logo

Genes within 1Mb (chr12:94702997:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 3.77e-01 0.123 0.139 0.079 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 8.88e-01 0.023 0.164 0.079 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.53e-01 -0.114 0.123 0.079 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 2.56e-01 0.176 0.155 0.079 B L1
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 5.52e-01 0.0843 0.141 0.079 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.05e-01 0.0953 0.0927 0.079 B L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0421 0.117 0.079 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 4.18e-01 0.115 0.142 0.079 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.97e-01 0.000229 0.0677 0.079 B L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0308 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00965 0.1 0.079 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0373 0.111 0.079 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 2.19e-01 0.187 0.152 0.079 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 4.95e-01 0.0669 0.0978 0.079 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 9.19e-04 0.336 0.0999 0.079 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.02e-02 0.182 0.107 0.079 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.90e-01 0.00175 0.139 0.079 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0341 0.0931 0.079 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 6.04e-02 -0.222 0.118 0.079 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 1.47e-01 0.218 0.15 0.079 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 7.56e-03 0.358 0.133 0.079 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 2.52e-01 0.147 0.128 0.079 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 3.48e-01 0.112 0.12 0.079 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 1.99e-02 0.227 0.0968 0.079 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0104 0.165 0.079 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 4.31e-01 0.138 0.174 0.079 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.08e-01 -0.143 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.74e-01 0.12 0.167 0.079 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 1.60e-01 0.22 0.156 0.079 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.69e-01 0.023 0.139 0.079 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0226 0.155 0.079 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.21e-01 0.105 0.13 0.079 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.18e-01 0.0154 0.151 0.079 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 2.68e-01 0.13 0.117 0.079 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 1.62e-01 -0.168 0.119 0.079 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 3.41e-01 0.136 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 2.92e-01 0.102 0.0968 0.079 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 4.17e-01 -0.116 0.143 0.079 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 1.52e-01 0.183 0.127 0.079 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 1.55e-02 0.221 0.0905 0.079 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.54e-01 -0.115 0.154 0.079 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.99e-01 0.186 0.145 0.079 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0146 0.122 0.079 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 3.24e-01 0.142 0.144 0.079 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 6.04e-01 0.0617 0.119 0.079 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 9.00e-01 0.017 0.135 0.079 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 1.27e-02 0.247 0.0982 0.079 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 1.85e-01 -0.226 0.17 0.079 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 8.25e-01 0.0322 0.145 0.079 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.75e-01 0.0948 0.133 0.079 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.53e-01 -0.124 0.165 0.079 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 9.46e-01 0.00916 0.134 0.079 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.34e-02 0.261 0.15 0.079 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 2.43e-02 0.189 0.0832 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.10e-01 0.156 0.189 0.079 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 9.28e-01 0.0146 0.162 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.04e-01 0.0491 0.198 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 2.15e-01 -0.235 0.189 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 5.03e-02 -0.282 0.143 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00888 0.153 0.079 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0736 0.19 0.079 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0375 0.134 0.079 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.94e-01 -0.115 0.168 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 2.51e-01 0.19 0.165 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 6.81e-02 0.304 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 2.13e-01 -0.19 0.152 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 7.34e-01 0.0569 0.167 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 5.26e-01 0.109 0.171 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.37e-01 0.0474 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00851 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 9.19e-01 0.0156 0.153 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0761 0.127 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.60e-02 0.31 0.174 0.08 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 2.36e-01 -0.211 0.177 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0325 0.17 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 1.88e-01 0.241 0.182 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 8.44e-01 0.0321 0.163 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.96e-01 0.0356 0.138 0.08 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 2.94e-01 -0.168 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 3.40e-01 0.155 0.162 0.08 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.43e-01 0.00941 0.13 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 3.63e-01 -0.15 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 4.11e-01 -0.138 0.167 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0619 0.141 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00263 0.172 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 6.80e-01 0.07 0.169 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.86e-03 0.375 0.14 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0353 0.147 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 4.07e-01 0.133 0.161 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.79e-01 0.00246 0.0937 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.21e-01 0.064 0.179 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.35e-01 0.0555 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 5.28e-01 0.105 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 9.05e-02 0.306 0.18 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0948 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0637 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 7.72e-01 -0.047 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 6.37e-01 0.0641 0.136 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 6.12e-02 0.249 0.132 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 2.14e-01 0.22 0.177 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 7.61e-02 0.328 0.184 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.49e-02 -0.372 0.184 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 7.57e-01 0.0457 0.148 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.67e-01 0.0492 0.166 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 7.88e-01 0.0457 0.17 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 8.26e-01 0.0336 0.153 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.24e-01 0.0126 0.131 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.22e-01 -0.112 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0796 0.139 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 2.10e-01 0.2 0.159 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0349 0.109 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 7.63e-04 0.391 0.115 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.69e-02 0.21 0.1 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0339 0.14 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.13e-01 0.107 0.131 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0196 0.152 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 3.07e-01 0.181 0.177 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 5.95e-01 0.0693 0.13 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 1.64e-02 0.332 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.01e-01 0.101 0.12 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 1.83e-01 -0.236 0.177 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0506 0.157 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 7.00e-01 0.0637 0.165 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0721 0.166 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.44e-01 0.134 0.141 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 3.59e-01 -0.146 0.159 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.81e-02 0.297 0.142 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.15e-01 0.129 0.157 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0739 0.139 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.33e-02 -0.334 0.156 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 2.89e-01 0.185 0.174 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 2.15e-02 0.382 0.165 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00838 0.143 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 3.60e-01 -0.144 0.157 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 6.20e-03 0.336 0.121 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 8.73e-01 -0.026 0.162 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.40e-01 0.0421 0.127 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 2.46e-01 -0.17 0.146 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 5.45e-01 0.0987 0.163 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 5.45e-01 0.0891 0.147 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 1.73e-01 0.203 0.148 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 5.67e-01 0.0821 0.143 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 1.10e-01 0.19 0.118 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0999 0.174 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.49e-03 0.421 0.131 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.07e-01 0.18 0.176 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.56e-01 0.132 0.177 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 4.81e-01 0.112 0.159 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 5.15e-01 0.109 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0867 0.172 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 2.15e-01 0.172 0.138 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 8.14e-01 0.0438 0.186 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0088 0.16 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 2.56e-01 -0.205 0.18 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 3.88e-02 0.391 0.188 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 8.16e-02 0.274 0.156 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 5.23e-01 0.115 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 4.75e-01 -0.133 0.185 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.53e-01 -0.119 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0507 0.172 0.078 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0783 0.146 0.078 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 7.47e-01 0.0542 0.168 0.078 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0267 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 5.11e-01 0.0941 0.143 0.078 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 1.75e-01 0.222 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.08e-02 0.292 0.142 0.078 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.93e-02 -0.356 0.18 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 9.65e-02 0.289 0.173 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00691 0.179 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 5.97e-01 0.0995 0.188 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 4.19e-01 0.124 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.19e-01 0.0358 0.156 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 2.09e-02 0.343 0.147 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0481 0.171 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 5.37e-01 0.0919 0.149 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0244 0.154 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.95e-01 0.0207 0.157 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.91e-01 0.118 0.138 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.88e-01 0.0226 0.16 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.01e-02 0.228 0.11 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0497 0.19 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0843 0.168 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 7.40e-01 0.0588 0.177 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 3.91e-01 0.16 0.186 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.84e-01 -0.133 0.152 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 5.82e-01 0.0965 0.175 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.24e-01 0.156 0.157 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0299 0.156 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.77e-01 0.216 0.16 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.11e-01 -0.131 0.159 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.64e-02 0.281 0.163 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 2.92e-01 -0.15 0.142 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 4.48e-01 -0.124 0.163 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.60e-02 0.238 0.113 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 6.04e-01 -0.109 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.25e-01 -0.29 0.188 0.081 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.80e-01 0.0317 0.21 0.081 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.96e-01 -0.136 0.199 0.081 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 2.76e-01 0.205 0.187 0.081 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 8.70e-02 0.331 0.192 0.081 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 6.09e-01 0.104 0.202 0.081 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 2.90e-01 0.178 0.167 0.081 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 5.00e-02 0.23 0.116 0.081 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 1.41e-01 -0.247 0.167 0.078 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.59e-02 -0.264 0.148 0.078 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 5.03e-01 0.0965 0.144 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 2.83e-01 -0.186 0.173 0.078 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0439 0.17 0.078 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.74e-01 0.0267 0.168 0.078 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.98e-02 0.215 0.104 0.078 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0415 0.17 0.079 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 1.57e-01 -0.226 0.159 0.079 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0458 0.169 0.079 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0294 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 1.37e-01 -0.232 0.155 0.079 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 4.06e-01 0.139 0.167 0.079 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.59e-01 0.0949 0.128 0.079 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.89e-01 -0.116 0.167 0.08 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 3.25e-01 0.177 0.18 0.08 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.11e-01 -0.185 0.183 0.08 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 6.83e-01 -0.072 0.176 0.08 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 2.73e-02 0.345 0.155 0.08 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0951 0.147 0.08 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 4.32e-01 -0.133 0.169 0.08 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.14e-01 0.145 0.144 0.08 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 5.96e-01 0.0891 0.168 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 4.28e-01 0.105 0.132 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 6.50e-02 -0.267 0.144 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.68e-01 0.0254 0.153 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.19e-02 0.209 0.116 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 3.79e-01 -0.14 0.158 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 1.54e-01 0.193 0.135 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.99e-01 -9.4e-05 0.0961 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0701 0.17 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 3.80e-01 0.131 0.149 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.50e-01 0.153 0.164 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 5.42e-01 0.0989 0.162 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 1.22e-01 -0.187 0.121 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.32e-01 0.0365 0.172 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0916 0.157 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 1.49e-04 0.417 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 6.01e-02 -0.394 0.208 0.082 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.94e-01 0.209 0.16 0.082 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0268 0.2 0.082 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.78e-01 -0.152 0.214 0.082 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 4.26e-01 0.162 0.203 0.082 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 2.42e-01 0.232 0.198 0.082 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 7.55e-01 0.054 0.173 0.082 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 6.09e-01 0.0917 0.179 0.08 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0584 0.173 0.08 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.59e-01 -0.135 0.182 0.08 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0571 0.17 0.08 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 6.80e-01 0.0604 0.146 0.08 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 7.57e-01 0.0546 0.176 0.08 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 5.51e-01 0.0944 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.36e-03 0.328 0.111 0.08 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 3.45e-02 0.351 0.165 0.079 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 9.91e-01 0.00176 0.161 0.079 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.67e-01 0.0293 0.175 0.079 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 6.86e-01 0.0702 0.174 0.079 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.35e-01 0.107 0.11 0.079 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0964 0.173 0.079 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 1.99e-01 0.211 0.164 0.079 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.91e-02 0.3 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 5.68e-01 0.103 0.18 0.088 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.088 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 5.75e-01 -0.103 0.184 0.088 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 1.55e-01 0.258 0.181 0.088 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.18e-01 0.0632 0.175 0.088 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 2.21e-01 0.23 0.187 0.088 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0703 0.158 0.088 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 3.02e-01 0.161 0.155 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 1.96e-02 0.388 0.165 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0379 0.177 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 3.47e-01 -0.147 0.155 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 8.04e-01 0.0444 0.179 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 6.99e-01 0.064 0.166 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 7.86e-01 0.029 0.107 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0251 0.149 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 5.76e-01 0.0831 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 9.25e-01 0.00962 0.102 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 4.45e-01 -0.12 0.157 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0253 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000772 0.131 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 4.91e-01 0.118 0.17 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -848479 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0555 0.151 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 4.71e-02 0.256 0.128 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0701 0.135 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 2.09e-01 0.209 0.166 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 2.27e-01 0.111 0.0915 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0174 0.154 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.75e-01 0.165 0.121 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 2.75e-01 -0.144 0.131 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 3.99e-01 0.121 0.143 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 6.46e-01 0.0497 0.108 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 4.67e-01 -0.107 0.147 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 3.82e-01 0.116 0.133 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 7.13e-02 0.164 0.0906 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 1.69e-02 0.406 0.169 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0472 0.158 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 4.86e-01 -0.109 0.156 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 6.26e-01 0.0856 0.175 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 3.88e-01 0.0873 0.101 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0171 0.168 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514485 sc-eQTL 7.77e-02 0.252 0.142 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 4.61e-03 0.321 0.112 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -514749 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00455 0.158 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52440 sc-eQTL 1.71e-01 0.202 0.147 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770523 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0199 0.127 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -370631 sc-eQTL 1.98e-01 0.185 0.143 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554420 sc-eQTL 9.68e-01 0.0051 0.126 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 243009 sc-eQTL 9.90e-01 0.00186 0.141 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 sc-eQTL 2.14e-02 0.238 0.103 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000184752 NDUFA12 -300751 eQTL 0.0212 0.0785 0.034 0.0 0.0 0.0726

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000258303 \N 866830 2.76e-07 1.34e-07 5.03e-08 1.9e-07 9.87e-08 9.9e-08 1.6e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.57e-07 1.05e-07 1.53e-07 7.13e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.09e-08 1.4e-07 6.32e-08 4.89e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.79e-08 1.63e-07 1.25e-07 1.07e-07 9.92e-08 1.23e-07 1.07e-07 1.06e-07 3.54e-08 3.96e-08 8.56e-08 5.99e-08 2.99e-08 5.29e-08 8.63e-08 6.57e-08 3.67e-08 5.28e-08 1.46e-07 5.27e-08 1.28e-08 3.41e-08 1.86e-08 1.18e-07 1.88e-09 4.99e-08