logo

Genes within 1Mb (chr12:94689500:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 4.15e-01 0.0646 0.0791 0.274 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 3.40e-01 0.0889 0.0929 0.274 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0538 0.0697 0.274 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.35e-01 0.0849 0.0879 0.274 B L1
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0835 0.0802 0.274 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 7.27e-01 0.0184 0.0528 0.274 B L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0793 0.0664 0.274 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00453 0.0806 0.274 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.03e-02 -0.098 0.0378 0.274 B L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0104 0.065 0.274 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 1.72e-01 -0.077 0.0562 0.274 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0588 0.0627 0.274 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.22e-02 -0.214 0.0846 0.274 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.47e-01 -0.052 0.0551 0.274 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 8.72e-01 -0.00934 0.0578 0.274 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 5.20e-01 -0.039 0.0606 0.274 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.82e-01 -0.032 0.078 0.274 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.08e-04 -0.2 0.0506 0.274 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.80e-02 -0.132 0.0661 0.274 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 2.36e-02 -0.191 0.0839 0.274 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.30e-03 -0.242 0.0742 0.274 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0451 0.0722 0.274 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 5.61e-01 0.0393 0.0674 0.274 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0114 0.0552 0.274 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0545 0.0925 0.282 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0481 0.0981 0.282 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 3.51e-01 0.0906 0.097 0.282 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 9.08e-02 -0.159 0.0935 0.282 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.18e-01 0.0203 0.0878 0.282 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 2.87e-01 0.0833 0.078 0.282 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00167 0.0871 0.282 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 7.04e-01 0.0279 0.0733 0.282 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.17e-02 0.149 0.0852 0.274 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00163 0.0667 0.274 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0176 0.0683 0.274 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0299 0.0814 0.274 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00427 0.0553 0.274 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0237 0.0817 0.274 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.51e-01 0.00449 0.0728 0.274 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 8.11e-01 0.0125 0.0523 0.274 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.07e-01 0.0443 0.0862 0.275 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.23e-02 -0.185 0.0803 0.275 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 9.18e-01 0.00703 0.0682 0.275 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0317 0.0808 0.275 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0576 0.0665 0.275 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 7.52e-03 -0.201 0.0744 0.275 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0332 0.0558 0.275 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0422 0.096 0.274 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 4.33e-03 -0.231 0.0802 0.274 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 5.85e-01 0.0408 0.0746 0.274 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00144 0.0932 0.274 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 1.68e-01 0.104 0.0753 0.274 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0849 0.0849 0.274 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0724 0.0471 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 4.92e-01 -0.073 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.38e-01 -0.107 0.0902 0.265 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 1.55e-01 0.157 0.11 0.265 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 6.21e-01 0.0526 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 4.52e-02 0.161 0.08 0.265 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.55e-01 0.0791 0.0853 0.265 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 4.09e-01 -0.088 0.106 0.265 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0725 0.0748 0.265 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 2.56e-01 -0.107 0.0935 0.265 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0123 0.0949 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 7.77e-01 0.0272 0.096 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0491 0.0875 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 6.40e-01 0.045 0.096 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 8.25e-01 0.0218 0.0983 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 2.06e-01 -0.102 0.0805 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.45e-02 -0.188 0.0886 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 1.23e-01 -0.135 0.0874 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0907 0.0724 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.33e-01 0.0213 0.101 0.274 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.102 0.274 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0871 0.0978 0.274 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.105 0.274 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 2.25e-01 -0.114 0.0935 0.274 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00742 0.0793 0.274 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 8.07e-01 0.0226 0.0925 0.274 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 3.38e-01 0.0894 0.0932 0.274 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.46e-01 -0.109 0.0747 0.274 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.31e-01 -0.02 0.0934 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.41e-02 0.23 0.0931 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.90e-01 0.011 0.0794 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.94e-01 -0.013 0.0969 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 4.02e-02 -0.195 0.0946 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 4.46e-01 0.0612 0.0801 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0566 0.0828 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00263 0.0908 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0657 0.0527 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 1.40e-01 0.151 0.102 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 5.17e-01 0.0606 0.0935 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0984 0.0944 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 6.38e-01 0.0488 0.103 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0949 0.0944 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 4.00e-01 0.0737 0.0874 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 5.59e-01 0.054 0.0923 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 8.25e-01 0.0172 0.0775 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0589 0.076 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 2.94e-01 -0.109 0.104 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 5.59e-01 0.0634 0.108 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 9.71e-01 0.00393 0.109 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.10e-01 -0.138 0.0858 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.24e-01 0.0957 0.0968 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 6.53e-01 0.0447 0.0992 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0897 0.0891 0.277 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 4.53e-01 0.0553 0.0735 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0809 0.0635 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 1.40e-01 -0.115 0.0774 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 6.72e-03 -0.241 0.0881 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 2.87e-01 -0.065 0.0609 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0612 0.0659 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0356 0.0566 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0314 0.0784 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 1.72e-01 -0.1 0.0732 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0636 0.0855 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 7.75e-01 0.0285 0.0996 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 5.14e-01 0.0478 0.0732 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.73e-01 0.0696 0.0779 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0205 0.0673 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000167 0.101 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0133 0.0896 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 2.67e-01 0.105 0.0939 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 7.68e-01 -0.028 0.0947 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 5.71e-01 0.0459 0.0808 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0219 0.0908 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0524 0.082 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.71e-01 0.0378 0.0888 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.79e-03 -0.242 0.0765 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0706 0.0887 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0715 0.0982 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.13e-03 -0.303 0.0919 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00169 0.0803 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 8.73e-01 0.0142 0.0885 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0105 0.0696 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 7.48e-01 -0.029 0.0902 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0801 0.0702 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 2.18e-01 -0.1 0.0813 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 4.25e-02 -0.183 0.0897 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.10e-01 -0.13 0.0813 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.07e-01 0.0845 0.0825 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 4.32e-01 0.0627 0.0797 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0101 0.0661 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 1.05e-01 -0.164 0.101 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.68e-02 -0.186 0.077 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.52e-01 0.0774 0.103 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 4.14e-02 -0.21 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 7.84e-01 0.0254 0.0928 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 1.29e-01 -0.148 0.0973 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0356 0.1 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.34e-01 -0.121 0.0803 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.01e-01 0.0257 0.102 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 3.20e-03 -0.255 0.0856 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00977 0.0988 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 4.30e-01 0.082 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0307 0.0862 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 1.60e-02 -0.235 0.0968 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 6.63e-01 0.0442 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0337 0.0865 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.46e-01 -0.06 0.0992 0.277 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 9.04e-04 -0.276 0.0818 0.277 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.45e-01 0.0737 0.0964 0.277 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 5.41e-01 0.0572 0.0935 0.277 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 2.66e-02 0.182 0.0814 0.277 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 9.92e-02 -0.155 0.0937 0.277 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.54e-01 -0.117 0.082 0.277 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.36e-01 0.0627 0.101 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0965 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.52e-01 0.0185 0.0995 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.99e-01 0.0882 0.104 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0481 0.0856 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.76e-03 -0.249 0.0849 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 8.22e-01 0.0187 0.0831 0.276 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0554 0.0967 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.14e-01 -0.105 0.084 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 3.16e-01 0.0875 0.0871 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0878 0.0888 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 1.37e-01 -0.116 0.0778 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0834 0.0902 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0512 0.0629 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 2.86e-02 0.237 0.108 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.85e-02 -0.226 0.0951 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0285 0.101 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.80e-01 0.0161 0.107 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 6.78e-01 0.0363 0.0874 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 1.60e-01 0.141 0.0999 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0406 0.0903 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.22e-01 0.0569 0.0887 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.14e-02 -0.229 0.0897 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.54e-02 -0.155 0.0895 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0305 0.0933 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.09e-01 0.082 0.0805 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 1.72e-01 -0.127 0.0923 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00507 0.0647 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 1.89e-01 0.159 0.12 0.259 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 8.32e-01 0.0232 0.109 0.259 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.74e-01 0.0348 0.121 0.259 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0705 0.115 0.259 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 1.73e-01 0.147 0.107 0.259 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0239 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.259 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 7.60e-01 0.0296 0.0967 0.259 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0749 0.0676 0.259 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00665 0.0942 0.276 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0682 0.0838 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.45e-01 0.0264 0.0808 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0973 0.276 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0231 0.0954 0.276 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00108 0.0945 0.276 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0451 0.059 0.276 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.59e-01 0.0426 0.0962 0.274 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0316 0.0908 0.274 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0204 0.0961 0.274 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 5.76e-01 0.0481 0.086 0.274 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0261 0.0886 0.274 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0398 0.0948 0.274 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0221 0.0727 0.274 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0782 0.0948 0.276 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0103 0.102 0.276 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 2.92e-02 0.226 0.103 0.276 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 2.05e-01 -0.127 0.0998 0.276 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 9.44e-01 0.00631 0.0894 0.276 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 5.73e-01 0.0473 0.0837 0.276 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 5.57e-01 0.0566 0.0962 0.276 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 3.51e-01 0.0763 0.0817 0.276 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 9.71e-02 0.157 0.094 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.23e-01 0.0906 0.0741 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 2.90e-01 0.0865 0.0815 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0497 0.086 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0658 0.0655 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 9.32e-01 0.00761 0.0894 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 8.53e-01 0.0142 0.0763 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 5.21e-01 0.0348 0.0541 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 7.68e-01 0.0286 0.0969 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 8.05e-01 0.021 0.0849 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0561 0.0936 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 9.81e-01 0.00224 0.0923 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.19e-01 0.0158 0.0692 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 1.91e-01 -0.128 0.0974 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 2.02e-01 -0.114 0.0892 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.10e-01 0.0526 0.0636 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 2.31e-01 0.148 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 3.61e-02 -0.197 0.093 0.279 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 3.69e-01 0.105 0.117 0.279 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0166 0.125 0.279 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.10e-01 0.0287 0.119 0.279 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 6.21e-01 0.0575 0.116 0.279 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 7.64e-01 0.0304 0.101 0.279 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 8.15e-01 0.0245 0.105 0.273 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0469 0.102 0.273 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.107 0.273 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 5.00e-01 0.0674 0.0996 0.273 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0112 0.0859 0.273 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 8.85e-01 0.015 0.103 0.273 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.66e-02 -0.154 0.0922 0.273 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.06e-01 0.0551 0.0662 0.273 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 3.42e-01 0.0905 0.0951 0.278 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 1.98e-01 -0.118 0.0916 0.278 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 3.04e-01 -0.103 0.0998 0.278 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 7.06e-01 0.0376 0.0994 0.278 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 2.28e-01 0.0763 0.0631 0.278 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0797 0.0989 0.278 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 3.51e-01 0.0878 0.0939 0.278 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0637 0.0835 0.278 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.28e-01 0.0658 0.104 0.28 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 8.98e-01 0.013 0.101 0.28 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0678 0.106 0.28 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0361 0.105 0.28 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0764 0.101 0.28 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 2.65e-01 -0.121 0.108 0.28 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0792 0.091 0.28 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 6.42e-01 0.0418 0.0899 0.28 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0485 0.0951 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.1 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0336 0.0886 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 3.60e-01 0.0931 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 9.13e-01 0.0103 0.0942 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 7.54e-01 -0.019 0.0607 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 2.07e-01 -0.107 0.0845 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0273 0.0843 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.44e-02 -0.142 0.0574 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 5.23e-01 0.0571 0.0892 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 3.83e-02 0.187 0.0896 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 8.53e-01 0.0138 0.0745 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.12e-01 0.0231 0.0969 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -861976 sc-eQTL 2.35e-02 -0.194 0.085 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.89e-01 0.0634 0.0734 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00642 0.0766 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0118 0.0945 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0799 0.0519 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 9.92e-02 0.144 0.0867 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 4.65e-01 0.0505 0.0691 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 9.07e-01 0.00876 0.0747 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00624 0.0812 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0517 0.0612 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0436 0.0835 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00646 0.0755 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.04e-01 0.0432 0.0517 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 2.57e-01 0.112 0.0987 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.12e-01 -0.114 0.0915 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0716 0.0906 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 8.75e-01 0.016 0.102 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 6.27e-01 0.0285 0.0585 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0329 0.0973 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -527982 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0393 0.0831 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 7.62e-01 0.0201 0.0662 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -528246 sc-eQTL 7.54e-01 0.0279 0.089 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 38943 sc-eQTL 2.55e-02 -0.185 0.0821 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -784020 sc-eQTL 7.77e-01 0.0201 0.0711 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -384128 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0916 0.0803 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 540923 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0435 0.0706 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 229512 sc-eQTL 1.60e-01 -0.112 0.0791 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -314248 sc-eQTL 4.94e-01 -0.04 0.0583 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -528246 eQTL 0.0123 -0.0383 0.0153 0.00202 0.0 0.302
ENSG00000057704 TMCC3 38943 eQTL 0.000613 -0.0483 0.0141 0.0 0.0 0.302

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028203 VEZT -528246 2.6e-07 1.1e-07 3.59e-08 1.84e-07 9.65e-08 9.32e-08 1.39e-07 5.21e-08 1.42e-07 4.24e-08 1.62e-07 7.58e-08 1.27e-07 6.38e-08 5.55e-08 8.01e-08 4.63e-08 1.07e-07 5.19e-08 4.03e-08 1.05e-07 1.33e-07 1.3e-07 4.67e-08 1.31e-07 1.13e-07 1.1e-07 8.71e-08 1.03e-07 1.1e-07 9.58e-08 3.96e-08 2.74e-08 8.82e-08 8.96e-08 3.97e-08 5.05e-08 9.55e-08 7.52e-08 3.77e-08 4.44e-08 1.37e-07 4.04e-08 3.36e-08 8.79e-08 1.68e-08 1.27e-07 3.83e-09 5.04e-08
ENSG00000057704 TMCC3 38943 9.82e-06 1.53e-05 2.48e-06 9.64e-06 2.43e-06 6.22e-06 1.61e-05 2.18e-06 1.17e-05 5.93e-06 1.57e-05 6.83e-06 2.07e-05 5.77e-06 3.67e-06 8.18e-06 6.37e-06 9.12e-06 3.62e-06 2.89e-06 6.39e-06 1.21e-05 1.12e-05 3.7e-06 2.57e-05 3.98e-06 7.57e-06 5.24e-06 1.42e-05 1.25e-05 8.36e-06 9.57e-07 1.18e-06 3.55e-06 6.62e-06 2.81e-06 1.91e-06 2.15e-06 2.18e-06 1.92e-06 9.75e-07 1.54e-05 1.61e-06 4.09e-07 1.05e-06 1.94e-06 1.93e-06 7.15e-07 4.56e-07
ENSG00000236349 \N 141259 1.3e-06 2.62e-06 2.75e-07 1.95e-06 3.47e-07 7.87e-07 1.38e-06 3.57e-07 1.72e-06 7.13e-07 1.99e-06 1.3e-06 2.64e-06 1.36e-06 3.86e-07 9.79e-07 1.15e-06 9.1e-07 5.55e-07 4.51e-07 8.02e-07 1.97e-06 1.35e-06 5.79e-07 3.53e-06 6.01e-07 1.05e-06 8.14e-07 1.62e-06 1.67e-06 7.71e-07 2.35e-07 1.94e-07 6.21e-07 1.65e-06 4.56e-07 6.87e-07 3.82e-07 4.73e-07 3.48e-07 2.96e-07 2.12e-06 1.24e-07 2.03e-07 3.1e-07 3.28e-07 2.47e-07 2.2e-07 2.44e-07