logo

Genes within 1Mb (chr12:94575177:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00396 0.104 0.139 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0273 0.122 0.139 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.38e-01 0.108 0.0913 0.139 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.58e-01 0.0678 0.116 0.139 B L1
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 8.09e-01 0.0256 0.106 0.139 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 7.75e-01 0.0198 0.0693 0.139 B L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.38e-01 0.0647 0.105 0.139 B L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0602 0.0874 0.139 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 4.07e-03 -0.301 0.104 0.139 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.07e-01 0.00591 0.0505 0.139 B L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0632 0.0855 0.139 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 3.18e-01 0.0742 0.0741 0.139 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 8.37e-01 0.017 0.0827 0.139 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 2.10e-01 0.142 0.113 0.139 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0431 0.0727 0.139 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 1.00e-01 0.195 0.118 0.139 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.31e-01 -0.074 0.076 0.139 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 6.03e-01 0.0415 0.0798 0.139 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0111 0.103 0.139 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0837 0.0687 0.139 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0256 0.0878 0.139 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 4.68e-01 0.0812 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0118 0.1 0.139 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0405 0.095 0.139 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0549 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.50e-01 -0.127 0.0883 0.139 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.37e-01 0.0698 0.0725 0.139 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.35e-01 0.00963 0.119 0.142 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0171 0.126 0.142 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 9.63e-02 -0.207 0.124 0.142 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0152 0.121 0.142 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0437 0.113 0.142 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.57e-01 0.00691 0.127 0.142 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 9.08e-02 -0.169 0.0996 0.142 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 8.26e-01 0.0246 0.112 0.142 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 5.94e-01 0.0502 0.0939 0.142 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0182 0.112 0.139 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.38e-01 0.0538 0.0871 0.139 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 6.23e-01 -0.044 0.0893 0.139 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.23e-01 0.068 0.106 0.139 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0191 0.0723 0.139 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00288 0.133 0.139 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 7.94e-01 0.028 0.107 0.139 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 2.87e-01 -0.101 0.0949 0.139 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00523 0.0684 0.139 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0242 0.114 0.139 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 3.96e-01 0.0912 0.107 0.139 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.20e-01 -0.111 0.0898 0.139 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.81e-01 0.00256 0.107 0.139 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0992 0.0877 0.139 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 2.59e-01 0.143 0.126 0.139 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.17e-01 0.157 0.0994 0.139 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 2.42e-01 0.0863 0.0735 0.139 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.24e-01 0.0119 0.124 0.139 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 1.05e-01 0.171 0.105 0.139 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.41e-01 0.142 0.0959 0.139 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0402 0.12 0.139 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.50e-01 -0.112 0.0973 0.139 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0617 0.118 0.139 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.37e-01 -0.106 0.11 0.139 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 5.99e-01 0.0321 0.0611 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 1.99e-01 0.18 0.139 0.133 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0796 0.119 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.62e-01 0.204 0.145 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 2.34e-01 -0.167 0.139 0.133 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0198 0.107 0.133 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 1.08e-01 0.181 0.112 0.133 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0868 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 4.02e-01 0.118 0.14 0.133 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 6.74e-02 -0.18 0.098 0.133 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 8.11e-01 0.0297 0.124 0.133 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0875 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 2.63e-01 -0.138 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.13e-01 0.14 0.112 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 7.38e-01 0.0414 0.124 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 8.37e-01 -0.026 0.127 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 9.00e-01 0.0131 0.104 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0947 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 7.55e-01 -0.036 0.115 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0355 0.113 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 6.02e-01 0.0489 0.0935 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 3.25e-01 0.126 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.95e-01 -0.069 0.13 0.138 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 4.73e-01 0.089 0.124 0.138 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 4.20e-01 -0.108 0.133 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0855 0.119 0.138 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 1.83e-01 0.134 0.1 0.138 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.66e-01 0.119 0.131 0.138 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0733 0.117 0.138 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 4.21e-02 -0.239 0.117 0.138 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 2.01e-01 0.121 0.0947 0.138 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0483 0.122 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 4.19e-01 0.1 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.78e-01 0.14 0.104 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.37e-01 0.01 0.127 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 4.22e-01 0.101 0.125 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0598 0.105 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.21e-01 -0.131 0.132 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0725 0.109 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0836 0.119 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0059 0.0694 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 5.02e-01 0.0889 0.132 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0875 0.121 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0398 0.122 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.79e-01 0.0744 0.134 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00426 0.122 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 3.19e-01 -0.113 0.113 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.52e-01 0.0759 0.128 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000597 0.12 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 1.27e-01 0.153 0.0997 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 8.03e-01 0.0247 0.0985 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 8.54e-01 0.0238 0.129 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.45e-01 -0.196 0.134 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0995 0.135 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 3.10e-02 0.23 0.106 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 6.01e-02 0.226 0.119 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.75e-01 0.108 0.122 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.91e-01 0.0169 0.123 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.46e-02 0.233 0.11 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0997 0.0972 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.89e-01 0.111 0.0841 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.81e-01 0.00246 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 4.54e-01 0.0889 0.119 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 9.03e-01 0.0099 0.0808 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.74e-02 0.204 0.123 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0538 0.0873 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 5.31e-01 0.047 0.075 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0481 0.103 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 8.69e-01 0.0159 0.0966 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0684 0.112 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 8.52e-02 0.225 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0643 0.0962 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0658 0.13 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 4.03e-01 -0.086 0.102 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.80e-01 0.00222 0.0884 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0801 0.131 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 4.01e-01 0.0979 0.116 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.33e-01 0.184 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 7.05e-01 0.0466 0.123 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 6.18e-02 -0.196 0.104 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.82e-01 0.113 0.129 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0892 0.118 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.12e-01 0.0118 0.107 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0845 0.119 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.17e-01 -0.068 0.105 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0386 0.119 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00592 0.132 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 3.18e-01 0.126 0.126 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0363 0.108 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0343 0.131 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.39e-01 -0.175 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.30e-01 0.091 0.0931 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 4.47e-02 0.239 0.118 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 2.69e-01 -0.103 0.0929 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 3.90e-01 0.0929 0.108 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 8.03e-01 0.0299 0.12 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0429 0.108 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0417 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.87e-01 -0.002 0.127 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 9.18e-01 0.0109 0.106 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0304 0.0874 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0036 0.132 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0185 0.102 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 6.31e-01 0.0645 0.134 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0974 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 1.61e-02 -0.29 0.119 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 3.57e-01 0.118 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.99e-01 0.071 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 2.98e-01 -0.136 0.131 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 1.24e-01 0.162 0.105 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 2.47e-02 -0.301 0.133 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 4.07e-01 -0.096 0.116 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 3.85e-01 -0.114 0.131 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.65e-01 0.191 0.137 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0271 0.114 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.53e-01 0.0771 0.13 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 1.11e-01 -0.219 0.137 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0271 0.134 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 8.82e-01 0.0171 0.115 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0746 0.128 0.141 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 3.18e-01 0.108 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 3.43e-01 0.118 0.124 0.141 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0376 0.121 0.141 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 1.92e-01 -0.139 0.106 0.141 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 2.06e-01 -0.171 0.135 0.141 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.88e-01 -0.16 0.121 0.141 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00135 0.107 0.141 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 7.86e-01 0.0355 0.131 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0119 0.125 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 4.13e-01 -0.105 0.128 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.26e-01 0.0857 0.135 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.13e-01 -0.138 0.11 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.61e-01 0.0783 0.134 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 4.45e-01 0.0857 0.112 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0284 0.107 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0531 0.128 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 3.54e-01 0.103 0.111 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0626 0.115 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0423 0.118 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0209 0.103 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.95e-01 0.115 0.134 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.46e-02 0.205 0.119 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.93e-01 0.0712 0.0831 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0446 0.139 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 2.45e-01 0.143 0.123 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0366 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 3.11e-01 0.139 0.136 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 6.62e-02 0.205 0.111 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 7.10e-01 -0.051 0.137 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 2.96e-01 -0.134 0.128 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 1.85e-01 0.153 0.115 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 4.67e-01 0.0849 0.116 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 9.86e-01 0.00209 0.12 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.67e-01 -0.131 0.118 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0366 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.69e-01 -0.117 0.106 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.03e-01 0.122 0.118 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 7.56e-01 0.0378 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.0844 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 7.85e-01 0.0419 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 3.13e-02 0.296 0.136 0.141 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 9.57e-02 0.255 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 2.69e-01 0.161 0.145 0.141 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 4.59e-01 -0.102 0.137 0.141 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00755 0.142 0.141 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 8.79e-02 0.222 0.129 0.141 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.14e-01 -0.148 0.147 0.141 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 1.99e-01 -0.157 0.122 0.141 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0314 0.0861 0.141 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 2.70e-01 0.14 0.127 0.137 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 8.62e-02 0.194 0.113 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 6.47e-01 0.0501 0.109 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.53e-02 -0.318 0.13 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 3.88e-01 0.111 0.129 0.137 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 1.95e-01 0.163 0.125 0.137 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.23e-01 -0.126 0.127 0.137 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.44e-01 0.0261 0.0798 0.137 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 5.79e-01 0.0695 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.78e-01 -0.128 0.118 0.139 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 2.93e-01 -0.131 0.125 0.139 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 4.14e-01 0.0915 0.112 0.139 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0776 0.115 0.139 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 1.49e-01 0.192 0.132 0.139 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0164 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 2.28e-01 -0.114 0.0943 0.139 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 2.72e-01 0.133 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0496 0.131 0.146 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0667 0.133 0.146 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0312 0.128 0.146 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 9.78e-01 0.00318 0.114 0.146 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 6.75e-01 -0.053 0.126 0.146 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0554 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0866 0.123 0.146 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00362 0.105 0.146 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 3.61e-01 0.112 0.123 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 7.57e-01 0.0299 0.0967 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00712 0.106 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0657 0.112 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0937 0.085 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0975 0.127 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 5.80e-01 0.0644 0.116 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0359 0.0991 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 5.09e-01 0.0465 0.0703 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 3.33e-01 -0.121 0.125 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.50e-01 0.0657 0.11 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 8.68e-01 0.0201 0.121 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 6.25e-01 0.0585 0.119 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 1.09e-01 0.143 0.089 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 7.16e-01 0.0499 0.137 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.18e-01 -0.126 0.126 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0304 0.116 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0852 0.0823 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.83e-02 0.245 0.147 0.155 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 4.30e-01 0.0897 0.113 0.155 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 6.50e-01 0.064 0.141 0.155 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.23e-01 -0.232 0.15 0.155 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 3.76e-01 0.127 0.143 0.155 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0778 0.14 0.155 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 7.00e-01 -0.054 0.14 0.155 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0047 0.122 0.155 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 6.28e-01 0.0642 0.132 0.142 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 6.49e-01 0.0585 0.128 0.142 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 1.22e-02 -0.335 0.133 0.142 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0112 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 3.07e-01 -0.111 0.108 0.142 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.58e-01 0.00652 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.68e-01 0.18 0.13 0.142 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 1.18e-01 -0.183 0.116 0.142 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 2.95e-01 0.0875 0.0834 0.142 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0792 0.123 0.14 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 6.93e-03 0.318 0.116 0.14 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 9.17e-01 0.0135 0.129 0.14 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.73e-02 0.303 0.126 0.14 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0655 0.0816 0.14 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 2.58e-01 0.144 0.127 0.14 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.86e-01 0.169 0.127 0.14 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 1.76e-01 -0.164 0.121 0.14 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0393 0.108 0.14 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 2.01e-01 -0.173 0.135 0.147 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 6.56e-01 -0.059 0.132 0.147 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.61e-01 -0.155 0.138 0.147 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.45e-01 -0.199 0.136 0.147 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 1.33e-01 -0.197 0.131 0.147 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0265 0.133 0.147 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.66e-01 0.0238 0.141 0.147 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 1.79e-01 0.16 0.118 0.147 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.27e-01 0.0409 0.117 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.43e-01 0.00878 0.123 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 5.59e-02 -0.248 0.129 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.50e-01 0.132 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0108 0.132 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 3.40e-01 -0.116 0.122 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 5.90e-01 0.0424 0.0785 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0036 0.134 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0335 0.11 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 4.29e-02 -0.22 0.108 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 3.69e-01 0.0677 0.0752 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 8.71e-01 -0.019 0.117 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 8.46e-01 0.0231 0.119 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 5.97e-01 0.0517 0.0976 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 5.44e-01 0.0772 0.127 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -976299 sc-eQTL 3.70e-01 0.101 0.112 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 2.28e-01 -0.116 0.096 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 3.49e-01 -0.12 0.127 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0861 0.1 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00233 0.124 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.11e-01 0.0077 0.0684 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0181 0.114 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 9.77e-01 0.00258 0.0902 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 7.74e-01 -0.028 0.0973 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00225 0.106 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0173 0.08 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0528 0.129 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 6.33e-01 -0.047 0.0983 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 9.14e-01 0.00728 0.0676 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 9.91e-01 0.00136 0.128 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 1.65e-02 0.283 0.117 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 2.19e-01 -0.144 0.117 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 1.85e-01 0.173 0.131 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0514 0.0755 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 2.75e-01 0.149 0.136 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.02e-01 0.205 0.125 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -642305 sc-eQTL 8.10e-02 -0.187 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 7.81e-01 0.0238 0.0855 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -642569 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0353 0.117 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -75380 sc-eQTL 3.19e-01 0.109 0.109 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -898343 sc-eQTL 3.43e-01 -0.089 0.0936 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -498451 sc-eQTL 9.71e-01 0.00386 0.106 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 426600 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0752 0.0931 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 897802 sc-eQTL 4.57e-01 0.0979 0.132 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 115189 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.104 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -428571 sc-eQTL 1.79e-01 0.103 0.0767 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -898343 pQTL 0.0108 -0.0446 0.0175 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina