 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.28e-02 -0.166 0.0985 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.50e-01 0.082 0.108 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0366 0.0991 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 3.25e-01 0.0903 0.0915 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 2.80e-01 0.105 0.0966 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 6.04e-01 0.0422 0.0812 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.74e-01 -0.071 0.0797 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0696 0.106 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 7.05e-01 0.0422 0.111 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 9.65e-01 0.00487 0.112 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 2.65e-02 -0.196 0.0876 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 5.97e-01 0.0527 0.0995 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.30e-01 -0.064 0.102 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0628 0.0916 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.01e-01 0.0653 0.0776 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 2.11e-01 -0.0841 0.0671 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0688 0.082 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 2.11e-02 -0.217 0.0935 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0287 0.0644 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 1.68e-01 -0.096 0.0694 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0668 0.0597 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0404 0.0827 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 1.06e-01 -0.125 0.077 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.06e-01 -0.075 0.0901 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 4.60e-01 0.0777 0.105 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.77e-01 0.104 0.0769 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 4.70e-01 0.0596 0.0822 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 7.78e-01 -0.02 0.0709 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0798 0.106 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 5.52e-01 0.0558 0.0937 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 1.08e-01 0.158 0.0979 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 6.76e-01 0.0414 0.099 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 5.16e-01 0.0549 0.0845 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0422 0.0949 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0788 0.0856 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0528 0.0937 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 1.19e-04 -0.313 0.0798 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0104 0.0938 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0486 0.104 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 3.19e-03 -0.291 0.0974 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0377 0.0848 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0221 0.0934 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0428 0.0735 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 7.00e-01 -0.037 0.0958 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0946 0.0746 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 2.20e-01 -0.106 0.0864 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 2.02e-02 -0.222 0.095 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 1.45e-01 -0.127 0.0864 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 2.29e-01 0.106 0.0876 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.74e-01 0.0477 0.0847 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0429 0.0702 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 1.67e-02 -0.194 0.0802 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.21e-01 0.0107 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 9.89e-02 -0.177 0.107 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 4.04e-01 0.0806 0.0964 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.41e-01 -0.15 0.101 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0512 0.105 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 8.65e-02 -0.144 0.0835 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.37e-01 0.083 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 1.37e-03 -0.29 0.0892 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00403 0.103 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 5.45e-01 0.0659 0.109 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0412 0.0902 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.32e-02 -0.253 0.101 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.03e-01 0.0712 0.106 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0583 0.0905 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 9.36e-01 0.00829 0.104 0.238 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 2.33e-03 -0.264 0.0857 0.238 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.43e-01 0.0954 0.1 0.238 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.02e-01 0.0819 0.0974 0.238 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 9.35e-02 0.144 0.0853 0.238 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 8.63e-02 -0.168 0.0976 0.238 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.32e-02 -0.166 0.0852 0.238 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 6.20e-01 0.0534 0.108 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0914 0.103 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.18e-01 -0.011 0.106 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 1.46e-01 0.161 0.111 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000312 0.0911 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 2.98e-02 -0.2 0.0912 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 9.75e-01 0.00277 0.0884 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00352 0.102 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0808 0.0888 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 7.08e-01 0.0345 0.0922 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0675 0.0939 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 9.16e-02 -0.139 0.082 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0277 0.0954 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0457 0.0665 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.32e-02 0.23 0.113 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.86e-03 -0.266 0.0992 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0981 0.106 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.05e-01 0.0579 0.112 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 8.97e-01 0.0118 0.0915 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 8.53e-01 0.0195 0.105 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0874 0.0944 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 2.95e-01 0.0986 0.0939 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.83e-03 -0.277 0.0947 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.51e-02 -0.201 0.0946 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.11e-01 0.0237 0.099 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 5.73e-01 0.0483 0.0856 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0959 0.0981 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0424 0.0685 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 1.90e-01 0.172 0.13 0.215 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.18e-01 0.0427 0.118 0.215 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 7.37e-01 0.044 0.131 0.215 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 9.05e-01 0.0148 0.124 0.215 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 4.02e-01 0.0982 0.117 0.215 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0792 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 1.75e-01 -0.17 0.125 0.215 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.75e-01 0.03 0.104 0.215 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 9.24e-02 -0.123 0.0725 0.215 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 8.46e-01 0.0194 0.0997 0.237 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0588 0.0887 0.237 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 5.75e-01 0.048 0.0855 0.237 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 5.75e-01 0.0578 0.103 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 6.30e-01 0.0488 0.101 0.237 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.52e-01 0.0595 0.1 0.237 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0706 0.0623 0.237 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.85e-01 0.0711 0.102 0.235 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0239 0.0961 0.235 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00443 0.102 0.235 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 6.68e-01 0.0391 0.0909 0.235 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 8.47e-01 0.0181 0.0937 0.235 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.81e-01 0.0279 0.1 0.235 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00897 0.0769 0.235 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0923 0.1 0.239 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0626 0.108 0.239 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 1.72e-02 0.261 0.108 0.239 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 1.66e-01 -0.147 0.105 0.239 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 7.86e-01 0.0257 0.0945 0.239 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 4.91e-01 0.0611 0.0885 0.239 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 3.79e-01 0.0896 0.102 0.239 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 4.78e-01 0.0615 0.0865 0.239 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 1.06e-01 0.16 0.0987 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.85e-01 0.0678 0.0779 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 5.21e-01 0.055 0.0856 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0648 0.0902 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0902 0.0686 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 8.51e-01 0.0177 0.0938 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0234 0.08 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.34e-01 0.0549 0.0567 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 7.46e-01 0.0328 0.101 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0277 0.0886 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0668 0.0977 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.52e-01 -0.018 0.0963 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 8.36e-01 -0.015 0.0722 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 2.93e-01 -0.107 0.102 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 3.86e-01 -0.081 0.0933 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 3.31e-01 0.0646 0.0664 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 3.39e-01 0.119 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.68e-03 -0.251 0.0927 0.248 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.35e-01 0.114 0.118 0.248 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0891 0.126 0.248 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 5.62e-01 0.0695 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.79e-01 0.0328 0.117 0.248 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 5.40e-01 0.0625 0.102 0.248 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 5.51e-01 0.0647 0.108 0.236 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0339 0.105 0.236 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 6.12e-01 -0.056 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.04e-01 0.086 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0275 0.0886 0.236 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.75e-01 0.0599 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.26e-02 -0.172 0.0951 0.236 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 8.50e-01 0.0129 0.0685 0.236 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.96e-01 0.0679 0.0994 0.24 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 2.88e-01 -0.102 0.0958 0.24 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 3.13e-01 -0.105 0.104 0.24 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 7.08e-01 0.0389 0.104 0.24 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 2.42e-01 0.0773 0.0659 0.24 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 3.14e-01 -0.104 0.103 0.24 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.02e-01 0.0376 0.0983 0.24 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0996 0.0871 0.24 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 7.16e-01 0.039 0.107 0.24 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0162 0.104 0.24 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0509 0.109 0.24 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0818 0.108 0.24 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.52e-01 -0.149 0.103 0.24 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 1.66e-01 -0.154 0.111 0.24 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 2.40e-01 -0.11 0.0934 0.24 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 7.00e-01 0.0357 0.0925 0.24 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0832 0.0999 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.106 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0113 0.0932 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 1.74e-01 0.145 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 7.61e-01 0.0302 0.0991 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0154 0.0639 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0285 0.0892 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0437 0.0887 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 1.70e-03 -0.19 0.0598 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.66e-01 0.0684 0.0937 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 4.21e-02 0.193 0.0943 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.30e-01 0.00687 0.0783 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.83e-01 0.015 0.102 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -847464 sc-eQTL 8.05e-02 -0.158 0.0897 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 3.99e-01 0.0651 0.0771 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 5.43e-01 0.049 0.0805 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.28e-01 0.0345 0.0993 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0843 0.0546 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 1.27e-01 0.139 0.0907 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 7.42e-01 0.0238 0.0722 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 9.88e-01 0.00116 0.078 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0212 0.0848 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 1.79e-01 -0.086 0.0638 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0225 0.0873 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0283 0.0788 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 1.96e-01 0.0699 0.0539 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 2.85e-01 0.11 0.103 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0936 0.0956 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 2.87e-01 -0.101 0.0944 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 8.32e-01 0.0226 0.106 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 7.80e-01 0.0171 0.0611 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 7.38e-01 -0.034 0.102 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -513470 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0838 0.0865 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 7.72e-01 -0.02 0.0691 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -513734 sc-eQTL 4.89e-01 0.0651 0.094 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 53455 sc-eQTL 3.24e-02 -0.187 0.0869 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -769508 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0595 0.075 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -369616 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0392 0.0851 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 555435 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0528 0.0746 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 244024 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0888 0.0838 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -299736 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0654 0.0615 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -513734 eQTL 0.00405 -0.0481 0.0167 0.00391 0.0 0.253
ENSG00000057704 TMCC3 53455 eQTL 8.74e-07 -0.0757 0.0153 0.0 0.0 0.253
ENSG00000258357 AC023161.2 182143 eQTL 0.0405 -0.077 0.0375 0.0 0.0 0.253
ENSG00000258365 AC073655.2 421168 eQTL 0.0146 0.0963 0.0394 0.0 0.0 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 53455 6.69e-06 6.3e-06 7.11e-07 3.06e-06 1.3e-06 1.56e-06 6.83e-06 9.52e-07 5.18e-06 2.46e-06 6.67e-06 3.43e-06 9.98e-06 2.02e-06 1.23e-06 3.71e-06 2.24e-06 3.96e-06 1.44e-06 1.15e-06 3.1e-06 5.07e-06 4.62e-06 1.44e-06 8.44e-06 1.72e-06 2.41e-06 1.77e-06 4.41e-06 7.35e-06 2.69e-06 4.51e-07 5.21e-07 1.79e-06 2.22e-06 1.02e-06 9.66e-07 4.59e-07 9.45e-07 4.29e-07 2.11e-07 8.15e-06 4.55e-07 1.9e-07 4.03e-07 3.93e-07 8.74e-07 2.02e-07 2.72e-07
ENSG00000136014 \N -847464 2.61e-07 1.01e-07 3.35e-08 1.76e-07 1.02e-07 9.36e-08 1.39e-07 5.21e-08 1.37e-07 4.24e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.26e-07 6.21e-08 5.44e-08 8.01e-08 4.94e-08 1.07e-07 5.22e-08 3.74e-08 1.03e-07 1.33e-07 1.29e-07 4.98e-08 1.29e-07 1.13e-07 1.13e-07 8.45e-08 9.97e-08 1.1e-07 9.58e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.02e-08 9.27e-08 4.07e-08 5.64e-08 8.78e-08 8.22e-08 3.59e-08 3.35e-08 1.36e-07 4.01e-08 0.0 9.21e-08 1.8e-08 1.37e-07 4.7e-09 4.74e-08
ENSG00000236349 \N 155771 1.93e-06 1.52e-06 3.49e-07 1.16e-06 2.66e-07 6.25e-07 1.49e-06 3.49e-07 1.45e-06 4.78e-07 2.07e-06 6.61e-07 2.62e-06 3.1e-07 5.42e-07 9.2e-07 9.26e-07 9.1e-07 8.67e-07 6.36e-07 5.66e-07 1.82e-06 1.04e-06 6.57e-07 2.41e-06 4.28e-07 9.62e-07 7.14e-07 1.46e-06 1.38e-06 8.22e-07 3.31e-08 2.45e-07 7.03e-07 6.02e-07 4.69e-07 5.17e-07 1.39e-07 3.43e-07 1.54e-07 1.14e-07 2.46e-06 9.48e-08 1.26e-08 1.82e-07 7.5e-08 1.62e-07 3.01e-08 6.58e-08