logo

Genes within 1Mb (chr12:94059706:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0541 0.155 0.081 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 1.63e-02 0.21 0.0868 0.081 B L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.46e-01 0.0612 0.133 0.081 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 2.97e-01 0.116 0.111 0.081 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.90e-01 0.00128 0.099 0.081 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0426 0.0873 0.081 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0494 0.064 0.081 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.36e-02 0.334 0.134 0.081 B L1
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0212 0.089 0.081 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0134 0.0935 0.081 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0373 0.153 0.081 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 1.53e-01 0.14 0.0974 0.081 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0476 0.0883 0.081 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0199 0.0821 0.081 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0802 0.103 0.081 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.91e-02 0.333 0.141 0.081 CD4T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0495 0.0887 0.081 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 8.87e-01 0.0169 0.119 0.081 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0329 0.122 0.081 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 2.50e-01 0.165 0.143 0.081 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.86e-02 0.2 0.113 0.081 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0553 0.0852 0.081 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 6.00e-01 0.0558 0.106 0.081 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.36e-01 0.0729 0.0933 0.081 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.14e-01 0.153 0.151 0.081 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0965 0.164 0.083 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 3.81e-01 0.129 0.146 0.083 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 4.79e-01 0.117 0.165 0.083 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 2.04e-01 0.166 0.13 0.083 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0333 0.136 0.083 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 3.50e-01 -0.129 0.137 0.083 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.123 0.083 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 4.77e-01 0.113 0.158 0.083 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0557 0.113 0.081 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 4.49e-01 0.0709 0.0935 0.081 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0657 0.172 0.081 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0964 0.138 0.081 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 1.99e-01 -0.152 0.118 0.081 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0214 0.0891 0.081 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.40e-01 0.0683 0.0884 0.081 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.55e-01 0.17 0.119 0.081 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 8.22e-01 0.0309 0.138 0.082 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 8.31e-01 -0.023 0.108 0.082 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 1.99e-01 0.145 0.112 0.082 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 1.80e-02 0.381 0.16 0.082 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.76e-01 0.0365 0.128 0.082 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 8.42e-01 0.0209 0.105 0.082 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.52e-01 0.0062 0.104 0.082 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.18e-01 0.0218 0.0945 0.082 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 8.04e-01 0.0368 0.148 0.082 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.082 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 9.39e-01 0.0106 0.137 0.081 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 4.55e-01 -0.101 0.135 0.081 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0314 0.127 0.081 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 1.13e-01 0.243 0.152 0.081 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.04e-01 0.0955 0.143 0.081 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0922 0.109 0.081 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 1.16e-01 0.159 0.101 0.081 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 1.58e-01 -0.112 0.0791 0.081 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 2.88e-01 0.128 0.12 0.081 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 9.84e-01 0.00334 0.162 0.074 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.65e-01 -0.171 0.153 0.074 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 1.31e-01 -0.272 0.179 0.074 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.92e-01 0.0505 0.191 0.074 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.57e-01 0.0713 0.16 0.074 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.98e-01 0.051 0.199 0.074 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0396 0.168 0.074 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.48e-01 0.062 0.193 0.074 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0971 0.161 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 4.34e-01 -0.106 0.135 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 9.03e-02 -0.272 0.16 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 6.05e-01 0.0775 0.15 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 8.25e-01 0.0296 0.134 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0856 0.136 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 1.97e-01 -0.157 0.121 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.19e-01 0.0169 0.166 0.082 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 1.58e-01 -0.237 0.167 0.082 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.79e-02 0.285 0.129 0.082 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 3.46e-01 0.16 0.17 0.082 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 3.65e-01 0.137 0.151 0.082 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 2.54e-01 -0.139 0.121 0.082 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 1.96e-01 -0.141 0.109 0.082 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 2.52e-01 -0.141 0.123 0.082 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 4.19e-03 0.46 0.159 0.082 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 3.42e-01 0.149 0.156 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.65e-02 0.228 0.132 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 7.49e-02 0.297 0.166 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.40e-01 0.0458 0.138 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0468 0.12 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.71e-01 0.0209 0.129 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 1.89e-01 0.115 0.0875 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.24e-02 0.317 0.147 0.081 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 1.04e-01 -0.251 0.154 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 9.67e-03 0.372 0.142 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 5.96e-01 0.0866 0.163 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.27e-02 0.274 0.152 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 7.35e-02 0.241 0.134 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 2.18e-01 -0.163 0.131 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.31e-01 -0.122 0.126 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.07e-01 0.275 0.17 0.082 B_Naive2 L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 5.68e-01 0.094 0.165 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0275 0.157 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 5.26e-01 -0.101 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00271 0.16 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 1.66e-02 -0.371 0.154 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0971 0.159 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.79e-01 -0.102 0.144 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.59e-01 0.0547 0.178 0.08 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.89e-01 0.00131 0.0917 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 7.34e-01 0.0353 0.104 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 4.39e-01 -0.123 0.158 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.01e-01 0.0755 0.112 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0447 0.093 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0221 0.0893 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0875 0.0961 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 6.98e-03 0.402 0.147 0.081 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 7.81e-01 -0.029 0.104 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.63e-01 -0.139 0.124 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.45e-01 0.0771 0.167 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 3.12e-01 0.133 0.132 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0103 0.105 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0374 0.101 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.85e-01 -0.099 0.114 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 5.24e-01 0.0981 0.154 0.081 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0324 0.113 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.28e-01 0.0296 0.136 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0203 0.167 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.86e-01 0.0832 0.152 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.93e-01 0.00108 0.132 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00438 0.135 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0772 0.138 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.09e-01 0.151 0.149 0.081 CD4_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 1.90e-01 -0.174 0.132 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0216 0.134 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 5.88e-02 0.256 0.135 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0542 0.165 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 3.10e-01 0.152 0.149 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 7.96e-01 0.0317 0.122 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.13e-01 0.0524 0.142 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.60e-01 0.0872 0.118 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0251 0.163 0.081 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.72e-01 0.131 0.119 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0283 0.125 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0263 0.14 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0705 0.162 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.56e-01 0.0797 0.135 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.56e-02 -0.187 0.111 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.22e-01 0.0276 0.122 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 7.62e-01 0.0339 0.112 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 5.13e-01 0.102 0.156 0.081 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00375 0.127 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 5.61e-01 0.0824 0.141 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.92e-01 0.168 0.159 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000469 0.168 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.10e-02 0.294 0.162 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.50e-01 0.00847 0.134 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0456 0.159 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.05e-01 -0.135 0.131 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.23e-01 0.0579 0.163 0.083 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 5.19e-02 -0.288 0.147 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.40e-01 0.0121 0.159 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 3.40e-01 -0.16 0.167 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.94e-02 0.321 0.176 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.86e-01 -0.094 0.172 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00264 0.163 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 3.26e-01 -0.153 0.155 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.57e-01 -0.136 0.147 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.16e-01 -0.017 0.161 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 7.16e-01 0.0526 0.144 0.078 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 1.97e-01 -0.198 0.153 0.078 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 1.55e-01 -0.2 0.141 0.078 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0697 0.18 0.078 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0529 0.162 0.078 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 7.56e-01 0.0406 0.13 0.078 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.13e-01 0.0588 0.16 0.078 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.72e-01 0.0228 0.141 0.078 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.26e-01 0.0574 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 5.58e-01 0.0937 0.16 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 3.64e-01 -0.132 0.145 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0322 0.141 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 5.11e-01 0.113 0.172 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 6.56e-01 0.0638 0.143 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 2.63e-01 -0.171 0.152 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.42e-01 0.0324 0.162 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.11e-01 -0.113 0.137 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.22e-01 0.16 0.161 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0774 0.151 0.084 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0653 0.141 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0532 0.12 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 9.64e-02 0.217 0.13 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 1.12e-02 0.43 0.168 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0221 0.151 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 7.94e-01 0.0316 0.121 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.81e-01 0.0641 0.116 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 7.56e-01 0.0329 0.106 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.79e-01 0.0043 0.161 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 5.78e-02 0.313 0.164 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 1.61e-01 0.218 0.155 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 4.15e-01 -0.126 0.154 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 5.33e-01 0.0882 0.141 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0772 0.173 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 8.24e-01 0.036 0.162 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 2.97e-01 0.151 0.144 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 3.86e-01 -0.141 0.162 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00561 0.146 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 4.39e-01 0.14 0.18 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 7.64e-01 -0.044 0.146 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 3.97e-01 0.13 0.153 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 3.26e-01 0.132 0.134 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 3.25e-01 0.134 0.136 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 8.83e-01 0.0224 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0402 0.156 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.12 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00554 0.138 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 9.14e-01 0.0118 0.109 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.55e-01 0.147 0.159 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 1.65e-01 0.221 0.159 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.20e-01 0.26 0.21 0.067 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 6.16e-01 -0.109 0.217 0.067 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 9.63e-01 0.00937 0.2 0.067 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 4.59e-01 -0.167 0.225 0.067 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0258 0.187 0.067 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 3.74e-01 -0.147 0.164 0.067 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 9.98e-01 0.000306 0.132 0.067 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00571 0.226 0.067 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 8.32e-01 0.0305 0.144 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0077 0.154 0.078 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 1.48e-01 0.236 0.163 0.078 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 1.02e-01 0.26 0.159 0.078 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 6.25e-01 0.0792 0.162 0.078 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 5.34e-01 0.0805 0.129 0.078 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.87e-01 0.00201 0.119 0.078 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0239 0.101 0.078 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 5.75e-01 0.0804 0.143 0.078 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.24e-02 -0.24 0.142 0.081 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 6.23e-01 0.0741 0.151 0.081 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 4.75e-01 0.124 0.174 0.081 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 2.00e-01 0.207 0.161 0.081 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 7.09e-01 0.0461 0.123 0.081 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0146 0.133 0.081 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 4.21e-01 0.0997 0.124 0.081 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 6.87e-02 0.304 0.166 0.081 Treg L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 9.15e-01 0.0178 0.167 0.09 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 4.48e-01 0.111 0.145 0.09 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 9.45e-01 0.011 0.161 0.09 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 4.09e-01 0.113 0.136 0.09 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0696 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0291 0.142 0.09 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 7.03e-01 0.0509 0.133 0.09 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.87e-01 0.215 0.162 0.09 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.04e-01 -0.16 0.125 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 5.68e-01 0.0634 0.111 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0887 0.165 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0445 0.151 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0755 0.121 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0605 0.0946 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.25e-01 0.0901 0.0914 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 2.04e-01 0.167 0.131 0.081 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 7.68e-01 0.0419 0.142 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.01e-01 0.0293 0.116 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0535 0.177 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0131 0.164 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0624 0.139 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.88e-01 0.017 0.121 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0248 0.107 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.49e-01 0.201 0.138 0.081 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0604 0.147 0.091 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.11e-02 -0.298 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 1.71e-01 0.253 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 4.45e-01 0.139 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.63e-02 -0.344 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.07e-01 0.0891 0.173 0.091 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.58e-01 0.111 0.189 0.091 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 1.11e-03 -0.505 0.152 0.091 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 3.16e-01 0.185 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.53e-01 0.19 0.166 0.084 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 6.30e-01 0.0676 0.14 0.084 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 8.15e-01 0.0378 0.161 0.084 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0308 0.169 0.084 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 4.84e-01 -0.103 0.147 0.084 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.52e-02 0.268 0.139 0.084 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 6.80e-01 0.0447 0.108 0.084 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0163 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 3.71e-01 0.138 0.154 0.081 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.81e-01 0.114 0.106 0.081 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 3.18e-01 0.165 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0902 0.166 0.081 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 3.82e-01 -0.127 0.145 0.081 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0358 0.141 0.081 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0031 0.14 0.081 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.41e-01 0.0485 0.147 0.081 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.53e-01 -0.184 0.161 0.096 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.66e-01 0.0273 0.161 0.096 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.18e-01 0.0812 0.163 0.096 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 2.54e-01 0.197 0.172 0.096 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0941 0.14 0.096 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 7.83e-01 0.0458 0.166 0.096 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0952 0.143 0.096 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.66e-01 0.237 0.171 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 1.42e-01 -0.248 0.169 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 4.80e-01 0.0724 0.102 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 2.70e-01 -0.192 0.174 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 3.65e-01 0.13 0.143 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 6.75e-01 0.0433 0.103 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0512 0.0939 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 1.45e-01 -0.143 0.0978 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 7.29e-02 0.274 0.152 0.081 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 8.65e-01 0.0256 0.151 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 2.31e-03 0.369 0.12 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 5.75e-02 0.307 0.161 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 2.66e-01 0.142 0.127 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 4.24e-01 0.0946 0.118 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0766 0.121 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 5.63e-01 0.0502 0.0868 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 2.70e-02 0.328 0.148 0.081 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0923 0.117 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 7.10e-01 0.0386 0.104 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0832 0.167 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 4.61e-01 -0.104 0.141 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 3.42e-01 -0.114 0.119 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 5.79e-01 -0.05 0.0901 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 3.80e-01 0.0769 0.0874 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 1.55e-01 0.178 0.124 0.081 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 2.11e-01 0.192 0.153 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 3.30e-01 0.0955 0.0979 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 4.68e-01 0.129 0.177 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 3.68e-01 -0.147 0.163 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 2.39e-01 -0.156 0.132 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 3.59e-01 0.122 0.132 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 7.31e-01 0.0382 0.111 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 9.61e-01 0.0068 0.14 0.082 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -590851 sc-eQTL 8.33e-01 0.0296 0.14 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 489892 sc-eQTL 9.62e-01 0.00525 0.109 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -88871 sc-eQTL 8.80e-02 0.203 0.118 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 382331 sc-eQTL 3.29e-02 0.358 0.167 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400282 sc-eQTL 7.92e-01 0.0354 0.134 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681823 sc-eQTL 4.85e-01 0.0747 0.107 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617759 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00542 0.103 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944042 sc-eQTL 8.41e-01 0.0198 0.0985 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 592218 sc-eQTL 8.62e-01 0.0268 0.154 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487938 sc-eQTL 6.22e-02 0.315 0.168 0.082 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258357 AC023161.2 -462163 eQTL 0.0373 0.138 0.0663 0.0 0.0 0.0662

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina