Genes within 1Mb (chr12:93611649:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0701 0.0802 0.109 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.32e-01 0.0499 0.0796 0.109 B L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 2.91e-01 -0.127 0.12 0.109 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 1.17e-03 -0.323 0.0981 0.109 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0204 0.0897 0.109 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0363 0.0791 0.109 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 5.78e-01 0.0497 0.0892 0.109 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 2.49e-01 0.142 0.123 0.109 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 4.26e-01 0.0978 0.123 0.109 B L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00473 0.0811 0.109 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 3.58e-02 -0.164 0.0776 0.109 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0649 0.0822 0.109 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 3.13e-01 0.136 0.135 0.109 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 6.64e-01 0.0374 0.0862 0.109 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0827 0.0776 0.109 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 8.65e-01 0.0123 0.0723 0.109 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 9.24e-01 0.012 0.126 0.109 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.07e-01 0.0106 0.0909 0.109 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00422 0.104 0.109 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0607 0.107 0.109 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 3.55e-01 0.117 0.126 0.109 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 2.84e-01 -0.107 0.1 0.109 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0122 0.0749 0.109 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 3.57e-01 0.0859 0.0931 0.109 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.12e-01 0.0317 0.133 0.109 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 7.32e-01 0.0414 0.121 0.11 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.62e-01 0.119 0.13 0.11 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.11e-01 0.234 0.146 0.11 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 3.03e-01 0.119 0.116 0.11 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0495 0.121 0.11 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 1.24e-01 -0.188 0.121 0.11 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 6.67e-01 0.0604 0.14 0.11 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 4.42e-01 0.0555 0.072 0.109 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.77e-01 0.0728 0.0822 0.109 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 2.82e-01 -0.163 0.151 0.109 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 3.48e-01 -0.114 0.121 0.109 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 4.11e-01 0.086 0.104 0.109 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0565 0.0783 0.109 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 4.24e-01 0.0844 0.105 0.109 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00358 0.101 0.109 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 2.22e-01 0.115 0.094 0.109 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.05e-01 0.159 0.0979 0.109 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 2.17e-01 -0.175 0.141 0.109 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 9.30e-02 -0.188 0.111 0.109 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 1.35e-01 -0.136 0.091 0.109 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 1.55e-01 0.128 0.0901 0.109 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 2.83e-01 0.139 0.129 0.109 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 1.39e-01 0.218 0.147 0.109 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00607 0.13 0.109 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 1.37e-02 -0.295 0.119 0.109 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 6.47e-01 0.0518 0.113 0.109 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0443 0.137 0.109 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 3.02e-01 0.131 0.127 0.109 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.34e-01 0.00804 0.0977 0.109 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0599 0.0904 0.109 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.51e-01 0.034 0.107 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00239 0.149 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.33e-01 0.188 0.124 0.117 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 9.66e-01 0.00635 0.147 0.117 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.48e-01 -0.118 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 7.52e-01 0.0414 0.131 0.117 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0483 0.162 0.117 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 3.94e-01 0.117 0.137 0.117 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.07e-01 0.0386 0.157 0.117 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 6.07e-01 0.0785 0.152 0.117 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 6.18e-01 -0.062 0.124 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.33e-01 0.0261 0.123 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.37e-01 -0.114 0.146 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.87e-01 0.0949 0.136 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.76e-01 -0.0037 0.122 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0573 0.124 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 2.15e-01 -0.171 0.137 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0892 0.151 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 4.95e-01 0.102 0.149 0.107 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 2.17e-01 -0.153 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 4.05e-01 0.0973 0.116 0.108 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.90e-02 -0.356 0.151 0.108 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0933 0.136 0.108 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.35e-01 0.0679 0.109 0.108 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0619 0.0977 0.108 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 4.39e-01 0.0964 0.124 0.108 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.69e-01 0.0426 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 5.32e-01 0.0907 0.145 0.108 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 2.77e-01 -0.124 0.114 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.67e-01 0.164 0.118 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0133 0.149 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 1.85e-02 -0.287 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0542 0.107 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0365 0.115 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 1.12e-01 0.201 0.126 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.05e-01 0.0884 0.132 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 3.51e-03 0.406 0.138 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 5.43e-01 0.0843 0.139 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.21e-01 0.0291 0.128 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 6.23e-01 0.071 0.144 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.65e-02 -0.268 0.134 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.24e-01 -0.076 0.119 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0453 0.117 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 3.66e-01 0.0916 0.101 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 4.10e-01 0.125 0.151 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 9.57e-01 0.00776 0.145 0.107 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.02e-01 0.0362 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 1.62e-01 -0.203 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 9.49e-01 0.00885 0.138 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.14e-01 0.221 0.139 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0335 0.141 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 3.05e-02 -0.296 0.136 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 2.48e-01 0.162 0.14 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 1.44e-01 -0.228 0.156 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00221 0.0853 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 1.37e-01 -0.12 0.0801 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0538 0.091 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00062 0.139 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.87e-01 0.0535 0.0984 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 1.23e-01 -0.126 0.0812 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0214 0.0784 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 4.57e-01 0.098 0.131 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 6.23e-01 0.0585 0.119 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 2.01e-01 -0.118 0.0921 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0253 0.11 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.73e-01 0.202 0.148 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00271 0.117 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.79e-01 0.0141 0.0929 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0503 0.0893 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 9.75e-01 0.00436 0.136 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 6.48e-01 0.0621 0.136 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 1.21e-01 -0.155 0.0998 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.62e-01 0.0698 0.12 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.51e-01 0.112 0.148 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.69e-01 -0.077 0.135 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 1.86e-01 0.154 0.116 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 3.25e-01 -0.118 0.12 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 3.07e-01 -0.135 0.131 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0372 0.122 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 3.39e-01 0.113 0.118 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.13e-01 0.0787 0.12 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.96e-01 0.189 0.145 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.28e-01 -0.105 0.132 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0275 0.108 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 7.31e-01 0.0432 0.126 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 2.10e-01 0.18 0.144 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 5.54e-01 0.0676 0.114 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 4.33e-02 -0.226 0.111 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.85e-02 -0.214 0.125 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0456 0.145 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0624 0.121 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 1.74e-01 -0.137 0.1 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 9.23e-02 0.184 0.109 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0765 0.14 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 2.09e-01 -0.196 0.155 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 7.06e-01 0.0505 0.134 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0939 0.15 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.27e-01 0.126 0.158 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0951 0.154 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.08e-02 0.213 0.125 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.18e-01 -0.075 0.15 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 4.76e-02 0.304 0.152 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00752 0.147 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 4.91e-01 0.0938 0.136 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0603 0.143 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 7.34e-01 0.0518 0.152 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 6.06e-01 0.0765 0.148 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.97e-01 0.074 0.14 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 4.21e-01 0.108 0.133 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0217 0.138 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00764 0.146 0.11 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 9.72e-02 -0.22 0.132 0.11 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 4.35e-01 0.0955 0.122 0.11 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0607 0.155 0.11 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.64e-01 0.0808 0.14 0.11 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 6.11e-01 0.0574 0.113 0.11 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 1.38e-01 -0.205 0.138 0.11 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 2.39e-01 0.167 0.141 0.11 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 4.42e-01 0.108 0.14 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 5.53e-01 0.0774 0.13 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.04e-01 0.131 0.127 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.73e-01 0.111 0.154 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0474 0.129 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.28e-01 0.0125 0.138 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 3.62e-01 0.133 0.146 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.87e-03 0.378 0.143 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 4.46e-01 -0.104 0.135 0.109 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 4.96e-01 0.0813 0.119 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 4.26e-01 0.0842 0.106 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.08e-02 0.291 0.113 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.55e-02 -0.36 0.148 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0715 0.133 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 3.18e-01 -0.106 0.106 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.31e-01 0.049 0.102 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 3.97e-02 0.289 0.14 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 2.43e-01 0.169 0.145 0.11 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 1.60e-01 -0.197 0.139 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 2.04e-01 0.175 0.138 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.126 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 5.21e-01 0.0995 0.155 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 8.83e-01 0.0214 0.145 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0739 0.129 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 1.13e-02 0.365 0.143 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 1.38e-02 -0.396 0.159 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 7.32e-01 0.0447 0.131 0.11 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0326 0.124 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 6.77e-01 0.0493 0.118 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0653 0.12 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0881 0.134 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 3.29e-01 -0.135 0.138 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0206 0.105 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.41e-01 0.0741 0.121 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.44e-01 -0.046 0.14 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 1.82e-01 0.187 0.14 0.11 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.42e-01 0.032 0.16 0.141 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.00e-01 0.155 0.149 0.141 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0315 0.138 0.141 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 1.51e-01 -0.223 0.154 0.141 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0394 0.129 0.141 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.74e-01 0.0641 0.113 0.141 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 7.78e-01 0.0452 0.16 0.141 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.16e-01 0.0363 0.156 0.141 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 5.07e-01 0.101 0.151 0.141 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0204 0.148 0.107 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 9.07e-01 0.0159 0.136 0.107 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0942 0.145 0.107 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 9.74e-01 0.00462 0.141 0.107 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 1.75e-02 0.339 0.141 0.107 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.82e-01 0.063 0.115 0.107 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.51e-01 -0.063 0.106 0.107 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.61e-01 0.0223 0.127 0.107 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.12e-01 0.0307 0.129 0.109 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 6.05e-01 0.0658 0.127 0.109 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.40e-01 -0.128 0.134 0.109 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0621 0.155 0.109 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 8.95e-01 0.019 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.11e-01 -0.072 0.11 0.109 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 2.74e-01 0.129 0.118 0.109 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.00e-01 0.1 0.149 0.109 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0227 0.127 0.115 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 4.48e-02 0.261 0.129 0.115 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.13e-01 0.228 0.143 0.115 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 2.01e-01 0.157 0.122 0.115 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 8.37e-01 0.0302 0.147 0.115 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 2.60e-01 -0.144 0.127 0.115 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.74e-01 0.0824 0.146 0.115 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 5.21e-01 0.0525 0.0817 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0184 0.0962 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 2.93e-01 -0.15 0.143 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0843 0.131 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 3.54e-01 0.097 0.105 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0442 0.0821 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0163 0.114 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 5.10e-01 0.07 0.106 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.09e-01 0.103 0.101 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.55e-01 -0.116 0.155 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.87e-01 0.078 0.143 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 7.08e-01 0.0458 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 6.99e-01 -0.041 0.106 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.88e-01 0.0327 0.122 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0314 0.188 0.091 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 5.60e-01 0.101 0.174 0.091 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 2.51e-01 0.209 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 2.90e-01 0.189 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 3.20e-01 0.177 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.04e-01 -0.113 0.169 0.091 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 2.10e-01 0.232 0.185 0.091 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0526 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 5.24e-01 0.0826 0.13 0.111 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00468 0.126 0.111 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 4.26e-01 0.116 0.145 0.111 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0619 0.152 0.111 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 6.62e-01 0.0579 0.132 0.111 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 3.09e-01 -0.128 0.126 0.111 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0612 0.136 0.111 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.09e-01 0.0128 0.112 0.111 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 5.44e-01 0.0567 0.0934 0.111 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 3.64e-01 -0.132 0.145 0.111 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 4.30e-01 -0.115 0.146 0.111 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.36e-02 0.214 0.127 0.111 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 4.31e-02 -0.251 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 7.68e-03 0.342 0.127 0.111 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 3.55e-01 0.145 0.157 0.107 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 8.82e-01 0.0226 0.152 0.107 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 5.77e-02 0.29 0.152 0.107 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0652 0.163 0.107 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0782 0.132 0.107 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00427 0.156 0.107 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 9.32e-01 0.0138 0.162 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0997 0.103 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 3.93e-01 0.079 0.0924 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.43e-01 -0.23 0.157 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00628 0.129 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 6.82e-01 0.0381 0.093 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0116 0.0848 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 7.57e-01 0.0339 0.109 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000126 0.138 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 6.30e-01 0.0694 0.144 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0544 0.112 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.83e-01 0.146 0.109 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0327 0.145 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 1.43e-03 -0.36 0.112 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0642 0.106 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0253 0.109 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 908806 sc-eQTL 9.21e-02 0.223 0.132 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 5.06e-01 0.0891 0.134 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 612431 sc-eQTL 5.41e-02 0.264 0.136 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 3.61e-01 0.0694 0.0758 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 6.45e-01 0.0414 0.0899 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 1.68e-01 -0.2 0.144 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0385 0.123 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 3.52e-01 0.0967 0.104 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0246 0.0782 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 8.74e-01 0.0173 0.108 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.62e-01 0.00486 0.103 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 2.73e-01 0.0944 0.086 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0772 0.156 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0825 0.143 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 1.42e-01 0.171 0.116 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 1.79e-01 -0.157 0.116 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 1.45e-01 0.179 0.122 0.11 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 682318 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00733 0.104 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 41835 sc-eQTL 1.28e-01 0.145 0.0951 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -536928 sc-eQTL 1.56e-01 0.148 0.104 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -65726 sc-eQTL 8.58e-02 -0.253 0.147 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -848339 sc-eQTL 9.87e-02 -0.194 0.117 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 233766 sc-eQTL 9.03e-02 -0.158 0.0931 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 169702 sc-eQTL 2.46e-01 0.105 0.0904 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 144161 sc-eQTL 4.65e-01 0.0991 0.135 0.11 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 39881 sc-eQTL 1.19e-01 0.232 0.148 0.11 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 \N 144161 4e-06 3.65e-06 5.15e-07 1.99e-06 7.44e-07 8.17e-07 2.37e-06 9.1e-07 2.37e-06 1.4e-06 3.14e-06 1.84e-06 4.79e-06 1.39e-06 9e-07 2.06e-06 1.57e-06 2.17e-06 1.48e-06 1.21e-06 1.54e-06 3.54e-06 3.2e-06 1.56e-06 4.02e-06 1.25e-06 1.63e-06 1.71e-06 2.77e-06 2.5e-06 1.91e-06 4.33e-07 6.23e-07 1.42e-06 1.63e-06 9.36e-07 9.41e-07 4.21e-07 1.2e-06 4.17e-07 1.51e-07 4.22e-06 5.42e-07 1.9e-07 3.41e-07 3.62e-07 8.28e-07 2.49e-07 1.76e-07
ENSG00000236349 \N -936592 2.67e-07 1.3e-07 4.98e-08 1.81e-07 9.24e-08 9.9e-08 1.53e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.47e-07 6.76e-08 6.12e-08 7.49e-08 3.93e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.21e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.46e-07 1.21e-07 1.1e-07 9.74e-08 1.12e-07 1.03e-07 9.92e-08 3.1e-08 3.66e-08 8.25e-08 7.02e-08 3.14e-08 5.37e-08 9.23e-08 6.55e-08 3.8e-08 4.94e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.26e-08 3.84e-08 1.87e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.02e-08