logo

Genes within 1Mb (chr12:94682753:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0943 0.136 0.081 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 4.56e-01 -0.12 0.16 0.081 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 7.13e-01 0.0443 0.12 0.081 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 2.36e-01 0.18 0.151 0.081 B L1
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0453 0.139 0.081 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0814 0.0908 0.081 B L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.56e-01 0.0209 0.115 0.081 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 8.13e-02 0.242 0.138 0.081 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0684 0.0661 0.081 B L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.65e-01 0.0487 0.113 0.081 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 2.34e-01 -0.116 0.0974 0.081 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0395 0.109 0.081 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 2.21e-01 -0.182 0.148 0.081 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.15e-01 0.0224 0.0956 0.081 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00308 0.1 0.081 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.93e-01 -0.137 0.105 0.081 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0798 0.134 0.081 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.87e-01 -0.119 0.09 0.081 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 7.33e-01 0.0393 0.115 0.081 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 1.94e-03 -0.449 0.143 0.081 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 1.95e-02 -0.305 0.129 0.081 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 7.45e-01 0.0406 0.125 0.081 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 2.84e-01 -0.125 0.116 0.081 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 8.61e-02 -0.163 0.0945 0.081 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.17e-01 0.0788 0.157 0.083 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 3.66e-01 -0.151 0.167 0.083 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.40e-01 0.158 0.165 0.083 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 5.24e-01 -0.102 0.16 0.083 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.79e-01 -0.161 0.149 0.083 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 2.83e-02 0.29 0.131 0.083 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 1.29e-01 0.224 0.147 0.083 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 6.34e-01 0.0595 0.125 0.083 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0386 0.148 0.081 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 5.06e-01 0.0763 0.115 0.081 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.081 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 2.38e-01 -0.165 0.14 0.081 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 4.33e-02 -0.192 0.0942 0.081 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0498 0.141 0.081 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 6.21e-01 0.0619 0.125 0.081 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0768 0.0898 0.081 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 4.54e-01 0.111 0.148 0.082 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0535 0.14 0.082 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 9.38e-01 0.00911 0.117 0.082 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.44e-01 0.106 0.138 0.082 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0186 0.114 0.082 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 1.83e-01 -0.173 0.129 0.082 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0808 0.0957 0.082 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.86e-01 0.0667 0.165 0.081 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.71e-03 -0.436 0.137 0.081 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0588 0.128 0.081 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.14e-01 0.0376 0.16 0.081 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 4.06e-02 0.265 0.129 0.081 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 2.05e-01 -0.185 0.146 0.081 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0639 0.0812 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 2.36e-01 -0.213 0.179 0.079 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 9.09e-02 -0.259 0.152 0.079 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.02e-02 0.366 0.186 0.079 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.84e-01 0.0264 0.18 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 7.88e-01 0.037 0.137 0.079 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 3.96e-01 0.123 0.145 0.079 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 5.77e-01 -0.101 0.18 0.079 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 2.02e-01 -0.162 0.127 0.079 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0834 0.159 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 2.74e-01 -0.182 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0677 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.51e-01 0.143 0.153 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0903 0.168 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 7.24e-01 0.0609 0.172 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 1.42e-01 -0.207 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.62e-02 -0.268 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0346 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.30e-01 0.124 0.127 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.16e-01 0.0632 0.173 0.08 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.51e-01 -0.252 0.175 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 2.81e-01 -0.182 0.168 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 3.08e-01 0.184 0.181 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 9.54e-01 0.00923 0.161 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.15e-02 -0.312 0.135 0.08 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 1.46e-01 0.231 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 2.40e-01 0.189 0.16 0.08 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0388 0.129 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.31e-01 -0.101 0.161 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 8.97e-02 0.276 0.162 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0201 0.137 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 9.70e-01 0.00623 0.167 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 1.55e-01 -0.235 0.164 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 7.52e-01 0.0439 0.139 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.22e-01 0.115 0.143 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 7.84e-01 0.043 0.157 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.65e-01 -0.127 0.091 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 9.21e-01 0.0181 0.183 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.75e-01 -0.07 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0558 0.169 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 9.31e-01 0.0161 0.185 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 4.70e-01 -0.122 0.169 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 5.46e-01 0.0945 0.156 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 5.82e-01 0.0908 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0186 0.138 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0954 0.136 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 4.32e-03 -0.483 0.167 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 8.91e-01 0.0244 0.178 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 5.73e-01 -0.101 0.179 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 3.04e-01 0.146 0.142 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 3.49e-01 0.149 0.159 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.21e-01 0.037 0.163 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0649 0.147 0.084 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 3.27e-01 0.125 0.127 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 2.74e-01 -0.121 0.11 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.23e-01 0.0303 0.135 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 2.54e-01 -0.177 0.155 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0251 0.106 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0907 0.114 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 2.12e-01 -0.123 0.098 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 4.17e-01 -0.11 0.136 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0733 0.127 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 1.64e-01 -0.206 0.148 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 3.01e-01 0.178 0.172 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 1.42e-02 0.31 0.125 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.23e-01 0.109 0.135 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.18e-01 -0.117 0.116 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.70e-01 -0.075 0.175 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.62e-01 -0.142 0.155 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.17e-01 0.0378 0.163 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 5.30e-01 -0.103 0.164 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0633 0.14 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.08e-01 0.13 0.157 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.84e-01 -0.124 0.142 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 9.75e-02 -0.258 0.155 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0666 0.137 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 9.87e-02 0.257 0.155 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.68e-01 -0.125 0.172 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 7.37e-02 -0.295 0.164 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 1.77e-01 -0.19 0.14 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 5.66e-02 -0.295 0.154 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.58e-01 -0.172 0.122 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 3.26e-01 -0.153 0.156 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.18e-01 -0.19 0.121 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 4.57e-01 0.105 0.141 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 6.92e-02 -0.284 0.155 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 1.61e-01 -0.198 0.141 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 4.89e-03 0.399 0.14 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0554 0.138 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.29e-01 -0.173 0.114 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 3.61e-01 -0.155 0.169 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0825 0.13 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 1.43e-01 -0.251 0.171 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 1.21e-01 -0.267 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 3.58e-01 0.143 0.155 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.74e-01 -0.179 0.163 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 2.64e-01 0.188 0.167 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.01e-01 -0.114 0.135 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0398 0.171 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0652 0.147 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.13e-01 -0.168 0.166 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 7.49e-01 -0.056 0.175 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0629 0.145 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0887 0.165 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 5.05e-01 0.114 0.17 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.88e-01 -0.101 0.146 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 9.74e-01 0.00527 0.164 0.082 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 3.59e-03 -0.401 0.136 0.082 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 1.19e-01 -0.249 0.159 0.082 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0307 0.155 0.082 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.38e-02 0.235 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 1.82e-01 -0.208 0.155 0.082 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.26e-02 -0.275 0.135 0.082 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.54e-02 0.311 0.168 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 3.66e-01 -0.147 0.162 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.08e-01 -0.111 0.167 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 9.73e-02 0.29 0.174 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 9.17e-01 0.0149 0.143 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0355 0.145 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0997 0.139 0.082 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.36e-01 0.102 0.164 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 8.87e-01 0.0203 0.143 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.40e-01 0.0907 0.148 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.04e-01 -0.126 0.151 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 6.10e-02 -0.247 0.131 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0725 0.153 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0753 0.107 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 3.47e-01 0.18 0.191 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 3.73e-01 0.151 0.17 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 7.11e-01 0.0664 0.179 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 3.40e-01 0.18 0.188 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.01e-01 0.0388 0.154 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 1.38e-01 0.262 0.176 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.70e-01 -0.218 0.158 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0413 0.155 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.73e-01 -0.216 0.158 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 8.24e-01 -0.035 0.157 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0437 0.163 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.31e-01 0.168 0.14 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 5.71e-01 0.0918 0.162 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00638 0.113 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0711 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0213 0.18 0.081 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 8.25e-01 0.0442 0.2 0.081 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 3.84e-01 0.166 0.189 0.081 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 6.51e-01 0.081 0.179 0.081 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0181 0.185 0.081 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 7.58e-01 0.0594 0.192 0.081 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 5.71e-01 0.0906 0.16 0.081 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0992 0.112 0.081 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0772 0.157 0.083 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.58e-01 -0.198 0.14 0.083 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.14e-01 0.0884 0.135 0.083 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 2.16e-01 0.201 0.162 0.083 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 4.81e-02 0.314 0.158 0.083 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.01e-01 -0.04 0.158 0.083 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 2.96e-01 -0.103 0.0984 0.083 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 1.81e-01 0.222 0.166 0.081 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.69e-01 -0.141 0.157 0.081 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 5.20e-01 0.107 0.166 0.081 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 5.95e-01 0.0791 0.149 0.081 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 3.73e-01 -0.136 0.153 0.081 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 7.52e-02 0.291 0.163 0.081 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.081 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.29e-01 0.103 0.164 0.083 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 5.08e-01 -0.117 0.176 0.083 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.89e-01 0.097 0.179 0.083 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 9.56e-01 0.00957 0.173 0.083 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 1.01e-01 -0.252 0.153 0.083 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.09e-02 0.294 0.143 0.083 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 2.36e-01 0.197 0.166 0.083 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00819 0.141 0.083 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.76e-01 0.0925 0.165 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.79e-01 0.174 0.129 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 9.60e-01 0.00716 0.143 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.52e-01 -0.113 0.15 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.58e-03 -0.299 0.113 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 3.92e-01 -0.134 0.156 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 7.73e-01 0.0385 0.133 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 9.19e-01 0.00968 0.0946 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 2.27e-01 -0.201 0.166 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 4.32e-01 -0.115 0.146 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 1.79e-01 0.216 0.161 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.61e-01 -0.117 0.159 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00476 0.119 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 8.52e-01 0.0315 0.168 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000917 0.154 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0872 0.11 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 8.35e-01 0.0464 0.223 0.07 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 2.37e-03 -0.512 0.165 0.07 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 6.38e-01 -0.1 0.212 0.07 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 3.94e-01 0.194 0.226 0.07 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 5.23e-01 0.138 0.215 0.07 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 1.51e-01 0.302 0.209 0.07 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.40e-01 0.141 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 3.92e-01 -0.152 0.177 0.08 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 1.20e-01 0.267 0.171 0.08 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.58e-01 0.106 0.18 0.08 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0406 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0363 0.145 0.08 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0697 0.175 0.08 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 1.51e-02 -0.379 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 2.58e-01 -0.127 0.112 0.08 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 4.02e-01 0.133 0.159 0.086 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 7.27e-01 0.0538 0.154 0.086 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 7.05e-01 0.0633 0.167 0.086 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 2.72e-01 0.182 0.166 0.086 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0855 0.106 0.086 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 4.20e-01 -0.134 0.165 0.086 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0588 0.157 0.086 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 2.81e-01 -0.151 0.139 0.086 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 6.40e-01 0.0885 0.189 0.079 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0342 0.184 0.079 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 4.99e-01 0.131 0.193 0.079 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 1.62e-01 -0.266 0.19 0.079 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 8.37e-01 0.0379 0.183 0.079 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 3.96e-01 0.168 0.197 0.079 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 2.68e-01 0.184 0.165 0.079 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.90e-01 0.141 0.163 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 2.36e-01 -0.195 0.164 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 2.74e-01 -0.19 0.173 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 3.31e-01 0.149 0.153 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 2.07e-01 0.222 0.175 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0338 0.163 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.54e-01 -0.12 0.105 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0474 0.147 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 3.48e-01 0.137 0.145 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 9.04e-01 0.0121 0.101 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0919 0.155 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.34e-01 0.075 0.157 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 8.38e-01 0.0265 0.13 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0264 0.169 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -868723 sc-eQTL 7.17e-02 -0.269 0.148 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 7.81e-01 0.0356 0.128 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 2.71e-01 0.146 0.133 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0212 0.164 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 1.61e-01 -0.127 0.0904 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0511 0.153 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.08e-01 0.062 0.121 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 4.22e-01 0.105 0.13 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0803 0.142 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 2.95e-02 -0.232 0.106 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0684 0.146 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 7.21e-01 0.0471 0.132 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0283 0.0906 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0143 0.167 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 3.46e-02 0.327 0.154 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 5.75e-01 0.0862 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0132 0.172 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0988 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0577 0.164 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -534729 sc-eQTL 6.40e-02 -0.26 0.139 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 3.39e-01 -0.107 0.112 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -534993 sc-eQTL 7.09e-01 0.0571 0.153 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 32196 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0638 0.143 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -790767 sc-eQTL 4.91e-01 0.0841 0.122 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -390875 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0995 0.138 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 534176 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0569 0.121 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 222765 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0557 0.137 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -320995 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0734 0.1 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028203 VEZT -534993 eQTL 0.00722 -0.0764 0.0284 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000057704 TMCC3 32196 eQTL 0.00873 0.0689 0.0262 0.0 0.0 0.0643
ENSG00000173588 CEP83 222765 eQTL 0.000462 0.175 0.0498 0.00208 0.0 0.0643

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028203 VEZT -534993 1.21e-06 7.46e-07 2.87e-07 1.01e-06 3.5e-07 5.09e-07 1.26e-06 1.31e-07 8.08e-07 3.89e-07 1.24e-06 5.69e-07 1.63e-06 2.59e-07 3.56e-07 3.96e-07 6.29e-07 5.82e-07 7.55e-07 6.87e-07 3.91e-07 6.91e-07 5.81e-07 5.98e-07 1.74e-06 2.56e-07 6.13e-07 4.92e-07 8.97e-07 1.25e-06 4.71e-07 1.89e-07 1.48e-07 6.13e-07 4.25e-07 4.69e-07 7.3e-07 3.23e-07 3.78e-07 2.05e-07 2.82e-07 1.29e-06 5.85e-08 1.96e-07 1.61e-07 1.28e-07 1.58e-07 8.35e-08 5.39e-08