Genes within 1Mb (chr12:93622562:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 3.10e-01 -0.0806 0.0792 0.1 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 8.37e-01 0.0162 0.0787 0.1 B L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 3.33e-01 -0.115 0.119 0.1 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.62e-01 0.0577 0.0993 0.1 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.78e-01 0.0781 0.0884 0.1 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 4.45e-01 0.0597 0.078 0.1 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 9.34e-01 0.00727 0.0882 0.1 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.51e-01 -0.092 0.122 0.1 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 4.73e-01 0.0871 0.121 0.1 B L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00783 0.0812 0.1 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 1.68e-01 -0.108 0.0781 0.1 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.04e-01 -0.105 0.0821 0.1 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.60e-01 0.0596 0.135 0.1 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 2.37e-01 -0.102 0.086 0.1 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.44e-01 0.0361 0.0779 0.1 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 5.27e-01 0.0458 0.0723 0.1 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.89e-01 0.087 0.126 0.1 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.04e-01 0.047 0.0906 0.1 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00564 0.104 0.1 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 5.02e-02 0.209 0.106 0.1 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.64e-01 0.00578 0.126 0.1 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 1.03e-01 -0.163 0.0995 0.1 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.30e-01 0.036 0.0748 0.1 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 8.74e-01 0.0148 0.0931 0.1 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.97e-01 0.0901 0.133 0.1 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.51e-02 -0.227 0.122 0.097 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 1.80e-01 -0.179 0.133 0.097 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 4.68e-01 0.109 0.15 0.097 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0723 0.119 0.097 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.22e-01 0.191 0.123 0.097 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 8.32e-01 0.0265 0.125 0.097 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.14e-01 -0.117 0.143 0.097 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 9.92e-01 0.000709 0.0722 0.1 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0821 0.1 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.21e-01 0.235 0.151 0.1 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0941 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 2.00e-02 0.242 0.103 0.1 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0804 0.0783 0.1 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.41e-01 -0.124 0.105 0.1 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0438 0.102 0.101 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0812 0.095 0.101 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 8.13e-01 0.0236 0.0994 0.101 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0617 0.143 0.101 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00379 0.113 0.101 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 2.03e-01 0.118 0.092 0.101 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.00e+00 -4.58e-05 0.0914 0.101 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0212 0.131 0.101 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 1.18e-01 -0.232 0.148 0.101 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 5.30e-01 0.0812 0.129 0.1 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.65e-01 0.133 0.12 0.1 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 1.17e-01 -0.176 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.69e-01 0.187 0.135 0.1 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.92e-01 0.087 0.126 0.1 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 8.27e-02 0.168 0.0965 0.1 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0357 0.09 0.1 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 7.59e-02 -0.189 0.106 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 1.71e-01 -0.203 0.148 0.107 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 8.27e-01 0.0274 0.125 0.107 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.00e-01 -0.24 0.146 0.107 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.93e-01 -0.021 0.156 0.107 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.21e-01 0.0646 0.131 0.107 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.37e-01 0.24 0.161 0.107 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 5.13e-02 0.266 0.136 0.107 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0665 0.157 0.107 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 9.70e-01 0.00572 0.152 0.107 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 9.20e-01 0.0122 0.121 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0807 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0564 0.143 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.88e-01 0.0922 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 9.33e-01 0.00995 0.119 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.52e-03 0.312 0.119 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0361 0.134 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 6.27e-01 0.0717 0.147 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 2.21e-01 0.178 0.145 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.36e-02 -0.227 0.122 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.96e-01 0.121 0.115 0.101 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 2.41e-01 0.177 0.151 0.101 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 2.42e-02 -0.302 0.133 0.101 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0387 0.108 0.101 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 2.00e-01 0.124 0.0964 0.101 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 1.32e-01 -0.185 0.123 0.101 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 5.93e-01 -0.077 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 3.52e-01 -0.134 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 5.97e-01 0.0605 0.114 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.71e-01 0.131 0.118 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0373 0.149 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0333 0.122 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.51e-01 0.0995 0.106 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 8.16e-01 0.0267 0.115 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 3.70e-01 0.113 0.126 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.07e-01 -0.213 0.131 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 6.64e-01 0.0609 0.14 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 8.90e-01 0.0192 0.139 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0135 0.128 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00534 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 1.36e-01 0.201 0.134 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 8.36e-01 0.0247 0.119 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0472 0.117 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 1.29e-01 0.154 0.101 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 9.59e-01 0.00772 0.151 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 6.01e-01 0.076 0.145 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 1.13e-01 -0.233 0.146 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.60e-01 -0.167 0.148 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0599 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 5.16e-01 0.0933 0.143 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0272 0.145 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.55e-01 -0.13 0.14 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 2.71e-02 0.315 0.142 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 7.66e-01 0.0477 0.16 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.60e-01 0.0261 0.0853 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0891 0.0804 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 1.51e-01 -0.131 0.0907 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 3.14e-01 0.14 0.139 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.05e-02 -0.178 0.0978 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 4.46e-01 0.0623 0.0816 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 4.61e-01 0.0579 0.0784 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.77e-01 0.0937 0.132 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.74e-01 0.0342 0.119 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.63e-01 -0.104 0.0925 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.19e-01 0.0396 0.11 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 2.36e-01 0.176 0.148 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0318 0.117 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 8.82e-01 0.0139 0.0932 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 5.53e-01 0.0532 0.0896 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 6.03e-01 0.0712 0.137 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 1.84e-01 0.187 0.141 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 8.12e-01 0.0248 0.104 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.83e-01 0.0344 0.125 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 8.99e-01 0.0195 0.154 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 9.35e-01 0.0115 0.14 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.74e-01 0.051 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 3.48e-01 -0.117 0.124 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00455 0.137 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0883 0.122 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 1.88e-01 -0.155 0.118 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0132 0.12 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0762 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.73e-01 0.0212 0.132 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0416 0.108 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 2.16e-01 0.155 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 5.94e-01 0.0766 0.144 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 8.04e-02 0.201 0.114 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 7.73e-02 0.2 0.113 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.18e-01 0.0459 0.127 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 7.04e-01 0.0559 0.147 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.25e-02 -0.247 0.121 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.24e-01 -0.17 0.11 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 6.68e-01 0.0608 0.141 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.38e-01 0.0536 0.16 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0523 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.07e-01 0.0582 0.155 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 8.71e-01 0.0267 0.163 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.97e-02 -0.278 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 2.72e-01 0.143 0.13 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 4.50e-01 0.117 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.52e-01 0.227 0.158 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 9.52e-01 0.00944 0.158 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.99e-01 0.152 0.146 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 1.37e-01 0.23 0.154 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 3.21e-01 -0.163 0.163 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0908 0.159 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 2.57e-02 -0.335 0.149 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 3.25e-01 -0.142 0.144 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 3.53e-01 -0.139 0.149 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 2.61e-01 0.169 0.15 0.102 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 4.43e-02 0.274 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.70e-02 -0.277 0.125 0.102 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.22e-01 0.248 0.159 0.102 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0956 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 7.89e-01 0.0312 0.116 0.102 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 3.83e-01 -0.124 0.142 0.102 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.92e-02 -0.34 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0742 0.14 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 2.25e-01 -0.158 0.13 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 6.12e-01 0.0646 0.127 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 2.22e-02 0.352 0.153 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.23e-01 0.0824 0.129 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.54e-01 0.197 0.137 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 4.54e-02 0.292 0.145 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0339 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0963 0.136 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0414 0.121 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0158 0.107 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.81e-01 -0.102 0.116 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.73e-01 0.064 0.151 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0719 0.134 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.50e-01 0.0487 0.107 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 5.98e-01 0.0544 0.103 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.81e-01 -0.191 0.142 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 4.90e-01 -0.101 0.147 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.55e-01 0.0437 0.139 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 4.05e-01 0.115 0.137 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.35e-01 0.0427 0.126 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.18e-01 -0.24 0.153 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0899 0.144 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 7.09e-01 0.0482 0.129 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 8.94e-01 0.0193 0.144 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.02e-01 0.205 0.16 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 7.47e-01 0.042 0.13 0.103 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0616 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 8.58e-02 -0.205 0.119 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.71e-01 0.108 0.121 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.17e-01 -0.212 0.134 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.47e-01 -0.027 0.139 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.04e-01 0.109 0.106 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.50e-01 -0.176 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.31e-01 0.17 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 2.78e-01 -0.154 0.141 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 2.27e-01 0.2 0.164 0.111 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.92e-01 0.132 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.51e-01 0.00869 0.142 0.111 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 1.90e-01 0.21 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.47e-01 0.125 0.133 0.111 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 2.74e-01 -0.128 0.117 0.111 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 6.53e-01 0.0743 0.165 0.111 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0377 0.161 0.111 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 2.33e-01 -0.186 0.155 0.111 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0245 0.146 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0785 0.134 0.102 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0775 0.142 0.102 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0219 0.139 0.102 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0559 0.141 0.102 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.63e-01 0.157 0.112 0.102 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0517 0.104 0.102 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.55e-01 -0.142 0.124 0.102 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.96e-01 0.0513 0.131 0.1 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 9.94e-02 0.212 0.128 0.1 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0638 0.136 0.1 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 8.85e-01 0.0227 0.157 0.1 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 9.07e-01 0.0171 0.146 0.1 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 9.21e-01 -0.011 0.111 0.1 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 8.82e-01 0.0179 0.12 0.1 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.26e-01 0.121 0.151 0.1 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 4.17e-02 -0.264 0.129 0.102 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0272 0.134 0.102 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.58e-01 0.00788 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.03e-01 0.0479 0.126 0.102 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.60e-02 0.36 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00736 0.131 0.102 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 9.66e-01 0.00646 0.15 0.102 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00814 0.0839 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0762 0.0986 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 4.59e-01 0.109 0.147 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0239 0.135 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00366 0.0843 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0829 0.117 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0805 0.107 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0979 0.102 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.23e-01 0.242 0.156 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 3.23e-01 -0.144 0.145 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.23e-01 0.0609 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.67e-02 -0.256 0.106 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0775 0.123 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0627 0.192 0.094 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0729 0.178 0.094 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0116 0.186 0.094 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 3.37e-01 0.175 0.182 0.094 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 3.17e-01 0.182 0.181 0.094 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.90e-01 0.227 0.172 0.094 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00195 0.19 0.094 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.81e-01 -0.2 0.184 0.094 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 3.08e-01 0.133 0.13 0.1 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.73e-01 -0.113 0.127 0.1 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 1.83e-01 -0.195 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0363 0.153 0.1 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.44e-01 0.126 0.133 0.1 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.09e-01 -0.203 0.126 0.1 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 2.56e-01 0.155 0.136 0.1 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.43e-01 0.0377 0.114 0.102 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0166 0.0955 0.102 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.41e-01 -0.011 0.149 0.102 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.45e-01 -0.114 0.149 0.102 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.01e-02 0.282 0.129 0.102 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0462 0.127 0.102 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.42e-01 -0.194 0.131 0.102 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 6.82e-01 0.0712 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 4.74e-01 -0.12 0.167 0.096 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 2.48e-01 0.196 0.169 0.096 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 1.53e-01 -0.257 0.179 0.096 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 9.09e-01 0.0167 0.146 0.096 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0568 0.173 0.096 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 1.15e-02 -0.448 0.175 0.096 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 5.07e-02 -0.198 0.101 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.01e-01 0.035 0.0909 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 9.55e-01 0.00876 0.155 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 2.90e-01 -0.134 0.127 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0411 0.0914 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 6.42e-02 0.154 0.0827 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0987 0.107 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0484 0.136 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 7.75e-01 0.0404 0.141 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 3.95e-01 0.0942 0.111 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 2.87e-01 0.115 0.108 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0634 0.144 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 7.92e-01 0.0299 0.113 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 3.42e-01 0.0996 0.105 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.41e-01 0.00791 0.107 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 919719 sc-eQTL 3.60e-01 0.12 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 3.29e-01 -0.129 0.132 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 623344 sc-eQTL 7.42e-01 0.0449 0.136 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0283 0.0772 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0801 0.0914 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 7.49e-02 0.262 0.147 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0974 0.125 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.87e-01 0.139 0.105 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 1.21e-01 -0.123 0.0792 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.36e-01 -0.086 0.11 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 4.89e-01 0.0716 0.103 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0308 0.0867 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 3.77e-01 -0.138 0.156 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0681 0.144 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.95e-02 0.272 0.116 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0746 0.117 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0899 0.124 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 693231 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0285 0.104 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 52748 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0892 0.0961 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -526015 sc-eQTL 9.85e-01 0.00192 0.105 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -54813 sc-eQTL 4.44e-01 -0.114 0.149 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -837426 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0288 0.118 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 244679 sc-eQTL 1.25e-01 0.144 0.0939 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 180615 sc-eQTL 9.42e-01 0.00666 0.0913 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 155074 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0394 0.136 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 50794 sc-eQTL 1.87e-01 -0.197 0.149 0.099 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -54813 eQTL 0.0129 -0.0562 0.0226 0.0 0.0 0.109


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257322 \N 406883 1.27e-06 1.25e-06 2.31e-07 1.44e-06 3.6e-07 6.36e-07 1.41e-06 3.63e-07 1.7e-06 6.18e-07 1.86e-06 9.17e-07 2.66e-06 4.76e-07 4.95e-07 9.14e-07 9.81e-07 8.55e-07 7.13e-07 5.08e-07 7.41e-07 1.89e-06 9.91e-07 6.47e-07 2.37e-06 5.67e-07 9.89e-07 8.66e-07 1.35e-06 1.36e-06 7.46e-07 2.06e-07 2.62e-07 5.94e-07 8.33e-07 4.32e-07 6.93e-07 2.88e-07 5.13e-07 3.34e-07 3.02e-07 1.61e-06 1.39e-07 1.52e-07 1.82e-07 2.88e-07 2.7e-07 7.75e-08 1.12e-07