logo

Genes within 1Mb (chr12:94702584:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.11e-01 0.0692 0.0839 0.235 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 4.91e-01 0.0681 0.0986 0.235 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0472 0.0739 0.235 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 4.47e-01 0.071 0.0933 0.235 B L1
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0423 0.0852 0.235 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.79e-01 0.0157 0.056 0.235 B L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0677 0.0705 0.235 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00146 0.0854 0.235 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 3.52e-03 -0.118 0.0399 0.235 B L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00411 0.0694 0.235 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0831 0.06 0.235 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00236 0.0671 0.235 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.77e-02 -0.167 0.091 0.235 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0113 0.059 0.235 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0634 0.0616 0.235 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 5.07e-01 -0.043 0.0647 0.235 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.21e-01 -0.067 0.0831 0.235 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 1.87e-06 -0.26 0.053 0.235 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.13e-02 -0.124 0.0707 0.235 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.98e-03 -0.239 0.0891 0.235 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 1.53e-02 -0.196 0.08 0.235 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0926 0.0768 0.235 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0186 0.072 0.235 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0239 0.0589 0.235 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0754 0.0986 0.241 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.35e-01 -0.101 0.104 0.241 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 3.60e-01 0.0948 0.103 0.241 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.06e-02 -0.181 0.0995 0.241 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.78e-01 0.039 0.0936 0.241 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 6.88e-01 0.0335 0.0833 0.241 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 8.44e-01 0.0182 0.0928 0.241 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 8.73e-01 0.0125 0.0782 0.241 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.01e-02 0.171 0.0903 0.235 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 9.99e-01 4.87e-05 0.0708 0.235 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0122 0.0725 0.235 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0349 0.0864 0.235 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0213 0.0587 0.235 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0117 0.0867 0.235 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0456 0.0772 0.235 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 4.63e-01 0.0408 0.0554 0.235 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.65e-01 0.0678 0.0927 0.236 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.23e-02 -0.199 0.0864 0.236 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0727 0.0732 0.236 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.69e-01 0.0256 0.0869 0.236 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0724 0.0715 0.236 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 1.63e-02 -0.194 0.0803 0.236 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0588 0.0599 0.236 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 7.49e-01 0.0327 0.102 0.235 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 7.45e-04 -0.289 0.0844 0.235 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 7.65e-01 0.0237 0.0792 0.235 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0364 0.0988 0.235 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 1.29e-01 0.121 0.0798 0.235 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 2.03e-01 -0.115 0.0899 0.235 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 7.26e-02 -0.09 0.0499 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0634 0.117 0.227 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 9.86e-02 -0.164 0.0988 0.227 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 1.75e-01 0.165 0.121 0.227 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.67e-01 0.00489 0.117 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 2.13e-02 0.204 0.0877 0.227 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.02e-01 0.12 0.0936 0.227 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0628 0.117 0.227 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0744 0.0823 0.227 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.10e-01 -0.129 0.103 0.227 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0121 0.1 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 8.66e-01 0.0172 0.102 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0243 0.0926 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.69e-01 0.00389 0.102 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 3.18e-01 0.104 0.104 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 1.49e-01 -0.123 0.085 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 8.92e-02 -0.161 0.094 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 1.85e-01 -0.123 0.0926 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.74e-02 -0.169 0.076 0.234 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 9.83e-01 0.00223 0.107 0.235 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 7.45e-01 0.0353 0.108 0.235 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 1.82e-01 -0.138 0.103 0.235 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 6.71e-01 0.0475 0.111 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.09e-02 -0.185 0.0984 0.235 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 8.00e-01 0.0213 0.0839 0.235 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 6.12e-01 0.0497 0.0978 0.235 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 6.81e-01 0.0406 0.0987 0.235 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 7.87e-02 -0.139 0.0789 0.235 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00182 0.0998 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 6.48e-02 0.186 0.1 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.71e-01 0.0481 0.0848 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0603 0.103 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 1.04e-01 -0.166 0.101 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 5.25e-01 0.0545 0.0857 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0462 0.0885 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 5.49e-01 0.0581 0.097 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0688 0.0563 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.00e-01 0.113 0.109 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 5.73e-01 0.0563 0.0997 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 1.42e-01 -0.148 0.1 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 2.83e-01 0.119 0.11 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0481 0.101 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.53e-01 0.042 0.0933 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.55e-01 0.0737 0.0984 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 6.46e-01 0.038 0.0826 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0619 0.0811 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0785 0.107 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.54e-01 0.0207 0.112 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.79e-01 0.0317 0.113 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 8.12e-02 -0.155 0.0887 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.1 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 7.78e-01 -0.029 0.103 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0287 0.0925 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.33e-01 0.0763 0.0787 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0844 0.068 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0626 0.0832 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 2.73e-02 -0.211 0.0949 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 5.41e-01 -0.04 0.0653 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 7.73e-02 -0.125 0.0702 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0598 0.0606 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0202 0.0838 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 9.25e-02 -0.132 0.078 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.55e-01 -0.054 0.0913 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 4.51e-01 0.0801 0.106 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.95e-01 0.0819 0.078 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.95e-01 0.0443 0.0833 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00652 0.0719 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0848 0.107 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.17e-01 0.022 0.0949 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.05e-02 0.168 0.099 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 7.22e-01 0.0356 0.1 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.03e-01 0.0445 0.0855 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0287 0.0961 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0472 0.0868 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0442 0.0951 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 4.69e-05 -0.335 0.0807 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 9.00e-01 -0.012 0.0952 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0604 0.105 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 3.51e-03 -0.292 0.0989 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 5.08e-01 -0.057 0.086 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0558 0.0947 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 6.49e-01 -0.034 0.0746 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0363 0.0971 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 1.80e-01 -0.102 0.0756 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 1.92e-01 -0.114 0.0876 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 2.55e-02 -0.217 0.0964 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 1.99e-01 -0.113 0.0877 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 1.96e-01 0.115 0.0887 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 6.80e-01 0.0355 0.0859 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0264 0.0712 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.22e-01 -0.106 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.77e-02 -0.18 0.0812 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 6.72e-01 0.0459 0.108 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 7.71e-02 -0.192 0.108 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 4.56e-01 0.0728 0.0976 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 1.49e-01 -0.149 0.102 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0787 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 1.01e-01 -0.139 0.0845 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.06e-01 0.0895 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.40e-04 -0.326 0.0895 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 9.99e-01 -8.88e-05 0.104 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 6.48e-01 0.0503 0.11 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.07e-01 -0.047 0.0911 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.00e-03 -0.283 0.102 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.08e-01 0.071 0.107 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0535 0.0914 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00474 0.105 0.238 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.60e-03 -0.265 0.0869 0.238 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 4.63e-01 0.0748 0.102 0.238 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 3.69e-01 0.0889 0.0987 0.238 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.81e-02 0.153 0.0863 0.238 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.30e-02 -0.201 0.0986 0.238 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 5.81e-02 -0.165 0.0863 0.238 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.48e-01 0.0828 0.109 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0899 0.104 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0264 0.107 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 1.77e-01 0.152 0.112 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0121 0.0924 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 1.15e-02 -0.235 0.0921 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 9.68e-01 0.00365 0.0896 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0443 0.104 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0981 0.0905 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 7.04e-01 0.0357 0.094 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 4.98e-01 -0.065 0.0957 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.84e-02 -0.153 0.0835 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0602 0.0972 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0533 0.0678 0.235 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 1.93e-02 0.27 0.114 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.63e-03 -0.296 0.101 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0799 0.108 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 6.75e-01 0.0479 0.114 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.94e-01 0.0243 0.093 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 8.59e-01 0.019 0.107 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0729 0.096 0.235 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.55e-01 0.0885 0.0954 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.02e-03 -0.288 0.096 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 2.78e-02 -0.213 0.096 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.57e-01 0.00548 0.101 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 5.96e-01 0.0462 0.0869 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 2.90e-01 -0.106 0.0996 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0266 0.0696 0.235 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 1.52e-01 0.192 0.133 0.211 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 5.77e-01 0.0676 0.121 0.211 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 7.01e-01 0.0517 0.134 0.211 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0127 0.128 0.211 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 3.82e-01 0.105 0.12 0.211 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.12e-01 -0.063 0.124 0.211 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 1.32e-01 -0.194 0.128 0.211 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 7.54e-01 0.0337 0.107 0.211 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 1.19e-01 -0.117 0.0745 0.211 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.71e-01 0.043 0.101 0.237 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0765 0.0898 0.237 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.89e-01 0.0469 0.0866 0.237 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 8.43e-01 0.0207 0.104 0.237 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 9.18e-01 0.0105 0.102 0.237 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.48e-01 0.0609 0.101 0.237 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0756 0.0631 0.237 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 4.74e-01 0.0738 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0268 0.0973 0.235 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.27e-01 0.00949 0.103 0.235 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 7.91e-01 0.0244 0.0921 0.235 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0248 0.0949 0.235 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 9.62e-01 0.00481 0.102 0.235 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0139 0.0779 0.235 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.18e-01 -0.1 0.1 0.241 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0644 0.108 0.241 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 2.65e-02 0.243 0.109 0.241 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 2.34e-01 -0.126 0.106 0.241 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00436 0.0946 0.241 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.32e-01 0.0698 0.0886 0.241 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 4.81e-01 0.0718 0.102 0.241 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 4.26e-01 0.0691 0.0866 0.241 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 5.22e-02 0.195 0.1 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 3.40e-01 0.0757 0.0791 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.01e-01 0.0586 0.087 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 2.71e-01 -0.101 0.0915 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0851 0.0697 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 9.60e-01 0.00483 0.0953 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0509 0.0813 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.62e-01 0.0648 0.0576 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 8.05e-01 0.0254 0.103 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0108 0.0901 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0648 0.0994 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 8.62e-01 0.0171 0.098 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00162 0.0735 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0969 0.104 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0994 0.0949 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 3.68e-01 0.0609 0.0675 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 1.61e-01 0.176 0.125 0.248 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 1.36e-02 -0.236 0.0946 0.248 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 2.39e-01 0.141 0.119 0.248 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0953 0.128 0.248 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 5.23e-01 0.0779 0.122 0.248 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00816 0.119 0.248 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 9.07e-01 0.0122 0.103 0.248 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 7.62e-01 0.0333 0.11 0.236 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0166 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0672 0.112 0.236 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 3.20e-01 0.104 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0277 0.09 0.236 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 5.83e-01 0.0596 0.108 0.236 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 1.22e-01 -0.15 0.0968 0.236 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 5.64e-01 0.0401 0.0695 0.236 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.98e-01 0.0854 0.101 0.24 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.19e-01 -0.12 0.0971 0.24 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0803 0.106 0.24 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 4.67e-01 0.0768 0.105 0.24 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.63e-01 0.0752 0.067 0.24 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.35e-01 -0.082 0.105 0.24 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 6.79e-01 0.0414 0.0998 0.24 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0864 0.0885 0.24 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 5.75e-01 0.0609 0.108 0.243 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00784 0.106 0.243 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0616 0.111 0.243 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0682 0.109 0.243 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 1.71e-01 -0.144 0.105 0.243 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 1.13e-01 -0.179 0.112 0.243 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0809 0.095 0.243 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 9.50e-01 0.00587 0.0939 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0396 0.101 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0196 0.107 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 8.16e-01 -0.022 0.0945 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 3.50e-01 0.102 0.108 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 6.51e-01 0.0455 0.1 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00395 0.0648 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0741 0.0903 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0473 0.0899 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 1.97e-03 -0.19 0.0607 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 5.94e-01 0.0509 0.0953 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 1.35e-01 0.144 0.0962 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 9.11e-01 0.00888 0.0796 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 9.61e-01 0.00512 0.104 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -848892 sc-eQTL 9.28e-02 -0.154 0.0912 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 6.33e-01 0.0375 0.0784 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 9.24e-01 0.00781 0.0818 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 6.55e-01 0.0451 0.101 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 9.23e-02 -0.0937 0.0554 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 7.00e-02 0.168 0.092 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 6.25e-01 0.0359 0.0734 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 9.49e-01 0.00507 0.0793 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0356 0.0862 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0775 0.0649 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 7.02e-01 -0.034 0.0887 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0591 0.08 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 1.53e-01 0.0785 0.0547 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 3.08e-01 0.107 0.105 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.96e-01 -0.102 0.0971 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0801 0.096 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.96e-01 0.0571 0.108 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 7.64e-01 0.0187 0.0621 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0211 0.103 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -514898 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0713 0.088 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 8.94e-01 0.0094 0.0702 0.235 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -515162 sc-eQTL 6.26e-01 0.0468 0.0958 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 52027 sc-eQTL 2.44e-02 -0.201 0.0884 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -770936 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0481 0.0765 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -371044 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0536 0.0867 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 554007 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0679 0.076 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 242596 sc-eQTL 2.01e-01 -0.109 0.0853 0.235 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -301164 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0657 0.0627 0.235 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -515162 eQTL 0.00881 -0.044 0.0168 0.00283 0.0 0.25
ENSG00000057704 TMCC3 52027 eQTL 9.76e-07 -0.0756 0.0153 0.0 0.0 0.25
ENSG00000136014 USP44 -848892 eQTL 0.0455 0.067 0.0335 0.0 0.0 0.25
ENSG00000258357 AC023161.2 180715 eQTL 0.0359 -0.0791 0.0376 0.0 0.0 0.25
ENSG00000258365 AC073655.2 419740 eQTL 0.0214 0.0911 0.0395 0.0 0.0 0.25

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 52027 1.08e-05 1.36e-05 1.51e-06 7.6e-06 2.43e-06 5e-06 1.31e-05 1.99e-06 9.97e-06 5.31e-06 1.38e-05 5.8e-06 2.09e-05 4.49e-06 3.33e-06 6.38e-06 5.91e-06 7.74e-06 3.04e-06 2.83e-06 5.35e-06 1.1e-05 9.75e-06 3.3e-06 1.95e-05 3.22e-06 5.62e-06 4.09e-06 1.25e-05 1.02e-05 6.68e-06 5.87e-07 1.09e-06 2.91e-06 4.89e-06 2.21e-06 1.55e-06 1.94e-06 1.64e-06 1.02e-06 7.37e-07 1.67e-05 1.39e-06 1.59e-07 6.87e-07 1.68e-06 1.4e-06 7.43e-07 4.74e-07
ENSG00000136014 USP44 -848892 2.8e-07 1.5e-07 5.49e-08 2.2e-07 9.87e-08 8.33e-08 1.73e-07 5.66e-08 1.45e-07 5.67e-08 1.59e-07 8.68e-08 1.69e-07 7.64e-08 5.82e-08 7.5e-08 4.18e-08 1.33e-07 7.29e-08 5.07e-08 1.27e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.64e-08 1.68e-07 1.26e-07 1.12e-07 1.01e-07 1.22e-07 1.06e-07 1.02e-07 3.66e-08 3.51e-08 8.44e-08 4.92e-08 3.05e-08 4.41e-08 8.63e-08 6.55e-08 3.71e-08 4.46e-08 1.46e-07 3.99e-08 7.35e-09 3.83e-08 1.83e-08 1.22e-07 3.92e-09 4.99e-08
ENSG00000236349 \N 154343 4.54e-06 5.32e-06 7.85e-07 3.06e-06 1.12e-06 1.59e-06 4.25e-06 8.92e-07 4.55e-06 2.17e-06 5.26e-06 3.2e-06 7.53e-06 2.08e-06 1.35e-06 2.63e-06 1.81e-06 2.87e-06 1.47e-06 9.86e-07 2.55e-06 4.91e-06 3.78e-06 1.82e-06 6.64e-06 1.29e-06 2.57e-06 1.57e-06 4.23e-06 4.17e-06 2.28e-06 3.45e-07 5.48e-07 1.36e-06 2.04e-06 9.52e-07 9.41e-07 4.37e-07 1.35e-06 3.28e-07 3.31e-07 6.04e-06 4.01e-07 1.67e-07 3.5e-07 3.31e-07 7.24e-07 2.44e-07 2.69e-07