logo

Genes within 1Mb (chr12:93989798:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 1.28e-01 0.283 0.185 0.051 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 2.40e-01 -0.124 0.105 0.051 B L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.67e-01 -0.144 0.16 0.051 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 2.34e-01 0.158 0.133 0.051 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0259 0.119 0.051 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0594 0.105 0.051 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 6.37e-02 0.302 0.162 0.051 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0926 0.163 0.051 B L1
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.108 0.051 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0857 0.113 0.051 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 5.54e-01 -0.11 0.185 0.051 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 5.50e-01 -0.071 0.119 0.051 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 2.05e-01 0.136 0.107 0.051 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 7.25e-01 0.0351 0.0994 0.051 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00782 0.173 0.051 CD4T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 3.44e-01 0.101 0.107 0.051 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 7.26e-01 0.0502 0.143 0.051 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.26e-01 0.117 0.147 0.051 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0466 0.173 0.051 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 7.70e-01 0.0403 0.138 0.051 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.07e-01 0.0386 0.103 0.051 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0612 0.128 0.051 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 2.40e-01 0.214 0.182 0.051 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 7.89e-01 0.0532 0.198 0.052 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0465 0.177 0.052 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 8.47e-01 0.0388 0.2 0.052 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 5.65e-01 0.091 0.158 0.052 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 9.22e-01 0.0162 0.165 0.052 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.56e-01 0.0302 0.166 0.052 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 3.36e-01 -0.184 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0114 0.134 0.051 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 3.14e-01 0.112 0.111 0.051 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 5.52e-01 -0.122 0.204 0.051 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 2.63e-01 0.184 0.164 0.051 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 2.78e-01 0.153 0.141 0.051 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 3.95e-01 -0.09 0.106 0.051 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.61e-01 -0.199 0.142 0.051 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 1.07e-01 0.268 0.165 0.052 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 3.77e-01 -0.115 0.13 0.052 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 2.52e-01 0.156 0.136 0.052 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.98e-01 0.165 0.195 0.052 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.44e-02 0.31 0.153 0.052 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.69e-01 0.0209 0.126 0.052 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 9.30e-01 0.011 0.125 0.052 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.88e-01 0.00259 0.179 0.052 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 418030 sc-eQTL 7.26e-01 0.0715 0.204 0.052 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 1.89e-02 0.394 0.167 0.051 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 7.41e-01 -0.055 0.166 0.051 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.66e-01 0.0896 0.156 0.051 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 9.36e-02 0.316 0.188 0.051 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0269 0.176 0.051 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 4.92e-01 0.0928 0.135 0.051 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 3.20e-01 -0.124 0.125 0.051 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.93e-01 0.192 0.147 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 7.79e-01 0.0536 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 1.78e-01 0.216 0.16 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0581 0.191 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.74e-01 0.128 0.178 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.61e-01 0.0485 0.159 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 2.25e-01 -0.196 0.162 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 4.52e-01 0.149 0.197 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0963 0.195 0.052 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 4.73e-01 -0.143 0.199 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0911 0.154 0.052 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0773 0.202 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 5.81e-01 0.0993 0.18 0.052 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0416 0.144 0.052 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0711 0.129 0.052 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.83e-01 0.256 0.191 0.052 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 7.24e-01 0.0678 0.192 0.052 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 6.25e-02 0.352 0.188 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 2.05e-01 -0.204 0.16 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 4.23e-02 -0.409 0.2 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 5.19e-01 0.107 0.166 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.90e-02 0.254 0.144 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 9.07e-01 0.0182 0.156 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.76e-01 0.243 0.179 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 1.72e-01 -0.26 0.19 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 3.77e-01 0.164 0.185 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.97e-01 -0.118 0.173 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 5.10e-01 0.129 0.195 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.86e-01 0.242 0.182 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0204 0.161 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0289 0.158 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.12e-02 0.345 0.203 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 1.37e-01 0.292 0.196 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0782 0.195 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 1.40e-01 0.274 0.185 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 9.42e-03 0.487 0.186 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 8.62e-01 0.0331 0.19 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 2.50e-01 0.213 0.184 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0705 0.189 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 4.48e-01 0.16 0.211 0.052 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 3.05e-01 -0.114 0.111 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0332 0.126 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 2.94e-01 -0.202 0.192 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.70e-01 -0.187 0.136 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 2.94e-01 0.118 0.113 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 5.78e-01 0.0604 0.108 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 7.01e-01 -0.07 0.182 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 2.79e-01 -0.136 0.126 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 9.61e-02 -0.249 0.149 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 4.62e-01 -0.149 0.202 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.12e-01 0.131 0.159 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.25e-01 0.125 0.126 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.91e-01 0.0167 0.122 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.10e-01 0.0211 0.186 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0626 0.136 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.46e-01 -0.124 0.163 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 5.73e-01 -0.113 0.2 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 3.72e-01 -0.163 0.182 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.79e-02 0.327 0.156 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 1.91e-01 0.212 0.162 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 3.91e-01 -0.153 0.178 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 2.26e-01 0.2 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 2.37e-02 0.376 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0712 0.169 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.51e-01 -0.192 0.205 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 3.39e-01 0.179 0.186 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.40e-01 0.146 0.152 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 1.75e-01 -0.24 0.176 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 8.82e-01 0.0303 0.203 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 4.14e-01 0.118 0.144 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 1.27e-01 -0.231 0.151 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 3.45e-01 0.16 0.169 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.83e-01 0.0542 0.196 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00866 0.164 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 9.74e-01 0.0045 0.136 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 6.04e-01 0.0771 0.148 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.29e-01 0.287 0.188 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 5.02e-01 0.116 0.173 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0641 0.184 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 7.66e-01 0.0579 0.194 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 2.90e-01 0.218 0.205 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 5.54e-01 0.119 0.2 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 1.70e-01 0.259 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0297 0.181 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 8.31e-01 0.0401 0.187 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 4.75e-01 -0.118 0.165 0.052 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 1.55e-01 -0.25 0.175 0.052 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0259 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.90e-01 -0.055 0.206 0.052 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 9.92e-01 0.00184 0.185 0.052 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0567 0.149 0.052 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 1.72e-01 0.25 0.182 0.052 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 4.33e-01 0.147 0.187 0.052 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 6.63e-02 0.314 0.17 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0563 0.146 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.01e-01 0.134 0.159 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 9.26e-01 0.0193 0.207 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 2.17e-01 0.227 0.183 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0208 0.147 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0646 0.141 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 7.16e-01 0.071 0.195 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 418030 sc-eQTL 7.94e-02 0.352 0.199 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 1.25e-01 0.297 0.192 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 1.73e-01 0.261 0.191 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 1.78e-01 0.236 0.174 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 5.52e-01 -0.128 0.215 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.47e-01 0.153 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.99e-01 0.0457 0.18 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 1.90e-01 -0.264 0.2 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 5.56e-01 0.132 0.224 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 418030 sc-eQTL 9.46e-01 0.0123 0.181 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 8.45e-01 -0.036 0.184 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 2.32e-01 -0.192 0.16 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 2.10e-01 -0.204 0.162 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 2.70e-01 0.201 0.182 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.29e-01 0.284 0.186 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.50e-01 0.0271 0.143 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 3.23e-01 0.163 0.164 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0246 0.191 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 418030 sc-eQTL 8.84e-02 -0.324 0.189 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 3.46e-01 -0.16 0.17 0.051 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 9.07e-01 0.0209 0.179 0.051 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 4.29e-01 0.164 0.207 0.051 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 2.04e-01 -0.244 0.191 0.051 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0371 0.147 0.051 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.98e-01 0.0204 0.158 0.051 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 8.65e-01 -0.034 0.199 0.051 Treg L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 6.89e-01 -0.061 0.152 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.79e-01 0.0746 0.134 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.45e-01 0.189 0.199 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.72e-01 0.25 0.182 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 4.31e-01 0.115 0.146 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0713 0.114 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.83e-01 -0.211 0.158 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0315 0.171 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 3.07e-01 0.142 0.139 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.98e-03 -0.609 0.209 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.25e-01 -0.157 0.197 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.26e-01 -0.165 0.167 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0871 0.146 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 4.82e-01 -0.118 0.167 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 4.61e-01 0.14 0.19 0.061 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 6.41e-01 0.107 0.229 0.061 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.75e-01 0.135 0.239 0.061 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 4.66e-01 0.172 0.235 0.061 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 2.76e-01 0.255 0.233 0.061 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 1.92e-01 0.291 0.222 0.061 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 6.56e-01 -0.109 0.244 0.061 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.98e-02 0.391 0.236 0.061 gdT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0677 0.201 0.051 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0596 0.17 0.051 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0916 0.195 0.051 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 6.73e-01 0.0863 0.204 0.051 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.02e-01 0.184 0.178 0.051 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.85e-01 0.0245 0.169 0.051 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 1.83e-01 0.243 0.182 0.051 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 4.41e-01 0.14 0.181 0.052 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 4.43e-01 0.096 0.125 0.052 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 9.53e-01 0.0114 0.195 0.052 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 8.30e-02 0.338 0.194 0.052 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.59e-01 0.157 0.171 0.052 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.14e-01 0.0394 0.167 0.052 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0171 0.173 0.052 ncMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 1.23e-01 -0.31 0.2 0.054 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 9.70e-01 0.00745 0.201 0.054 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 4.75e-01 0.145 0.203 0.054 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.31e-01 0.326 0.214 0.054 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 3.44e-01 -0.165 0.174 0.054 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 2.13e-01 -0.258 0.206 0.054 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0707 0.214 0.054 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0201 0.202 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 6.90e-01 0.0488 0.122 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0794 0.208 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 8.76e-01 0.0266 0.171 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0202 0.123 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 9.63e-02 -0.186 0.111 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 2.09e-01 0.229 0.182 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0892 0.19 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 9.84e-02 0.299 0.18 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 2.20e-01 -0.181 0.147 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 1.83e-01 -0.26 0.194 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.28e-01 0.233 0.153 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 4.77e-01 0.101 0.142 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0195 0.146 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 6.21e-02 0.335 0.178 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 990580 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0912 0.185 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0452 0.14 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 3.96e-01 0.105 0.124 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 2.58e-01 -0.226 0.199 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.01e-01 0.142 0.169 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 7.13e-01 0.0528 0.143 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0528 0.108 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 8.94e-02 -0.253 0.148 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 6.06e-01 0.0954 0.185 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.59e-01 0.0689 0.118 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0101 0.213 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 1.92e-01 0.255 0.195 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 6.00e-01 0.0837 0.159 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 9.08e-01 0.0185 0.16 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 4.94e-01 0.115 0.168 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -660759 sc-eQTL 8.79e-02 0.287 0.168 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 419984 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0801 0.131 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -158779 sc-eQTL 5.41e-01 0.0877 0.143 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 312423 sc-eQTL 3.57e-01 0.187 0.202 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -470190 sc-eQTL 4.62e-02 0.321 0.16 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 611915 sc-eQTL 6.75e-01 0.054 0.129 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 547851 sc-eQTL 8.90e-01 0.0173 0.125 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 522310 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0201 0.186 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 418030 sc-eQTL 9.49e-01 0.013 0.204 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257345 LINC02413 990580 eQTL 0.014 0.192 0.0782 0.0022 0.0 0.0613
ENSG00000278916 CEP83-DT -470205 eQTL 0.00141 0.232 0.0724 0.00344 0.00177 0.0613

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina