logo

Genes within 1Mb (chr12:94573217:C:CTCA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 6.88e-01 0.0422 0.105 0.135 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0372 0.123 0.135 B L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 2.46e-01 0.107 0.0921 0.135 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 6.27e-01 0.0567 0.117 0.135 B L1
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 6.72e-01 0.0452 0.106 0.135 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 9.54e-01 0.00401 0.07 0.135 B L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 5.34e-01 0.0659 0.106 0.135 B L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0451 0.0883 0.135 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 5.47e-03 -0.294 0.105 0.135 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.94e-01 0.000405 0.0509 0.135 B L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0695 0.0865 0.135 CD4T L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 4.23e-01 0.0603 0.0751 0.135 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.49e-01 0.0159 0.0837 0.135 CD4T L1
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 2.34e-01 0.136 0.114 0.135 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0363 0.0735 0.135 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 1.99e-01 0.155 0.12 0.135 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0873 0.0768 0.135 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.25e-01 0.0285 0.0808 0.135 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.46e-01 0.00701 0.104 0.135 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 9.49e-02 -0.116 0.0692 0.135 CD8T L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0305 0.0887 0.135 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.68e-01 0.0645 0.113 0.135 CD8T L1
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0494 0.101 0.135 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0201 0.096 0.135 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0692 0.113 0.135 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.13e-01 -0.142 0.0892 0.135 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 3.32e-01 0.0712 0.0732 0.135 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.31e-01 0.0104 0.12 0.137 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0144 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 5.70e-02 -0.239 0.125 0.137 DC L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0228 0.122 0.137 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.81e-01 -0.047 0.114 0.137 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 9.96e-01 0.000589 0.129 0.137 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 4.08e-02 -0.207 0.1 0.137 DC L1
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 8.82e-01 0.0168 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.88e-01 0.0382 0.0951 0.137 DC L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0302 0.113 0.135 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 7.61e-01 0.0268 0.088 0.135 Mono L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0424 0.0901 0.135 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 3.89e-01 0.0926 0.107 0.135 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 5.66e-01 -0.042 0.0729 0.135 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 7.67e-01 0.0399 0.134 0.135 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 9.48e-01 0.00704 0.108 0.135 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0811 0.0959 0.135 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0231 0.069 0.135 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.10e-01 -0.013 0.115 0.135 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 6.38e-01 0.0511 0.108 0.135 NK L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 2.17e-01 -0.112 0.0906 0.135 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0118 0.108 0.135 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0947 0.0885 0.135 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.37e-01 0.122 0.127 0.135 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.82e-01 0.134 0.1 0.135 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 2.78e-01 0.0807 0.0742 0.135 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00563 0.126 0.135 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 1.02e-01 0.175 0.107 0.135 Other_T L1
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.98e-01 0.126 0.0975 0.135 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0274 0.122 0.135 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 2.29e-01 -0.119 0.0989 0.135 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0999 0.12 0.135 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.52e-01 -0.128 0.111 0.135 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.23e-01 0.0221 0.0621 0.135 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 2.69e-01 0.157 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0695 0.121 0.128 B_Activated L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.67e-01 0.205 0.148 0.128 B_Activated L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 3.19e-01 -0.142 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00136 0.109 0.128 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.34e-02 0.212 0.114 0.128 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0565 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 3.99e-01 0.12 0.142 0.128 B_Activated L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 9.37e-02 -0.168 0.0997 0.128 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.10e-01 0.0468 0.126 0.128 B_Activated L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0864 0.123 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 1.63e-01 -0.174 0.124 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 2.70e-01 0.126 0.114 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 7.25e-01 0.044 0.125 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0157 0.128 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 9.98e-01 0.000253 0.105 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0726 0.125 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0565 0.117 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 6.75e-01 -0.048 0.114 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.44e-01 0.0438 0.0947 0.135 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 2.59e-01 0.146 0.129 0.134 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.98e-01 -0.069 0.131 0.134 B_Memory L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 5.17e-01 0.0812 0.125 0.134 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 3.87e-01 -0.116 0.134 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0821 0.12 0.134 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.67e-01 0.14 0.101 0.134 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.48e-01 0.124 0.132 0.134 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 3.41e-01 -0.113 0.118 0.134 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 6.28e-02 -0.221 0.118 0.134 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 2.92e-01 0.101 0.0957 0.134 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 8.78e-01 0.0191 0.124 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.03e-01 0.0839 0.125 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.76e-01 0.143 0.105 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 9.71e-01 0.00466 0.129 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 4.41e-01 0.0977 0.127 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0448 0.106 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00212 0.11 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0747 0.12 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0159 0.0702 0.135 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 5.05e-01 0.0897 0.134 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0505 0.123 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.97e-01 -0.032 0.124 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 4.62e-01 0.1 0.136 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 7.59e-01 0.0382 0.124 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.37e-01 -0.171 0.114 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.71e-01 0.116 0.129 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00709 0.121 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 1.59e-01 0.143 0.101 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.82e-01 0.0278 0.1 0.133 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 7.38e-01 0.0436 0.13 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.73e-01 -0.185 0.135 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 3.76e-01 -0.121 0.136 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 3.35e-02 0.229 0.107 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.01e-01 0.199 0.121 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.41e-01 0.118 0.123 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 7.22e-01 0.0442 0.124 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.25e-02 0.188 0.111 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.09e-01 -0.101 0.0985 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 2.75e-01 0.0933 0.0853 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 9.47e-01 -0.007 0.104 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 5.06e-01 0.08 0.12 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0819 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 1.57e-01 0.177 0.124 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0754 0.0884 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.20e-01 0.0377 0.076 0.135 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0644 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 8.14e-01 0.023 0.0978 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0516 0.114 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 6.11e-02 0.247 0.131 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.08e-01 -0.05 0.0973 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0982 0.131 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0714 0.104 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00464 0.0895 0.135 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0531 0.133 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 5.44e-01 0.0715 0.118 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 1.51e-01 0.177 0.123 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 7.41e-01 0.0412 0.124 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 5.49e-02 -0.203 0.105 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.90e-01 0.112 0.13 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0817 0.119 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 8.10e-01 0.0259 0.108 0.135 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0931 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 3.59e-01 -0.097 0.105 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0382 0.12 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0185 0.133 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 3.14e-01 0.128 0.127 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0219 0.108 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 6.94e-01 -0.052 0.132 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 9.05e-02 -0.202 0.119 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 3.00e-01 0.0974 0.0938 0.135 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.15e-02 0.259 0.12 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 9.32e-02 -0.158 0.0938 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 4.18e-01 0.0888 0.109 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.88e-01 0.0172 0.121 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 4.12e-01 -0.09 0.109 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0221 0.111 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.88e-01 0.0182 0.128 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 7.97e-01 0.0275 0.107 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.35e-01 -0.03 0.0886 0.135 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 7.50e-01 0.0429 0.135 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0212 0.104 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.35e-01 0.0462 0.136 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 4.17e-01 -0.111 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 2.37e-02 -0.277 0.122 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 2.72e-01 0.143 0.13 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 6.03e-01 0.0715 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.19e-01 -0.164 0.133 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 1.65e-01 0.149 0.107 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.69e-02 -0.271 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 2.84e-01 -0.126 0.117 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0914 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 2.03e-01 0.178 0.139 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 9.09e-01 0.0132 0.116 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 5.24e-01 0.0841 0.132 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.02e-02 -0.244 0.139 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0289 0.136 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0119 0.116 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.48e-01 -0.122 0.13 0.136 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 2.85e-01 0.118 0.11 0.136 MAIT L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 4.71e-01 0.0911 0.126 0.136 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 7.14e-01 -0.045 0.122 0.136 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 2.01e-01 -0.138 0.107 0.136 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 6.90e-02 -0.248 0.136 0.136 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.81e-01 -0.165 0.123 0.136 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0224 0.108 0.136 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 6.73e-01 0.0557 0.132 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0104 0.126 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 3.58e-01 -0.119 0.13 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.35e-01 0.0847 0.136 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 2.84e-01 -0.12 0.111 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 7.27e-01 0.0475 0.136 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 6.33e-01 0.054 0.113 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0382 0.108 0.131 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0581 0.129 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.83e-01 0.062 0.113 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0708 0.117 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0638 0.119 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0261 0.104 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 4.15e-01 0.111 0.136 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.15e-01 0.19 0.12 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 4.46e-01 0.0643 0.0841 0.134 NK_CD56dim L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.99e-01 0.000249 0.14 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 3.62e-01 0.113 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0558 0.13 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 2.49e-01 0.159 0.137 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.36e-01 0.167 0.112 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0891 0.138 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.77e-01 -0.174 0.128 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 1.73e-01 0.158 0.116 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.94e-01 0.1 0.117 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0219 0.121 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 3.16e-01 -0.12 0.119 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0259 0.124 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0984 0.107 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.49e-01 0.112 0.119 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 8.42e-01 0.0245 0.123 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 1.79e-01 0.115 0.0853 0.134 NK_cytokine L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 5.01e-01 0.105 0.155 0.133 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 1.45e-02 0.338 0.136 0.133 PB L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.30e-01 0.234 0.153 0.133 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.16e-01 0.0958 0.147 0.133 PB L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 4.26e-01 -0.111 0.138 0.133 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0478 0.143 0.133 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.14e-01 0.133 0.132 0.133 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.74e-01 -0.163 0.148 0.133 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 1.03e-01 -0.201 0.122 0.133 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.84e-01 -0.024 0.0871 0.133 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 1.52e-01 0.185 0.128 0.133 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.61e-02 0.219 0.114 0.133 Pro_T L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 6.01e-01 0.058 0.111 0.133 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 1.70e-02 -0.317 0.132 0.133 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 3.25e-01 0.129 0.13 0.133 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 1.65e-01 0.177 0.127 0.133 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.77e-01 -0.175 0.129 0.133 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.37e-01 0.0382 0.0808 0.133 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 8.41e-01 0.0254 0.127 0.135 Treg L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.94e-01 -0.155 0.119 0.135 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 4.08e-01 -0.105 0.126 0.135 Treg L2
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 5.27e-01 0.0716 0.113 0.135 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.31e-01 -0.056 0.117 0.135 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 2.00e-01 0.172 0.134 0.135 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0399 0.125 0.135 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 2.01e-01 -0.122 0.0953 0.135 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.122 0.141 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0197 0.132 0.141 cDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0984 0.134 0.141 cDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0166 0.13 0.141 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00519 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0291 0.128 0.141 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0901 0.108 0.141 cDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0944 0.124 0.141 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0348 0.106 0.141 cDC L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.28e-01 0.0986 0.124 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.95e-01 0.0129 0.0978 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 8.24e-01 -0.024 0.107 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0331 0.113 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.78e-01 -0.116 0.0859 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0711 0.128 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 7.46e-01 0.0381 0.118 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0256 0.1 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.62e-01 0.0312 0.0712 0.135 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.66e-01 -0.115 0.127 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 7.36e-01 0.0375 0.111 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 6.55e-01 0.0548 0.123 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.43e-01 0.0737 0.121 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.54e-01 0.129 0.0902 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 6.64e-01 0.0604 0.139 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0909 0.128 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 9.25e-01 0.011 0.117 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 2.14e-01 -0.104 0.0832 0.135 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 1.14e-01 0.236 0.148 0.152 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.08e-01 0.0759 0.114 0.152 gdT L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.56e-01 0.0443 0.142 0.152 gdT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 1.27e-01 -0.231 0.151 0.152 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 4.67e-01 0.105 0.144 0.152 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0959 0.141 0.152 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0644 0.141 0.152 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00591 0.123 0.152 gdT L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 4.59e-01 0.0991 0.133 0.138 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.45e-01 0.0254 0.13 0.138 intMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 7.90e-03 -0.359 0.134 0.138 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0304 0.127 0.138 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 3.47e-01 -0.103 0.109 0.138 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.29e-01 0.0272 0.126 0.138 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.89e-01 0.14 0.131 0.138 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 1.58e-01 -0.167 0.118 0.138 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 4.32e-01 0.0663 0.0843 0.138 intMono L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 3.56e-01 -0.114 0.124 0.136 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 1.90e-02 0.279 0.118 0.136 ncMono L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00728 0.13 0.136 ncMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 1.86e-02 0.303 0.127 0.136 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 3.56e-01 -0.076 0.0822 0.136 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 1.62e-01 0.179 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.89e-01 0.137 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 1.86e-01 -0.162 0.122 0.136 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0516 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 2.46e-01 -0.16 0.137 0.141 pDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0784 0.134 0.141 pDC L2
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.87e-01 -0.186 0.14 0.141 pDC L2
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 1.11e-01 -0.221 0.138 0.141 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.27e-01 -0.203 0.133 0.141 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0431 0.135 0.141 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 8.62e-01 -0.025 0.144 0.141 pDC L2
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 1.83e-01 0.161 0.12 0.141 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 8.28e-01 0.026 0.119 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 8.52e-01 0.0231 0.124 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 4.25e-02 -0.265 0.13 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 2.77e-01 0.126 0.115 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0128 0.133 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 4.02e-01 -0.103 0.123 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 5.17e-01 0.0515 0.0793 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.74e-01 0.0215 0.135 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0719 0.111 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 7.34e-02 -0.197 0.109 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 4.72e-01 0.0548 0.076 0.135 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 7.74e-01 0.034 0.118 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.48e-01 0.0231 0.12 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 5.82e-01 0.0544 0.0988 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 5.05e-01 0.0858 0.128 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136014 USP44 -978259 sc-eQTL 2.93e-01 0.12 0.114 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 1.26e-01 -0.149 0.097 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 3.99e-01 -0.109 0.129 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0319 0.102 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00139 0.125 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00264 0.0693 0.135 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0232 0.115 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0183 0.0912 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0185 0.0984 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 7.98e-01 0.0274 0.107 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0377 0.0808 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0273 0.13 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0255 0.11 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0233 0.0995 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00859 0.0683 0.135 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0104 0.129 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 4.52e-02 0.239 0.119 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 1.51e-01 -0.17 0.118 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 2.16e-01 0.164 0.132 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0662 0.0763 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 1.88e-01 0.182 0.138 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 1.77e-01 0.171 0.126 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -644265 sc-eQTL 9.17e-02 -0.182 0.108 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 9.91e-01 0.00097 0.0865 0.136 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -644529 sc-eQTL 8.00e-01 -0.03 0.119 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -77340 sc-eQTL 5.23e-01 0.0708 0.111 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111142 METAP2 -900303 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0885 0.0945 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -500411 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0114 0.107 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 424640 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0714 0.094 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 895842 sc-eQTL 4.84e-01 0.0932 0.133 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 113229 sc-eQTL 2.24e-01 0.129 0.106 0.134 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -430531 sc-eQTL 2.16e-01 0.0961 0.0775 0.134 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111142 METAP2 -900303 pQTL 0.00954 -0.0455 0.0175 0.0 0.0 0.136

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina