logo

Genes within 1Mb (chr12:94692412:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 5.26e-01 0.0578 0.0911 0.192 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 5.03e-01 0.0719 0.107 0.192 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0402 0.0802 0.192 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.75e-01 0.029 0.101 0.192 B L1
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0409 0.0924 0.192 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 3.10e-01 0.0617 0.0606 0.192 B L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 1.89e-01 -0.101 0.0763 0.192 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0557 0.0926 0.192 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.26e-02 -0.0941 0.0437 0.192 B L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 9.73e-01 0.00254 0.075 0.192 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0846 0.0648 0.192 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0629 0.0724 0.192 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 1.40e-02 -0.242 0.0976 0.192 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0566 0.0636 0.192 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.67e-02 -0.118 0.0662 0.192 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0281 0.0699 0.192 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.35e-01 0.0427 0.0898 0.192 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.30e-03 -0.171 0.0592 0.192 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.42e-02 -0.148 0.0762 0.192 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0802 0.0977 0.192 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 1.74e-02 -0.207 0.0864 0.192 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 2.22e-01 0.102 0.0829 0.192 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 9.57e-01 0.00418 0.0777 0.192 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.22e-01 0.0227 0.0636 0.192 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 1.79e-01 -0.143 0.106 0.198 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0524 0.113 0.198 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.37e-01 0.166 0.111 0.198 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.23e-02 -0.194 0.107 0.198 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0164 0.101 0.198 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0131 0.0898 0.198 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 5.41e-01 0.0611 0.0999 0.198 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00853 0.0842 0.198 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.84e-03 0.263 0.098 0.192 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.81e-02 -0.16 0.0767 0.192 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 8.09e-01 0.0192 0.0794 0.192 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0176 0.0946 0.192 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.09e-01 0.0156 0.0643 0.192 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.11e-01 0.0353 0.0949 0.192 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 6.49e-01 0.0385 0.0845 0.192 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.47e-01 0.0196 0.0608 0.192 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 4.40e-01 0.0772 0.0999 0.193 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.47e-03 -0.266 0.0925 0.193 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0524 0.079 0.193 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0587 0.0936 0.193 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0348 0.0772 0.193 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 9.53e-04 -0.287 0.0855 0.193 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0471 0.0647 0.193 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0022 0.112 0.192 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 1.61e-01 -0.133 0.0948 0.192 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.00e-01 0.143 0.0864 0.192 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0318 0.108 0.192 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 9.05e-01 0.0105 0.0881 0.192 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 1.39e-01 -0.146 0.0986 0.192 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 9.22e-02 -0.0927 0.0548 0.192 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0525 0.127 0.181 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 9.48e-01 0.00703 0.108 0.181 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 4.53e-01 0.0992 0.132 0.181 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 9.83e-01 0.00277 0.127 0.181 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 8.66e-04 0.318 0.0937 0.181 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 4.06e-01 0.085 0.102 0.181 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 3.95e-01 -0.108 0.127 0.181 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 8.78e-01 0.0137 0.0896 0.181 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.03e-01 -0.115 0.112 0.181 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 8.96e-01 0.0144 0.11 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.30e-01 0.088 0.111 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 7.60e-01 -0.031 0.102 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 6.29e-01 0.0538 0.111 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 8.26e-01 0.0251 0.114 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0994 0.0935 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.63e-02 -0.23 0.103 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 1.45e-01 -0.149 0.101 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0769 0.0842 0.193 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.192 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 9.18e-01 0.0122 0.118 0.192 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00655 0.113 0.192 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 9.33e-01 0.0102 0.121 0.192 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 5.72e-02 -0.204 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 3.22e-01 0.0903 0.091 0.192 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.00e-01 -0.041 0.106 0.192 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 6.67e-01 0.0462 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 1.14e-01 -0.136 0.0858 0.192 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 5.90e-01 0.0583 0.108 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.11e-01 0.09 0.109 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 7.54e-01 0.0289 0.092 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0787 0.112 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 3.47e-01 -0.104 0.11 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.86e-01 0.123 0.0926 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0369 0.096 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 6.41e-01 0.0492 0.105 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.44e-01 -0.047 0.0612 0.192 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 3.95e-01 0.0996 0.117 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0439 0.107 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 3.25e-01 -0.107 0.108 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.45e-01 0.0385 0.118 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0758 0.108 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 4.76e-01 0.0713 0.1 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 9.43e-01 0.00761 0.106 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 6.77e-01 0.037 0.0886 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.92e-01 -0.023 0.0871 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 1.73e-01 0.159 0.116 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0311 0.122 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 3.17e-01 -0.122 0.122 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 2.16e-01 -0.12 0.0966 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 3.94e-01 0.0929 0.109 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 4.40e-01 0.086 0.111 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0548 0.1 0.191 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 4.97e-01 0.0582 0.0855 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0422 0.0741 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 2.09e-01 -0.114 0.0902 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 2.30e-03 -0.315 0.102 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.67e-01 -0.098 0.0707 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.25e-02 -0.148 0.0761 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0246 0.0659 0.192 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0182 0.0909 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.02e-01 -0.139 0.0846 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0116 0.0991 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0141 0.115 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00651 0.0848 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0662 0.0903 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00968 0.0779 0.192 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0395 0.118 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 9.98e-01 0.000266 0.104 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 2.45e-01 0.127 0.109 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 5.39e-01 0.0677 0.11 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.56e-01 0.133 0.0937 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.16e-01 -0.131 0.105 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0681 0.0954 0.192 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 2.31e-01 0.122 0.102 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.77e-02 -0.178 0.0893 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 2.43e-01 -0.119 0.102 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 2.72e-01 -0.124 0.113 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 1.51e-02 -0.262 0.107 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.50e-01 0.133 0.092 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 8.51e-01 0.015 0.0801 0.192 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.68e-01 0.0448 0.104 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0195 0.0815 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0706 0.0943 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0796 0.105 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0991 0.0943 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 5.11e-01 0.063 0.0956 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00523 0.0923 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.05e-01 0.0289 0.0764 0.192 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0619 0.121 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 1.97e-01 -0.12 0.0926 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 3.17e-02 0.262 0.121 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0971 0.123 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0421 0.11 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0744 0.116 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0899 0.119 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 5.27e-01 -0.061 0.0961 0.183 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 5.07e-01 0.0767 0.115 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 2.68e-03 -0.295 0.0971 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0206 0.112 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.94e-01 0.0308 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0187 0.0979 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.46e-01 -0.162 0.111 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 6.52e-01 0.0519 0.115 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 9.12e-01 0.0109 0.0983 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0641 0.115 0.195 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.67e-02 -0.203 0.0966 0.195 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 2.91e-02 0.244 0.111 0.195 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 2.71e-01 0.12 0.108 0.195 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.38e-01 0.045 0.0956 0.195 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.34e-02 -0.211 0.109 0.195 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0157 0.0958 0.195 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.10e-01 0.0588 0.115 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0489 0.11 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 3.09e-01 0.115 0.113 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 9.71e-01 0.00434 0.119 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 2.83e-01 -0.105 0.0973 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 6.50e-04 -0.332 0.096 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.50e-01 0.0302 0.0946 0.193 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 2.34e-01 -0.133 0.112 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 6.80e-02 -0.178 0.0967 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0226 0.101 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0939 0.103 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0566 0.0904 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 1.89e-01 -0.137 0.104 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0497 0.0728 0.192 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 8.75e-02 0.211 0.123 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 9.48e-03 -0.283 0.108 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 8.24e-01 0.0258 0.116 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0386 0.122 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.21e-01 0.0493 0.0996 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.88e-01 0.062 0.114 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 8.22e-01 0.0232 0.103 0.194 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 8.08e-02 0.18 0.103 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 2.84e-03 -0.314 0.104 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 3.17e-01 -0.105 0.105 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 5.82e-01 0.0599 0.109 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.51e-02 0.162 0.0935 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.73e-02 -0.238 0.107 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0622 0.0753 0.192 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 1.41e-01 0.211 0.142 0.185 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.66e-01 0.117 0.129 0.185 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 4.56e-01 0.107 0.143 0.185 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0828 0.136 0.185 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 2.38e-01 0.152 0.128 0.185 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.51e-01 -0.025 0.133 0.185 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.55e-01 -0.157 0.137 0.185 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0311 0.115 0.185 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0534 0.0805 0.185 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.44e-01 0.0353 0.108 0.193 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0275 0.0961 0.193 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 8.27e-01 0.0203 0.0926 0.193 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 6.33e-01 0.0534 0.112 0.193 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0574 0.109 0.193 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.51e-01 0.0345 0.108 0.193 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0836 0.0674 0.193 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0457 0.111 0.192 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0401 0.105 0.192 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 6.27e-01 0.054 0.111 0.192 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 4.08e-01 0.0821 0.0991 0.192 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.44e-01 0.0202 0.102 0.192 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.56e-01 -0.124 0.109 0.192 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0269 0.0839 0.192 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0956 0.108 0.193 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 5.60e-01 0.0682 0.117 0.193 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 4.58e-03 0.334 0.116 0.193 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 1.73e-01 -0.156 0.114 0.193 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.72e-01 0.0165 0.102 0.193 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.29e-01 0.0603 0.0957 0.193 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 2.50e-01 0.127 0.11 0.193 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.13e-01 0.0767 0.0934 0.193 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 1.57e-01 0.156 0.11 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0813 0.0863 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.34e-01 0.142 0.0945 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00263 0.1 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0452 0.0763 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.38e-01 0.0348 0.104 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0271 0.0887 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 5.16e-01 0.041 0.0629 0.192 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 9.61e-02 0.188 0.112 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0572 0.0989 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0613 0.109 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 4.66e-01 0.0785 0.108 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 5.87e-01 0.0439 0.0807 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0635 0.114 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0485 0.104 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.87e-01 0.0517 0.0742 0.192 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 2.12e-01 0.172 0.138 0.203 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 8.14e-01 -0.025 0.106 0.203 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 1.20e-01 0.204 0.131 0.203 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0449 0.141 0.203 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.87e-01 0.054 0.134 0.203 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 5.35e-02 -0.251 0.129 0.203 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.03e-01 -0.117 0.113 0.203 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 5.92e-01 0.0643 0.12 0.191 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 5.29e-02 -0.224 0.115 0.191 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0477 0.122 0.191 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 8.11e-01 0.0272 0.114 0.191 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 9.68e-01 0.00387 0.098 0.191 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0308 0.118 0.191 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0241 0.106 0.191 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 1.90e-01 0.0991 0.0753 0.191 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 2.56e-01 0.127 0.112 0.192 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.00e-02 -0.233 0.107 0.192 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.117 0.192 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 8.78e-01 -0.018 0.117 0.192 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 4.94e-01 0.0509 0.0744 0.192 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 8.20e-01 0.0265 0.116 0.192 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 1.04e-01 0.18 0.11 0.192 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0123 0.0983 0.192 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0414 0.124 0.198 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0548 0.121 0.198 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.07e-01 -0.084 0.126 0.198 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0177 0.125 0.198 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 1.89e-01 -0.158 0.12 0.198 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 1.02e-02 -0.329 0.127 0.198 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 1.53e-01 -0.155 0.108 0.198 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0334 0.107 0.198 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 1.96e-01 -0.141 0.109 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 5.82e-01 0.0637 0.115 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0316 0.102 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 2.68e-01 0.13 0.117 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 8.10e-01 0.026 0.108 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.29e-01 0.0337 0.0698 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 1.38e-01 -0.144 0.097 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0527 0.0969 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 1.61e-02 -0.16 0.066 0.192 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 3.21e-01 0.102 0.103 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 4.03e-01 0.0875 0.104 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 9.19e-01 0.00871 0.086 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0368 0.112 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -859064 sc-eQTL 3.09e-01 -0.101 0.0991 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 3.12e-01 0.0859 0.0847 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0259 0.0884 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 7.39e-01 0.0365 0.109 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0567 0.0602 0.192 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 2.10e-02 0.233 0.1 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0961 0.0801 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 6.39e-01 0.0407 0.0867 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 6.99e-01 0.0365 0.0943 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0174 0.0712 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00213 0.097 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00878 0.0876 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.03e-01 0.0504 0.0601 0.192 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.88e-02 0.201 0.114 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.46e-03 -0.309 0.104 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0602 0.105 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0614 0.118 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 6.91e-01 0.027 0.0679 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0237 0.113 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -525070 sc-eQTL 3.55e-01 0.0891 0.0962 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 4.27e-01 0.061 0.0767 0.192 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -525334 sc-eQTL 7.28e-01 0.0359 0.103 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 41855 sc-eQTL 3.03e-03 -0.283 0.0943 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -781108 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0684 0.0823 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -381216 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0917 0.0932 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 543835 sc-eQTL 8.37e-01 0.0169 0.0819 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 232424 sc-eQTL 2.78e-02 -0.202 0.0911 0.192 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -311336 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0617 0.0675 0.192 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 41855 eQTL 7.32e-08 -0.082 0.0151 0.0 0.0 0.247
ENSG00000173588 CEP83 232424 eQTL 0.0338 -0.062 0.0292 0.0 0.0 0.247
ENSG00000258357 AC023161.2 170543 eQTL 0.0201 -0.0865 0.0372 0.0 0.0 0.247

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 41855 5.6e-05 1.51e-05 2.48e-06 9.42e-06 2.35e-06 1.21e-05 1.61e-05 2.12e-06 1.17e-05 6.06e-06 1.6e-05 6.79e-06 2.41e-05 4.27e-06 3.95e-06 8.06e-06 6.8e-06 1.31e-05 2.97e-06 3.12e-06 6.26e-06 1.39e-05 1.22e-05 3.32e-06 2.26e-05 4.4e-06 7.14e-06 3.98e-06 1.35e-05 1.21e-05 7.97e-06 8.65e-07 1.27e-06 3.06e-06 6.33e-06 2.65e-06 1.87e-06 1.98e-06 2.14e-06 1.26e-06 9.87e-07 1.88e-05 2.52e-06 1.56e-07 7.72e-07 1.64e-06 1.98e-06 6.46e-07 5.77e-07
ENSG00000173588 CEP83 232424 5.14e-06 4.18e-06 3.22e-07 2.44e-06 4.67e-07 1.6e-06 2.13e-06 4.99e-07 1.91e-06 9.75e-07 2.52e-06 1.39e-06 4.86e-06 1.42e-06 9.17e-07 1.62e-06 1.56e-06 2.12e-06 6.74e-07 1.16e-06 9.48e-07 3.35e-06 2.59e-06 8.95e-07 4.32e-06 1.26e-06 1.36e-06 1.46e-06 1.95e-06 2.55e-06 1.8e-06 2.48e-07 3.21e-07 1.22e-06 1.88e-06 6.66e-07 7.88e-07 3.93e-07 1.09e-06 3.46e-07 3.03e-07 4.11e-06 6.18e-07 1.99e-07 2.16e-07 3.47e-07 6.93e-07 1.97e-07 2.4e-07
ENSG00000236349 \N 144171 1.2e-05 8.15e-06 7.29e-07 3.95e-06 1.62e-06 4.34e-06 7.3e-06 9.96e-07 5.06e-06 2.8e-06 6.97e-06 2.86e-06 9.94e-06 1.91e-06 1.06e-06 3.81e-06 2.16e-06 3.84e-06 1.48e-06 1.19e-06 2.9e-06 6.58e-06 4.77e-06 1.69e-06 8.86e-06 1.74e-06 2.29e-06 1.71e-06 4.66e-06 6.2e-06 2.74e-06 5.26e-07 7.35e-07 1.47e-06 2.38e-06 9.43e-07 9.24e-07 4.7e-07 8.29e-07 6.22e-07 2.22e-07 7.97e-06 6.91e-07 1.93e-07 2.97e-07 7.09e-07 1.09e-06 2.32e-07 1.53e-07