Genes within 1Mb (chr12:94059251:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0405 0.172 0.06 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.05e-01 0.0651 0.0976 0.06 B L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.08e-01 0.122 0.148 0.06 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.29e-01 0.187 0.123 0.06 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.79e-01 0.00285 0.11 0.06 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 7.22e-01 0.0346 0.097 0.06 B L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0315 0.0711 0.06 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.00e-02 0.351 0.15 0.06 B L1
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 5.58e-02 -0.19 0.0988 0.06 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 7.80e-01 0.0292 0.105 0.06 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 2.09e-01 0.216 0.171 0.06 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 2.86e-01 0.117 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.42e-01 0.0326 0.099 0.06 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0916 0.0917 0.06 CD4T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0669 0.115 0.06 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.85e-01 0.212 0.159 0.06 CD4T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00131 0.0958 0.06 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 6.44e-02 -0.236 0.127 0.06 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 7.85e-01 0.036 0.132 0.06 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 9.72e-01 0.00539 0.155 0.06 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.54e-01 0.175 0.123 0.06 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.66e-01 0.0398 0.0921 0.06 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 3.86e-01 0.0995 0.114 0.06 CD8T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.79e-01 -0.135 0.1 0.06 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.60e-01 0.15 0.163 0.06 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 8.89e-01 0.0247 0.177 0.059 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 3.00e-01 -0.164 0.158 0.059 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.80e-01 -0.157 0.178 0.059 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0899 0.141 0.059 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.30e-01 -0.116 0.146 0.059 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.77e-01 -0.2 0.147 0.059 DC L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 2.95e-01 -0.138 0.132 0.059 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 9.27e-03 0.44 0.167 0.059 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.49e-02 0.243 0.126 0.06 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0436 0.105 0.06 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 2.87e-01 0.207 0.194 0.06 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 7.91e-01 0.0413 0.156 0.06 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 2.86e-01 -0.143 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 7.92e-02 -0.176 0.0997 0.06 Mono L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.51e-01 -0.143 0.0992 0.06 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.86e-03 0.369 0.133 0.06 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 8.97e-02 0.253 0.148 0.06 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 3.65e-01 0.106 0.117 0.06 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.30e-01 0.0589 0.122 0.06 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 5.17e-01 0.114 0.175 0.06 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0188 0.139 0.06 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00446 0.114 0.06 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.32e-01 0.00962 0.112 0.06 NK L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0967 0.102 0.06 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.77e-02 0.332 0.159 0.06 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 6.49e-01 0.0833 0.183 0.06 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0731 0.148 0.06 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 5.16e-01 0.095 0.146 0.06 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0319 0.137 0.06 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 7.94e-01 0.0434 0.166 0.06 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.09e-01 0.102 0.154 0.06 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.27e-01 0.0941 0.118 0.06 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 2.18e-01 -0.135 0.109 0.06 Other_T L1
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0868 0.0857 0.06 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.72e-01 -0.143 0.13 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 1.98e-02 0.373 0.159 0.061 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.70e-01 -0.065 0.152 0.061 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.85e-01 0.155 0.178 0.061 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 8.48e-01 0.0362 0.189 0.061 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.05e-01 0.132 0.159 0.061 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 6.67e-01 0.0849 0.197 0.061 B_Activated L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 7.80e-01 0.0467 0.167 0.061 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.59e-01 0.269 0.19 0.061 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 7.33e-01 0.0581 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 9.07e-01 0.0168 0.143 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0365 0.17 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.39e-01 0.0977 0.159 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.67e-01 0.0612 0.142 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0948 0.145 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0975 0.129 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0358 0.176 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 9.33e-01 -0.015 0.178 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00856 0.138 0.06 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.51e-01 0.0817 0.18 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 9.00e-01 0.0203 0.161 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 1.52e-01 -0.185 0.128 0.06 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0407 0.115 0.06 B_Memory L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.42e-01 0.0606 0.13 0.06 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.61e-01 0.24 0.171 0.06 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 4.30e-01 -0.14 0.177 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.07e-01 0.0367 0.15 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.11e-02 0.384 0.187 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.02e-01 0.253 0.154 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000879 0.135 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 4.49e-01 0.11 0.145 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.10e-01 -0.158 0.0984 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 7.04e-02 0.302 0.166 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.92e-01 0.0921 0.171 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.61e-01 0.0934 0.16 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.79e-01 -0.128 0.181 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.25e-01 0.167 0.169 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 3.83e-01 0.131 0.149 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.48e-01 -0.212 0.146 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 2.51e-01 0.16 0.139 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.60e-01 0.174 0.189 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 2.92e-01 -0.184 0.175 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.78e-02 -0.304 0.165 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 9.30e-01 0.0148 0.169 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.30e-01 0.258 0.17 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 3.36e-01 -0.16 0.165 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.85e-01 0.224 0.168 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 8.10e-01 -0.037 0.154 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0298 0.189 0.059 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 3.81e-04 -0.356 0.0986 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0782 0.115 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 2.14e-01 0.218 0.175 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.41e-01 0.0958 0.124 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.19e-01 0.0514 0.103 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 4.19e-01 -0.08 0.0988 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 2.77e-01 -0.116 0.106 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.37e-01 0.159 0.166 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 5.55e-01 -0.068 0.115 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.74e-01 0.0769 0.137 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.70e-01 0.165 0.184 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.18e-01 0.0942 0.146 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 8.12e-01 0.0275 0.116 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.81e-01 -0.149 0.111 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0291 0.126 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 4.49e-02 0.339 0.168 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 9.56e-01 0.00672 0.122 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.31e-01 0.0705 0.147 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 8.33e-01 0.0382 0.181 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.15e-01 0.134 0.164 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0122 0.142 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 4.48e-01 0.111 0.146 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.96e-01 -0.127 0.149 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.34e-01 0.191 0.16 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 4.89e-01 -0.1 0.144 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 4.06e-01 0.121 0.146 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 1.30e-01 0.224 0.147 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 5.60e-01 0.105 0.18 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.66e-02 0.31 0.162 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.53e-01 -0.042 0.133 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.70e-02 0.368 0.153 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0927 0.128 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.15e-01 0.22 0.177 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 7.02e-01 0.0496 0.13 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 3.41e-01 -0.129 0.136 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0799 0.152 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 7.55e-01 -0.055 0.176 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.34e-01 0.142 0.147 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.34e-01 0.0954 0.122 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0524 0.133 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.11e-01 -0.194 0.121 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.19e-01 0.11 0.17 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0742 0.141 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0291 0.157 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.30e-01 0.0379 0.176 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0725 0.186 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.74e-01 0.161 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0467 0.148 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.21e-01 0.0176 0.176 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.72e-01 -0.13 0.145 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.34e-01 0.112 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 4.41e-02 -0.312 0.154 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0435 0.166 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.86e-01 0.0251 0.175 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.29e-01 0.181 0.185 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0974 0.18 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.57e-02 0.339 0.169 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.34e-02 0.273 0.162 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.69e-01 0.138 0.154 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.05e-01 0.273 0.168 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 7.72e-01 -0.044 0.152 0.061 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 6.99e-01 0.0627 0.162 0.061 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 2.27e-01 -0.18 0.148 0.061 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0938 0.189 0.061 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0543 0.17 0.061 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.23e-01 0.0488 0.137 0.061 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00733 0.169 0.061 MAIT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 4.13e-01 -0.122 0.149 0.061 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 9.72e-01 0.00594 0.172 0.061 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 2.08e-01 0.221 0.175 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 7.34e-01 0.0542 0.159 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0398 0.155 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 1.57e-01 0.266 0.187 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 2.06e-01 0.198 0.156 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0741 0.168 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.59e-01 0.25 0.177 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0189 0.15 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.60e-01 0.163 0.177 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 7.47e-02 0.294 0.164 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 4.88e-01 0.107 0.154 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 1.90e-01 0.172 0.131 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 1.88e-01 0.188 0.142 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0799 0.186 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 2.92e-01 -0.174 0.165 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.85e-01 0.0922 0.132 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 4.67e-01 0.0922 0.127 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0248 0.115 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.11e-01 0.178 0.175 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0958 0.18 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 6.77e-02 0.308 0.168 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 4.56e-01 0.125 0.168 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.34e-01 0.0954 0.153 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 2.58e-01 0.213 0.187 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.86e-01 0.123 0.176 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 5.93e-02 -0.295 0.156 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.21e-01 -0.113 0.176 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0981 0.158 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0417 0.196 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 8.60e-01 0.028 0.159 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 3.36e-01 0.161 0.166 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 3.98e-01 0.123 0.146 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 4.43e-01 -0.113 0.148 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.49e-01 0.125 0.165 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 9.97e-01 0.000682 0.17 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0109 0.13 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 2.70e-02 -0.329 0.148 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.84e-01 -0.157 0.118 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 6.48e-02 0.319 0.172 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 9.59e-01 0.0088 0.173 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 9.91e-01 0.00203 0.181 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 2.91e-01 0.195 0.184 0.063 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0994 0.17 0.063 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.49e-01 0.181 0.192 0.063 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0656 0.159 0.063 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 7.34e-01 0.0478 0.14 0.063 PB L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0551 0.112 0.063 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.76e-03 0.525 0.187 0.063 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 6.24e-01 0.0756 0.154 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 7.38e-02 -0.293 0.163 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.25e-01 0.0386 0.175 0.061 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 7.41e-01 0.0566 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.89e-02 0.356 0.171 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.77e-01 0.00402 0.138 0.061 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0812 0.128 0.061 Pro_T L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 2.52e-01 -0.124 0.108 0.061 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 4.21e-01 -0.123 0.153 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 4.93e-01 -0.106 0.155 0.06 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 2.71e-01 0.18 0.163 0.06 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 8.93e-01 0.0254 0.189 0.06 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 9.95e-01 0.00107 0.175 0.06 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 5.93e-01 0.0714 0.134 0.06 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0536 0.144 0.06 Treg L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0535 0.134 0.06 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.44e-01 0.265 0.18 0.06 Treg L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 9.49e-01 0.013 0.204 0.051 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 2.17e-01 -0.22 0.177 0.051 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0163 0.197 0.051 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.49e-01 -0.156 0.167 0.051 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0646 0.2 0.051 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 4.03e-01 -0.146 0.174 0.051 cDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0633 0.163 0.051 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.54e-01 0.185 0.199 0.051 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 3.26e-01 0.144 0.146 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0222 0.129 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 8.16e-02 0.334 0.191 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 8.80e-01 0.0267 0.176 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.141 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 2.08e-01 -0.139 0.11 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 3.11e-02 -0.229 0.106 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.71e-01 0.209 0.152 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 7.70e-01 0.0493 0.168 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 1.36e-01 0.204 0.136 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 7.46e-01 0.068 0.21 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.64e-01 -0.142 0.194 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0965 0.144 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0486 0.126 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 1.36e-02 0.404 0.162 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.01e-01 -0.116 0.172 0.058 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 5.56e-01 0.122 0.207 0.058 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.34e-01 0.135 0.216 0.058 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.55e-02 -0.444 0.209 0.058 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.95e-01 -0.274 0.21 0.058 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.56e-01 0.0628 0.202 0.058 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.12e-01 -0.145 0.221 0.058 gdT L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 4.05e-01 0.153 0.184 0.058 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 4.48e-01 0.164 0.215 0.058 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 3.69e-01 -0.18 0.199 0.056 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 3.35e-01 0.162 0.168 0.056 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 2.58e-01 0.219 0.194 0.056 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 3.04e-02 -0.437 0.201 0.056 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.40e-02 -0.326 0.175 0.056 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0105 0.168 0.056 intMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 5.35e-02 -0.25 0.129 0.056 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.99e-01 0.188 0.181 0.056 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.19e-01 0.106 0.165 0.059 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 9.80e-02 -0.187 0.113 0.059 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.51e-01 -0.133 0.177 0.059 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 7.47e-02 0.316 0.176 0.059 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.71e-01 -0.112 0.155 0.059 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.70e-01 0.207 0.151 0.059 ncMono L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0632 0.15 0.059 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.76e-01 0.139 0.157 0.059 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 1.21e-01 0.296 0.19 0.059 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.10e-01 -0.126 0.19 0.059 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 3.39e-01 -0.184 0.192 0.059 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.98e-01 -0.139 0.204 0.059 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 8.75e-01 0.0261 0.166 0.059 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 1.72e-01 -0.268 0.195 0.059 pDC L2
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.76e-01 -0.23 0.169 0.059 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.48e-02 0.453 0.2 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 4.37e-01 0.14 0.18 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 8.00e-01 0.0277 0.109 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.95e-01 0.0727 0.185 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 5.91e-01 0.0818 0.152 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 9.90e-01 0.00144 0.11 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0104 0.0999 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0471 0.104 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 2.29e-01 0.196 0.162 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 5.06e-01 -0.113 0.169 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 7.51e-01 0.0436 0.138 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 1.02e-01 0.298 0.181 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 1.21e-01 0.222 0.143 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.83e-01 0.0367 0.133 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 8.36e-01 0.0282 0.137 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0441 0.0977 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.35e-02 0.324 0.167 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 1.87e-01 0.179 0.136 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.05e-01 0.0805 0.121 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 1.60e-01 0.273 0.194 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0523 0.164 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 7.91e-02 -0.244 0.138 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 3.14e-02 -0.225 0.104 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 1.78e-01 -0.137 0.102 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 4.55e-02 0.29 0.144 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00607 0.167 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0956 0.106 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 4.18e-01 -0.156 0.193 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0153 0.177 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 4.25e-01 -0.115 0.144 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 5.40e-01 0.0886 0.144 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 9.18e-02 -0.203 0.12 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 3.76e-02 0.315 0.151 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -591306 sc-eQTL 1.61e-01 0.214 0.152 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 489437 sc-eQTL 2.05e-01 0.151 0.118 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -89326 sc-eQTL 5.01e-01 0.0873 0.13 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 381876 sc-eQTL 6.12e-01 0.0932 0.183 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -400737 sc-eQTL 4.60e-01 -0.108 0.146 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 681368 sc-eQTL 6.76e-01 0.0487 0.116 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 617304 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0498 0.113 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000184752 NDUFA12 -944497 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0868 0.107 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 591763 sc-eQTL 5.74e-02 0.319 0.167 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 487483 sc-eQTL 9.84e-01 0.00375 0.185 0.058 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 591763 eQTL 3.51e-03 0.146 0.0498 0.0 0.0 0.0397


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina