logo

Genes within 1Mb (chr12:94694966:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 8.45e-01 0.0204 0.105 0.122 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0105 0.123 0.122 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 7.53e-01 -0.029 0.0921 0.122 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.47e-01 0.0533 0.116 0.122 B L1
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 6.01e-01 0.0555 0.106 0.122 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0543 0.0696 0.122 B L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 8.44e-01 0.0173 0.088 0.122 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 5.74e-02 0.202 0.106 0.122 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0551 0.0506 0.122 B L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0682 0.0858 0.122 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0255 0.0746 0.122 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 8.78e-01 0.0127 0.0831 0.122 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0374 0.113 0.122 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 2.90e-01 0.0773 0.0728 0.122 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.14e-03 0.232 0.0748 0.122 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.10e-01 0.128 0.0797 0.122 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.88e-02 -0.201 0.102 0.122 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 5.53e-02 -0.132 0.0683 0.122 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0221 0.0876 0.122 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0518 0.111 0.122 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 5.61e-01 -0.058 0.0997 0.122 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0681 0.0948 0.122 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0654 0.0885 0.122 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.24e-01 0.058 0.0724 0.122 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 9.56e-01 0.00671 0.122 0.122 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0288 0.13 0.122 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0565 0.128 0.122 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 9.23e-01 -0.012 0.124 0.122 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 2.10e-01 0.145 0.115 0.122 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.51e-01 0.0779 0.103 0.122 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 2.73e-01 -0.126 0.115 0.122 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.05e-01 0.122 0.0964 0.122 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 2.25e-01 -0.137 0.112 0.122 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 7.50e-03 0.232 0.0861 0.122 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 1.57e-01 -0.127 0.0893 0.122 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.12e-01 0.0544 0.107 0.122 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0385 0.0726 0.122 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0985 0.107 0.122 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 4.09e-01 0.079 0.0954 0.122 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 8.34e-02 0.119 0.0682 0.122 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.74e-01 -0.082 0.114 0.122 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 6.90e-01 0.0431 0.108 0.122 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.38e-01 0.0703 0.0904 0.122 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 2.05e-01 0.136 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0203 0.0883 0.122 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 5.22e-01 0.0644 0.1 0.122 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.47e-01 0.107 0.0737 0.122 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.20e-01 -0.102 0.126 0.122 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 2.16e-02 -0.245 0.106 0.122 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0175 0.0981 0.122 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 1.48e-01 -0.177 0.122 0.122 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.88e-02 0.232 0.0981 0.122 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.10e-01 0.0922 0.112 0.122 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.40e-01 0.0481 0.0621 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0118 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 6.92e-02 -0.222 0.122 0.12 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.12 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.03e-01 0.075 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 4.93e-02 -0.215 0.109 0.12 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 9.59e-01 0.006 0.116 0.12 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 9.46e-01 0.00982 0.144 0.12 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0874 0.101 0.12 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0195 0.127 0.12 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.97e-01 0.0847 0.125 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 6.47e-01 0.0579 0.126 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0732 0.115 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 4.01e-01 -0.106 0.126 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 2.16e-01 0.16 0.129 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0185 0.106 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0563 0.118 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 8.18e-01 0.0267 0.116 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00878 0.0956 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.02e-01 0.212 0.129 0.123 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0136 0.132 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 2.81e-01 -0.136 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 1.48e-01 0.196 0.135 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0133 0.121 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.08e-01 -0.104 0.102 0.123 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.88e-01 0.103 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 1.37e-01 0.178 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0436 0.0965 0.123 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 2.34e-01 -0.146 0.122 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 2.56e-01 0.141 0.124 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 9.95e-01 0.000615 0.104 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0245 0.127 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 5.72e-01 -0.071 0.125 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.53e-01 0.0979 0.105 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0105 0.109 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 4.23e-01 0.0955 0.119 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0453 0.0694 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0593 0.137 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 7.77e-01 0.0355 0.125 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 9.91e-01 0.00136 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 9.21e-01 0.0137 0.139 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0543 0.127 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 8.51e-01 -0.022 0.117 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.92e-01 0.13 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0637 0.104 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0129 0.102 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 2.21e-02 -0.297 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 2.30e-01 0.163 0.136 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 3.38e-01 0.131 0.136 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00337 0.108 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.03e-01 0.198 0.121 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0764 0.124 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.11e-01 0.0922 0.112 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00635 0.0977 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0866 0.0844 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 9.67e-01 0.00425 0.103 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00181 0.119 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 4.75e-01 0.0579 0.0809 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.17e-02 0.2 0.0865 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.44e-01 0.11 0.0749 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.78e-01 -0.14 0.103 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0973 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0565 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 7.44e-01 0.0431 0.132 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 7.14e-02 0.174 0.0962 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 1.34e-02 0.254 0.102 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.69e-01 0.122 0.0887 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.40e-01 -0.103 0.133 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.26e-01 -0.026 0.118 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.84e-01 0.0507 0.124 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 3.54e-01 -0.116 0.125 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.91e-01 0.0573 0.107 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.87e-01 0.104 0.12 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.10e-01 0.173 0.108 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.69e-02 -0.281 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 3.08e-02 -0.224 0.103 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.45e-01 0.0231 0.118 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 1.69e-01 0.18 0.13 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 4.10e-01 -0.103 0.125 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 2.36e-01 -0.126 0.106 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.14e-02 -0.239 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 7.39e-01 0.0309 0.0926 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 3.52e-01 -0.111 0.119 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 2.28e-01 -0.112 0.0929 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.70e-01 0.0177 0.108 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0626 0.12 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 2.96e-01 -0.113 0.108 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.76e-02 0.207 0.109 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 8.76e-01 0.0165 0.106 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 5.81e-01 0.0482 0.0874 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.83e-01 -0.171 0.128 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 8.95e-01 0.0131 0.0991 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0639 0.13 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0676 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 1.74e-01 0.16 0.117 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0923 0.124 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.99e-01 0.132 0.127 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0365 0.102 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.54e-01 -0.189 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 7.47e-01 0.0369 0.114 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.04e-01 -0.032 0.129 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 1.88e-01 0.179 0.135 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0726 0.113 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.19e-01 -0.2 0.127 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.60e-01 -0.121 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0334 0.113 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.53e-01 -0.058 0.129 0.123 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.16e-02 -0.274 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 2.24e-01 -0.152 0.125 0.123 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0693 0.121 0.123 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.64e-02 0.255 0.105 0.123 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 7.13e-01 0.0451 0.122 0.123 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0958 0.107 0.123 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0593 0.131 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 6.23e-01 -0.062 0.126 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 3.85e-01 -0.113 0.129 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 8.28e-02 0.235 0.135 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 4.87e-01 0.0774 0.111 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 9.89e-01 0.00158 0.113 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 3.80e-01 0.0949 0.108 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 5.69e-01 0.0726 0.127 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 3.07e-01 0.113 0.111 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 3.13e-01 0.116 0.115 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0152 0.117 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 2.31e-01 -0.123 0.102 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.33e-01 0.0931 0.119 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.56e-01 0.0942 0.0826 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 7.47e-01 0.0451 0.14 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 8.56e-01 0.0226 0.124 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0795 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 2.94e-01 0.144 0.137 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 9.49e-01 0.00722 0.112 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.65e-01 0.144 0.128 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00434 0.116 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 2.03e-01 -0.149 0.117 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0303 0.12 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0917 0.119 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 9.66e-01 0.00526 0.123 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0343 0.107 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.26e-01 0.12 0.122 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 5.72e-02 0.162 0.0846 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0376 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.77e-01 -0.19 0.14 0.107 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0505 0.157 0.107 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 3.46e-01 0.14 0.148 0.107 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 7.38e-01 0.0469 0.14 0.107 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0492 0.145 0.107 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 7.93e-01 0.0396 0.151 0.107 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 1.61e-01 0.175 0.124 0.107 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 7.31e-01 0.0303 0.0879 0.107 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.30e-01 -0.059 0.122 0.122 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.30e-01 -0.165 0.109 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.15e-01 0.0858 0.105 0.122 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0399 0.127 0.122 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 2.27e-01 0.15 0.124 0.122 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0324 0.123 0.122 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.09e-01 0.0634 0.0767 0.122 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.61e-01 0.0551 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 3.52e-01 -0.11 0.118 0.122 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 5.39e-01 -0.077 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 3.12e-01 -0.113 0.112 0.122 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.57e-02 -0.22 0.115 0.122 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.10e-01 0.126 0.123 0.122 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.37e-01 0.141 0.0943 0.122 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 2.20e-01 -0.155 0.126 0.122 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0817 0.136 0.122 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.44e-01 -0.106 0.139 0.122 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0578 0.134 0.122 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.23e-01 0.118 0.119 0.122 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0526 0.112 0.122 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 2.14e-01 -0.16 0.128 0.122 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.64e-01 0.122 0.109 0.122 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 5.73e-01 0.0709 0.125 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.38e-02 0.242 0.0973 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0858 0.108 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0787 0.114 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0224 0.087 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.12e-01 -0.148 0.118 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 2.29e-01 0.122 0.101 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.87e-01 0.0765 0.0717 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.19e-01 -0.198 0.126 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.96e-01 0.144 0.111 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0151 0.123 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0639 0.121 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.88e-01 -0.119 0.0902 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 7.32e-01 -0.044 0.128 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 6.21e-01 -0.058 0.117 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.67e-02 0.199 0.0823 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.48e-01 -0.115 0.151 0.127 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 2.92e-01 -0.122 0.115 0.127 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 8.77e-01 0.0222 0.144 0.127 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 4.72e-01 -0.111 0.153 0.127 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 6.80e-01 0.0603 0.146 0.127 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 1.83e-03 0.437 0.138 0.127 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 5.60e-02 0.235 0.122 0.127 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0692 0.138 0.12 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 1.41e-01 0.197 0.133 0.12 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0958 0.14 0.12 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 1.98e-01 0.169 0.131 0.12 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.73e-01 -0.101 0.113 0.12 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.27e-01 0.108 0.136 0.12 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 3.94e-01 -0.104 0.122 0.12 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 2.26e-01 0.106 0.0869 0.12 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 7.30e-01 0.0424 0.123 0.127 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 2.28e-01 0.143 0.118 0.127 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 9.34e-01 0.0106 0.129 0.127 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 4.07e-02 0.261 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 1.85e-01 0.108 0.0812 0.127 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.52e-01 -0.119 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0379 0.121 0.127 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00753 0.108 0.127 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 3.21e-01 0.136 0.136 0.124 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00339 0.133 0.124 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0933 0.139 0.124 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 5.16e-01 0.0897 0.138 0.124 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0809 0.133 0.124 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.96e-01 0.149 0.142 0.124 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00647 0.12 0.124 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.79e-01 0.159 0.118 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 9.46e-02 0.21 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0367 0.133 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0628 0.117 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 8.39e-01 0.0273 0.134 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 7.88e-01 0.0335 0.124 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0763 0.08 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 8.28e-01 0.0244 0.112 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 2.95e-01 0.117 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0142 0.0769 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 1.28e-01 -0.178 0.116 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 7.72e-01 0.0345 0.119 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 6.92e-01 0.0387 0.0977 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0564 0.127 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -856510 sc-eQTL 3.23e-01 -0.111 0.113 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.74e-01 0.0857 0.0962 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 4.98e-01 0.068 0.1 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 7.18e-01 0.0448 0.124 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0466 0.0684 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0838 0.115 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 9.50e-03 0.234 0.0895 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0868 0.098 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 7.94e-01 -0.028 0.107 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 3.27e-01 -0.079 0.0805 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 3.87e-01 -0.095 0.11 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 4.21e-01 0.0799 0.0991 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 5.97e-02 0.128 0.0676 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00506 0.13 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 4.43e-02 0.242 0.12 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 1.91e-01 -0.156 0.119 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 2.06e-02 0.308 0.132 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 9.92e-01 0.000817 0.077 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 7.74e-01 0.0368 0.128 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -522516 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0579 0.109 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 4.04e-01 0.0728 0.087 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -522780 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0355 0.118 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 44409 sc-eQTL 4.63e-01 0.081 0.11 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -778554 sc-eQTL 2.85e-01 0.101 0.0941 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -378662 sc-eQTL 4.34e-01 0.0837 0.107 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 546389 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0513 0.0937 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 234978 sc-eQTL 2.66e-01 0.117 0.105 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -308782 sc-eQTL 1.59e-01 0.109 0.0771 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173588 CEP83 234978 eQTL 0.000572 0.144 0.0416 0.0 0.0 0.0952

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina