logo

Genes within 1Mb (chr12:94677614:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.28e-02 0.147 0.0786 0.28 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.31e-01 0.0199 0.0931 0.28 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.22e-01 0.0561 0.0696 0.28 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 8.84e-01 0.0129 0.0881 0.28 B L1
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 5.89e-01 0.0435 0.0803 0.28 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.06e-01 0.0439 0.0527 0.28 B L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.10e-01 -0.034 0.0666 0.28 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 4.02e-01 0.0676 0.0804 0.28 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0218 0.0384 0.28 B L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.04e-02 0.127 0.0646 0.28 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0262 0.0565 0.28 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 7.18e-01 0.0228 0.063 0.28 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0435 0.086 0.28 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00823 0.0553 0.28 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0333 0.0579 0.28 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 8.02e-01 0.0153 0.0608 0.28 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 7.99e-01 0.0201 0.079 0.28 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0245 0.0531 0.28 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 8.87e-02 -0.115 0.0671 0.28 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0738 0.0858 0.28 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 2.74e-01 0.0842 0.0767 0.28 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.62e-01 0.032 0.0731 0.28 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.27e-01 0.0149 0.0683 0.28 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.19e-01 0.0361 0.0559 0.28 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 8.09e-01 0.0233 0.0963 0.277 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0152 0.102 0.277 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 2.67e-01 0.112 0.101 0.277 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 4.30e-02 -0.197 0.0969 0.277 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.67e-01 0.0393 0.0913 0.277 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0249 0.0814 0.277 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0534 0.0905 0.277 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 4.34e-01 0.0597 0.0762 0.277 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 8.22e-02 0.151 0.0865 0.28 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 1.33e-03 -0.215 0.0661 0.28 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 3.86e-01 0.0602 0.0693 0.28 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 7.72e-01 -0.024 0.0827 0.28 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 1.13e-01 0.0888 0.0558 0.28 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0901 0.0828 0.28 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 4.27e-01 0.0587 0.0738 0.28 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 3.76e-01 0.047 0.053 0.28 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00332 0.088 0.281 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0617 0.0829 0.281 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0493 0.0695 0.281 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0969 0.0822 0.281 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0231 0.0679 0.281 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 1.91e-01 -0.101 0.0769 0.281 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0184 0.057 0.281 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 8.00e-01 0.025 0.0985 0.28 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 7.04e-01 0.0318 0.0838 0.28 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 5.49e-01 0.0459 0.0765 0.28 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.40e-01 -0.141 0.095 0.28 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0566 0.0775 0.28 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 1.38e-01 -0.129 0.0868 0.28 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0587 0.0484 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0327 0.107 0.283 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 3.87e-01 0.0792 0.0914 0.283 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 2.30e-01 -0.134 0.111 0.283 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 3.90e-01 0.0924 0.107 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 7.59e-01 0.0252 0.0819 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 9.61e-01 0.00419 0.0865 0.283 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0274 0.108 0.283 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0232 0.0758 0.283 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 7.77e-01 0.027 0.0949 0.283 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 7.24e-01 0.0337 0.0951 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 4.21e-02 0.195 0.0953 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0121 0.0878 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0543 0.0962 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 9.31e-01 0.0086 0.0986 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 9.57e-01 0.00437 0.081 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 7.29e-01 0.0311 0.0897 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 5.33e-01 0.055 0.088 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 1.05e-01 -0.118 0.0724 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.66e-01 0.0042 0.0997 0.28 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 7.99e-02 0.177 0.1 0.28 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.64e-01 0.00435 0.0967 0.28 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 3.91e-01 0.0892 0.104 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 2.54e-01 -0.106 0.0923 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 5.30e-01 0.0492 0.0782 0.28 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 7.81e-01 0.0254 0.0913 0.28 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00602 0.0921 0.28 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 7.90e-01 0.0198 0.0741 0.28 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 2.85e-03 0.278 0.092 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0916 0.0949 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 3.79e-01 0.0704 0.0798 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.82e-01 0.0538 0.0975 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 3.78e-01 0.0848 0.096 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 3.80e-01 0.071 0.0806 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0151 0.0834 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 1.12e-01 0.145 0.0909 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0324 0.0532 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 7.61e-01 0.0306 0.1 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0762 0.0917 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0145 0.0929 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 9.38e-01 0.00793 0.102 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 1.89e-01 0.122 0.0925 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 9.63e-01 -0.004 0.0859 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.47e-01 -0.069 0.0906 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 7.10e-03 0.203 0.0748 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 4.82e-01 0.0526 0.0747 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 4.18e-01 0.0807 0.0994 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.64e-01 0.00468 0.104 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.66e-01 -0.145 0.104 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0809 0.0827 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 2.07e-01 -0.117 0.0927 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0292 0.0952 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0784 0.0855 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 3.34e-02 0.157 0.0735 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0222 0.0643 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 7.68e-01 0.0232 0.0785 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 1.93e-01 -0.118 0.0901 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0219 0.0616 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 1.09e-01 -0.107 0.0662 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 8.01e-01 0.0144 0.0572 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 2.77e-01 0.0857 0.0786 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0399 0.0738 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 9.16e-01 0.00909 0.086 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 7.45e-01 0.0325 0.1 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.26e-01 0.0359 0.0735 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.74e-01 0.033 0.0784 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 8.34e-01 0.0142 0.0676 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0588 0.102 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.66e-01 0.00389 0.0907 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 3.22e-01 0.0943 0.0951 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 1.31e-01 0.145 0.0953 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 5.82e-01 0.045 0.0817 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00399 0.0918 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.13e-01 0.0543 0.0829 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.84e-01 0.0372 0.0912 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0185 0.0804 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 1.58e-01 -0.129 0.0908 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 8.43e-01 0.02 0.101 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0725 0.0966 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 2.21e-01 0.101 0.0822 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.66e-01 0.0154 0.0909 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.11e-01 0.0471 0.0715 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.84e-01 0.0501 0.0914 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 2.40e-01 0.0839 0.0712 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 7.50e-02 -0.147 0.0822 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0749 0.0917 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 9.11e-02 0.14 0.0824 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0229 0.0839 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00346 0.0809 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 1.34e-01 0.1 0.0667 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.75e-01 0.00322 0.102 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.18e-01 0.0181 0.0786 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 7.37e-01 0.0348 0.103 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 2.84e-01 -0.111 0.104 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.093 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0708 0.0984 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.76e-01 0.0722 0.101 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00281 0.0813 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 1.15e-02 0.262 0.103 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 2.12e-01 -0.112 0.0895 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 2.29e-01 0.122 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 6.31e-01 0.0513 0.107 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 7.10e-01 0.033 0.0886 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 8.36e-01 0.0209 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.80e-01 -0.043 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0438 0.0888 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.49e-01 0.00639 0.0997 0.281 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 5.29e-01 0.0531 0.0843 0.281 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 3.20e-01 0.0965 0.0967 0.281 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.16e-01 0.061 0.0939 0.281 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0119 0.0827 0.281 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.05e-01 -0.079 0.0946 0.281 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0386 0.0828 0.281 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.14e-01 0.011 0.101 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 9.67e-01 0.00403 0.0971 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 5.12e-01 0.0654 0.0997 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.42e-01 -0.064 0.105 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 1.16e-01 -0.135 0.0854 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0527 0.0869 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 1.83e-01 0.111 0.083 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 7.98e-02 -0.173 0.0982 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0634 0.086 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 2.41e-01 -0.105 0.089 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.94e-01 -0.118 0.0906 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00624 0.0799 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0426 0.0923 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0212 0.0644 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.47e-02 0.205 0.106 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 1.65e-02 -0.227 0.0937 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.65e-01 0.0731 0.0998 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 2.55e-01 -0.12 0.105 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.65e-01 0.0258 0.0861 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 9.16e-01 0.0105 0.0989 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 6.96e-02 0.161 0.0883 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 1.86e-01 0.12 0.0906 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 6.90e-02 -0.169 0.0926 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.18e-01 0.00957 0.0923 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0464 0.0955 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.49e-01 0.0376 0.0827 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0587 0.0949 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0141 0.0662 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.11e-02 0.234 0.124 0.281 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0827 0.113 0.281 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 6.83e-01 0.0513 0.125 0.281 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0992 0.119 0.281 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 1.29e-02 0.276 0.109 0.281 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 8.93e-01 0.0156 0.116 0.281 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.76e-01 -0.086 0.12 0.281 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 6.14e-01 0.0506 0.1 0.281 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.90e-01 -0.038 0.0704 0.281 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.79e-01 0.0528 0.095 0.28 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 9.77e-01 0.00239 0.0847 0.28 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0224 0.0816 0.28 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.76e-01 0.0552 0.0984 0.28 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 1.79e-01 -0.129 0.096 0.28 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0656 0.0953 0.28 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.91e-01 -0.032 0.0596 0.28 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.20e-02 0.189 0.0968 0.28 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0658 0.0921 0.28 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0804 0.0974 0.28 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0362 0.0873 0.28 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.22e-01 0.0722 0.0898 0.28 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.63e-01 0.042 0.0962 0.28 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 6.57e-01 0.0328 0.0738 0.28 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 2.87e-01 0.104 0.0971 0.28 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.28 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.97e-03 0.273 0.105 0.28 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.28 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 5.65e-01 0.0528 0.0916 0.28 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0176 0.086 0.28 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00753 0.0988 0.28 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 9.81e-02 0.139 0.0834 0.28 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0964 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 3.41e-02 -0.16 0.075 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 6.28e-02 0.154 0.0826 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0929 0.0875 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 1.68e-01 0.092 0.0666 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.69e-01 -0.066 0.091 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0586 0.0776 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 3.26e-01 0.0542 0.0551 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 4.08e-02 0.199 0.0967 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 3.49e-02 -0.18 0.0846 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0318 0.0943 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 7.54e-02 0.165 0.0923 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.12e-01 0.0258 0.0697 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 1.57e-01 -0.139 0.0981 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 9.98e-02 0.148 0.0897 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 2.93e-01 0.0676 0.064 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 2.11e-01 0.156 0.124 0.276 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.56e-01 0.0173 0.0956 0.276 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0634 0.119 0.276 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.57e-01 -0.179 0.126 0.276 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0626 0.12 0.276 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0398 0.118 0.276 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.78e-01 -0.057 0.102 0.276 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 5.20e-01 0.0685 0.106 0.271 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0593 0.103 0.271 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.12e-01 0.0888 0.108 0.271 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00476 0.101 0.271 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.20e-01 0.0701 0.0868 0.271 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 2.98e-01 -0.109 0.104 0.271 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0124 0.094 0.271 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 5.07e-01 0.0446 0.0671 0.271 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 3.39e-02 0.21 0.0981 0.281 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 2.85e-03 -0.283 0.0936 0.281 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.75e-01 0.0745 0.104 0.281 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 2.67e-01 -0.115 0.103 0.281 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 6.37e-01 0.0311 0.0659 0.281 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.08e-01 0.0252 0.103 0.281 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 7.64e-02 0.173 0.0972 0.281 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0603 0.087 0.281 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.90e-01 0.043 0.108 0.288 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0272 0.105 0.288 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 2.29e-01 -0.132 0.109 0.288 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0589 0.108 0.288 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 8.08e-01 0.0254 0.104 0.288 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0496 0.112 0.288 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0848 0.0942 0.288 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00539 0.0931 0.288 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0389 0.0952 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 5.84e-03 0.275 0.0987 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 9.93e-01 0.000823 0.0887 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 6.80e-01 0.0421 0.102 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00835 0.0944 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.60e-01 0.0186 0.0608 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 8.37e-01 0.0175 0.0849 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 8.41e-01 0.0169 0.0845 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0731 0.0581 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 6.21e-03 0.243 0.0878 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 5.15e-01 -0.059 0.0906 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 3.20e-01 0.0742 0.0744 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 6.53e-01 0.0437 0.097 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -873862 sc-eQTL 2.78e-01 0.0935 0.0859 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 5.54e-01 0.0436 0.0735 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0532 0.0766 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 8.69e-03 0.247 0.0931 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 9.23e-01 0.00506 0.0523 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 1.47e-01 0.128 0.088 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 8.54e-03 -0.183 0.069 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.13e-01 0.0619 0.0755 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0149 0.0823 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 2.75e-01 0.0679 0.062 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0842 0.0845 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 7.07e-01 0.0288 0.0764 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 2.24e-01 0.0638 0.0523 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 2.96e-02 0.221 0.101 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 5.75e-03 -0.26 0.093 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 5.95e-01 0.0498 0.0935 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 1.90e-01 -0.137 0.104 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 4.30e-01 0.0477 0.0604 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 2.61e-01 -0.113 0.1 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -539868 sc-eQTL 3.82e-01 0.075 0.0856 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0108 0.0684 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -540132 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0167 0.091 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 27057 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0916 0.0848 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -795906 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0526 0.0726 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -396014 sc-eQTL 8.96e-02 -0.14 0.0819 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 529037 sc-eQTL 7.16e-01 0.0263 0.0723 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 217626 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0926 0.0811 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0214 0.0597 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 27057 eQTL 1.1799999999999999e-30 -0.153 0.0128 0.204 0.203 0.304
ENSG00000173588 CEP83 217626 eQTL 7e-05 -0.104 0.026 0.0112 0.00896 0.304
ENSG00000184752 NDUFA12 -326134 eQTL 0.00828 0.0493 0.0186 0.0 0.0 0.304
ENSG00000236349 SUCLG2P2 129373 eQTL 7.14e-07 -0.116 0.0232 0.209 0.201 0.304
ENSG00000258357 AC023161.2 155745 eQTL 0.00256 -0.1 0.0332 0.00184 0.00221 0.304

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 27057 2.69e-05 2.76e-05 5.11e-06 1.5e-05 4.7e-06 1.2e-05 4.17e-05 4.35e-06 2.72e-05 1.25e-05 3.3e-05 1.38e-05 4.23e-05 1.17e-05 6.21e-06 1.5e-05 1.42e-05 2.19e-05 7.36e-06 6.18e-06 1.15e-05 2.64e-05 2.63e-05 8.13e-06 3.73e-05 7.01e-06 1.17e-05 1.08e-05 3.05e-05 2.19e-05 1.74e-05 1.6e-06 2.29e-06 6.44e-06 1.06e-05 4.68e-06 2.77e-06 3.14e-06 3.71e-06 2.9e-06 1.63e-06 3.25e-05 2.99e-06 4.02e-07 2.18e-06 3.41e-06 3.79e-06 1.48e-06 1.46e-06
ENSG00000236349 SUCLG2P2 129373 9.14e-06 1.12e-05 1.35e-06 6.84e-06 2.35e-06 4.14e-06 1.32e-05 2.11e-06 1e-05 5.06e-06 1.24e-05 5.17e-06 1.64e-05 3.66e-06 2.89e-06 6.42e-06 4.66e-06 7.37e-06 2.72e-06 2.79e-06 4.51e-06 9e-06 7.91e-06 3.35e-06 1.31e-05 3.49e-06 4.67e-06 3.89e-06 1.2e-05 8.21e-06 5.94e-06 8.22e-07 1.09e-06 2.88e-06 4.73e-06 2.18e-06 1.63e-06 1.9e-06 1.46e-06 9.79e-07 7.1e-07 1.25e-05 1.4e-06 2.36e-07 7.78e-07 1.63e-06 1.26e-06 7.12e-07 4.77e-07
ENSG00000258357 AC023161.2 155745 7.79e-06 9.52e-06 1.35e-06 5.52e-06 1.82e-06 3.28e-06 1.05e-05 1.75e-06 7.29e-06 4.12e-06 1.06e-05 4.03e-06 1.26e-05 3.87e-06 2.18e-06 4.81e-06 3.74e-06 5e-06 2.61e-06 2.59e-06 3.04e-06 7.66e-06 6.67e-06 2.75e-06 1.11e-05 2.46e-06 4.39e-06 2.96e-06 8.7e-06 7.69e-06 4.77e-06 5.57e-07 8.01e-07 2.53e-06 3.62e-06 1.73e-06 1.21e-06 1.25e-06 1.24e-06 8.7e-07 5.19e-07 9.18e-06 1.22e-06 2.03e-07 6.91e-07 1.02e-06 9.29e-07 6.84e-07 5.63e-07