logo

Genes within 1Mb (chr12:94592825:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 4.54e-01 0.0935 0.125 0.09 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 7.04e-01 0.0558 0.147 0.09 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.03e-01 -0.14 0.109 0.09 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0477 0.139 0.09 B L1
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 8.84e-01 0.0185 0.127 0.09 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.17e-02 0.19 0.0821 0.09 B L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.14e-01 0.0636 0.126 0.09 B L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 4.72e-01 0.0756 0.105 0.09 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0952 0.127 0.09 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.74e-01 0.0663 0.0604 0.09 B L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 5.48e-01 0.0622 0.104 0.09 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0278 0.0899 0.09 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.27e-01 0.0488 0.1 0.09 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 3.34e-01 0.132 0.137 0.09 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 6.99e-01 -0.034 0.088 0.09 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.98e-01 -0.056 0.144 0.09 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.10e-02 0.233 0.0908 0.09 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 6.20e-01 0.0479 0.0966 0.09 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 6.68e-01 0.0543 0.127 0.09 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 8.22e-01 0.0192 0.0851 0.09 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0574 0.108 0.09 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.98e-01 0.0535 0.138 0.09 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 3.92e-03 0.353 0.121 0.09 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 5.81e-01 0.0648 0.117 0.09 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0616 0.138 0.09 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 9.64e-01 0.00491 0.11 0.09 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.86e-01 0.0956 0.0894 0.09 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 3.97e-01 0.124 0.146 0.095 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 8.96e-01 0.0204 0.155 0.095 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 1.37e-01 -0.228 0.153 0.095 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 3.34e-01 0.144 0.149 0.095 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 3.88e-01 0.12 0.139 0.095 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 4.39e-01 0.122 0.157 0.095 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 6.86e-01 0.0501 0.124 0.095 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0032 0.138 0.095 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.06e-01 -0.119 0.116 0.095 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 9.50e-01 0.00862 0.138 0.09 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 7.19e-01 0.0387 0.108 0.09 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.03e-01 0.0739 0.11 0.09 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.81e-01 0.0541 0.131 0.09 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0511 0.0892 0.09 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 1.80e-01 0.22 0.164 0.09 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.72e-01 -0.18 0.131 0.09 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.117 0.09 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.23e-01 0.13 0.0839 0.09 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.23e-01 0.213 0.138 0.09 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 5.90e-02 0.245 0.129 0.09 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 1.26e-02 -0.271 0.108 0.09 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 2.54e-01 -0.148 0.129 0.09 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0427 0.107 0.09 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 7.68e-01 0.0453 0.153 0.09 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0855 0.121 0.09 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.41e-01 0.132 0.0891 0.09 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.27e-01 -0.23 0.15 0.09 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 5.00e-01 0.087 0.129 0.09 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0309 0.118 0.09 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0649 0.147 0.09 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 4.47e-01 0.0906 0.119 0.09 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 4.20e-01 0.116 0.144 0.09 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.64e-01 0.122 0.134 0.09 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 5.07e-01 0.0495 0.0745 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 4.22e-01 -0.133 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 6.50e-01 0.0644 0.142 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 6.25e-01 0.0848 0.173 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 3.71e-02 -0.345 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 2.34e-01 -0.151 0.126 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 8.59e-01 0.0238 0.134 0.094 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.12e-01 0.0798 0.157 0.094 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 5.54e-01 0.0987 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 4.88e-01 0.0814 0.117 0.094 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.07e-01 0.185 0.146 0.094 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 6.31e-01 0.072 0.15 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 1.61e-01 0.212 0.151 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.88e-01 -0.147 0.138 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0528 0.152 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 4.65e-01 -0.113 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.50e-01 0.147 0.127 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0504 0.152 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 4.14e-01 0.116 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0125 0.139 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.16e-01 -0.142 0.114 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 8.95e-01 0.0209 0.158 0.091 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 2.33e-01 -0.191 0.16 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 3.41e-01 0.146 0.153 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0173 0.165 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 2.83e-01 0.158 0.147 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0278 0.124 0.091 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.10e-01 0.0829 0.162 0.091 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.01e-01 0.0367 0.145 0.091 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.67e-01 0.0061 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0184 0.118 0.091 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 5.94e-01 0.079 0.148 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 2.19e-01 0.184 0.149 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.11e-02 -0.289 0.124 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0216 0.153 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 4.35e-01 0.118 0.151 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.74e-01 0.139 0.127 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.00e-01 0.0837 0.159 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0241 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.34e-01 0.0118 0.144 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.81e-01 0.0904 0.0836 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.51e-01 0.185 0.161 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0702 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 4.46e-01 0.114 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.91e-01 0.213 0.162 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 5.90e-01 0.0802 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 5.82e-02 0.26 0.137 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.12e-01 0.194 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.40e-01 0.0295 0.145 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 2.53e-01 -0.14 0.122 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.51e-02 0.267 0.118 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.43e-01 0.229 0.155 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.64e-01 -0.182 0.163 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0718 0.164 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 5.06e-01 0.0864 0.13 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0996 0.146 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 5.89e-01 0.0801 0.148 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 2.92e-01 0.157 0.149 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0906 0.134 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 5.24e-01 0.075 0.118 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 9.37e-01 0.00809 0.102 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 4.22e-01 0.1 0.124 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 4.65e-01 0.105 0.143 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0951 0.0973 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.31e-01 -0.178 0.148 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.79e-01 0.142 0.105 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.42e-01 0.0181 0.0906 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.58e-01 -0.178 0.125 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0265 0.118 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0111 0.137 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 5.61e-01 0.0931 0.16 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0566 0.117 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.07e-01 0.2 0.158 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.86e-02 0.293 0.124 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.61e-01 0.121 0.108 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 7.51e-01 0.0503 0.159 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 1.76e-01 0.19 0.14 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 3.21e-01 -0.147 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0708 0.148 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.34e-01 0.0431 0.127 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 9.81e-01 0.00376 0.156 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.54e-01 0.132 0.142 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.15e-01 -0.129 0.128 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.15e-01 0.176 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0892 0.125 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0894 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 5.83e-01 0.0866 0.157 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 1.21e-03 0.483 0.147 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0357 0.129 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 3.15e-01 -0.157 0.156 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0896 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.16e-01 0.112 0.111 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.36e-01 0.172 0.145 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00811 0.113 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0846 0.131 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.25e-01 0.0512 0.146 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 2.48e-02 0.294 0.13 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00252 0.133 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.23e-01 -0.187 0.153 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 4.20e-01 0.104 0.128 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.78e-01 0.0937 0.106 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 7.76e-01 0.0456 0.16 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00411 0.124 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.65e-02 -0.359 0.16 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.83e-01 0.218 0.163 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 4.78e-01 -0.104 0.147 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.92e-01 0.0409 0.155 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 3.72e-01 0.146 0.163 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 6.02e-01 0.083 0.159 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 6.65e-01 0.0555 0.128 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0223 0.164 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 6.89e-01 0.0564 0.141 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 8.47e-01 0.0307 0.159 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.54e-01 0.238 0.167 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 3.66e-01 0.126 0.139 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 1.23e-01 0.244 0.157 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.25e-01 0.203 0.167 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.70e-01 -0.147 0.163 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.99e-01 0.0177 0.139 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0231 0.156 0.091 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0102 0.132 0.091 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0727 0.152 0.091 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 8.53e-01 0.0273 0.147 0.091 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.23e-01 0.158 0.129 0.091 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 1.52e-01 0.236 0.164 0.091 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.06e-01 0.0366 0.148 0.091 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.36e-01 0.193 0.129 0.091 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.70e-01 0.218 0.158 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 3.66e-01 0.138 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0219 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.55e-01 0.0515 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 4.01e-01 -0.113 0.135 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 5.77e-01 0.0916 0.164 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 2.97e-01 -0.142 0.136 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 5.10e-01 0.0862 0.131 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.40e-01 0.226 0.153 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.30e-01 0.106 0.133 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 4.09e-03 -0.394 0.136 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.49e-01 -0.204 0.14 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.04e-01 -0.157 0.124 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 5.60e-01 0.0942 0.161 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0458 0.143 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.73e-01 0.11 0.0997 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 3.02e-01 -0.175 0.169 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 1.06e-01 0.243 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 8.62e-01 0.0275 0.158 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.40e-01 0.0126 0.167 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 3.81e-01 -0.119 0.136 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.38e-01 -0.197 0.166 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0212 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.83e-01 0.0207 0.141 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 3.62e-01 0.128 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 7.17e-03 0.385 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0373 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.09e-01 0.017 0.148 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00665 0.128 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0635 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 2.88e-01 -0.156 0.147 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.55e-02 0.176 0.102 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 4.80e-01 0.142 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.59e-01 -0.134 0.18 0.085 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.45e-01 -0.121 0.2 0.085 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 5.86e-01 -0.104 0.19 0.085 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0508 0.179 0.085 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.54e-02 0.41 0.181 0.085 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 1.11e-02 -0.428 0.166 0.085 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 4.87e-01 -0.134 0.192 0.085 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 8.93e-01 0.0216 0.16 0.085 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.44e-01 0.164 0.111 0.085 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 9.34e-01 0.0125 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0613 0.135 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.72e-01 -0.143 0.13 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 5.05e-01 -0.105 0.157 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 1.44e-01 -0.224 0.153 0.089 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 3.74e-01 0.134 0.15 0.089 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 9.45e-01 0.0106 0.152 0.089 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 2.78e-01 0.103 0.0948 0.089 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.43e-01 0.179 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 3.21e-01 -0.143 0.144 0.09 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0469 0.153 0.09 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 1.13e-01 0.217 0.136 0.09 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.24e-01 -0.05 0.141 0.09 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0565 0.163 0.09 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.78e-01 0.203 0.15 0.09 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0585 0.116 0.09 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.92e-01 0.191 0.145 0.102 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 8.81e-01 0.0237 0.158 0.102 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0882 0.16 0.102 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 8.41e-01 0.031 0.154 0.102 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 2.79e-01 0.149 0.137 0.102 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0211 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 9.20e-01 0.0129 0.129 0.102 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0253 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.98e-01 -0.107 0.126 0.102 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 4.39e-01 -0.118 0.152 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.97e-01 0.0815 0.12 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 3.80e-01 -0.116 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0736 0.139 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0341 0.106 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 8.03e-01 0.0392 0.157 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 7.60e-01 0.044 0.144 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 2.30e-01 0.148 0.123 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.87e-02 0.148 0.0867 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.03e-01 0.197 0.154 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0161 0.136 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 1.01e-02 0.383 0.147 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 6.36e-01 0.0699 0.148 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0301 0.111 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.47e-01 0.196 0.169 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 5.48e-01 -0.094 0.156 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 3.14e-01 0.144 0.143 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 3.30e-01 0.0992 0.102 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 3.35e-01 -0.191 0.197 0.088 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 2.47e-02 0.338 0.149 0.088 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 7.62e-01 -0.057 0.188 0.088 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 8.82e-01 0.0299 0.201 0.088 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 9.46e-02 0.318 0.189 0.088 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 7.96e-01 0.0484 0.187 0.088 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 5.17e-01 -0.121 0.186 0.088 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 9.17e-01 0.0169 0.162 0.088 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0682 0.164 0.093 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 1.32e-01 0.238 0.158 0.093 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 4.72e-01 -0.12 0.166 0.093 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0499 0.155 0.093 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 5.14e-01 0.0874 0.134 0.093 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 7.08e-01 0.0578 0.154 0.093 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.15e-01 -0.254 0.16 0.093 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00257 0.145 0.093 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 4.61e-02 0.205 0.102 0.093 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 5.76e-01 0.0841 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0105 0.145 0.093 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0767 0.158 0.093 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.98e-01 0.201 0.156 0.093 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0869 0.0996 0.093 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 3.50e-01 0.145 0.155 0.093 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.43e-01 -0.148 0.156 0.093 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 7.14e-01 0.0545 0.148 0.093 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 9.27e-01 0.0121 0.132 0.093 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.25e-01 0.239 0.155 0.11 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 1.71e-01 -0.207 0.151 0.11 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.01e-01 -0.203 0.158 0.11 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.65e-01 0.00697 0.157 0.11 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 6.56e-01 0.0674 0.151 0.11 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0377 0.153 0.11 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 1.44e-01 0.237 0.161 0.11 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 9.77e-01 0.00393 0.137 0.11 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0888 0.135 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 9.48e-01 0.00991 0.151 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 6.70e-01 0.0683 0.16 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00999 0.141 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.77e-01 -0.218 0.161 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0201 0.15 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 3.29e-01 0.0944 0.0965 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 9.37e-01 0.0129 0.165 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.60e-01 0.123 0.135 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 8.34e-01 0.0282 0.134 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0225 0.0927 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 1.90e-01 0.185 0.141 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.39e-01 0.111 0.143 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 4.99e-02 -0.231 0.117 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 4.36e-01 0.12 0.153 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -958651 sc-eQTL 3.36e-01 0.131 0.136 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 6.63e-02 0.213 0.116 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 4.05e-01 0.129 0.154 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0182 0.121 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0724 0.15 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 5.97e-02 0.155 0.0821 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0114 0.14 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 7.41e-01 0.0369 0.111 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 4.70e-01 0.0869 0.12 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 9.50e-01 0.00821 0.131 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0671 0.0985 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 2.81e-01 0.172 0.159 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0593 0.134 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 2.69e-01 0.134 0.121 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.06e-01 0.135 0.0828 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 6.59e-01 0.0694 0.157 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 7.60e-01 0.0447 0.146 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0685 0.144 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 7.63e-01 0.0487 0.161 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0303 0.093 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 3.02e-01 0.174 0.168 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 3.92e-02 -0.317 0.153 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -624657 sc-eQTL 3.68e-01 0.119 0.132 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -624921 sc-eQTL 2.10e-01 0.178 0.141 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 sc-eQTL 4.24e-02 0.268 0.131 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -880695 sc-eQTL 2.77e-02 -0.249 0.112 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -480803 sc-eQTL 1.27e-01 -0.196 0.128 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 444248 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0246 0.113 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 915450 sc-eQTL 8.03e-01 0.0398 0.159 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 132837 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0716 0.127 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -410923 sc-eQTL 1.36e-01 0.139 0.0927 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 -57732 eQTL 0.0124 0.0532 0.0212 0.00378 0.00102 0.0986
ENSG00000186076 AC012085.1 951239 eQTL 2.52e-02 -0.128 0.0571 0.0 0.0 0.0986

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina