logo

Genes within 1Mb (chr12:94690691:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 4.15e-01 0.0646 0.0791 0.274 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 3.40e-01 0.0889 0.0929 0.274 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0538 0.0697 0.274 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.35e-01 0.0849 0.0879 0.274 B L1
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0835 0.0802 0.274 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 7.27e-01 0.0184 0.0528 0.274 B L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0793 0.0664 0.274 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00453 0.0806 0.274 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.03e-02 -0.098 0.0378 0.274 B L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0104 0.065 0.274 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 1.72e-01 -0.077 0.0562 0.274 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0588 0.0627 0.274 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.22e-02 -0.214 0.0846 0.274 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.47e-01 -0.052 0.0551 0.274 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00934 0.0578 0.274 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 5.20e-01 -0.039 0.0606 0.274 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.82e-01 -0.032 0.078 0.274 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.08e-04 -0.2 0.0506 0.274 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.80e-02 -0.132 0.0661 0.274 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 2.36e-02 -0.191 0.0839 0.274 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.30e-03 -0.242 0.0742 0.274 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0451 0.0722 0.274 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 5.61e-01 0.0393 0.0674 0.274 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0114 0.0552 0.274 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0545 0.0925 0.282 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0481 0.0981 0.282 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 3.51e-01 0.0906 0.097 0.282 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 9.08e-02 -0.159 0.0935 0.282 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.18e-01 0.0203 0.0878 0.282 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 2.87e-01 0.0833 0.078 0.282 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00167 0.0871 0.282 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 7.04e-01 0.0279 0.0733 0.282 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.17e-02 0.149 0.0852 0.274 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00163 0.0667 0.274 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0176 0.0683 0.274 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0299 0.0814 0.274 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00427 0.0553 0.274 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0237 0.0817 0.274 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.51e-01 0.00449 0.0728 0.274 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 8.11e-01 0.0125 0.0523 0.274 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.07e-01 0.0443 0.0862 0.275 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.23e-02 -0.185 0.0803 0.275 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 9.18e-01 0.00703 0.0682 0.275 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0317 0.0808 0.275 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0576 0.0665 0.275 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 7.52e-03 -0.201 0.0744 0.275 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0332 0.0558 0.275 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0422 0.096 0.274 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 4.33e-03 -0.231 0.0802 0.274 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 5.85e-01 0.0408 0.0746 0.274 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00144 0.0932 0.274 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 1.68e-01 0.104 0.0753 0.274 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0849 0.0849 0.274 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0724 0.0471 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 4.92e-01 -0.073 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.38e-01 -0.107 0.0902 0.265 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 1.55e-01 0.157 0.11 0.265 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 6.21e-01 0.0526 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 4.52e-02 0.161 0.08 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.55e-01 0.0791 0.0853 0.265 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 4.09e-01 -0.088 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0725 0.0748 0.265 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0935 0.265 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0123 0.0949 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 7.77e-01 0.0272 0.096 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0491 0.0875 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 6.40e-01 0.045 0.096 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 8.25e-01 0.0218 0.0983 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 2.06e-01 -0.102 0.0805 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.45e-02 -0.188 0.0886 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 1.23e-01 -0.135 0.0874 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0907 0.0724 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.33e-01 0.0213 0.101 0.274 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.102 0.274 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0871 0.0978 0.274 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.105 0.274 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 2.25e-01 -0.114 0.0935 0.274 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00742 0.0793 0.274 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 8.07e-01 0.0226 0.0925 0.274 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 3.38e-01 0.0894 0.0932 0.274 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.46e-01 -0.109 0.0747 0.274 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.31e-01 -0.02 0.0934 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.41e-02 0.23 0.0931 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.90e-01 0.011 0.0794 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.0969 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 4.02e-02 -0.195 0.0946 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 4.46e-01 0.0612 0.0801 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0566 0.0828 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00263 0.0908 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0657 0.0527 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 1.40e-01 0.151 0.102 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 5.17e-01 0.0606 0.0935 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0984 0.0944 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 6.38e-01 0.0488 0.103 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0949 0.0944 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 4.00e-01 0.0737 0.0874 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 5.59e-01 0.054 0.0923 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 8.25e-01 0.0172 0.0775 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0589 0.076 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 2.94e-01 -0.109 0.104 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 5.59e-01 0.0634 0.108 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 9.71e-01 0.00393 0.109 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.10e-01 -0.138 0.0858 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 6.53e-01 0.0447 0.0992 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0897 0.0891 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 4.53e-01 0.0553 0.0735 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0809 0.0635 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 1.40e-01 -0.115 0.0774 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 6.72e-03 -0.241 0.0881 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 2.87e-01 -0.065 0.0609 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0612 0.0659 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0356 0.0566 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0314 0.0784 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 1.72e-01 -0.1 0.0732 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0636 0.0855 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0996 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 5.14e-01 0.0478 0.0732 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.73e-01 0.0696 0.0779 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0205 0.0673 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000167 0.101 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0133 0.0896 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 2.67e-01 0.105 0.0939 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 7.68e-01 -0.028 0.0947 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 5.71e-01 0.0459 0.0808 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0219 0.0908 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0524 0.082 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.71e-01 0.0378 0.0888 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.79e-03 -0.242 0.0765 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0706 0.0887 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0715 0.0982 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.13e-03 -0.303 0.0919 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00169 0.0803 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 8.73e-01 0.0142 0.0885 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0105 0.0696 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 7.48e-01 -0.029 0.0902 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0801 0.0702 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 2.18e-01 -0.1 0.0813 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 4.25e-02 -0.183 0.0897 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.10e-01 -0.13 0.0813 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.07e-01 0.0845 0.0825 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 4.32e-01 0.0627 0.0797 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0101 0.0661 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 1.05e-01 -0.164 0.101 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.68e-02 -0.186 0.077 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.52e-01 0.0774 0.103 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 4.14e-02 -0.21 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 7.84e-01 0.0254 0.0928 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 1.29e-01 -0.148 0.0973 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0356 0.1 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.34e-01 -0.121 0.0803 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.01e-01 0.0257 0.102 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 3.20e-03 -0.255 0.0856 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00977 0.0988 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 4.30e-01 0.082 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0307 0.0862 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 1.60e-02 -0.235 0.0968 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 6.63e-01 0.0442 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0337 0.0865 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.46e-01 -0.06 0.0992 0.277 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 9.04e-04 -0.276 0.0818 0.277 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.45e-01 0.0737 0.0964 0.277 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 5.41e-01 0.0572 0.0935 0.277 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 2.66e-02 0.182 0.0814 0.277 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 9.92e-02 -0.155 0.0937 0.277 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.54e-01 -0.117 0.082 0.277 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.36e-01 0.0627 0.101 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0965 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.52e-01 0.0185 0.0995 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.99e-01 0.0882 0.104 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0481 0.0856 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.76e-03 -0.249 0.0849 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 8.22e-01 0.0187 0.0831 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0554 0.0967 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.14e-01 -0.105 0.084 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 3.16e-01 0.0875 0.0871 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0878 0.0888 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 1.37e-01 -0.116 0.0778 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0834 0.0902 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0512 0.0629 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 2.86e-02 0.237 0.108 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.85e-02 -0.226 0.0951 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0285 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.80e-01 0.0161 0.107 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 6.78e-01 0.0363 0.0874 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 1.60e-01 0.141 0.0999 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0406 0.0903 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.22e-01 0.0569 0.0887 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.14e-02 -0.229 0.0897 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.54e-02 -0.155 0.0895 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0305 0.0933 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.09e-01 0.082 0.0805 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 1.72e-01 -0.127 0.0923 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00507 0.0647 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 1.89e-01 0.159 0.12 0.259 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 8.32e-01 0.0232 0.109 0.259 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.74e-01 0.0348 0.121 0.259 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0705 0.115 0.259 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 1.73e-01 0.147 0.107 0.259 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0239 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.259 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 7.60e-01 0.0296 0.0967 0.259 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0749 0.0676 0.259 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00665 0.0942 0.276 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0682 0.0838 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.45e-01 0.0264 0.0808 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0973 0.276 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0231 0.0954 0.276 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0945 0.276 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0451 0.059 0.276 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.59e-01 0.0426 0.0962 0.274 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0316 0.0908 0.274 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0204 0.0961 0.274 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 5.76e-01 0.0481 0.086 0.274 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0261 0.0886 0.274 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0398 0.0948 0.274 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0221 0.0727 0.274 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0782 0.0948 0.276 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0103 0.102 0.276 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 2.92e-02 0.226 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 2.05e-01 -0.127 0.0998 0.276 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 9.44e-01 0.00631 0.0894 0.276 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 5.73e-01 0.0473 0.0837 0.276 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 5.57e-01 0.0566 0.0962 0.276 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 3.51e-01 0.0763 0.0817 0.276 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 9.71e-02 0.157 0.094 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.23e-01 0.0906 0.0741 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 2.90e-01 0.0865 0.0815 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0497 0.086 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0658 0.0655 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 9.32e-01 0.00761 0.0894 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 8.53e-01 0.0142 0.0763 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 5.21e-01 0.0348 0.0541 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 7.68e-01 0.0286 0.0969 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 8.05e-01 0.021 0.0849 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0561 0.0936 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 9.81e-01 0.00224 0.0923 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.19e-01 0.0158 0.0692 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 1.91e-01 -0.128 0.0974 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 2.02e-01 -0.114 0.0892 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.10e-01 0.0526 0.0636 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 2.31e-01 0.148 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 3.61e-02 -0.197 0.093 0.279 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 3.69e-01 0.105 0.117 0.279 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0166 0.125 0.279 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.10e-01 0.0287 0.119 0.279 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 6.21e-01 0.0575 0.116 0.279 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 7.64e-01 0.0304 0.101 0.279 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.273 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0469 0.102 0.273 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.107 0.273 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 5.00e-01 0.0674 0.0996 0.273 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0112 0.0859 0.273 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 8.85e-01 0.015 0.103 0.273 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.66e-02 -0.154 0.0922 0.273 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.06e-01 0.0551 0.0662 0.273 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 3.42e-01 0.0905 0.0951 0.278 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 1.98e-01 -0.118 0.0916 0.278 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 3.04e-01 -0.103 0.0998 0.278 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 7.06e-01 0.0376 0.0994 0.278 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 2.28e-01 0.0763 0.0631 0.278 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0797 0.0989 0.278 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 3.51e-01 0.0878 0.0939 0.278 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0637 0.0835 0.278 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.28e-01 0.0658 0.104 0.28 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 8.98e-01 0.013 0.101 0.28 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0678 0.106 0.28 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0361 0.105 0.28 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0764 0.101 0.28 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 2.65e-01 -0.121 0.108 0.28 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0792 0.091 0.28 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 6.42e-01 0.0418 0.0899 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0485 0.0951 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.1 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0336 0.0886 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 3.60e-01 0.0931 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 9.13e-01 0.0103 0.0942 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 7.54e-01 -0.019 0.0607 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 2.07e-01 -0.107 0.0845 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0273 0.0843 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.44e-02 -0.142 0.0574 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 5.23e-01 0.0571 0.0892 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 3.83e-02 0.187 0.0896 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 8.53e-01 0.0138 0.0745 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.12e-01 0.0231 0.0969 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -860785 sc-eQTL 2.35e-02 -0.194 0.085 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.89e-01 0.0634 0.0734 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00642 0.0766 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0118 0.0945 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0799 0.0519 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 9.92e-02 0.144 0.0867 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 4.65e-01 0.0505 0.0691 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 9.07e-01 0.00876 0.0747 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00624 0.0812 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0517 0.0612 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0436 0.0835 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00646 0.0755 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.04e-01 0.0432 0.0517 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 2.57e-01 0.112 0.0987 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.12e-01 -0.114 0.0915 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0716 0.0906 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 8.75e-01 0.016 0.102 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 6.27e-01 0.0285 0.0585 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0329 0.0973 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -526791 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0393 0.0831 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 7.62e-01 0.0201 0.0662 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -527055 sc-eQTL 7.54e-01 0.0279 0.089 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 40134 sc-eQTL 2.55e-02 -0.185 0.0821 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -782829 sc-eQTL 7.77e-01 0.0201 0.0711 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -382937 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0916 0.0803 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 542114 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0435 0.0706 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 230703 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0791 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -313057 sc-eQTL 4.94e-01 -0.04 0.0583 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 40134 eQTL 7.05e-05 -0.0552 0.0138 0.0 0.0 0.318

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 40134 4.04e-05 2.73e-05 4.84e-06 1.4e-05 4.91e-06 1.34e-05 3.63e-05 3.73e-06 2.44e-05 1.23e-05 3.08e-05 1.31e-05 3.98e-05 1.02e-05 6.04e-06 1.54e-05 1.33e-05 2.16e-05 6.6e-06 5.32e-06 1.16e-05 2.79e-05 2.59e-05 7.36e-06 3.68e-05 6.16e-06 1.15e-05 9.46e-06 2.59e-05 2.13e-05 1.59e-05 1.61e-06 2.22e-06 5.98e-06 1.01e-05 4.59e-06 2.72e-06 2.99e-06 3.64e-06 2.9e-06 1.67e-06 3.29e-05 2.95e-06 2.62e-07 2.11e-06 3.2e-06 3.75e-06 1.5e-06 1.37e-06
ENSG00000136014 \N -860785 2.8e-07 1.3e-07 4.47e-08 2.2e-07 9.24e-08 8.21e-08 1.6e-07 5.2e-08 1.45e-07 6.08e-08 1.59e-07 8.68e-08 2.13e-07 6.56e-08 6.18e-08 7.17e-08 3.9e-08 1.33e-07 6.92e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.44e-07 3.79e-08 1.4e-07 1.19e-07 1.07e-07 1.01e-07 1.08e-07 1e-07 1.14e-07 3.65e-08 3.51e-08 8.23e-08 7.36e-08 3.22e-08 4.84e-08 9.22e-08 6.71e-08 3.67e-08 5.14e-08 1.46e-07 4.04e-08 1.34e-08 5.19e-08 1.87e-08 1.19e-07 3.81e-09 5e-08
ENSG00000173588 \N 230703 4.83e-06 4.57e-06 7.62e-07 3.48e-06 1.57e-06 1.64e-06 3e-06 8.04e-07 3.56e-06 1.97e-06 4.2e-06 1.66e-06 7.25e-06 1.2e-06 1.14e-06 2.42e-06 1.55e-06 2.83e-06 1.41e-06 9.87e-07 2.98e-06 4.47e-06 3.54e-06 1.77e-06 4.66e-06 1.29e-06 1.88e-06 1.44e-06 3.06e-06 3.8e-06 1.94e-06 5.93e-07 7.93e-07 1.76e-06 2.07e-06 9.6e-07 9.54e-07 4.74e-07 1.32e-06 4.73e-07 1.96e-07 4.84e-06 5.42e-07 2.07e-07 4.19e-07 7.78e-07 8.68e-07 1.82e-07 3.24e-07
ENSG00000236349 \N 142450 1.24e-05 9.55e-06 1.36e-06 6.07e-06 2.58e-06 4.65e-06 1.01e-05 1.43e-06 7.72e-06 5.06e-06 1.08e-05 4.5e-06 1.44e-05 3.47e-06 2.39e-06 6.37e-06 3.67e-06 5.6e-06 2.69e-06 2.65e-06 4.98e-06 9.54e-06 6.85e-06 2.84e-06 1.24e-05 2.14e-06 4.85e-06 3e-06 7.08e-06 7.79e-06 4.77e-06 5.42e-07 1.14e-06 2.77e-06 4.34e-06 2.22e-06 1.65e-06 1.57e-06 1.38e-06 1e-06 7.46e-07 1.16e-05 1.29e-06 1.58e-07 7.16e-07 1.64e-06 1.06e-06 6.58e-07 4.78e-07