logo

Genes within 1Mb (chr12:94587575:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 1.38e-01 0.205 0.137 0.068 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.43e-01 0.124 0.162 0.068 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0671 0.121 0.068 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 9.80e-01 0.00393 0.153 0.068 B L1
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 9.64e-01 0.00633 0.14 0.068 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.10e-01 0.0606 0.0919 0.068 B L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.81e-01 0.0769 0.139 0.068 B L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0391 0.116 0.068 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0744 0.14 0.068 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 4.79e-01 0.0474 0.0669 0.068 B L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 9.00e-02 0.195 0.114 0.068 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 8.51e-01 0.0188 0.0999 0.068 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0598 0.111 0.068 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 6.58e-01 0.0674 0.152 0.068 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0525 0.0977 0.068 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0987 0.16 0.068 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 3.22e-02 0.218 0.101 0.068 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.89e-01 0.043 0.107 0.068 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.99e-01 0.0945 0.14 0.068 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 9.52e-01 0.0057 0.0939 0.068 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 3.28e-01 -0.117 0.119 0.068 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.44e-01 -0.03 0.152 0.068 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 1.98e-02 0.315 0.134 0.068 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.12e-01 0.0848 0.129 0.068 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 4.87e-01 -0.106 0.152 0.068 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.08e-01 0.08 0.121 0.068 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 9.03e-02 0.167 0.0982 0.068 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.54e-01 0.121 0.161 0.072 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 2.65e-01 0.19 0.17 0.072 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.43e-01 -0.247 0.168 0.072 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 3.76e-01 0.145 0.163 0.072 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 6.45e-01 0.0706 0.153 0.072 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 4.97e-01 0.117 0.172 0.072 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.26e-01 0.0299 0.136 0.072 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.63e-01 -0.066 0.151 0.072 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 4.29e-01 -0.101 0.127 0.072 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0279 0.152 0.068 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.118 0.068 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.75e-01 0.164 0.121 0.068 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 7.78e-01 0.0407 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00856 0.0982 0.068 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 2.04e-01 0.229 0.18 0.068 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.74e-01 -0.159 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.13e-01 0.0654 0.129 0.068 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 3.16e-01 0.0931 0.0926 0.068 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.83e-01 0.133 0.152 0.069 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 5.78e-02 0.272 0.142 0.069 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.30e-01 -0.182 0.12 0.069 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.30e-02 -0.275 0.141 0.069 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.82e-01 0.00258 0.118 0.069 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0294 0.169 0.069 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0872 0.134 0.069 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.67e-01 0.109 0.0984 0.069 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 8.78e-02 -0.287 0.167 0.068 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 2.65e-01 0.16 0.143 0.068 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0281 0.131 0.068 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0369 0.163 0.068 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 6.81e-01 0.0545 0.133 0.068 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 2.45e-01 0.186 0.16 0.068 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 6.59e-01 0.0658 0.149 0.068 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 1.83e-01 0.11 0.0827 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.82e-01 -0.159 0.182 0.074 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0257 0.155 0.074 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 3.05e-01 0.195 0.189 0.074 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.67e-02 -0.346 0.18 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 4.57e-01 -0.103 0.139 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0427 0.147 0.074 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.81e-01 0.0952 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 9.01e-01 0.0227 0.183 0.074 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.26e-01 0.0627 0.129 0.074 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 1.17e-01 0.252 0.16 0.074 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.68e-01 0.12 0.165 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.51e-01 0.239 0.166 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 3.07e-01 -0.155 0.152 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 1.00e+00 -1.97e-05 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 7.70e-01 0.05 0.171 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 7.74e-01 0.0403 0.14 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.44e-01 0.0328 0.167 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 4.26e-01 0.124 0.155 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 9.66e-01 0.00659 0.153 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 1.88e-01 -0.166 0.126 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 2.75e-01 0.19 0.173 0.069 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0482 0.176 0.069 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.74e-01 0.229 0.168 0.069 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0308 0.181 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 3.34e-01 0.156 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.83e-01 -0.119 0.136 0.069 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 4.97e-01 0.121 0.178 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0921 0.159 0.069 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.10e-01 0.0821 0.161 0.069 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0384 0.129 0.069 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 7.32e-01 0.0563 0.164 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.77e-01 0.224 0.165 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 4.64e-02 -0.277 0.138 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 4.90e-01 0.118 0.17 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 8.42e-01 0.0334 0.168 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.32e-01 0.0881 0.141 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 6.47e-01 0.0811 0.177 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0956 0.145 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 9.91e-01 0.00188 0.159 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 7.31e-01 0.032 0.0928 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.70e-02 0.352 0.176 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0395 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 2.01e-01 0.21 0.164 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 6.53e-01 0.081 0.18 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 5.17e-01 0.107 0.164 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 1.49e-01 0.219 0.151 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.28e-01 0.108 0.171 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0842 0.16 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 4.23e-01 -0.108 0.134 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 4.90e-02 0.26 0.131 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.28e-01 0.136 0.172 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0719 0.18 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0804 0.181 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0838 0.143 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.32e-01 -0.101 0.161 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 6.57e-01 0.0727 0.163 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 4.42e-01 0.126 0.164 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0741 0.148 0.073 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 1.64e-01 0.182 0.13 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.54e-01 0.0355 0.113 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0236 0.138 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 7.69e-01 0.0468 0.159 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 1.27e-01 -0.165 0.108 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.10e-01 -0.168 0.165 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.87e-01 0.125 0.117 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 4.74e-01 0.0721 0.1 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0374 0.138 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 9.90e-01 0.00161 0.129 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0741 0.151 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 6.63e-01 0.0765 0.175 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0248 0.129 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 1.93e-01 0.226 0.173 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 3.66e-02 0.286 0.136 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 3.54e-01 0.11 0.118 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.06e-01 0.181 0.176 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 2.81e-01 0.169 0.156 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.13e-01 -0.108 0.164 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 9.20e-01 0.0166 0.165 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.37e-01 0.0871 0.141 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0121 0.174 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.19e-01 0.194 0.158 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.19e-01 -0.176 0.143 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 1.45e-01 0.23 0.157 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.55e-01 -0.104 0.139 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0913 0.158 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.12e-01 0.115 0.175 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 3.64e-02 0.35 0.166 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0499 0.143 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 4.10e-01 -0.143 0.174 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 1.34e-01 -0.236 0.157 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 1.00e-01 0.203 0.123 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 5.90e-01 0.0868 0.161 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 9.90e-01 0.00165 0.126 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 4.62e-01 -0.107 0.145 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00753 0.161 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 1.81e-02 0.343 0.144 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.70e-01 0.0839 0.147 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.05e-01 -0.175 0.17 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 1.46e-01 0.206 0.142 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.20e-02 0.219 0.117 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 6.84e-01 0.072 0.176 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 5.67e-01 -0.078 0.136 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.05e-01 -0.29 0.178 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 7.21e-01 0.0643 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 8.88e-01 0.0228 0.162 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0712 0.17 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.54e-01 0.0331 0.18 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0317 0.175 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 3.62e-01 0.128 0.14 0.069 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0654 0.182 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.71e-01 0.213 0.155 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0195 0.176 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 9.75e-02 0.307 0.184 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 2.54e-01 0.175 0.153 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.28e-01 0.171 0.175 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 1.33e-01 0.278 0.185 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.98e-01 0.0955 0.181 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0797 0.154 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0282 0.173 0.069 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0179 0.147 0.069 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0754 0.168 0.069 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.33e-01 0.102 0.163 0.069 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.23e-01 0.142 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 6.40e-02 0.337 0.181 0.069 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0231 0.164 0.069 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 7.50e-02 0.255 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 5.44e-01 0.106 0.174 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 7.53e-01 0.0526 0.167 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0626 0.172 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 4.76e-01 -0.129 0.18 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.74e-01 0.00474 0.148 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.20e-01 0.0409 0.18 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.86e-01 -0.16 0.149 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.31e-01 0.0689 0.143 0.071 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.96e-01 0.115 0.169 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.13e-01 0.121 0.147 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.35e-01 -0.229 0.152 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 2.67e-02 -0.344 0.154 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 2.82e-01 -0.147 0.137 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.56e-01 0.105 0.178 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 1.00e+00 4.07e-05 0.158 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 5.41e-01 0.0676 0.11 0.069 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0989 0.189 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 6.15e-02 0.312 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0301 0.176 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 9.53e-01 0.011 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.12e-01 -0.153 0.151 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.61e-01 -0.17 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 9.54e-01 0.00995 0.174 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0742 0.157 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 6.70e-01 0.0662 0.155 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.70e-03 0.447 0.156 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0451 0.158 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0303 0.163 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 8.60e-01 0.0249 0.141 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 2.72e-01 -0.173 0.157 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.43e-01 -0.189 0.162 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 5.59e-02 0.216 0.112 0.069 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 7.99e-01 0.0597 0.234 0.059 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 2.73e-01 -0.231 0.21 0.059 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0172 0.234 0.059 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 9.14e-01 0.0241 0.222 0.059 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 4.72e-01 0.151 0.209 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.53e-02 0.451 0.212 0.059 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 7.20e-02 -0.356 0.196 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.53e-01 -0.256 0.223 0.059 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 3.89e-01 -0.161 0.186 0.059 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 5.70e-01 0.0746 0.131 0.059 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0696 0.167 0.07 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0696 0.149 0.07 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.59e-02 -0.254 0.142 0.07 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 3.69e-01 -0.155 0.172 0.07 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 2.50e-01 -0.194 0.169 0.07 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 7.76e-01 0.0471 0.165 0.07 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0975 0.167 0.07 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 5.73e-02 0.198 0.104 0.07 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 9.35e-02 0.283 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 5.23e-01 -0.102 0.159 0.068 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 4.85e-01 -0.118 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 8.36e-02 0.26 0.15 0.068 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 2.19e-01 -0.191 0.155 0.068 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.11e-01 -0.182 0.179 0.068 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 2.32e-01 0.199 0.166 0.068 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.31e-01 -0.153 0.127 0.068 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 1.18e-01 0.25 0.159 0.078 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 3.09e-01 0.176 0.172 0.078 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0532 0.176 0.078 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.89e-01 0.0917 0.169 0.078 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 4.56e-01 0.113 0.151 0.078 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.04e-01 0.0415 0.167 0.078 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0332 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 4.08e-01 -0.135 0.162 0.078 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 4.02e-01 -0.116 0.138 0.078 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.92e-01 -0.144 0.168 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 8.08e-02 0.23 0.131 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0542 0.145 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0619 0.153 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.12e-01 0.0129 0.117 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0169 0.173 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 3.76e-01 0.141 0.159 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 5.83e-01 0.0745 0.136 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.21e-01 0.118 0.096 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 8.06e-01 0.042 0.171 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 2.61e-01 0.168 0.149 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 4.00e-03 0.471 0.162 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 5.09e-01 0.107 0.162 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 8.49e-01 0.0233 0.122 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 2.44e-01 0.217 0.186 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0548 0.172 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.89e-01 0.0632 0.158 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 6.61e-01 0.0493 0.112 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 1.76e-01 -0.301 0.222 0.067 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.12e-02 0.429 0.167 0.067 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.15e-01 0.0777 0.212 0.067 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 4.48e-01 0.172 0.226 0.067 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 3.49e-01 0.202 0.215 0.067 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 2.07e-01 0.266 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0283 0.21 0.067 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 5.97e-01 0.0969 0.183 0.067 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 8.37e-01 0.0372 0.18 0.071 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.16e-01 0.274 0.174 0.071 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 4.34e-01 -0.144 0.183 0.071 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0633 0.171 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 6.97e-01 0.0574 0.147 0.071 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.79e-01 0.149 0.169 0.071 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 7.67e-02 -0.313 0.176 0.071 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 4.07e-01 0.132 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.20e-01 0.139 0.113 0.071 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.25e-01 0.133 0.166 0.07 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0243 0.16 0.07 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 8.44e-01 0.0344 0.174 0.07 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 7.44e-01 0.0567 0.173 0.07 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0605 0.11 0.07 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.89e-01 0.0241 0.172 0.07 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.42e-02 -0.297 0.171 0.07 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 5.33e-01 0.102 0.164 0.07 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00278 0.146 0.07 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 4.02e-01 0.143 0.17 0.085 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0248 0.166 0.085 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 2.94e-01 -0.183 0.174 0.085 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0698 0.172 0.085 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 6.22e-01 0.0818 0.165 0.085 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0491 0.167 0.085 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.88e-02 0.302 0.176 0.085 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 5.17e-01 0.0972 0.15 0.085 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 7.17e-01 0.0535 0.148 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.38e-01 0.16 0.166 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.31e-01 0.138 0.176 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 7.34e-01 0.0528 0.155 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 3.45e-01 -0.168 0.178 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 5.67e-01 0.0946 0.165 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0187 0.106 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 6.71e-01 0.0771 0.181 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.93e-01 0.0201 0.149 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.28e-01 0.0716 0.148 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 7.46e-01 -0.033 0.102 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 9.73e-02 0.259 0.156 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 3.04e-01 0.163 0.158 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 1.72e-01 -0.178 0.13 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 2.79e-01 0.184 0.17 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -963901 sc-eQTL 6.06e-01 0.0778 0.151 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 2.39e-01 0.152 0.128 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 6.49e-01 0.078 0.171 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 3.44e-01 -0.127 0.134 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0653 0.166 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 1.73e-01 0.125 0.0912 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0995 0.155 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 1.10e-01 0.196 0.122 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 2.15e-01 0.164 0.132 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.76e-01 0.0225 0.144 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0107 0.109 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 3.26e-01 0.172 0.175 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 8.48e-01 0.0283 0.148 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 6.99e-01 0.0517 0.134 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 3.16e-01 0.0921 0.0916 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 3.68e-01 0.156 0.172 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 7.89e-01 0.043 0.16 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 8.86e-01 0.0228 0.158 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0387 0.177 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0277 0.102 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 5.38e-01 0.114 0.185 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 1.17e-02 -0.425 0.167 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -629907 sc-eQTL 1.69e-01 0.199 0.144 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 3.39e-01 0.111 0.115 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -630171 sc-eQTL 5.10e-01 0.104 0.157 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 sc-eQTL 4.32e-02 0.295 0.145 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -885945 sc-eQTL 2.23e-01 -0.153 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -486053 sc-eQTL 2.81e-02 -0.311 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 438998 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0157 0.125 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 910200 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0248 0.176 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 127587 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0524 0.14 0.069 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -416173 sc-eQTL 2.60e-01 0.116 0.103 0.069 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 -62982 eQTL 0.014 0.0586 0.0238 0.0127 0.00363 0.081
ENSG00000186076 AC012085.1 945989 eQTL 7.85e-03 -0.171 0.064 0.0013 0.0 0.081

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina