logo

Genes within 1Mb (chr12:93808706:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 2.63e-01 0.184 0.164 0.056 B L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0935 0.056 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.40e-01 0.0435 0.093 0.056 B L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.36e-01 0.0668 0.141 0.056 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 7.22e-01 0.0418 0.117 0.056 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0861 0.105 0.056 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 9.16e-01 0.00974 0.0924 0.056 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.73e-01 0.104 0.144 0.056 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 6.80e-02 -0.261 0.142 0.056 B L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 8.08e-02 -0.169 0.0962 0.056 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 3.02e-01 0.0967 0.0935 0.056 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 1.53e-01 0.14 0.0979 0.056 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0514 0.161 0.056 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 8.83e-01 0.0152 0.103 0.056 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 9.48e-01 0.00603 0.093 0.056 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 5.89e-01 0.0467 0.0863 0.056 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00972 0.15 0.056 CD4T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 8.91e-02 -0.162 0.0946 0.056 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 7.51e-01 0.0353 0.111 0.056 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 2.63e-01 -0.143 0.127 0.056 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 8.87e-02 0.223 0.13 0.056 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 4.32e-01 0.121 0.154 0.056 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00285 0.123 0.056 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0849 0.0914 0.056 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.68e-01 -0.126 0.114 0.056 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.24e-01 0.0362 0.162 0.056 CD8T L1
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 5.28e-01 0.11 0.175 0.056 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.87e-01 -0.154 0.144 0.056 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 8.47e-01 0.0303 0.156 0.056 DC L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.45e-01 -0.167 0.176 0.056 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.59e-01 0.128 0.139 0.056 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000971 0.145 0.056 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 8.77e-02 -0.25 0.146 0.056 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 1.32e-01 -0.254 0.168 0.056 DC L1
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.28e-01 0.0418 0.12 0.056 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0434 0.0871 0.056 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.59e-01 0.044 0.0994 0.056 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 9.79e-01 0.00489 0.183 0.056 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 2.70e-01 -0.162 0.147 0.056 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 4.02e-01 -0.106 0.126 0.056 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.28e-01 0.0752 0.0946 0.056 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0529 0.127 0.056 Mono L1
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 1.59e-01 -0.205 0.145 0.056 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 1.60e-02 -0.292 0.12 0.056 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 7.59e-01 0.035 0.114 0.056 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.01e-01 0.0623 0.119 0.056 NK L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.17e-01 0.171 0.171 0.056 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 7.31e-02 0.242 0.134 0.056 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.53e-01 0.103 0.11 0.056 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.70e-01 0.0792 0.109 0.056 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0919 0.156 0.056 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 9.02e-01 0.022 0.178 0.056 NK L1
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 6.18e-01 0.0784 0.157 0.056 Other_T L1
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0577 0.167 0.056 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 9.74e-01 0.00512 0.155 0.056 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 3.52e-01 0.135 0.145 0.056 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.80e-01 0.154 0.175 0.056 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.15e-01 0.257 0.162 0.056 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 4.24e-02 -0.253 0.124 0.056 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.21e-01 0.142 0.116 0.056 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 3.33e-01 0.133 0.137 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 2.64e-01 -0.171 0.153 0.059 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 7.63e-01 0.0519 0.172 0.059 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 1.44e-02 0.352 0.142 0.059 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 1.88e-01 -0.224 0.169 0.059 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00768 0.18 0.059 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0523 0.151 0.059 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0788 0.188 0.059 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.84e-01 -0.1 0.182 0.059 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 1.33e-01 -0.265 0.175 0.059 B_Activated L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 2.04e-01 -0.225 0.176 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 1.60e-01 0.211 0.15 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 4.83e-02 -0.293 0.148 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 5.06e-01 -0.118 0.177 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.73e-01 -0.225 0.164 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0666 0.15 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0407 0.183 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0885 0.181 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 8.37e-01 0.0388 0.188 0.054 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 3.40e-01 -0.148 0.155 0.054 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 5.07e-01 -0.097 0.146 0.054 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 4.10e-01 -0.157 0.191 0.054 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 9.89e-02 0.28 0.169 0.054 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 1.78e-01 -0.184 0.136 0.054 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 5.23e-01 0.0781 0.122 0.054 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0376 0.182 0.054 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 3.66e-01 -0.164 0.181 0.054 B_Memory L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 4.90e-02 0.332 0.168 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0137 0.138 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0468 0.144 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 9.53e-01 0.0107 0.18 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 4.62e-01 0.109 0.148 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.88e-01 -0.111 0.129 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 9.50e-01 0.00878 0.139 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 7.50e-02 0.285 0.159 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 1.50e-01 -0.245 0.169 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 4.82e-01 0.118 0.167 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 3.19e-01 0.169 0.169 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 5.18e-01 0.101 0.157 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 9.33e-01 0.0149 0.177 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 6.73e-01 0.07 0.166 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.58e-01 -0.134 0.146 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 7.90e-01 0.038 0.143 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 1.56e-01 0.263 0.184 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 5.74e-01 -0.1 0.178 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.99e-01 -0.197 0.189 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 6.35e-02 -0.353 0.189 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0764 0.182 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.60e-01 -0.169 0.184 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.69e-01 -0.167 0.186 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.85e-01 -0.157 0.181 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.77e-01 0.131 0.184 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0107 0.206 0.05 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.58e-01 -0.116 0.102 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 1.86e-01 0.127 0.0961 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 1.52e-01 0.156 0.109 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 5.03e-01 -0.112 0.166 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 7.15e-01 0.0431 0.118 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 9.68e-01 0.00398 0.0979 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00533 0.094 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0429 0.158 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 3.35e-01 -0.138 0.143 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 7.23e-01 0.0396 0.112 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 3.75e-01 0.118 0.132 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.48e-01 0.0818 0.179 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0774 0.141 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 6.56e-01 -0.05 0.112 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.95e-01 0.0918 0.108 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.35e-01 0.0781 0.165 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 9.89e-01 0.00238 0.172 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 6.29e-01 0.0615 0.127 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0493 0.152 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.85e-02 -0.387 0.186 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 8.11e-01 -0.041 0.171 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 8.82e-01 0.022 0.148 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.92e-01 -0.16 0.152 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.41e-01 0.0335 0.167 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0212 0.149 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0265 0.155 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 8.85e-01 0.0218 0.151 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 9.14e-01 0.0165 0.153 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 7.79e-01 0.0521 0.186 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.69e-01 0.151 0.168 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0212 0.138 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.95e-01 -0.136 0.159 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.80e-01 -0.129 0.183 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 1.00e-01 -0.207 0.125 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.68e-01 -0.149 0.134 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 8.59e-02 -0.227 0.132 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 2.90e-01 0.157 0.148 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.56e-01 0.158 0.171 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0501 0.143 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00865 0.119 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 8.71e-01 0.021 0.129 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 2.20e-01 0.203 0.165 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.67e-02 -0.252 0.141 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 5.98e-01 0.0977 0.185 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 9.06e-01 0.0187 0.159 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 1.03e-01 0.29 0.177 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 1.81e-01 -0.252 0.188 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 2.76e-01 -0.2 0.183 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0773 0.15 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.38e-01 -0.171 0.178 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 2.21e-01 0.223 0.182 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 4.69e-01 -0.119 0.164 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 6.25e-01 0.092 0.188 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 4.26e-02 -0.353 0.173 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 3.52e-01 -0.171 0.184 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 1.51e-03 0.612 0.19 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 2.77e-01 0.206 0.189 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 8.10e-01 0.0433 0.18 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.86e-01 -0.149 0.171 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.03e-01 0.0925 0.178 0.055 CD8_TEM L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 3.78e-01 -0.134 0.152 0.052 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.23e-02 -0.405 0.176 0.052 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 9.37e-01 0.0128 0.162 0.052 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 1.17e-01 0.233 0.148 0.052 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 2.33e-01 0.226 0.189 0.052 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.28e-04 0.584 0.166 0.052 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0819 0.138 0.052 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.44e-01 0.196 0.168 0.052 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.04e-03 0.47 0.169 0.052 MAIT L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 8.04e-01 0.0423 0.17 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0955 0.165 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 2.67e-01 -0.171 0.154 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 7.28e-02 -0.269 0.149 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.39e-01 -0.086 0.183 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.83e-01 -0.203 0.152 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0721 0.163 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00346 0.173 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.44e-01 0.034 0.172 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0887 0.16 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 4.22e-01 -0.12 0.149 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 1.36e-01 -0.214 0.143 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 2.34e-01 0.152 0.127 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 2.53e-01 0.158 0.138 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 8.74e-01 0.0288 0.18 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.41e-01 0.235 0.159 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0727 0.128 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 8.20e-01 0.028 0.123 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 8.47e-01 0.0328 0.17 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000213 0.175 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 5.55e-01 0.1 0.169 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0797 0.17 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 4.79e-01 -0.119 0.168 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 8.93e-01 0.0207 0.154 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 8.51e-01 0.0355 0.188 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.13e-01 0.178 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.48e-02 0.301 0.156 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.14e-01 0.178 0.176 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.83e-02 -0.371 0.195 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0393 0.159 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.76e-02 -0.284 0.16 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 5.58e-02 -0.282 0.147 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 6.40e-01 0.0661 0.141 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 7.19e-01 0.0517 0.143 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 5.11e-01 0.105 0.16 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 4.74e-02 0.325 0.163 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.16e-01 0.0816 0.126 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.34e-01 0.14 0.144 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.17e-01 -0.136 0.167 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 7.11e-01 0.0621 0.168 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 1.41e-01 -0.26 0.176 0.063 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0276 0.194 0.063 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 4.21e-01 -0.146 0.181 0.063 PB L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 5.89e-01 0.0905 0.167 0.063 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.68e-04 0.635 0.179 0.063 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.15e-01 -0.157 0.156 0.063 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.28e-01 -0.109 0.137 0.063 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 3.30e-01 -0.185 0.188 0.063 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 4.56e-01 -0.137 0.183 0.063 PB L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0944 0.15 0.057 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 1.23e-01 0.269 0.174 0.057 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 4.74e-01 0.115 0.16 0.057 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 2.76e-01 0.186 0.17 0.057 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 8.85e-01 -0.024 0.167 0.057 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.15e-01 -0.11 0.169 0.057 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.32e-01 -0.131 0.135 0.057 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 9.72e-01 0.0044 0.124 0.057 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0702 0.149 0.057 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.45e-01 -0.178 0.153 0.056 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 3.58e-01 0.139 0.151 0.056 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 2.36e-01 0.189 0.159 0.056 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.60e-01 0.0811 0.184 0.056 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.23e-01 0.263 0.17 0.056 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 7.08e-01 0.0489 0.13 0.056 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.20e-01 0.114 0.141 0.056 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.27e-01 0.112 0.177 0.056 Treg L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.72e-01 0.0533 0.184 0.054 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 9.31e-01 0.0136 0.156 0.054 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 3.24e-01 0.158 0.16 0.054 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.36e-01 0.0841 0.177 0.054 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 2.08e-01 -0.19 0.15 0.054 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.99e-01 0.0951 0.18 0.054 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 1.87e-02 -0.367 0.155 0.054 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0753 0.18 0.054 cDC L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 2.12e-01 0.168 0.134 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00976 0.101 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0271 0.119 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 7.27e-01 0.0617 0.177 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0119 0.162 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 2.00e-01 -0.166 0.129 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0797 0.101 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0582 0.14 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.02e-02 -0.277 0.152 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 4.80e-02 -0.258 0.129 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 5.03e-01 0.0837 0.125 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0698 0.191 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.99e-01 -0.227 0.176 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.81e-01 0.0829 0.15 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.75e-02 0.287 0.129 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0882 0.15 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 8.32e-01 -0.039 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 7.68e-01 -0.047 0.159 0.058 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.19e-01 0.0771 0.155 0.058 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 8.11e-01 0.0427 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.79e-01 -0.104 0.186 0.058 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 4.09e-01 -0.134 0.162 0.058 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 5.76e-02 0.293 0.153 0.058 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.62e-01 0.123 0.166 0.058 intMono L2
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0159 0.158 0.059 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 3.89e-02 0.269 0.129 0.059 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0571 0.109 0.059 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0814 0.17 0.059 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 4.37e-01 -0.133 0.17 0.059 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0937 0.149 0.059 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 6.60e-01 -0.064 0.145 0.059 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.11e-01 0.0993 0.151 0.059 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 4.43e-01 -0.138 0.18 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 2.02e-01 0.155 0.121 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 9.12e-01 -0.012 0.109 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 1.63e-01 -0.258 0.185 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 9.26e-01 0.0142 0.152 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 6.95e-01 -0.043 0.11 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 5.39e-01 0.0615 0.0999 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.44e-01 -0.125 0.163 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 7.44e-02 -0.302 0.168 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 9.01e-02 0.273 0.16 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 9.79e-01 0.00359 0.134 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 9.49e-01 0.00842 0.131 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 9.56e-01 0.00953 0.174 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 5.13e-01 0.0894 0.137 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 1.70e-01 -0.174 0.126 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0271 0.13 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 1.26e-01 0.245 0.159 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 809488 sc-eQTL 1.82e-01 -0.219 0.164 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 6.41e-01 0.0583 0.125 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0676 0.0932 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 8.18e-01 0.0254 0.111 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 7.90e-01 0.0475 0.178 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.78e-01 -0.133 0.15 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0887 0.128 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 5.64e-01 0.0555 0.0961 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0724 0.133 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0591 0.16 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 4.22e-01 0.0982 0.122 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0529 0.102 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 3.44e-01 -0.175 0.185 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 3.69e-01 -0.153 0.17 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.10e-01 -0.14 0.138 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 2.17e-01 0.171 0.138 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 7.22e-01 0.052 0.146 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 sc-eQTL 9.86e-02 -0.244 0.147 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 879375 sc-eQTL 1.49e-02 -0.302 0.123 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 238892 sc-eQTL 6.86e-01 0.0465 0.115 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -339871 sc-eQTL 2.30e-01 0.151 0.125 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD 131331 sc-eQTL 2.96e-01 0.186 0.177 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -651282 sc-eQTL 1.03e-02 0.361 0.139 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 430823 sc-eQTL 3.92e-01 0.0967 0.113 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 366759 sc-eQTL 3.33e-01 0.106 0.109 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 341218 sc-eQTL 4.93e-01 -0.112 0.163 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 236938 sc-eQTL 9.44e-01 0.0126 0.179 0.056 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 eQTL 0.0221 0.0761 0.0332 0.0 0.0 0.0427
ENSG00000258035 AC123567.2 -377338 eQTL 0.00438 -0.181 0.0632 0.0035 0.00148 0.0427

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000057704 TMCC3 -841851 2.8e-07 1.5e-07 4.69e-08 2.24e-07 9.24e-08 9.91e-08 1.81e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.2e-07 1.71e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.36e-08 4.12e-08 1.33e-07 6.92e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 3.07e-08 1.65e-07 1.14e-07 1.1e-07 1.06e-07 1.22e-07 1e-07 1.07e-07 4.77e-08 3.46e-08 9.3e-08 3.12e-08 2.69e-08 4.49e-08 7.92e-08 5.95e-08 7.65e-08 3.2e-08 1.46e-07 3.25e-08 1.43e-08 4.06e-08 1.55e-08 1.19e-07 2.1e-09 4.91e-08