logo

Genes within 1Mb (chr12:94695220:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.89e-01 0.00187 0.132 0.071 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.14e-01 0.0363 0.155 0.071 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0325 0.116 0.071 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.55e-01 0.0456 0.146 0.071 B L1
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 3.59e-01 -0.122 0.133 0.071 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0723 0.0875 0.071 B L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 7.45e-01 0.036 0.111 0.071 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 2.81e-01 0.144 0.133 0.071 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0752 0.0636 0.071 B L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0526 0.108 0.071 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0031 0.0939 0.071 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0222 0.105 0.071 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.53e-01 -0.107 0.143 0.071 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0088 0.0919 0.071 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 1.33e-01 0.144 0.0958 0.071 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0283 0.101 0.071 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.91e-02 -0.253 0.128 0.071 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.69e-02 -0.206 0.0857 0.071 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 6.19e-01 0.0551 0.11 0.071 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 2.42e-02 -0.316 0.139 0.071 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.85e-02 -0.248 0.125 0.071 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 1.07e-02 -0.303 0.118 0.071 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0242 0.112 0.071 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0903 0.0912 0.071 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 3.96e-01 0.129 0.151 0.072 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0667 0.16 0.072 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0464 0.159 0.072 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0588 0.154 0.072 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 7.92e-01 0.0379 0.144 0.072 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 7.47e-02 0.227 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0998 0.142 0.072 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.78e-01 0.106 0.12 0.072 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.42e-01 -0.11 0.144 0.071 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 5.47e-03 0.308 0.11 0.071 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0428 0.114 0.071 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0398 0.136 0.071 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.24e-01 -0.112 0.0923 0.071 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0949 0.137 0.071 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0478 0.122 0.071 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 8.51e-01 0.0165 0.0876 0.071 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00296 0.143 0.071 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0148 0.135 0.071 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 2.89e-01 0.12 0.113 0.071 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 5.53e-01 0.0796 0.134 0.071 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0649 0.11 0.071 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.80e-01 0.00308 0.126 0.071 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0127 0.0926 0.071 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0422 0.158 0.071 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.14e-03 -0.432 0.131 0.071 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.35e-02 -0.219 0.122 0.071 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0251 0.153 0.071 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 1.58e-02 0.298 0.122 0.071 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 7.54e-01 0.0438 0.14 0.071 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 6.81e-01 -0.032 0.0777 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.19e-01 -0.142 0.175 0.071 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.47e-02 -0.258 0.149 0.071 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 1.06e-01 0.295 0.182 0.071 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 3.21e-01 0.175 0.175 0.071 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 3.40e-01 -0.128 0.134 0.071 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.70e-01 0.0605 0.142 0.071 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.16e-01 0.0185 0.176 0.071 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 1.59e-01 -0.175 0.123 0.071 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.76e-01 0.0442 0.155 0.071 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0593 0.158 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0949 0.159 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 8.20e-01 0.0332 0.146 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 3.72e-01 -0.142 0.159 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 7.39e-01 0.0546 0.163 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00073 0.134 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 4.92e-01 -0.102 0.149 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0457 0.146 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0432 0.121 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 1.50e-01 0.237 0.164 0.071 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0409 0.168 0.071 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 2.85e-01 -0.171 0.16 0.071 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.47e-01 0.0555 0.172 0.071 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 7.86e-01 0.0417 0.153 0.071 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 1.60e-01 -0.182 0.129 0.071 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 1.42e-01 0.222 0.151 0.071 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 3.15e-01 0.153 0.152 0.071 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0912 0.123 0.071 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 3.54e-01 -0.144 0.155 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.22e-02 0.392 0.155 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0733 0.132 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.26e-01 0.0356 0.161 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 8.22e-02 -0.276 0.158 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0968 0.134 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00588 0.138 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0331 0.151 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0747 0.088 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.20e-01 0.061 0.17 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 4.00e-01 0.13 0.155 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0111 0.157 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 9.58e-01 -0.009 0.172 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.94e-01 -0.107 0.157 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.35e-01 0.0689 0.145 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 3.46e-01 0.144 0.153 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 3.68e-01 -0.116 0.128 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.70e-01 -0.113 0.126 0.071 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 1.56e-04 -0.602 0.156 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 3.54e-01 0.157 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 1.20e-01 0.264 0.169 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.53e-01 -0.101 0.135 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 5.63e-01 0.0876 0.151 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 3.51e-01 -0.144 0.154 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0473 0.139 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.19e-01 0.0126 0.123 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0801 0.106 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0179 0.13 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0185 0.149 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.95e-01 0.0399 0.102 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 5.69e-01 0.0627 0.11 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0519 0.0944 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0853 0.131 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 8.48e-01 0.0236 0.123 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 2.69e-01 -0.158 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 8.07e-01 0.0407 0.166 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.04e-01 0.155 0.122 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.20e-02 0.226 0.13 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0116 0.112 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.27e-01 0.0155 0.169 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.95e-01 -0.039 0.15 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.82e-01 0.0234 0.157 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 2.48e-01 -0.182 0.158 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.06e-01 -0.112 0.135 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 1.41e-01 0.223 0.151 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 8.67e-01 -0.023 0.137 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.11e-02 -0.343 0.148 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.18e-02 -0.33 0.13 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 1.88e-01 0.197 0.149 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.84e-01 0.0673 0.165 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.75e-02 -0.313 0.157 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.51e-02 -0.302 0.134 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.84e-02 -0.253 0.148 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0994 0.117 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 3.91e-01 -0.13 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.55e-01 -0.168 0.117 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.91e-01 0.0016 0.137 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 8.35e-02 -0.262 0.151 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 1.94e-01 -0.178 0.136 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.50e-01 0.159 0.138 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 5.11e-01 0.088 0.133 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0954 0.11 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 1.30e-01 -0.247 0.162 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 6.57e-02 -0.231 0.125 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 2.04e-01 -0.21 0.165 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 1.17e-01 -0.261 0.166 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 2.81e-01 0.161 0.149 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 1.32e-01 -0.237 0.157 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 5.34e-01 0.101 0.162 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 1.27e-01 -0.198 0.129 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.83e-01 -0.18 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.144 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.14e-01 0.0596 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.70e-01 0.0732 0.171 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 4.25e-01 -0.113 0.142 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 5.99e-02 -0.303 0.16 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0307 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 6.54e-01 -0.064 0.142 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0359 0.162 0.071 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 5.55e-03 -0.377 0.134 0.071 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 1.49e-02 -0.381 0.155 0.071 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0651 0.152 0.071 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.72e-03 0.344 0.132 0.071 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0308 0.154 0.071 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.47e-03 -0.357 0.132 0.071 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.89e-01 0.115 0.166 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 2.28e-01 -0.191 0.158 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 3.14e-01 -0.164 0.163 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 1.18e-01 0.268 0.17 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.38e-01 0.109 0.14 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 6.64e-01 0.0618 0.142 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0704 0.136 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 3.12e-01 0.161 0.159 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.51e-01 0.0262 0.139 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 6.23e-02 0.268 0.143 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0661 0.147 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.28e-02 -0.216 0.128 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00331 0.149 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0274 0.104 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.81e-01 0.19 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.63e-01 0.0269 0.156 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 5.30e-01 -0.103 0.164 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 4.42e-01 0.133 0.173 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 8.63e-01 0.0245 0.141 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 2.41e-01 0.19 0.162 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0876 0.146 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 1.60e-01 -0.208 0.147 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0402 0.152 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 2.78e-01 -0.163 0.15 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 2.34e-01 -0.185 0.155 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0542 0.134 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 2.21e-01 0.189 0.154 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 5.85e-01 0.0589 0.108 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.73e-01 0.0595 0.206 0.059 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 3.49e-01 -0.174 0.185 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 5.66e-01 -0.118 0.205 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 4.80e-01 0.138 0.195 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 9.93e-01 0.00153 0.184 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 3.80e-01 -0.167 0.189 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0612 0.198 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 4.36e-01 0.128 0.164 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.21e-01 -0.115 0.115 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0149 0.155 0.072 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 2.74e-01 -0.151 0.138 0.072 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.73e-01 0.0386 0.133 0.072 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.08e-01 0.0826 0.161 0.072 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.96e-01 0.165 0.157 0.072 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0283 0.156 0.072 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 9.04e-01 0.0118 0.0975 0.072 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.75e-01 0.174 0.159 0.071 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.11e-01 0.0558 0.15 0.071 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 4.41e-01 -0.123 0.159 0.071 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0873 0.142 0.071 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.47e-01 -0.112 0.146 0.071 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 4.01e-01 0.132 0.157 0.071 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 6.12e-01 0.0612 0.12 0.071 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0495 0.162 0.071 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.99e-01 -0.224 0.173 0.071 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.01e-01 -0.068 0.177 0.071 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0213 0.171 0.071 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0744 0.152 0.071 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 6.19e-01 0.071 0.143 0.071 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 5.20e-01 -0.105 0.164 0.071 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 7.16e-01 0.0508 0.139 0.071 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.47e-01 0.121 0.159 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 2.56e-03 0.373 0.122 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0409 0.137 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 3.44e-01 -0.137 0.144 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 1.06e-01 -0.178 0.11 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00601 0.15 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 4.62e-01 0.0942 0.128 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 4.74e-01 0.0651 0.0908 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 1.01e-01 -0.265 0.161 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 2.31e-01 0.169 0.141 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0193 0.156 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 3.59e-01 -0.141 0.154 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0604 0.115 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 1.30e-01 -0.247 0.162 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 3.29e-01 -0.146 0.149 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 9.35e-01 0.00871 0.106 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0278 0.192 0.07 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.63e-03 -0.381 0.143 0.07 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0478 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 9.42e-01 0.0142 0.195 0.07 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0312 0.185 0.07 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 2.75e-03 0.533 0.175 0.07 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 4.63e-02 0.311 0.155 0.07 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 7.60e-01 -0.053 0.173 0.071 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.71e-02 0.398 0.166 0.071 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 8.91e-01 0.0243 0.176 0.071 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 3.89e-01 0.142 0.164 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 3.24e-01 -0.14 0.141 0.071 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 4.57e-01 0.127 0.17 0.071 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 2.72e-02 -0.337 0.151 0.071 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0869 0.109 0.071 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 3.76e-01 -0.137 0.155 0.075 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.91e-01 0.195 0.149 0.075 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.04e-01 0.0197 0.163 0.075 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 1.98e-01 0.208 0.161 0.075 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.86e-01 0.0718 0.103 0.075 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 1.68e-01 -0.222 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 4.69e-01 -0.111 0.153 0.075 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 2.54e-01 -0.155 0.136 0.075 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.10e-01 0.223 0.177 0.068 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 4.62e-01 0.128 0.173 0.068 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00752 0.182 0.068 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0811 0.18 0.068 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00735 0.173 0.068 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 2.56e-01 0.211 0.185 0.068 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 7.08e-01 0.0585 0.156 0.068 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 1.51e-01 0.221 0.153 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 5.36e-01 0.0986 0.159 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 4.97e-01 -0.114 0.168 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.99e-01 0.0379 0.148 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0617 0.171 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0134 0.158 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0691 0.102 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.08e-01 0.0164 0.142 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 6.57e-01 0.0628 0.141 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0566 0.0975 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 4.78e-01 -0.105 0.147 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.19e-01 0.233 0.149 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00974 0.123 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 9.76e-01 0.00482 0.16 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -856256 sc-eQTL 5.82e-02 -0.268 0.141 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0265 0.121 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 4.26e-01 0.101 0.126 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 4.72e-01 -0.112 0.156 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 2.01e-01 -0.11 0.0859 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0582 0.146 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 1.10e-02 0.293 0.114 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0372 0.125 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 4.39e-01 -0.105 0.136 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 9.07e-02 -0.173 0.102 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0825 0.14 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 8.85e-01 0.0183 0.126 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 5.07e-01 0.0576 0.0867 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 2.43e-01 -0.191 0.163 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 8.58e-03 0.396 0.149 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0399 0.15 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 2.12e-01 0.209 0.167 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0403 0.0968 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0153 0.161 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522262 sc-eQTL 3.57e-02 -0.287 0.136 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0925 0.109 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522526 sc-eQTL 9.33e-01 0.0125 0.148 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44663 sc-eQTL 9.29e-01 0.0124 0.138 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778300 sc-eQTL 1.10e-01 0.188 0.117 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378408 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0423 0.134 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546643 sc-eQTL 2.93e-01 -0.123 0.117 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 235232 sc-eQTL 6.61e-01 0.0579 0.132 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308528 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00261 0.0969 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -522526 eQTL 0.0129 -0.0782 0.0314 0.0 0.0 0.0525
ENSG00000173588 CEP83 235232 eQTL 0.00394 0.16 0.0552 0.0 0.0 0.0525

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina