logo

Genes within 1Mb (chr12:94577145:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0179 0.108 0.13 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0157 0.127 0.13 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 6.20e-01 0.0472 0.0951 0.13 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.81e-01 0.0665 0.12 0.13 B L1
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00728 0.11 0.13 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 4.28e-01 0.0572 0.0719 0.13 B L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 5.89e-01 0.0589 0.109 0.13 B L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0759 0.0908 0.13 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 9.66e-04 -0.359 0.107 0.13 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0248 0.0524 0.13 B L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0801 0.089 0.13 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.26e-01 0.0617 0.0773 0.13 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00133 0.0862 0.13 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 1.49e-01 0.17 0.117 0.13 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0275 0.0758 0.13 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 5.05e-02 0.242 0.123 0.13 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0425 0.0793 0.13 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.72e-01 0.0134 0.0832 0.13 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0728 0.107 0.13 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0931 0.0718 0.13 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0279 0.0917 0.13 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 1.19e-01 0.182 0.116 0.13 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.13 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0398 0.0993 0.13 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.26e-01 -0.115 0.117 0.13 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0949 0.0925 0.13 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 5.10e-01 0.0501 0.0758 0.13 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0542 0.124 0.133 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0468 0.131 0.133 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.50e-01 -0.187 0.129 0.133 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0302 0.126 0.133 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000695 0.117 0.133 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00703 0.132 0.133 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.37e-01 -0.155 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0147 0.116 0.133 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.52e-01 0.0182 0.0979 0.133 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0349 0.117 0.13 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 4.47e-01 0.069 0.0907 0.13 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0933 0.0929 0.13 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 3.08e-01 0.113 0.111 0.13 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00598 0.0754 0.13 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 8.26e-01 0.0305 0.139 0.13 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0162 0.111 0.13 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 4.08e-01 -0.082 0.099 0.13 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 9.97e-01 0.000237 0.0713 0.13 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.82e-01 0.00269 0.118 0.131 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.93e-01 0.144 0.111 0.131 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 9.04e-02 -0.157 0.0926 0.131 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0295 0.11 0.131 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 1.74e-01 -0.124 0.0905 0.131 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 2.10e-01 0.164 0.13 0.131 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.46e-01 0.15 0.103 0.131 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 1.85e-01 0.101 0.0759 0.131 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.62e-01 0.0226 0.129 0.13 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.59e-01 0.155 0.11 0.13 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.87e-01 0.133 0.1 0.13 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0827 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0962 0.102 0.13 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.98e-01 -0.104 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0624 0.115 0.13 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 7.14e-01 0.0234 0.0638 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 2.58e-01 0.167 0.147 0.122 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 8.09e-01 0.0304 0.126 0.122 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 9.78e-02 0.254 0.152 0.122 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 3.40e-01 -0.141 0.147 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0288 0.112 0.122 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.76e-01 0.129 0.118 0.122 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0556 0.139 0.122 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 3.80e-01 0.13 0.147 0.122 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.84e-01 -0.138 0.104 0.122 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.65e-01 0.0564 0.13 0.122 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0914 0.125 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.18e-01 -0.127 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 5.16e-01 0.0753 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 4.43e-01 0.0974 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0553 0.13 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.65e-01 0.0616 0.107 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.58e-01 -0.117 0.127 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00699 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0595 0.116 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.86e-01 0.0139 0.0962 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 1.84e-01 0.176 0.132 0.131 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0767 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 6.06e-01 0.0662 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0292 0.138 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 2.70e-01 -0.135 0.122 0.131 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 3.39e-01 0.0992 0.104 0.131 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 1.89e-01 0.178 0.135 0.131 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 2.92e-01 -0.127 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.68e-02 -0.29 0.12 0.131 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 4.87e-01 0.0684 0.0982 0.131 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0182 0.126 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 4.45e-01 0.0973 0.127 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.03e-01 0.0896 0.107 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 8.07e-01 -0.032 0.131 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 5.68e-01 0.0736 0.129 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.14e-01 0.0117 0.108 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.00e-01 -0.141 0.135 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0886 0.112 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0675 0.122 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0415 0.0713 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 6.88e-01 0.0552 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0661 0.125 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0772 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 4.35e-01 0.108 0.139 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 9.93e-01 0.00114 0.127 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0681 0.117 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 4.72e-01 0.0951 0.132 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0129 0.124 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.48e-01 0.15 0.103 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0397 0.102 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.49e-01 0.00862 0.133 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.35e-01 -0.208 0.139 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 3.53e-01 -0.13 0.14 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 4.41e-02 0.223 0.11 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 1.32e-01 0.188 0.124 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 2.95e-01 0.133 0.126 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.79e-01 0.0194 0.128 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 5.27e-02 0.222 0.114 0.13 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 1.89e-01 -0.133 0.101 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 2.38e-01 0.104 0.0876 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0305 0.107 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 1.96e-01 0.16 0.123 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 7.38e-01 0.0282 0.0841 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 8.22e-02 0.223 0.128 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0166 0.091 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.79e-01 0.0324 0.0781 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0398 0.107 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 9.78e-01 0.00278 0.1 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0536 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 2.37e-01 0.161 0.135 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.63e-01 -0.112 0.0996 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0478 0.135 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0541 0.106 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0188 0.0918 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.84e-01 0.02 0.137 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 6.39e-01 0.057 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 1.71e-01 0.174 0.127 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 5.22e-01 0.0821 0.128 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.65e-01 -0.122 0.109 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 2.20e-01 0.165 0.134 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 3.74e-01 -0.109 0.123 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0254 0.111 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 2.31e-01 -0.148 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 2.23e-01 -0.133 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0903 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00459 0.137 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 8.50e-02 0.225 0.13 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 7.66e-01 0.0333 0.112 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 9.94e-01 0.00106 0.136 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 2.12e-01 -0.154 0.123 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 4.48e-01 0.0734 0.0966 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.33e-02 0.222 0.123 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0994 0.0967 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 6.81e-01 0.0462 0.112 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.18e-01 0.0451 0.125 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0289 0.112 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0709 0.114 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.65e-01 -0.057 0.132 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 7.83e-01 0.0302 0.11 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0224 0.0909 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.05e-01 0.0166 0.138 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0436 0.106 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 5.99e-01 0.0736 0.14 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0657 0.141 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 3.43e-02 -0.266 0.125 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 4.37e-01 0.104 0.133 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 7.96e-01 0.0364 0.141 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.06e-01 -0.114 0.136 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 1.60e-01 0.154 0.109 0.13 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 3.96e-02 -0.281 0.136 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.76e-01 -0.104 0.118 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0223 0.133 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.38e-02 0.269 0.139 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0167 0.116 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.49e-01 0.0793 0.132 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 2.03e-01 -0.179 0.14 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0848 0.137 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 9.57e-01 0.00636 0.117 0.135 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00664 0.133 0.132 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 5.12e-01 0.0736 0.112 0.132 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 8.15e-01 0.0302 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 3.22e-01 -0.124 0.125 0.132 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 3.60e-01 -0.101 0.11 0.132 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 1.66e-01 -0.193 0.139 0.132 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.93e-01 -0.164 0.125 0.132 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0348 0.11 0.132 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.84e-01 0.0199 0.136 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 5.89e-01 0.0704 0.13 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 3.85e-01 -0.116 0.134 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 4.87e-01 0.0979 0.14 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.79e-01 -0.125 0.115 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 4.99e-01 0.0946 0.14 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.65e-01 0.0199 0.117 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0637 0.112 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.78e-01 0.0203 0.132 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 2.75e-01 0.126 0.115 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.41e-01 -0.092 0.119 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.82e-01 -0.067 0.122 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0653 0.107 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.45e-01 0.132 0.139 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.12e-01 0.196 0.123 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 2.68e-01 0.0955 0.0859 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0485 0.144 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 2.60e-01 0.144 0.127 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0418 0.134 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.68e-01 0.0809 0.141 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.13e-01 0.144 0.115 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 7.13e-01 0.0522 0.142 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 2.65e-01 -0.148 0.132 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 3.48e-01 0.112 0.119 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 5.79e-01 0.0668 0.12 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 7.04e-01 0.047 0.123 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.79e-02 -0.215 0.121 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0953 0.126 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.93e-01 -0.115 0.109 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.15e-01 0.123 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 5.95e-01 0.0669 0.126 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 7.39e-02 0.156 0.087 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00904 0.162 0.133 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 2.07e-02 0.335 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.65e-01 0.225 0.161 0.133 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.94e-01 0.0821 0.154 0.133 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 2.49e-01 -0.167 0.144 0.133 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0139 0.15 0.133 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.17e-02 0.256 0.136 0.133 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 2.59e-01 -0.176 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.00e-01 -0.212 0.128 0.133 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0692 0.0907 0.133 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 2.91e-01 0.141 0.133 0.128 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.35e-01 0.178 0.118 0.128 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 8.82e-01 0.017 0.115 0.128 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 9.39e-03 -0.357 0.136 0.128 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.30e-01 0.162 0.135 0.128 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 3.37e-01 0.127 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 3.97e-01 -0.114 0.134 0.128 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.95e-01 0.0111 0.0837 0.128 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 6.88e-01 0.0523 0.13 0.13 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.57e-01 -0.174 0.122 0.13 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 2.07e-01 -0.164 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 5.99e-01 0.0612 0.116 0.13 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0126 0.12 0.13 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 8.24e-02 0.24 0.137 0.13 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0255 0.128 0.13 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 3.01e-01 -0.102 0.098 0.13 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.11e-01 0.0466 0.126 0.137 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0389 0.136 0.137 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0457 0.138 0.137 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0407 0.133 0.137 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 6.91e-01 0.0472 0.118 0.137 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0834 0.131 0.137 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0182 0.111 0.137 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 2.31e-01 -0.153 0.127 0.137 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0155 0.109 0.137 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 4.61e-01 0.0943 0.128 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 8.37e-01 0.0207 0.1 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0783 0.11 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0643 0.116 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0599 0.0885 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0326 0.132 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.68e-01 0.0876 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 8.17e-01 0.0239 0.103 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 5.97e-01 0.0387 0.0731 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0973 0.13 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.01e-01 0.118 0.114 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 9.59e-01 0.00646 0.126 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 2.84e-01 0.133 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 1.51e-01 0.134 0.0926 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.46e-01 0.0655 0.142 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.23e-01 -0.202 0.131 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0433 0.12 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0798 0.0855 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.47e-02 0.271 0.151 0.142 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.99e-01 0.0988 0.117 0.142 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.28e-01 0.0506 0.145 0.142 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 8.78e-02 -0.264 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 4.50e-01 0.111 0.147 0.142 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0719 0.145 0.142 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0242 0.144 0.142 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0338 0.125 0.142 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.22e-01 0.0134 0.138 0.133 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 3.84e-01 0.116 0.133 0.133 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 3.06e-03 -0.411 0.137 0.133 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.47e-01 0.0422 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0713 0.112 0.133 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 6.29e-01 0.0627 0.13 0.133 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.86e-01 0.0945 0.135 0.133 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 8.46e-02 -0.209 0.121 0.133 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 3.74e-01 0.0774 0.0868 0.133 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 7.33e-01 -0.044 0.129 0.131 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.73e-02 0.295 0.123 0.131 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0386 0.135 0.131 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.75e-02 0.237 0.134 0.131 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0694 0.0856 0.131 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 5.97e-01 0.0707 0.133 0.131 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 5.09e-01 0.0886 0.134 0.131 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.75e-01 -0.173 0.127 0.131 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0534 0.113 0.131 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 2.81e-01 -0.149 0.137 0.141 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0692 0.134 0.141 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 2.43e-01 -0.164 0.14 0.141 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 2.95e-01 -0.146 0.139 0.141 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 7.62e-02 -0.236 0.132 0.141 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0137 0.135 0.141 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.11e-01 0.0345 0.144 0.141 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.31e-01 0.183 0.12 0.141 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.09e-01 0.0289 0.119 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.33e-01 0.0271 0.128 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.25e-01 -0.207 0.134 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 4.97e-01 0.081 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.81e-01 0.0382 0.137 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 2.15e-01 -0.157 0.126 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 4.86e-01 0.057 0.0817 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 9.25e-01 0.0131 0.139 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0486 0.114 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 1.23e-02 -0.283 0.112 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.08e-01 0.0403 0.0784 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00556 0.121 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 8.55e-01 0.0225 0.122 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 8.30e-01 0.0217 0.101 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.13e-01 0.0483 0.131 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -974331 sc-eQTL 4.96e-01 0.0793 0.116 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0993 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 4.31e-01 -0.104 0.132 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 2.94e-01 -0.109 0.103 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00589 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 6.20e-01 -0.035 0.0706 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0248 0.118 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 8.70e-01 0.0153 0.0937 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0646 0.101 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 6.99e-01 0.0425 0.11 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00817 0.0831 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0121 0.134 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0201 0.113 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0172 0.102 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 8.90e-01 0.00976 0.0702 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0196 0.134 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.55e-02 0.299 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 5.65e-02 -0.233 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 1.99e-01 0.176 0.137 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0318 0.0793 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 4.11e-01 0.118 0.143 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 4.39e-01 0.102 0.132 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -640337 sc-eQTL 7.88e-02 -0.197 0.112 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 7.92e-01 0.0236 0.0897 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -640601 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00747 0.121 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -73412 sc-eQTL 1.85e-01 0.15 0.113 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -896375 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0964 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -496483 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0309 0.11 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 428568 sc-eQTL 2.50e-01 -0.111 0.096 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 899770 sc-eQTL 4.00e-01 0.115 0.136 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 117157 sc-eQTL 1.66e-01 0.15 0.108 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -426603 sc-eQTL 1.34e-01 0.119 0.0792 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -896375 pQTL 0.00361 -0.0515 0.0177 0.00202 0.00114 0.129

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina