logo

Genes within 1Mb (chr12:94686040:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.24e-01 0.0439 0.0895 0.201 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.38e-01 0.0496 0.105 0.201 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0296 0.0788 0.201 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.12e-01 0.0368 0.0995 0.201 B L1
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00952 0.0908 0.201 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.37e-01 0.0705 0.0594 0.201 B L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0928 0.075 0.201 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0607 0.0909 0.201 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.03e-02 -0.0847 0.043 0.201 B L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.67e-01 0.00308 0.0739 0.201 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0885 0.0638 0.201 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0707 0.0712 0.201 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 3.31e-02 -0.207 0.0965 0.201 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0338 0.0627 0.201 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0819 0.0655 0.201 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0128 0.0689 0.201 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.05e-01 0.0457 0.0882 0.201 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 1.88e-03 -0.183 0.058 0.201 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 5.01e-02 -0.147 0.0748 0.201 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0673 0.096 0.201 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 2.19e-02 -0.196 0.0849 0.201 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.56e-01 0.0928 0.0815 0.201 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.53e-01 0.0045 0.0763 0.201 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.31e-01 0.0391 0.0624 0.201 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 2.11e-01 -0.131 0.104 0.207 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0633 0.111 0.207 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 2.09e-01 0.138 0.109 0.207 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.60e-02 -0.188 0.105 0.207 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.67e-01 0.0166 0.0991 0.207 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0114 0.0882 0.207 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 6.67e-01 0.0423 0.0982 0.207 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00152 0.0827 0.207 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.69e-03 0.251 0.0962 0.201 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.00e-02 -0.148 0.0753 0.201 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00231 0.0779 0.201 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0336 0.0928 0.201 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 5.75e-01 0.0354 0.063 0.201 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.99e-01 0.0119 0.0932 0.201 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 5.09e-01 0.0549 0.0829 0.201 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.21e-01 0.0295 0.0596 0.201 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.08e-01 0.081 0.0977 0.202 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.28e-03 -0.255 0.0906 0.202 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0548 0.0773 0.202 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0562 0.0916 0.202 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0506 0.0755 0.202 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 3.36e-03 -0.25 0.0841 0.202 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0109 0.0634 0.202 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0299 0.11 0.201 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.40e-02 -0.172 0.0926 0.201 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 1.42e-01 0.125 0.0848 0.201 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0228 0.106 0.201 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0143 0.0863 0.201 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 2.17e-01 -0.12 0.0968 0.201 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0784 0.0538 0.201 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0197 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00923 0.105 0.191 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.68e-01 0.038 0.129 0.191 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 9.96e-01 0.000626 0.123 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 1.66e-03 0.292 0.0915 0.191 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 4.46e-01 0.0759 0.0992 0.191 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 7.35e-01 -0.042 0.124 0.191 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00588 0.0872 0.191 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 2.09e-01 -0.137 0.109 0.191 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.49e-01 0.00691 0.108 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 3.36e-01 0.105 0.109 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0673 0.0994 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 5.58e-01 0.0639 0.109 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 8.02e-01 0.028 0.112 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.93e-01 -0.12 0.0915 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.74e-02 -0.241 0.1 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 1.37e-01 -0.148 0.0994 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0757 0.0825 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.2 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 9.66e-01 0.00486 0.116 0.2 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0239 0.11 0.2 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.96e-01 0.0308 0.119 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 1.43e-01 -0.155 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.65e-01 0.0996 0.0892 0.2 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0335 0.104 0.2 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 9.42e-01 0.00768 0.105 0.2 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 1.84e-01 -0.112 0.0843 0.2 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.54e-01 0.0477 0.106 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.93e-01 0.0575 0.107 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 5.33e-01 0.0564 0.0904 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0908 0.11 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0854 0.109 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.45e-01 0.133 0.0909 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0604 0.0943 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 2.73e-01 0.113 0.103 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0323 0.0602 0.201 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.48e-01 0.0875 0.115 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0398 0.105 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0891 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.03e-01 0.0445 0.116 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0539 0.106 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 3.80e-01 0.0866 0.0983 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.22e-01 0.0102 0.104 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 7.49e-01 0.0279 0.0872 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0339 0.0856 0.2 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 2.67e-01 0.127 0.114 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 9.98e-01 0.000331 0.119 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 2.08e-01 -0.15 0.119 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.0946 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 4.40e-01 0.0823 0.106 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 4.17e-01 0.0886 0.109 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0262 0.0981 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 5.97e-01 0.0445 0.0841 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0721 0.0727 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 2.25e-01 -0.108 0.0886 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 7.92e-03 -0.27 0.101 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0783 0.0695 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.20e-01 -0.117 0.075 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 8.89e-01 -0.00902 0.0648 0.201 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.76e-01 0.00264 0.0893 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 2.04e-01 -0.106 0.0833 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0198 0.0974 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 9.94e-01 0.000855 0.113 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 7.02e-01 0.0319 0.0833 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0144 0.0889 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0105 0.0766 0.201 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 5.92e-01 -0.062 0.115 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 8.08e-01 0.0249 0.102 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.107 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 5.55e-01 0.0638 0.108 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.08e-02 0.161 0.0916 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.33e-01 -0.155 0.103 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0215 0.0937 0.201 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 1.86e-01 0.132 0.0997 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 2.61e-02 -0.195 0.0872 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 2.17e-01 -0.124 0.0998 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0889 0.111 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 1.96e-02 -0.247 0.105 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.74e-01 0.123 0.0902 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 2.96e-01 0.104 0.0995 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.88e-01 0.0316 0.0785 0.201 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.42e-01 0.0075 0.102 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0433 0.0799 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0743 0.0925 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0974 0.103 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 2.52e-01 -0.106 0.0925 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 4.30e-01 0.0741 0.0938 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0906 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.28e-01 0.0261 0.075 0.201 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0583 0.117 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 1.91e-01 -0.118 0.09 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 3.62e-02 0.248 0.118 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 3.56e-01 -0.111 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 7.52e-01 -0.034 0.107 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0765 0.113 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0333 0.116 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0437 0.0935 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.36e-01 0.0882 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 4.12e-03 -0.277 0.0953 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0185 0.11 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.31e-01 0.0398 0.116 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 9.50e-01 0.00603 0.096 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.78e-01 -0.147 0.109 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 5.08e-01 0.0747 0.113 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.35e-01 0.0326 0.0963 0.203 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0841 0.113 0.203 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 3.22e-02 -0.204 0.0946 0.203 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 3.28e-02 0.233 0.109 0.203 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 2.02e-01 0.136 0.106 0.203 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.00e-01 0.0238 0.0937 0.203 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.12e-01 -0.17 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0345 0.0938 0.203 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.08e-01 0.058 0.113 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0558 0.108 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.14e-01 0.0908 0.111 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0408 0.117 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.42e-01 -0.14 0.0951 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.37e-03 -0.306 0.0944 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.0927 0.202 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 1.96e-01 -0.142 0.109 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 8.74e-02 -0.163 0.0948 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0376 0.0989 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0686 0.101 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0539 0.0885 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 3.69e-01 -0.092 0.102 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.80e-01 -0.02 0.0714 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 7.06e-02 0.218 0.12 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 1.15e-02 -0.269 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 6.39e-01 0.0529 0.112 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0158 0.119 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.16e-01 0.0226 0.097 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 5.54e-01 0.0659 0.111 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 6.61e-01 0.044 0.1 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.68e-02 0.201 0.101 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 4.38e-03 -0.294 0.102 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 3.02e-01 -0.106 0.103 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 6.44e-01 0.0493 0.107 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 1.44e-01 0.135 0.0918 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.72e-02 -0.251 0.105 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0208 0.0739 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 1.76e-01 0.193 0.142 0.189 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 3.48e-01 0.121 0.129 0.189 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.92e-01 0.0985 0.143 0.189 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.99e-01 -0.092 0.136 0.189 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 1.43e-01 0.187 0.127 0.189 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 9.24e-01 0.0126 0.132 0.189 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 3.68e-01 -0.124 0.137 0.189 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 9.74e-01 0.00376 0.114 0.189 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0425 0.0803 0.189 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.61e-01 0.0467 0.106 0.202 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0359 0.0948 0.202 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.84e-01 0.0251 0.0913 0.202 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 6.81e-01 0.0454 0.11 0.202 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0856 0.108 0.202 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00558 0.107 0.202 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0639 0.0665 0.202 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0286 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0693 0.103 0.201 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 6.53e-01 0.049 0.109 0.201 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0973 0.201 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000867 0.1 0.201 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 3.36e-01 -0.103 0.107 0.201 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 9.62e-01 0.00394 0.0824 0.201 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 3.21e-01 -0.106 0.106 0.202 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.72e-01 0.0485 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 1.11e-02 0.294 0.115 0.202 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 1.17e-01 -0.176 0.112 0.202 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 6.65e-01 0.0434 0.1 0.202 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 5.99e-01 0.0494 0.0939 0.202 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 3.55e-01 0.0997 0.108 0.202 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 2.76e-01 0.1 0.0915 0.202 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 1.53e-01 0.154 0.107 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0664 0.0847 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 1.79e-01 0.125 0.0928 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00556 0.0982 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00827 0.0749 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.30e-01 -0.009 0.102 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 8.99e-01 -0.011 0.087 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.64e-01 0.0356 0.0617 0.201 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 1.08e-01 0.178 0.111 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0567 0.0973 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0752 0.107 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 5.08e-01 0.0702 0.106 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 6.04e-01 0.0412 0.0793 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0164 0.112 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0469 0.103 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 4.29e-01 0.0579 0.073 0.201 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 3.20e-01 0.134 0.134 0.212 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0419 0.103 0.212 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 3.21e-01 0.127 0.128 0.212 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0476 0.137 0.212 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 8.38e-01 0.0266 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 8.85e-02 -0.216 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0951 0.11 0.212 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 7.93e-01 0.0309 0.118 0.2 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 6.09e-02 -0.213 0.113 0.2 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0462 0.12 0.2 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0204 0.112 0.2 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 7.43e-01 0.0315 0.0962 0.2 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0469 0.116 0.2 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00245 0.104 0.2 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 1.63e-01 0.104 0.0739 0.2 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 2.47e-01 0.127 0.109 0.201 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 2.68e-02 -0.233 0.104 0.201 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 2.39e-01 -0.135 0.115 0.201 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0249 0.114 0.201 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 3.16e-01 0.073 0.0726 0.201 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.16e-01 -0.012 0.114 0.201 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 1.07e-01 0.174 0.107 0.201 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00217 0.0962 0.201 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0175 0.121 0.209 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0677 0.117 0.209 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 5.32e-01 -0.077 0.123 0.209 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 9.01e-01 0.0152 0.122 0.209 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.89e-01 -0.124 0.117 0.209 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 2.13e-02 -0.288 0.124 0.209 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 1.39e-01 -0.156 0.105 0.209 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0582 0.104 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.107 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.61e-01 0.0659 0.113 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0606 0.0999 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 2.07e-01 0.145 0.114 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 6.69e-01 0.0455 0.106 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 7.69e-01 0.0201 0.0685 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 1.82e-01 -0.128 0.0953 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0784 0.095 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 2.05e-02 -0.151 0.0649 0.201 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 4.31e-01 0.0798 0.101 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 5.63e-01 0.0596 0.103 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 6.40e-01 0.0396 0.0845 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0342 0.11 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -865436 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0851 0.0975 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 2.05e-01 0.106 0.0831 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0346 0.0869 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 4.31e-01 0.0845 0.107 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0448 0.0592 0.201 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 2.17e-02 0.228 0.0983 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 2.87e-01 -0.084 0.0787 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 7.97e-01 0.0219 0.0852 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 7.29e-01 0.0321 0.0926 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 9.33e-01 0.0059 0.07 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0109 0.0953 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 9.11e-01 0.00959 0.0861 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 4.02e-01 0.0496 0.059 0.201 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 9.31e-02 0.189 0.112 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 3.42e-03 -0.303 0.102 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.38e-01 -0.08 0.103 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0909 0.115 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 4.84e-01 0.0466 0.0665 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0571 0.111 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -531442 sc-eQTL 3.07e-01 0.0966 0.0943 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 3.24e-01 0.0743 0.0752 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -531706 sc-eQTL 6.48e-01 0.0462 0.101 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 35483 sc-eQTL 4.37e-03 -0.266 0.0924 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -787480 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0673 0.0805 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -387588 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0777 0.0913 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 537463 sc-eQTL 9.58e-01 0.00426 0.0802 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 226052 sc-eQTL 5.18e-02 -0.175 0.0894 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -317708 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0237 0.0662 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 \N 35483 1.2e-05 1.27e-05 2.53e-06 7.63e-06 2.69e-06 6.12e-06 1.65e-05 2.44e-06 1.24e-05 6.27e-06 1.64e-05 6.79e-06 2.28e-05 4.48e-06 4.14e-06 8.62e-06 7.29e-06 1.18e-05 4.09e-06 4.17e-06 7e-06 1.25e-05 1.29e-05 4.98e-06 2.22e-05 5.1e-06 7.34e-06 5.45e-06 1.48e-05 1.52e-05 7.81e-06 1.16e-06 1.67e-06 4.49e-06 5.87e-06 3.89e-06 2.04e-06 2.43e-06 3.21e-06 2.1e-06 1.67e-06 1.63e-05 1.79e-06 3.73e-07 1.85e-06 2.35e-06 2.48e-06 1.26e-06 9.96e-07
ENSG00000236349 \N 137799 4.33e-06 4.09e-06 8.49e-07 1.89e-06 1.47e-06 1.19e-06 3.02e-06 1.03e-06 4.15e-06 2.01e-06 4.16e-06 3.3e-06 6.75e-06 1.52e-06 1.42e-06 2.98e-06 2.02e-06 2.75e-06 1.33e-06 1e-06 2.66e-06 4.23e-06 3.38e-06 1.38e-06 4.9e-06 1.65e-06 2.43e-06 1.67e-06 4.32e-06 3.82e-06 2.01e-06 5.26e-07 6.12e-07 1.73e-06 1.94e-06 9.03e-07 9.66e-07 4.92e-07 1.04e-06 4.29e-07 6.17e-07 4.71e-06 3.78e-07 1.58e-07 5.95e-07 4.12e-07 8.71e-07 4.41e-07 3.42e-07