logo

Genes within 1Mb (chr12:94437572:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 7.82e-03 0.412 0.153 0.051 B L1
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 2.25e-01 0.222 0.183 0.051 B L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0284 0.173 0.051 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 8.03e-01 0.026 0.104 0.051 B L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 4.83e-01 -0.11 0.157 0.051 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00256 0.131 0.051 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.32e-01 0.123 0.103 0.051 B L1
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 7.35e-01 0.0536 0.158 0.051 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 6.03e-02 -0.142 0.075 0.051 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 2.43e-01 -0.188 0.16 0.051 B L1
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 9.32e-02 0.215 0.127 0.051 CD4T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 7.35e-01 -0.042 0.124 0.051 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 7.61e-01 0.0317 0.104 0.051 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 8.10e-01 0.0262 0.109 0.051 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 3.24e-01 -0.176 0.178 0.051 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 9.30e-01 -0.01 0.114 0.051 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 9.87e-01 0.0016 0.0957 0.051 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.73e-02 0.283 0.118 0.051 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 6.64e-01 0.0723 0.166 0.051 CD4T L1
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 9.82e-01 0.00339 0.154 0.051 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 1.68e-03 -0.323 0.101 0.051 CD8T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 5.33e-02 -0.324 0.167 0.051 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0935 0.139 0.051 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0187 0.143 0.051 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 3.19e-01 -0.168 0.168 0.051 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0953 0.133 0.051 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 5.33e-01 0.0774 0.124 0.051 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 7.51e-01 0.0347 0.109 0.051 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 8.66e-01 0.0299 0.177 0.051 CD8T L1
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 8.24e-01 0.0386 0.173 0.051 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 9.04e-02 0.227 0.134 0.051 Mono L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 1.64e-01 0.228 0.164 0.051 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 2.40e-01 0.131 0.111 0.051 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0106 0.205 0.051 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0827 0.165 0.051 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 8.67e-02 -0.182 0.105 0.051 Mono L1
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 3.20e-02 0.313 0.145 0.051 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 4.26e-01 0.0841 0.105 0.051 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 9.48e-01 0.00926 0.143 0.051 Mono L1
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 4.03e-01 -0.144 0.172 0.052 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 4.82e-01 -0.114 0.162 0.052 NK L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 5.72e-01 0.0912 0.161 0.052 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 1.55e-01 0.181 0.127 0.052 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 3.14e-01 0.134 0.133 0.052 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0742 0.191 0.052 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 1.15e-01 -0.237 0.15 0.052 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 8.40e-02 0.211 0.121 0.052 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 3.17e-01 0.112 0.111 0.052 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 1.18e-01 -0.273 0.174 0.052 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 865804 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0735 0.199 0.052 NK L1
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.39e-04 0.711 0.183 0.051 Other_T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 2.30e-01 0.193 0.161 0.051 Other_T L1
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.24e-01 0.0175 0.184 0.051 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 1.81e-01 0.213 0.158 0.051 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 4.27e-01 -0.119 0.149 0.051 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 5.60e-01 0.105 0.18 0.051 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 9.96e-02 0.276 0.167 0.051 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 9.51e-01 0.00738 0.119 0.051 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00826 0.0935 0.051 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 1.35e-01 0.211 0.141 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 5.84e-01 0.109 0.198 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0158 0.2 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 4.20e-01 -0.162 0.2 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 7.11e-01 0.0625 0.169 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 1.81e-02 -0.471 0.198 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.76e-01 -0.133 0.187 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 9.56e-01 0.00942 0.17 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 4.95e-02 0.359 0.182 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.49e-01 -0.219 0.151 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 7.78e-01 0.0584 0.207 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.20e-01 0.314 0.201 0.052 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 9.54e-01 0.0117 0.205 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 6.36e-01 0.0999 0.211 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 5.59e-01 0.0928 0.159 0.052 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 9.36e-02 0.347 0.206 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 1.96e-01 -0.239 0.184 0.052 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 3.23e-02 0.284 0.132 0.052 B_Memory L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 5.85e-01 0.102 0.187 0.052 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0618 0.15 0.052 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 3.35e-02 -0.418 0.195 0.052 B_Memory L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.52e-01 0.275 0.191 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 7.54e-01 0.0609 0.194 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 3.92e-01 0.171 0.199 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 7.58e-01 -0.051 0.165 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 4.75e-01 -0.148 0.207 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 5.36e-01 0.106 0.171 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0895 0.16 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 6.42e-01 0.0871 0.187 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 2.65e-01 -0.122 0.109 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 2.82e-01 0.198 0.184 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 3.52e-01 0.189 0.202 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 6.63e-01 0.0809 0.185 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.34e-01 -0.017 0.205 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 8.99e-02 -0.293 0.172 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 2.18e-01 0.241 0.195 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 7.02e-01 0.0702 0.183 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 1.77e-01 0.213 0.157 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 3.18e-01 -0.153 0.153 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 2.92e-01 -0.159 0.15 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 5.52e-01 -0.122 0.205 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.06e-01 0.335 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0633 0.218 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 3.81e-01 0.178 0.203 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 6.05e-01 -0.1 0.194 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 7.91e-01 0.0521 0.197 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 9.48e-01 0.013 0.198 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 5.93e-01 -0.105 0.197 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 3.00e-01 -0.185 0.178 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 1.73e-02 0.52 0.217 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.22e-01 0.225 0.144 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 6.52e-01 0.0693 0.154 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 6.82e-01 0.0438 0.106 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 8.25e-01 0.0266 0.12 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0792 0.184 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 3.24e-01 -0.128 0.13 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.81e-01 0.112 0.103 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 2.16e-02 0.256 0.11 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 9.67e-01 0.0073 0.174 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 7.52e-01 0.0493 0.156 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 2.37e-01 -0.201 0.17 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0241 0.123 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 5.04e-01 0.0973 0.145 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 2.84e-01 -0.21 0.196 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 6.07e-01 0.0798 0.155 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 6.55e-01 0.053 0.118 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 3.77e-03 0.384 0.131 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 5.20e-01 0.116 0.181 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 5.51e-01 0.125 0.209 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.02e-01 -0.024 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 1.02e-01 -0.228 0.139 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 4.56e-01 0.125 0.167 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0931 0.206 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.08e-01 -0.155 0.188 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 4.04e-01 -0.139 0.167 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.92e-01 0.222 0.169 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 3.21e-01 -0.182 0.183 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 2.31e-01 0.209 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 5.23e-03 -0.427 0.151 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0222 0.194 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 3.44e-01 -0.148 0.156 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0552 0.158 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 7.55e-01 0.0601 0.192 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0341 0.174 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 5.05e-01 0.11 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 5.63e-01 0.0795 0.137 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 6.42e-01 0.0882 0.19 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 5.85e-01 -0.103 0.189 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 8.36e-02 -0.254 0.146 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 3.08e-02 -0.407 0.187 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 3.64e-01 0.14 0.154 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 4.89e-02 0.34 0.171 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 2.47e-01 -0.232 0.2 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 7.75e-01 0.0477 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.09e-01 -0.19 0.151 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0733 0.138 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 5.53e-01 -0.115 0.193 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 3.35e-01 0.188 0.195 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0371 0.168 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0452 0.199 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 3.96e-01 -0.152 0.178 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 5.85e-01 -0.103 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0236 0.199 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 3.31e-01 -0.189 0.194 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 9.39e-02 0.293 0.174 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 3.92e-01 -0.142 0.166 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00433 0.182 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.21e-03 0.625 0.191 0.052 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 8.37e-01 -0.034 0.165 0.052 MAIT L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0815 0.184 0.052 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 1.31e-01 0.266 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00782 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0197 0.206 0.052 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 3.05e-01 0.19 0.185 0.052 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 6.43e-01 0.0851 0.183 0.052 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.02e-01 -0.265 0.161 0.052 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 4.20e-01 0.151 0.187 0.052 MAIT L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 6.82e-01 0.0836 0.204 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0914 0.195 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 2.76e-01 0.23 0.21 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 4.74e-02 0.35 0.175 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 2.48e-01 0.199 0.172 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 1.00e-01 0.344 0.208 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 8.55e-01 -0.032 0.175 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 1.82e-01 0.265 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 5.47e-01 0.101 0.167 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0561 0.198 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 865804 sc-eQTL 2.03e-01 0.234 0.183 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0338 0.203 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 2.13e-02 0.412 0.177 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 3.07e-01 0.204 0.199 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 1.78e-01 -0.24 0.177 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0118 0.163 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 2.04e-01 0.253 0.199 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 1.92e-01 -0.244 0.186 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.54e-01 0.213 0.186 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 8.93e-01 0.0226 0.168 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 6.19e-01 0.104 0.208 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 865804 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0446 0.169 0.053 NK_HLA L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 5.40e-01 -0.142 0.231 0.052 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 5.96e-01 -0.111 0.208 0.052 PB L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00804 0.22 0.052 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 5.30e-01 0.134 0.213 0.052 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 6.12e-01 -0.1 0.197 0.052 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 5.53e-01 -0.132 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0369 0.162 0.052 PB L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 4.44e-01 -0.142 0.184 0.052 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 2.80e-01 -0.14 0.129 0.052 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 5.08e-01 0.148 0.222 0.052 PB L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 6.72e-01 0.08 0.189 0.052 Pro_T L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 3.82e-01 0.147 0.168 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0223 0.195 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0562 0.18 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 3.36e-01 -0.184 0.191 0.052 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 4.85e-01 0.13 0.187 0.052 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 1.42e-01 0.278 0.188 0.052 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0953 0.139 0.052 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 3.02e-01 0.122 0.118 0.052 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 3.60e-01 0.154 0.167 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 6.63e-02 0.377 0.204 0.051 Treg L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 6.08e-01 0.106 0.206 0.051 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 867758 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0206 0.18 0.051 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0868 0.19 0.051 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 3.45e-01 -0.207 0.219 0.051 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 3.92e-01 0.174 0.203 0.051 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.65e-01 -0.187 0.167 0.051 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 8.35e-01 0.0325 0.156 0.051 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 7.82e-01 0.0583 0.211 0.051 Treg L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 2.40e-01 -0.221 0.188 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 6.29e-02 0.274 0.147 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 2.82e-01 0.184 0.171 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 2.20e-01 0.16 0.13 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 4.00e-02 -0.397 0.192 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.87e-01 0.124 0.178 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0877 0.111 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 3.94e-03 0.434 0.149 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 8.54e-01 0.0198 0.108 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 2.27e-01 0.186 0.154 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 2.06e-01 0.241 0.19 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 1.08e-01 0.268 0.166 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 5.64e-01 0.105 0.182 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 6.26e-01 0.0664 0.136 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 3.73e-02 0.433 0.206 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.85e-02 -0.379 0.191 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 3.27e-01 -0.14 0.142 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 6.61e-02 0.323 0.175 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 9.41e-01 0.0093 0.126 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 9.30e-02 -0.274 0.163 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 5.46e-01 0.124 0.206 0.051 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 6.74e-01 0.0843 0.2 0.051 intMono L2
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 4.29e-02 0.395 0.194 0.051 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 3.61e-01 0.154 0.168 0.051 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 1.19e-01 0.302 0.193 0.051 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.41e-01 -0.157 0.203 0.051 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 8.52e-02 -0.289 0.167 0.051 intMono L2
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0243 0.182 0.051 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.34e-01 0.195 0.129 0.051 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 4.64e-01 0.133 0.181 0.051 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 1.80e-01 0.263 0.195 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 2.67e-01 0.23 0.207 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 5.52e-01 -0.125 0.21 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 2.25e-01 0.152 0.125 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 3.62e-01 -0.194 0.213 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 1.66e-01 -0.242 0.174 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 2.79e-01 0.124 0.115 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 1.34e-01 0.26 0.173 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.55e-01 -0.171 0.12 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 1.43e-01 -0.274 0.186 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 8.95e-02 0.305 0.179 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0116 0.183 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 4.35e-01 0.153 0.195 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 3.57e-01 -0.136 0.148 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0609 0.196 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 4.93e-01 0.106 0.154 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 7.03e-01 0.0561 0.147 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0417 0.19 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 1.51e-01 -0.151 0.105 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 5.84e-01 0.0991 0.181 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028203 VEZT -780174 sc-eQTL 9.29e-01 0.0157 0.175 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -212985 sc-eQTL 1.82e-02 0.326 0.137 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120798 NR2C1 -636056 sc-eQTL 2.44e-01 0.19 0.163 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 288995 sc-eQTL 4.37e-01 0.0957 0.123 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 760197 sc-eQTL 4.44e-01 -0.152 0.198 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -22416 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0677 0.168 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 995625 sc-eQTL 1.82e-01 -0.143 0.107 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000180263 FGD6 -779910 sc-eQTL 3.11e-03 0.444 0.148 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -566176 sc-eQTL 8.76e-01 0.0163 0.104 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 970084 sc-eQTL 8.45e-01 0.029 0.148 0.051 CD14_Mono LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000236349 SUCLG2P2 -110669 eQTL 0.0268 -0.101 0.0454 0.0 0.0 0.0643

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000028203 \N -780174 3.21e-07 1.51e-07 6.41e-08 2.24e-07 1.02e-07 8.33e-08 1.99e-07 5.62e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.69e-07 1.31e-07 2.13e-07 8.07e-08 5.97e-08 8.71e-08 4.45e-08 1.77e-07 7.39e-08 5.87e-08 1.22e-07 1.56e-07 1.58e-07 3.49e-08 2.02e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.26e-07 1.32e-07 1.1e-07 1.21e-07 4.61e-08 3.56e-08 9.8e-08 3.36e-08 2.74e-08 3.91e-08 8.37e-08 6.39e-08 6.79e-08 5.03e-08 1.59e-07 4.7e-08 7.47e-09 3.48e-08 1.01e-08 8.61e-08 2.16e-09 4.94e-08
ENSG00000278916 \N -22431 1.57e-05 2.06e-05 4.28e-06 1.22e-05 4.03e-06 9.84e-06 2.83e-05 3.46e-06 1.92e-05 9.83e-06 2.58e-05 9.95e-06 3.63e-05 9.13e-06 5.5e-06 1.17e-05 1.12e-05 1.74e-05 6.7e-06 5.45e-06 9.81e-06 2.08e-05 2.11e-05 7.73e-06 3.26e-05 5.96e-06 8.4e-06 9e-06 2.34e-05 2.47e-05 1.29e-05 1.55e-06 2.5e-06 6.67e-06 8.83e-06 5.22e-06 3.13e-06 2.98e-06 4.54e-06 3.28e-06 1.66e-06 2.49e-05 2.68e-06 4.31e-07 2.12e-06 3.2e-06 3.35e-06 1.46e-06 1.43e-06