logo

Genes within 1Mb (chr12:93998317:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 4.88e-01 0.0959 0.138 0.103 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.86e-01 0.0317 0.0783 0.103 B L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0983 0.118 0.103 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.80e-01 0.0276 0.0988 0.103 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 8.26e-01 0.0195 0.0881 0.103 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.00e-01 0.00983 0.0777 0.103 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0243 0.121 0.103 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0249 0.121 0.103 B L1
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 9.50e-01 0.00504 0.0807 0.103 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 2.60e-01 0.0955 0.0845 0.103 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 2.24e-01 -0.169 0.138 0.103 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 8.11e-02 -0.155 0.0882 0.103 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.18e-01 0.08 0.08 0.103 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0144 0.0744 0.103 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.71e-01 -0.177 0.129 0.103 CD4T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0932 0.0804 0.103 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 7.61e-02 -0.191 0.107 0.103 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0128 0.111 0.103 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 2.82e-01 -0.141 0.13 0.103 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 1.45e-01 -0.151 0.103 0.103 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0165 0.0775 0.103 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 4.59e-01 0.0716 0.0964 0.103 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 4.33e-01 -0.108 0.137 0.103 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.86e-01 0.157 0.147 0.106 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0135 0.132 0.106 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 8.91e-01 0.0204 0.149 0.106 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 2.89e-01 -0.124 0.117 0.106 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0448 0.122 0.106 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.74e-01 0.135 0.123 0.106 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 9.31e-01 0.0122 0.142 0.106 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.75e-01 0.11 0.1 0.103 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 7.86e-01 0.0226 0.0833 0.103 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 3.84e-01 0.133 0.153 0.103 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 6.55e-01 0.055 0.123 0.103 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.02e-01 0.0886 0.106 0.103 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00949 0.0793 0.103 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0604 0.107 0.103 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.40e-01 0.0409 0.123 0.103 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0686 0.0963 0.103 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.89e-02 0.183 0.0999 0.103 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0755 0.144 0.103 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.03e-02 0.207 0.114 0.103 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.37e-01 0.0898 0.0933 0.103 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0551 0.0925 0.103 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 2.64e-01 -0.148 0.132 0.103 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 6.76e-01 0.0631 0.151 0.103 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.99e-01 0.0644 0.122 0.103 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 2.55e-01 0.137 0.12 0.103 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 1.46e-01 0.164 0.113 0.103 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 5.99e-03 0.373 0.134 0.103 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.47e-01 0.0768 0.127 0.103 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000208 0.0978 0.103 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.13e-02 0.208 0.0895 0.103 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.47e-01 0.0207 0.107 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.48e-01 0.0785 0.13 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 1.68e-01 0.17 0.123 0.112 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.43e-01 -0.111 0.144 0.112 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.38e-01 -0.147 0.153 0.112 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 5.37e-02 0.247 0.127 0.112 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.67e-01 0.0475 0.16 0.112 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 7.20e-01 0.0556 0.155 0.112 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.112 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0165 0.142 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 4.66e-02 0.236 0.118 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.51e-01 -0.064 0.141 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 1.91e-01 0.173 0.131 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.08e-01 0.0977 0.118 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 4.02e-01 -0.101 0.12 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.95e-01 -0.19 0.146 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00109 0.144 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0805 0.15 0.103 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0578 0.116 0.103 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 5.10e-01 0.1 0.151 0.103 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.54e-01 0.0801 0.135 0.103 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.07e-01 -0.09 0.108 0.103 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.85e-01 0.0265 0.0971 0.103 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 5.30e-01 0.0906 0.144 0.103 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 4.12e-01 -0.118 0.144 0.103 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.20e-01 0.0502 0.14 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 1.04e-01 -0.193 0.118 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.21e-01 -0.12 0.149 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.20e-01 -0.122 0.123 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 1.40e-01 0.158 0.106 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 3.22e-01 -0.114 0.115 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0983 0.133 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0297 0.141 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 8.97e-01 0.0178 0.137 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 4.59e-01 0.095 0.128 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 7.65e-01 0.0433 0.144 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00875 0.135 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.26e-01 0.117 0.119 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.11e-02 0.268 0.115 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.98e-01 0.195 0.151 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 3.18e-01 0.145 0.145 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 4.04e-01 0.121 0.144 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.04e-01 0.0716 0.138 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 1.11e-01 -0.222 0.139 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.40e-01 0.134 0.141 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 1.82e-01 0.182 0.136 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0329 0.14 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 3.92e-01 -0.134 0.156 0.107 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 9.88e-01 0.00129 0.083 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 3.87e-01 0.0813 0.0937 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.29e-01 -0.113 0.143 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.42e-02 -0.214 0.1 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.37e-01 0.0655 0.0841 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0286 0.0808 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.08e-01 -0.218 0.135 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 6.65e-01 -0.041 0.0946 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0353 0.112 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 1.64e-01 -0.211 0.151 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 8.33e-01 0.0253 0.12 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.86e-01 0.0825 0.0949 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0892 0.0912 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.09e-01 -0.223 0.139 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 3.00e-01 -0.105 0.101 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.55e-01 0.0222 0.121 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.47e-01 0.114 0.149 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.45e-02 -0.242 0.135 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 7.80e-01 0.0329 0.118 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 3.84e-01 0.105 0.121 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.11e-01 -0.212 0.132 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 1.86e-01 -0.157 0.118 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 8.94e-01 -0.016 0.12 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0974 0.122 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0719 0.148 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.34e-01 -0.13 0.134 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0253 0.11 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.37e-01 -0.151 0.127 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.26e-01 0.0321 0.146 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 1.93e-01 -0.139 0.107 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 4.47e-02 -0.224 0.111 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 7.94e-01 0.0328 0.126 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 7.11e-01 0.0538 0.145 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 1.78e-01 -0.163 0.121 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 9.82e-01 0.00225 0.101 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.18e-01 0.135 0.109 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.15e-01 -0.221 0.139 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0431 0.116 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 3.31e-01 -0.126 0.129 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 5.11e-01 0.0956 0.145 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0773 0.153 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0917 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.05e-01 0.102 0.122 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 5.50e-01 0.0869 0.145 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.23e-01 0.0333 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 1.00e-01 0.219 0.133 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0302 0.142 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.90e-02 0.272 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 2.93e-01 0.167 0.158 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 9.98e-01 0.000469 0.155 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 1.08e-01 0.235 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 1.45e-01 -0.203 0.139 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0959 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 1.19e-01 -0.203 0.129 0.102 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 9.86e-01 0.00237 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.35e-02 0.22 0.127 0.102 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.91e-01 0.112 0.162 0.102 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 2.41e-01 0.171 0.146 0.102 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 6.63e-01 0.0514 0.118 0.102 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 6.22e-02 0.269 0.143 0.102 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 5.56e-01 0.0869 0.147 0.102 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 4.22e-01 0.115 0.143 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 2.57e-01 -0.147 0.129 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0235 0.126 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0228 0.154 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.86e-01 0.111 0.128 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.42e-01 0.13 0.136 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 4.26e-01 -0.116 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.52e-01 0.207 0.144 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 3.47e-01 -0.127 0.135 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.80e-01 0.137 0.127 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0283 0.109 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 9.78e-02 0.195 0.117 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0258 0.154 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 1.99e-02 0.316 0.135 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0482 0.109 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0659 0.105 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 2.87e-01 -0.154 0.145 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 1.44e-01 0.218 0.148 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.25e-01 0.0493 0.14 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 7.11e-01 0.0515 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0623 0.127 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0153 0.155 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0907 0.145 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 2.00e-03 0.397 0.127 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.11e-01 -0.182 0.145 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 3.72e-01 0.145 0.162 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 7.51e-01 0.0417 0.131 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0897 0.135 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 3.80e-01 -0.104 0.118 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00995 0.12 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 2.12e-01 -0.167 0.133 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.60e-01 0.0421 0.138 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 7.76e-01 0.03 0.105 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 2.04e-01 0.153 0.121 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 4.01e-01 -0.118 0.14 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 4.59e-01 -0.104 0.14 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0221 0.177 0.085 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0886 0.181 0.085 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 5.40e-01 -0.102 0.167 0.085 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.82e-01 0.165 0.188 0.085 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0858 0.156 0.085 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 8.89e-01 0.0193 0.138 0.085 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 9.15e-01 0.0202 0.189 0.085 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 1.61e-02 -0.437 0.179 0.085 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0225 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 1.51e-01 0.194 0.135 0.102 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 3.69e-01 0.129 0.144 0.102 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 1.27e-01 0.214 0.14 0.102 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0537 0.142 0.102 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 1.79e-01 -0.153 0.113 0.102 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.19e-01 0.0107 0.105 0.102 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0601 0.126 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 1.01e-01 -0.208 0.126 0.103 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0183 0.134 0.103 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0405 0.155 0.103 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.69e-01 -0.129 0.143 0.103 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 7.44e-01 0.0359 0.11 0.103 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0601 0.118 0.103 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 1.18e-01 -0.232 0.148 0.103 Treg L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.89e-02 0.328 0.149 0.107 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.61e-01 0.0231 0.132 0.107 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 3.79e-01 -0.128 0.145 0.107 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 1.52e-01 -0.177 0.123 0.107 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.45e-01 0.14 0.148 0.107 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.79e-01 0.00343 0.129 0.107 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 5.54e-01 0.0874 0.147 0.107 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 4.16e-01 0.0914 0.112 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 4.28e-01 0.0785 0.0988 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.94e-01 0.101 0.147 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.35e-01 0.0457 0.135 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.90e-01 0.0925 0.108 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 4.14e-01 -0.069 0.0843 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 7.91e-01 -0.031 0.117 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 1.57e-01 0.178 0.126 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0366 0.103 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0285 0.158 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 4.27e-01 0.116 0.145 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 9.71e-01 0.00456 0.124 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.10e-01 0.0121 0.108 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 2.17e-01 -0.153 0.123 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000672 0.144 0.106 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 5.29e-01 0.109 0.173 0.106 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00085 0.181 0.106 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 4.52e-03 0.498 0.172 0.106 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.03e-01 0.119 0.176 0.106 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0834 0.169 0.106 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.44e-01 0.013 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 9.69e-01 0.00706 0.18 0.106 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.97e-01 0.0382 0.149 0.104 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0841 0.125 0.104 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 2.83e-01 -0.155 0.144 0.104 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0838 0.151 0.104 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 5.60e-01 0.0766 0.131 0.104 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.28e-01 0.0435 0.125 0.104 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.74e-01 0.0214 0.135 0.104 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.70e-01 0.0774 0.136 0.104 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0143 0.0938 0.104 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 1.23e-01 0.225 0.145 0.104 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 5.11e-01 0.0965 0.147 0.104 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 7.63e-01 0.0388 0.128 0.104 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 6.26e-01 -0.061 0.125 0.104 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 3.75e-01 -0.115 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0894 0.149 0.116 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 8.93e-02 -0.251 0.147 0.116 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.69e-01 0.0641 0.15 0.116 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 4.53e-01 0.12 0.159 0.116 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0739 0.129 0.116 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 1.22e-01 0.236 0.152 0.116 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0289 0.158 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0564 0.15 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 3.07e-01 0.0927 0.0906 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 7.47e-01 0.0499 0.155 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 2.81e-01 0.137 0.126 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 6.52e-01 0.0413 0.0914 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00515 0.0833 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0973 0.136 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 9.25e-01 0.0133 0.141 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 7.59e-01 0.0412 0.134 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0402 0.109 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.44e-01 -0.067 0.145 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0437 0.114 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 2.63e-01 0.118 0.105 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 6.71e-01 0.0461 0.108 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 9.28e-01 0.0121 0.133 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 999099 sc-eQTL 4.17e-01 0.111 0.137 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 2.81e-01 0.111 0.103 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 5.70e-01 0.0521 0.0916 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.36e-01 0.07 0.148 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.52e-01 0.116 0.125 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 3.74e-01 0.0941 0.106 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0228 0.0797 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0929 0.11 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 4.26e-01 0.109 0.137 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 4.43e-01 -0.067 0.0872 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 6.13e-01 0.0799 0.158 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 7.93e-01 0.0382 0.145 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 6.08e-01 0.0607 0.118 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 7.88e-01 0.0317 0.118 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 7.67e-01 -0.037 0.125 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -652240 sc-eQTL 8.17e-01 0.029 0.125 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 428503 sc-eQTL 5.52e-01 -0.058 0.0974 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -150260 sc-eQTL 1.39e-01 0.158 0.106 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 320942 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0549 0.151 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -461671 sc-eQTL 3.43e-02 0.253 0.119 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 620434 sc-eQTL 4.53e-01 0.0718 0.0954 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 556370 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0195 0.0924 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 530829 sc-eQTL 9.48e-02 -0.23 0.137 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 426549 sc-eQTL 5.33e-01 0.0946 0.151 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120833 \N 428503 1.04e-06 6.56e-07 1.59e-07 4.26e-07 9.23e-08 2.67e-07 6.19e-07 2.26e-07 6.92e-07 3.1e-07 9.73e-07 5.15e-07 9.77e-07 1.54e-07 3.12e-07 3.79e-07 5.55e-07 4.25e-07 2.87e-07 1.91e-07 2.42e-07 5.5e-07 4.06e-07 2.89e-07 9.82e-07 2.52e-07 4.37e-07 3.24e-07 5.43e-07 7.06e-07 3.66e-07 5.25e-08 4.83e-08 2.06e-07 3.34e-07 1.8e-07 1.4e-07 1.07e-07 7.99e-08 1.6e-08 1.35e-07 6.49e-07 5.44e-08 1.98e-08 1.94e-07 1.52e-08 1.37e-07 2.44e-08 5.26e-08
ENSG00000278916 \N -461686 8.7e-07 5.6e-07 1.46e-07 3.61e-07 1.05e-07 2.12e-07 5.65e-07 1.78e-07 5.74e-07 2.82e-07 7.67e-07 4.28e-07 8.16e-07 1.41e-07 2.57e-07 2.89e-07 3.93e-07 4.24e-07 2.65e-07 1.67e-07 2.35e-07 4.38e-07 3.84e-07 2.17e-07 7.71e-07 2.57e-07 3.26e-07 2.63e-07 4.33e-07 5.82e-07 3.32e-07 6.56e-08 5.39e-08 1.73e-07 3.08e-07 1.44e-07 1.02e-07 9.33e-08 6.81e-08 2.74e-08 1.03e-07 5.09e-07 4.18e-08 1.81e-08 1.45e-07 1.31e-08 1.32e-07 1.24e-08 6.46e-08