logo

Genes within 1Mb (chr12:94686136:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.43e-01 0.0377 0.0811 0.261 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 8.27e-01 0.0208 0.0954 0.261 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0378 0.0714 0.261 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 4.19e-01 0.0729 0.0901 0.261 B L1
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0459 0.0823 0.261 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 6.18e-01 0.027 0.054 0.261 B L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0634 0.0681 0.261 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00165 0.0825 0.261 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.38e-02 -0.0885 0.0389 0.261 B L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0196 0.0667 0.261 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0843 0.0577 0.261 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0774 0.0643 0.261 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.95e-02 -0.205 0.087 0.261 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0227 0.0567 0.261 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0342 0.0593 0.261 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0292 0.0622 0.261 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0172 0.08 0.261 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 4.08e-05 -0.217 0.0517 0.261 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 1.04e-01 -0.111 0.068 0.261 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 5.44e-02 -0.167 0.0863 0.261 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.62e-03 -0.243 0.0761 0.261 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 9.84e-01 -0.0015 0.0741 0.261 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.68e-01 0.00282 0.0692 0.261 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 9.85e-01 0.00104 0.0566 0.261 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0554 0.0945 0.268 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0859 0.1 0.268 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 3.24e-01 0.0978 0.099 0.268 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 7.43e-02 -0.171 0.0953 0.268 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 8.38e-01 0.0183 0.0897 0.268 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 2.97e-01 0.0833 0.0796 0.268 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 8.88e-01 0.0125 0.0889 0.268 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.60e-01 0.0132 0.0749 0.268 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.68e-02 0.16 0.0869 0.261 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0315 0.0681 0.261 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00405 0.0698 0.261 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0806 0.083 0.261 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00349 0.0565 0.261 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00595 0.0835 0.261 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 5.21e-01 0.0478 0.0742 0.261 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 7.66e-01 0.0159 0.0534 0.261 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 4.03e-01 0.0739 0.0881 0.262 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 8.94e-03 -0.216 0.0819 0.262 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0059 0.0699 0.262 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0323 0.0827 0.262 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0448 0.0681 0.262 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.79e-03 -0.205 0.0762 0.262 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 7.14e-01 -0.021 0.0572 0.262 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0441 0.0987 0.261 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.96e-04 -0.308 0.0814 0.261 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.35e-01 0.0476 0.0767 0.261 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0438 0.0958 0.261 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.60e-01 0.0876 0.0776 0.261 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0858 0.0873 0.261 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 1.62e-01 -0.068 0.0485 0.261 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0251 0.109 0.25 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0868 0.0929 0.25 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 2.35e-01 0.135 0.113 0.25 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.90e-01 0.0435 0.109 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.39e-02 0.203 0.0818 0.25 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.75e-01 0.096 0.0877 0.25 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0446 0.109 0.25 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 4.69e-01 -0.056 0.077 0.25 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0998 0.0962 0.25 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0377 0.0974 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 6.27e-01 0.048 0.0985 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.81e-01 -0.025 0.0899 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0986 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 9.21e-01 0.01 0.101 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 1.99e-01 -0.106 0.0826 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.90e-03 -0.242 0.0904 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 1.67e-01 -0.124 0.0898 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0396 0.0746 0.26 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0134 0.103 0.261 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0341 0.105 0.261 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0989 0.1 0.261 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 3.85e-01 0.0937 0.108 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.77e-01 -0.129 0.0956 0.261 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 7.92e-01 0.0214 0.0811 0.261 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 4.79e-01 0.067 0.0945 0.261 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 5.47e-01 0.0576 0.0954 0.261 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.36e-02 -0.133 0.0763 0.261 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 9.37e-01 0.00767 0.0963 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.39e-01 0.144 0.0968 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 9.53e-01 0.00484 0.0819 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0455 0.0998 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.77e-01 -0.133 0.0981 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.40e-01 0.0972 0.0824 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0432 0.0854 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 4.39e-01 0.0725 0.0935 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 3.22e-01 -0.054 0.0544 0.261 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 3.67e-01 0.0947 0.105 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 9.09e-01 0.0109 0.0959 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0701 0.0968 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.63e-01 0.0463 0.106 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 4.15e-01 -0.079 0.0968 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 4.21e-01 0.0722 0.0896 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 6.83e-01 0.0388 0.0946 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0148 0.0794 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0533 0.0779 0.26 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0965 0.104 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.05e-01 0.0414 0.109 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0793 0.11 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0947 0.0868 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 4.34e-01 0.0765 0.0976 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.65e-01 0.0299 0.0999 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0268 0.09 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.22e-01 0.0485 0.0756 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0928 0.0652 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0803 0.0797 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.09e-02 -0.233 0.0907 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0372 0.0626 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0869 0.0676 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0298 0.0582 0.261 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0501 0.0806 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0801 0.0754 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0908 0.0878 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 7.85e-01 0.0279 0.102 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.59e-01 0.085 0.0751 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 3.71e-01 0.0719 0.0801 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0312 0.0692 0.261 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0524 0.103 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 9.90e-01 0.0012 0.0917 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 2.75e-01 0.105 0.0961 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0221 0.0969 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.17e-01 0.102 0.0824 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0897 0.0927 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0416 0.0839 0.261 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 9.57e-01 0.00489 0.0907 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.71e-03 -0.248 0.0781 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0537 0.0907 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0558 0.1 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 2.45e-03 -0.289 0.0941 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 7.81e-01 0.0228 0.082 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0167 0.0904 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 9.99e-01 6.08e-05 0.0711 0.261 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 7.54e-01 -0.029 0.0925 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0997 0.0719 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0569 0.0836 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.14e-02 -0.173 0.0921 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 8.40e-02 -0.145 0.0833 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 1.63e-01 0.118 0.0844 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.25e-01 0.0289 0.0818 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00885 0.0678 0.261 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 2.44e-01 -0.121 0.104 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 5.83e-02 -0.151 0.0795 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 3.19e-01 0.105 0.105 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 5.67e-02 -0.202 0.105 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 9.43e-01 0.00686 0.0953 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.07e-01 -0.127 0.1 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.83e-01 0.0284 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0995 0.0827 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 9.65e-03 -0.228 0.0873 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0188 0.1 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.26e-01 0.0515 0.105 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 9.92e-01 0.000825 0.0875 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 5.79e-02 -0.188 0.0987 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 5.62e-01 0.0596 0.103 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 9.76e-01 0.0026 0.0878 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0688 0.101 0.264 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.80e-04 -0.317 0.0831 0.264 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 4.84e-01 0.0692 0.0986 0.264 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 4.68e-01 0.0695 0.0956 0.264 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 1.03e-01 0.137 0.0837 0.264 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 1.80e-01 -0.129 0.096 0.264 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 1.11e-01 -0.134 0.0838 0.264 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 3.89e-01 0.0901 0.104 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0977 0.0999 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 6.88e-01 0.0413 0.103 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.37e-01 0.0511 0.108 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.78e-01 -0.096 0.0883 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 4.69e-03 -0.251 0.0879 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00648 0.0859 0.262 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0618 0.0992 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.31e-01 -0.13 0.086 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.36e-01 0.0555 0.0895 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0984 0.091 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 1.36e-01 -0.119 0.0798 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0572 0.0926 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0347 0.0646 0.261 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 2.68e-02 0.241 0.108 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 3.85e-02 -0.2 0.0959 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 8.53e-01 0.019 0.102 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 8.39e-01 0.0218 0.107 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 8.33e-01 0.0186 0.0878 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0151 0.0907 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 1.81e-01 0.121 0.0905 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 4.64e-03 -0.262 0.0915 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 1.47e-01 -0.134 0.0918 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00949 0.0955 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 1.10e-01 0.132 0.0821 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.82e-02 -0.157 0.0943 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 9.81e-01 0.00158 0.0662 0.261 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 2.81e-01 0.134 0.124 0.244 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 7.62e-01 0.0341 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 8.10e-01 0.03 0.124 0.244 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0137 0.118 0.244 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.64e-01 0.155 0.11 0.244 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 6.09e-01 -0.059 0.115 0.244 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0875 0.119 0.244 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 7.72e-01 0.0288 0.0995 0.244 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0749 0.0696 0.244 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 8.47e-01 0.0188 0.0968 0.263 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 1.91e-01 -0.113 0.0859 0.263 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.74e-01 0.0468 0.0831 0.263 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 4.84e-01 0.0702 0.1 0.263 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00825 0.0981 0.263 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0365 0.0971 0.263 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.77e-01 -0.066 0.0605 0.263 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 9.27e-01 0.00908 0.0988 0.261 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0512 0.0932 0.261 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0142 0.0987 0.261 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 4.71e-01 0.0637 0.0882 0.261 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 6.93e-01 -0.036 0.0909 0.261 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 6.82e-01 -0.04 0.0973 0.261 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.63e-01 0.0129 0.0747 0.261 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0962 0.0972 0.261 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.261 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 2.01e-02 0.247 0.105 0.261 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.261 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 9.53e-01 0.00536 0.0917 0.261 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 2.82e-01 0.0925 0.0858 0.261 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 5.48e-01 0.0594 0.0987 0.261 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 3.79e-01 0.074 0.0839 0.261 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 1.49e-01 0.14 0.0965 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 4.52e-01 0.0573 0.0762 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 2.82e-01 0.09 0.0835 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0845 0.0881 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0641 0.0671 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 8.96e-01 0.012 0.0916 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 6.90e-01 0.0313 0.0782 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 5.44e-01 0.0338 0.0555 0.261 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.40e-01 0.0467 0.0996 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0126 0.0872 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0373 0.0963 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 9.26e-01 0.00878 0.0949 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 7.34e-01 0.0242 0.0711 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 5.38e-01 -0.062 0.101 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0664 0.092 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 4.14e-01 0.0535 0.0654 0.261 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.63e-01 0.0722 0.125 0.267 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 7.48e-02 -0.169 0.0944 0.267 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 4.10e-01 0.0977 0.118 0.267 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0292 0.127 0.267 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 8.43e-01 0.0238 0.12 0.267 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.26e-01 0.011 0.118 0.267 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.52e-01 0.0191 0.102 0.267 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 8.18e-01 0.0246 0.107 0.26 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0412 0.104 0.26 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0383 0.109 0.26 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 9.97e-01 -0.00041 0.102 0.26 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00649 0.0874 0.26 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0145 0.105 0.26 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 1.23e-01 -0.146 0.094 0.26 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 4.94e-01 0.0462 0.0674 0.26 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 2.29e-01 0.117 0.0968 0.265 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 2.31e-01 -0.112 0.0934 0.265 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 2.98e-01 -0.106 0.102 0.265 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 7.39e-01 0.0338 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 2.40e-01 0.0758 0.0644 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 2.57e-01 -0.114 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0957 0.265 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0789 0.0851 0.265 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 4.79e-01 0.0752 0.106 0.268 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0275 0.103 0.268 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0408 0.108 0.268 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0275 0.107 0.268 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0923 0.103 0.268 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 1.75e-01 -0.15 0.11 0.268 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0899 0.0929 0.268 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.46e-01 0.0179 0.0919 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0806 0.0972 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 9.60e-01 0.00518 0.103 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0258 0.0906 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 2.84e-01 0.112 0.104 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 9.98e-01 0.000206 0.0964 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 8.35e-01 -0.013 0.0621 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0944 0.0865 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0443 0.0862 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.97e-02 -0.129 0.0589 0.261 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 6.35e-01 0.0437 0.0919 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 2.66e-01 0.104 0.093 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 7.82e-01 0.0213 0.0767 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0236 0.0998 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -865340 sc-eQTL 1.04e-01 -0.144 0.088 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 3.33e-01 0.0733 0.0755 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.21e-01 0.00778 0.0789 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 8.11e-01 0.0234 0.0973 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0677 0.0536 0.261 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 1.21e-01 0.139 0.0891 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 8.63e-01 0.0122 0.071 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 8.28e-01 0.0167 0.0767 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0368 0.0834 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0459 0.0629 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00297 0.0858 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 6.82e-01 0.0318 0.0774 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 3.82e-01 0.0465 0.0531 0.261 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 1.56e-01 0.143 0.1 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0918 0.0934 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0803 0.0923 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0493 0.103 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 6.60e-01 0.0263 0.0597 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0817 0.099 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531346 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0203 0.0847 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 8.25e-01 0.0149 0.0675 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531610 sc-eQTL 5.41e-01 0.0557 0.0911 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35579 sc-eQTL 8.50e-03 -0.222 0.0837 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787384 sc-eQTL 9.90e-01 0.000907 0.0728 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387492 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0888 0.0823 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537559 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0132 0.0724 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226148 sc-eQTL 1.39e-01 -0.12 0.081 0.261 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317612 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0278 0.0598 0.261 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -531610 eQTL 0.00603 -0.0428 0.0156 0.00332 0.0 0.289
ENSG00000057704 TMCC3 35579 eQTL 0.000155 -0.0544 0.0143 0.0 0.0 0.289

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028203 VEZT -531610 7.87e-07 2.5e-07 6.57e-08 2.57e-07 1.07e-07 1.5e-07 4.05e-07 6.2e-08 2.35e-07 1.39e-07 2.98e-07 2.11e-07 4.27e-07 8.55e-08 1.12e-07 1.14e-07 7.3e-08 2.83e-07 8.93e-08 7.4e-08 1.39e-07 2.3e-07 2.04e-07 5.6e-08 3.98e-07 1.82e-07 1.57e-07 1.54e-07 1.87e-07 2e-07 1.71e-07 4.78e-08 4.97e-08 1.03e-07 1.29e-07 3.57e-08 5.96e-08 5.8e-08 4.99e-08 8.61e-08 5.56e-08 2.43e-07 3.09e-08 1.08e-08 8.45e-08 1.05e-08 9.19e-08 0.0 4.83e-08
ENSG00000057704 TMCC3 35579 1.65e-05 1.19e-05 1.98e-06 6.74e-06 2.58e-06 6.21e-06 1.41e-05 2.12e-06 1.04e-05 5.47e-06 1.38e-05 5.8e-06 1.85e-05 3.9e-06 3.66e-06 6.87e-06 5.51e-06 9.83e-06 2.99e-06 2.86e-06 6.27e-06 1.1e-05 1.03e-05 3.66e-06 1.67e-05 4.39e-06 5.97e-06 4.44e-06 1.27e-05 1.12e-05 6.69e-06 1.01e-06 1.2e-06 3.55e-06 4.71e-06 2.67e-06 1.82e-06 1.96e-06 2.11e-06 1.08e-06 9.58e-07 1.43e-05 1.68e-06 1.67e-07 9.48e-07 1.81e-06 1.84e-06 7.8e-07 4.67e-07
ENSG00000236349 \N 137895 4.58e-06 3.63e-06 4.42e-07 1.96e-06 6.39e-07 1.03e-06 2.48e-06 7.37e-07 2.33e-06 1.4e-06 3.25e-06 1.84e-06 5.41e-06 1.34e-06 9.92e-07 2.06e-06 1.64e-06 2.03e-06 1.54e-06 1.3e-06 1.39e-06 3.54e-06 3.36e-06 1.66e-06 4.31e-06 1.09e-06 1.56e-06 1.79e-06 3.55e-06 2.65e-06 1.94e-06 3.41e-07 6.12e-07 1.35e-06 1.63e-06 8.92e-07 7.76e-07 4.46e-07 1.18e-06 4.35e-07 2.4e-07 3.87e-06 5.05e-07 1.91e-07 3.27e-07 3.48e-07 8.72e-07 2.34e-07 2.05e-07