logo

Genes within 1Mb (chr12:94598204:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 1.38e-01 0.205 0.137 0.068 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.43e-01 0.124 0.162 0.068 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0671 0.121 0.068 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 9.80e-01 0.00393 0.153 0.068 B L1
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 9.64e-01 0.00633 0.14 0.068 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.10e-01 0.0606 0.0919 0.068 B L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.81e-01 0.0769 0.139 0.068 B L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0391 0.116 0.068 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0744 0.14 0.068 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 4.79e-01 0.0474 0.0669 0.068 B L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 9.00e-02 0.195 0.114 0.068 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 8.51e-01 0.0188 0.0999 0.068 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0598 0.111 0.068 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 6.58e-01 0.0674 0.152 0.068 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0525 0.0977 0.068 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0987 0.16 0.068 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 3.22e-02 0.218 0.101 0.068 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.89e-01 0.043 0.107 0.068 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.99e-01 0.0945 0.14 0.068 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 9.52e-01 0.0057 0.0939 0.068 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 3.28e-01 -0.117 0.119 0.068 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.44e-01 -0.03 0.152 0.068 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 1.98e-02 0.315 0.134 0.068 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.12e-01 0.0848 0.129 0.068 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 4.87e-01 -0.106 0.152 0.068 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.08e-01 0.08 0.121 0.068 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 9.03e-02 0.167 0.0982 0.068 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.54e-01 0.121 0.161 0.072 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 2.65e-01 0.19 0.17 0.072 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.43e-01 -0.247 0.168 0.072 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 3.76e-01 0.145 0.163 0.072 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 6.45e-01 0.0706 0.153 0.072 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 4.97e-01 0.117 0.172 0.072 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.26e-01 0.0299 0.136 0.072 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.63e-01 -0.066 0.151 0.072 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0279 0.152 0.068 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.068 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.75e-01 0.164 0.121 0.068 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 7.78e-01 0.0407 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00856 0.0982 0.068 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 2.04e-01 0.229 0.18 0.068 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.74e-01 -0.159 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.13e-01 0.0654 0.129 0.068 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 3.16e-01 0.0931 0.0926 0.068 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.83e-01 0.133 0.152 0.069 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 5.78e-02 0.272 0.142 0.069 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.30e-01 -0.182 0.12 0.069 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.30e-02 -0.275 0.141 0.069 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.82e-01 0.00258 0.118 0.069 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0294 0.169 0.069 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0872 0.134 0.069 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.67e-01 0.109 0.0984 0.069 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 8.78e-02 -0.287 0.167 0.068 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 2.65e-01 0.16 0.143 0.068 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0281 0.131 0.068 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0369 0.163 0.068 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 6.81e-01 0.0545 0.133 0.068 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 2.45e-01 0.186 0.16 0.068 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 6.59e-01 0.0658 0.149 0.068 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 1.83e-01 0.11 0.0827 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.82e-01 -0.159 0.182 0.074 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0257 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 3.05e-01 0.195 0.189 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.67e-02 -0.346 0.18 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 4.57e-01 -0.103 0.139 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0427 0.147 0.074 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.81e-01 0.0952 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 9.01e-01 0.0227 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.26e-01 0.0627 0.129 0.074 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 1.17e-01 0.252 0.16 0.074 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.68e-01 0.12 0.165 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.51e-01 0.239 0.166 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 3.07e-01 -0.155 0.152 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 1.00e+00 -1.97e-05 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 7.70e-01 0.05 0.171 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 7.74e-01 0.0403 0.14 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.44e-01 0.0328 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 9.66e-01 0.00659 0.153 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 1.88e-01 -0.166 0.126 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 2.75e-01 0.19 0.173 0.069 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0482 0.176 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.74e-01 0.229 0.168 0.069 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0308 0.181 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 3.34e-01 0.156 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.83e-01 -0.119 0.136 0.069 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 4.97e-01 0.121 0.178 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0921 0.159 0.069 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.10e-01 0.0821 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0384 0.129 0.069 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 7.32e-01 0.0563 0.164 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.77e-01 0.224 0.165 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 4.64e-02 -0.277 0.138 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 4.90e-01 0.118 0.17 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 8.42e-01 0.0334 0.168 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.32e-01 0.0881 0.141 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 6.47e-01 0.0811 0.177 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0956 0.145 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 9.91e-01 0.00188 0.159 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 7.31e-01 0.032 0.0928 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.70e-02 0.352 0.176 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0395 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 2.01e-01 0.21 0.164 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 6.53e-01 0.081 0.18 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 5.17e-01 0.107 0.164 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 1.49e-01 0.219 0.151 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.28e-01 0.108 0.171 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0842 0.16 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.134 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 4.90e-02 0.26 0.131 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.28e-01 0.136 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0719 0.18 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0804 0.181 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0838 0.143 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.32e-01 -0.101 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 6.57e-01 0.0727 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 4.42e-01 0.126 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0741 0.148 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 1.64e-01 0.182 0.13 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.54e-01 0.0355 0.113 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0236 0.138 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 7.69e-01 0.0468 0.159 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 1.27e-01 -0.165 0.108 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.10e-01 -0.168 0.165 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.87e-01 0.125 0.117 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 4.74e-01 0.0721 0.1 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0374 0.138 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 9.90e-01 0.00161 0.129 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0741 0.151 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 6.63e-01 0.0765 0.175 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0248 0.129 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 1.93e-01 0.226 0.173 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 3.66e-02 0.286 0.136 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 3.54e-01 0.11 0.118 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.06e-01 0.181 0.176 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 2.81e-01 0.169 0.156 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.13e-01 -0.108 0.164 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 9.20e-01 0.0166 0.165 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.37e-01 0.0871 0.141 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0121 0.174 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.19e-01 0.194 0.158 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.19e-01 -0.176 0.143 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 1.45e-01 0.23 0.157 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.55e-01 -0.104 0.139 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0913 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.12e-01 0.115 0.175 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 3.64e-02 0.35 0.166 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0499 0.143 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 4.10e-01 -0.143 0.174 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 1.34e-01 -0.236 0.157 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 5.90e-01 0.0868 0.161 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 9.90e-01 0.00165 0.126 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 4.62e-01 -0.107 0.145 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00753 0.161 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 1.81e-02 0.343 0.144 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.70e-01 0.0839 0.147 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.05e-01 -0.175 0.17 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 1.46e-01 0.206 0.142 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.20e-02 0.219 0.117 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 6.84e-01 0.072 0.176 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 5.67e-01 -0.078 0.136 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.05e-01 -0.29 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 7.21e-01 0.0643 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 8.88e-01 0.0228 0.162 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0712 0.17 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.54e-01 0.0331 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0317 0.175 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 3.62e-01 0.128 0.14 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0654 0.182 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.71e-01 0.213 0.155 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0195 0.176 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 9.75e-02 0.307 0.184 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 2.54e-01 0.175 0.153 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.28e-01 0.171 0.175 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 1.33e-01 0.278 0.185 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.98e-01 0.0955 0.181 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0797 0.154 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0282 0.173 0.069 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0179 0.147 0.069 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0754 0.168 0.069 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.33e-01 0.102 0.163 0.069 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.23e-01 0.142 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 6.40e-02 0.337 0.181 0.069 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0231 0.164 0.069 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 7.50e-02 0.255 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 5.44e-01 0.106 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 7.53e-01 0.0526 0.167 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0626 0.172 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 4.76e-01 -0.129 0.18 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.74e-01 0.00474 0.148 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.20e-01 0.0409 0.18 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.86e-01 -0.16 0.149 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.31e-01 0.0689 0.143 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.96e-01 0.115 0.169 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.13e-01 0.121 0.147 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.35e-01 -0.229 0.152 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 2.67e-02 -0.344 0.154 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.137 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.56e-01 0.105 0.178 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 1.00e+00 4.07e-05 0.158 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 5.41e-01 0.0676 0.11 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0989 0.189 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 6.15e-02 0.312 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0301 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 9.53e-01 0.011 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.12e-01 -0.153 0.151 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.61e-01 -0.17 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 9.54e-01 0.00995 0.174 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0742 0.157 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 6.70e-01 0.0662 0.155 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.70e-03 0.447 0.156 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0451 0.158 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0303 0.163 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 8.60e-01 0.0249 0.141 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 2.72e-01 -0.173 0.157 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.43e-01 -0.189 0.162 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 5.59e-02 0.216 0.112 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 7.99e-01 0.0597 0.234 0.059 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 2.73e-01 -0.231 0.21 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0172 0.234 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 9.14e-01 0.0241 0.222 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 4.72e-01 0.151 0.209 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.53e-02 0.451 0.212 0.059 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 7.20e-02 -0.356 0.196 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.53e-01 -0.256 0.223 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 3.89e-01 -0.161 0.186 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 5.70e-01 0.0746 0.131 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0696 0.167 0.07 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0696 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.59e-02 -0.254 0.142 0.07 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 3.69e-01 -0.155 0.172 0.07 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 2.50e-01 -0.194 0.169 0.07 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 7.76e-01 0.0471 0.165 0.07 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0975 0.167 0.07 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 5.73e-02 0.198 0.104 0.07 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 9.35e-02 0.283 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 5.23e-01 -0.102 0.159 0.068 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 4.85e-01 -0.118 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 8.36e-02 0.26 0.15 0.068 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 2.19e-01 -0.191 0.155 0.068 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.11e-01 -0.182 0.179 0.068 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 2.32e-01 0.199 0.166 0.068 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.31e-01 -0.153 0.127 0.068 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 1.18e-01 0.25 0.159 0.078 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 3.09e-01 0.176 0.172 0.078 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0532 0.176 0.078 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.89e-01 0.0917 0.169 0.078 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 4.56e-01 0.113 0.151 0.078 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.04e-01 0.0415 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0332 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 4.08e-01 -0.135 0.162 0.078 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 4.02e-01 -0.116 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.92e-01 -0.144 0.168 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 8.08e-02 0.23 0.131 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0542 0.145 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0619 0.153 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.12e-01 0.0129 0.117 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0169 0.173 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 3.76e-01 0.141 0.159 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 5.83e-01 0.0745 0.136 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.21e-01 0.118 0.096 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 8.06e-01 0.042 0.171 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 2.61e-01 0.168 0.149 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 4.00e-03 0.471 0.162 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 5.09e-01 0.107 0.162 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 8.49e-01 0.0233 0.122 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 2.44e-01 0.217 0.186 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0548 0.172 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.89e-01 0.0632 0.158 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 6.61e-01 0.0493 0.112 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 1.76e-01 -0.301 0.222 0.067 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.12e-02 0.429 0.167 0.067 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.15e-01 0.0777 0.212 0.067 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 4.48e-01 0.172 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 3.49e-01 0.202 0.215 0.067 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 2.07e-01 0.266 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0283 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 5.97e-01 0.0969 0.183 0.067 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 8.37e-01 0.0372 0.18 0.071 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.16e-01 0.274 0.174 0.071 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 4.34e-01 -0.144 0.183 0.071 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0633 0.171 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 6.97e-01 0.0574 0.147 0.071 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.79e-01 0.149 0.169 0.071 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 7.67e-02 -0.313 0.176 0.071 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 4.07e-01 0.132 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.20e-01 0.139 0.113 0.071 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.25e-01 0.133 0.166 0.07 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0243 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 8.44e-01 0.0344 0.174 0.07 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 7.44e-01 0.0567 0.173 0.07 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0605 0.11 0.07 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.89e-01 0.0241 0.172 0.07 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.42e-02 -0.297 0.171 0.07 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 5.33e-01 0.102 0.164 0.07 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00278 0.146 0.07 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 4.02e-01 0.143 0.17 0.085 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0248 0.166 0.085 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 2.94e-01 -0.183 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0698 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 6.22e-01 0.0818 0.165 0.085 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0491 0.167 0.085 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.88e-02 0.302 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 5.17e-01 0.0972 0.15 0.085 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 7.17e-01 0.0535 0.148 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.38e-01 0.16 0.166 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.31e-01 0.138 0.176 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 7.34e-01 0.0528 0.155 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 3.45e-01 -0.168 0.178 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 5.67e-01 0.0946 0.165 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.106 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 6.71e-01 0.0771 0.181 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.93e-01 0.0201 0.149 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.28e-01 0.0716 0.148 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 7.46e-01 -0.033 0.102 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 9.73e-02 0.259 0.156 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 3.04e-01 0.163 0.158 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 1.72e-01 -0.178 0.13 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 2.79e-01 0.184 0.17 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -953272 sc-eQTL 6.06e-01 0.0778 0.151 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 2.39e-01 0.152 0.128 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 6.49e-01 0.078 0.171 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 3.44e-01 -0.127 0.134 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0653 0.166 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 1.73e-01 0.125 0.0912 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0995 0.155 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 1.10e-01 0.196 0.122 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 2.15e-01 0.164 0.132 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.76e-01 0.0225 0.144 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 3.26e-01 0.172 0.175 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 8.48e-01 0.0283 0.148 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 6.99e-01 0.0517 0.134 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 3.16e-01 0.0921 0.0916 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 3.68e-01 0.156 0.172 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 7.89e-01 0.043 0.16 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 8.86e-01 0.0228 0.158 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0387 0.177 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0277 0.102 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 5.38e-01 0.114 0.185 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 1.17e-02 -0.425 0.167 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -619278 sc-eQTL 1.69e-01 0.199 0.144 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 3.39e-01 0.111 0.115 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -619542 sc-eQTL 5.10e-01 0.104 0.157 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 sc-eQTL 4.32e-02 0.295 0.145 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -875316 sc-eQTL 2.23e-01 -0.153 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -475424 sc-eQTL 2.81e-02 -0.311 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 449627 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0157 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 920829 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0248 0.176 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 138216 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0524 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -405544 sc-eQTL 2.60e-01 0.116 0.103 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 -52353 eQTL 0.0115 0.0586 0.0231 0.00772 0.00218 0.0844
ENSG00000186076 AC012085.1 956618 eQTL 1.16e-02 -0.157 0.0622 0.00102 0.0 0.0844

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina