logo

Genes within 1Mb (chr12:94656818:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0566 0.159 0.056 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 2.77e-01 0.204 0.187 0.056 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0742 0.14 0.056 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0431 0.177 0.056 B L1
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 7.88e-01 0.0435 0.162 0.056 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 4.06e-01 0.0883 0.106 0.056 B L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0925 0.161 0.056 B L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 3.15e-01 -0.135 0.134 0.056 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 6.33e-01 0.0773 0.162 0.056 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0537 0.0772 0.056 B L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.55e-01 0.123 0.133 0.056 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0577 0.116 0.056 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 6.24e-01 0.0632 0.129 0.056 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 1.50e-01 -0.253 0.175 0.056 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00869 0.113 0.056 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 4.93e-01 0.127 0.185 0.056 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.03e-01 0.151 0.118 0.056 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 4.71e-01 0.0897 0.124 0.056 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.41e-01 0.0762 0.163 0.056 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0399 0.11 0.056 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.70e-01 -0.125 0.139 0.056 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 6.32e-01 0.0852 0.178 0.056 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 7.31e-02 -0.284 0.158 0.056 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 1.09e-02 0.383 0.149 0.056 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.11e-02 0.382 0.176 0.056 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 4.25e-01 -0.113 0.141 0.056 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 3.64e-01 0.105 0.115 0.056 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0511 0.193 0.054 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.88e-01 -0.111 0.204 0.054 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 7.63e-01 0.0613 0.203 0.054 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 3.02e-01 -0.203 0.196 0.054 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.98e-01 0.071 0.183 0.054 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 7.18e-01 0.0749 0.207 0.054 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 9.76e-01 0.0049 0.163 0.054 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0257 0.182 0.054 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 4.74e-01 -0.11 0.153 0.054 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.88e-01 0.149 0.172 0.056 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0846 0.134 0.056 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0816 0.137 0.056 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 3.53e-01 -0.152 0.163 0.056 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.04e-01 0.0276 0.111 0.056 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.06e-02 -0.471 0.202 0.056 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 8.29e-01 0.0356 0.164 0.056 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 3.20e-02 0.312 0.145 0.056 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0483 0.105 0.056 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.83e-01 0.159 0.182 0.056 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.25e-01 -0.137 0.171 0.056 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 8.39e-01 0.0293 0.144 0.056 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 5.00e-01 -0.115 0.17 0.056 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.62e-01 0.0614 0.14 0.056 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 1.72e-01 -0.275 0.201 0.056 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.23e-01 -0.194 0.159 0.056 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.66e-01 0.00509 0.118 0.056 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.35e-01 -0.194 0.2 0.056 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0674 0.171 0.056 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 9.48e-01 0.0103 0.156 0.056 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 1.03e-02 -0.496 0.192 0.056 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 1.99e-01 0.203 0.157 0.056 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.99e-01 -0.161 0.191 0.056 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 5.14e-01 -0.116 0.178 0.056 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 2.25e-02 -0.225 0.0978 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 8.07e-01 0.0574 0.235 0.051 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0605 0.2 0.051 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 7.40e-01 0.0816 0.245 0.051 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0255 0.235 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0168 0.179 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0326 0.189 0.051 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 8.21e-01 0.0503 0.222 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.59e-01 0.0726 0.236 0.051 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 6.86e-01 0.0673 0.166 0.051 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.90e-01 -0.112 0.208 0.051 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 2.25e-01 0.243 0.2 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 2.15e-02 0.464 0.2 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0668 0.185 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 8.92e-02 -0.344 0.201 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 9.99e-01 0.000225 0.208 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 3.00e-01 -0.177 0.17 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.95e-01 -0.212 0.202 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 1.28e-01 -0.287 0.188 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 3.47e-01 -0.174 0.185 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 1.00e+00 1.51e-05 0.154 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 4.57e-01 0.153 0.206 0.056 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0841 0.209 0.056 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 5.27e-01 0.127 0.2 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 2.57e-01 0.244 0.214 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 8.50e-01 0.0362 0.192 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.29e-01 0.0784 0.162 0.056 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.83e-02 -0.437 0.21 0.056 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 1.38e-01 0.28 0.188 0.056 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000312 0.191 0.056 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.64e-01 0.0886 0.153 0.056 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0712 0.193 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 7.18e-01 0.0708 0.195 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0173 0.164 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 1.45e-01 -0.292 0.199 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 1.66e-01 -0.274 0.197 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 2.36e-01 0.197 0.165 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 9.62e-01 0.00999 0.208 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 8.27e-01 0.0375 0.171 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 1.78e-01 -0.253 0.187 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 8.74e-01 0.0174 0.109 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0831 0.207 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 3.10e-01 0.193 0.189 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.21e-02 -0.409 0.19 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0403 0.21 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 4.70e-01 0.138 0.191 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 7.45e-01 0.0577 0.177 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0428 0.2 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 3.29e-01 -0.183 0.187 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 9.06e-01 0.0187 0.157 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 4.33e-02 -0.311 0.153 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0273 0.208 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 2.20e-01 0.266 0.216 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 9.45e-01 0.0151 0.218 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 3.18e-01 -0.173 0.172 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0448 0.194 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.74e-01 -0.216 0.196 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.10e-01 -0.248 0.198 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.83e-02 -0.337 0.177 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 2.08e-01 0.189 0.15 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 1.90e-01 -0.171 0.13 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 7.05e-01 0.0603 0.159 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 2.28e-01 -0.221 0.183 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 5.35e-01 0.0774 0.125 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0599 0.19 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 4.67e-02 0.267 0.134 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.61e-01 0.0674 0.116 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.13e-01 0.0822 0.162 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 9.14e-01 0.0165 0.152 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 5.58e-01 0.104 0.177 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 4.01e-01 0.173 0.206 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0272 0.152 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.26e-02 0.435 0.202 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0416 0.162 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.64e-01 0.0804 0.139 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 2.61e-01 0.236 0.209 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.88e-01 -0.16 0.185 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 4.54e-01 0.146 0.195 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 2.81e-01 -0.211 0.196 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.49e-02 0.308 0.166 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0122 0.206 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0321 0.188 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 3.39e-01 0.162 0.17 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 1.08e-01 0.298 0.185 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.45e-01 0.0756 0.164 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0818 0.186 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0474 0.206 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 4.37e-01 -0.153 0.197 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 2.44e-01 0.196 0.168 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.90e-01 0.175 0.204 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 9.22e-01 0.0182 0.185 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 6.54e-01 0.0653 0.146 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 8.30e-01 0.0402 0.187 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.47e-01 0.0881 0.146 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 4.74e-01 -0.121 0.169 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 7.59e-01 0.0576 0.188 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 5.03e-02 -0.331 0.168 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.15e-02 0.32 0.17 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.16e-01 0.199 0.198 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 6.93e-01 0.0655 0.166 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00338 0.137 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.84e-01 0.116 0.212 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 3.34e-01 -0.176 0.182 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 9.98e-01 0.000597 0.206 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 5.58e-01 0.127 0.216 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 4.43e-01 0.138 0.179 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 2.46e-01 -0.237 0.204 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 1.06e-01 0.35 0.215 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0642 0.211 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 1.90e-01 0.236 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 9.46e-01 -0.014 0.207 0.056 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.62e-01 -0.129 0.175 0.056 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0466 0.201 0.056 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 3.40e-01 -0.186 0.195 0.056 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.64e-03 0.463 0.169 0.056 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 7.52e-01 0.0692 0.218 0.056 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.39e-01 0.0655 0.197 0.056 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 2.92e-01 -0.181 0.172 0.056 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.74e-01 0.12 0.213 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.85e-01 -0.112 0.204 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 5.13e-01 0.137 0.21 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 6.80e-01 -0.091 0.22 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 2.66e-01 -0.201 0.18 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.60e-01 -0.247 0.219 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 5.04e-01 -0.122 0.183 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0992 0.175 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.92e-01 0.109 0.203 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 3.34e-01 -0.171 0.176 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 1.31e-01 -0.276 0.182 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 2.97e-01 -0.195 0.186 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.50e-01 0.0309 0.164 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 4.11e-01 -0.175 0.213 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0648 0.189 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 6.18e-01 -0.066 0.132 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.01e-03 0.642 0.214 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 9.98e-01 0.000434 0.194 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 1.32e-01 0.306 0.203 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 5.58e-01 -0.126 0.215 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.06e-02 0.306 0.174 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 1.67e-01 -0.297 0.214 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.06e-01 0.0761 0.201 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.99e-01 0.0955 0.181 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.58e-01 -0.112 0.191 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0982 0.196 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.57e-01 0.179 0.194 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0623 0.201 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 1.62e-01 0.243 0.173 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.49e-02 -0.434 0.192 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 8.57e-01 -0.036 0.2 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 2.48e-01 0.161 0.139 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0583 0.25 0.056 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.44e-01 0.137 0.225 0.056 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.94e-01 0.213 0.249 0.056 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 5.75e-01 0.133 0.237 0.056 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 2.78e-01 0.242 0.222 0.056 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 9.08e-02 0.388 0.228 0.056 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 7.97e-01 0.0547 0.212 0.056 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 6.66e-01 0.104 0.24 0.056 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 1.02e-01 0.325 0.197 0.056 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 6.81e-02 0.254 0.138 0.056 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 7.92e-01 -0.051 0.194 0.057 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.85e-01 -0.07 0.172 0.057 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 5.79e-01 0.0922 0.166 0.057 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 1.53e-01 -0.286 0.199 0.057 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.22e-01 0.0968 0.196 0.057 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.80e-01 -0.207 0.191 0.057 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 1.83e-01 -0.258 0.193 0.057 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0675 0.121 0.057 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.00e-01 -0.133 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 2.50e-01 0.213 0.185 0.056 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 3.00e-01 0.203 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0664 0.176 0.056 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0796 0.181 0.056 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 4.14e-01 0.171 0.209 0.056 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.38e-01 -0.228 0.193 0.056 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00878 0.149 0.056 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 4.17e-01 0.159 0.195 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 3.42e-01 -0.146 0.154 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 3.44e-01 -0.16 0.169 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 2.21e-01 -0.218 0.177 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0545 0.136 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 9.67e-03 -0.519 0.199 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0365 0.185 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 2.24e-01 0.192 0.157 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0843 0.112 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0865 0.196 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.63e-01 -0.126 0.171 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 6.08e-01 0.0971 0.189 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 8.36e-01 0.0387 0.187 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0765 0.14 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.76e-01 -0.233 0.214 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0898 0.198 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 2.49e-01 0.209 0.181 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.14e-01 0.0842 0.129 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.00e-01 0.224 0.215 0.053 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 9.99e-01 0.000369 0.209 0.053 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 8.29e-01 0.0474 0.22 0.053 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0855 0.205 0.053 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.30e-01 0.038 0.176 0.053 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 1.14e-01 0.321 0.202 0.053 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.73e-01 0.233 0.212 0.053 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 5.46e-01 -0.115 0.191 0.053 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0123 0.136 0.053 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.38e-01 0.094 0.2 0.054 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 2.65e-01 0.215 0.192 0.054 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0886 0.21 0.054 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 6.55e-01 0.093 0.208 0.054 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 5.54e-01 0.0786 0.133 0.054 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 2.88e-01 -0.22 0.206 0.054 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 6.91e-01 0.0826 0.207 0.054 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 9.22e-03 0.51 0.194 0.054 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 2.54e-01 -0.2 0.175 0.054 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.55e-01 0.186 0.201 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 6.49e-02 0.391 0.211 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 7.22e-01 0.0667 0.187 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0737 0.215 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 8.83e-01 0.0293 0.199 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0207 0.128 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 5.71e-02 -0.415 0.217 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00456 0.179 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0624 0.178 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0135 0.123 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0547 0.183 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.22e-01 0.149 0.186 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 4.36e-01 -0.119 0.153 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 4.17e-01 -0.162 0.199 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -894658 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0729 0.177 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 2.05e-01 0.191 0.15 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0212 0.2 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0923 0.157 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 3.38e-01 -0.186 0.194 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0587 0.107 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 6.77e-01 0.074 0.177 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0923 0.14 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0734 0.152 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 4.69e-01 -0.12 0.165 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 3.69e-01 -0.112 0.124 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 3.03e-03 -0.591 0.197 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0587 0.17 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 6.01e-02 0.288 0.152 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0407 0.105 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 5.02e-02 0.389 0.198 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.55e-01 0.138 0.185 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0424 0.183 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 9.04e-01 0.0247 0.204 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 6.33e-01 0.0564 0.118 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0211 0.213 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 4.22e-01 0.157 0.196 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -560664 sc-eQTL 4.92e-01 0.115 0.167 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 3.50e-01 -0.125 0.133 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -560928 sc-eQTL 3.45e-01 0.176 0.186 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 6261 sc-eQTL 4.51e-01 -0.132 0.174 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -816702 sc-eQTL 8.77e-01 -0.023 0.149 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -416810 sc-eQTL 4.95e-01 -0.116 0.169 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 508241 sc-eQTL 1.98e-01 0.191 0.148 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 979443 sc-eQTL 1.29e-01 -0.318 0.208 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 196830 sc-eQTL 2.48e-01 -0.192 0.166 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -346930 sc-eQTL 9.03e-01 0.0149 0.123 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 6261 eQTL 0.00756 -0.0731 0.0273 0.0 0.0 0.0599
ENSG00000236349 SUCLG2P2 108577 eQTL 0.0408 -0.096 0.0469 0.0 0.0 0.0599

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000236349 SUCLG2P2 108577 6.14e-05 2.43e-05 3.05e-06 1.04e-05 2.34e-06 1.03e-05 2.08e-05 1.97e-06 1.49e-05 5.3e-06 1.94e-05 7.03e-06 2.88e-05 4.48e-06 3.8e-06 9.17e-06 1e-05 1.25e-05 2.93e-06 2.81e-06 6.47e-06 1.66e-05 1.8e-05 3.69e-06 2.48e-05 5.11e-06 7.06e-06 3.57e-06 1.8e-05 1.63e-05 1.05e-05 8.65e-07 1.18e-06 3.26e-06 7.8e-06 2.81e-06 1.89e-06 2.07e-06 1.57e-06 1.11e-06 1.01e-06 3.06e-05 2.71e-06 1.92e-07 7.91e-07 1.75e-06 1.93e-06 8.03e-07 4.9e-07
ENSG00000258303 \N 820651 1.31e-06 8.81e-07 1.55e-07 3.81e-07 1.07e-07 3.24e-07 7.44e-07 5.4e-08 3.03e-07 9.35e-08 3.66e-07 1.59e-07 9.44e-07 1.1e-07 5.97e-08 2.23e-07 8.53e-08 3.79e-07 1.13e-07 5.07e-08 1.91e-07 2.7e-07 4e-07 3.68e-08 6.59e-07 2.13e-07 1.78e-07 1.12e-07 4.88e-07 7.39e-07 2.83e-07 3.8e-08 3.35e-08 1.16e-07 1.95e-07 3.57e-08 5.02e-08 9.03e-08 6.62e-08 3.86e-08 4.36e-08 6.15e-07 6.11e-08 1.9e-08 5.59e-08 1.31e-08 8.98e-08 4.09e-09 4.85e-08