Genes within 1Mb (chr12:93608556:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.32e-01 0.0782 0.0994 0.062 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0695 0.0985 0.062 B L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.43e-01 0.0296 0.149 0.062 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.43e-01 0.0246 0.125 0.062 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.00e-01 0.115 0.111 0.062 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.26e-01 0.149 0.0974 0.062 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 2.43e-01 0.129 0.11 0.062 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0836 0.153 0.062 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0941 0.152 0.062 B L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.84e-01 0.0723 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0368 0.0998 0.062 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 4.24e-01 0.0838 0.105 0.062 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0483 0.172 0.062 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 4.57e-01 0.0817 0.11 0.062 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 7.10e-01 0.0369 0.0991 0.062 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00753 0.0921 0.062 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.46e-01 -0.0109 0.16 0.062 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 3.22e-02 0.243 0.113 0.062 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 2.70e-01 0.144 0.131 0.062 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0753 0.135 0.062 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.35e-01 0.0754 0.159 0.062 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.85e-01 -0.135 0.126 0.062 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 5.62e-01 0.0547 0.0941 0.062 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0695 0.117 0.062 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.95e-01 -0.175 0.167 0.062 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0142 0.157 0.056 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 6.52e-02 0.312 0.168 0.056 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.25e-01 0.0423 0.191 0.056 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 7.26e-01 0.053 0.151 0.056 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.36e-02 0.291 0.156 0.056 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 3.90e-01 0.137 0.159 0.056 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0215 0.183 0.056 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0623 0.0913 0.062 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 8.32e-01 0.0222 0.104 0.062 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0505 0.192 0.062 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0451 0.154 0.062 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 9.84e-01 0.00268 0.132 0.062 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.65e-01 0.111 0.0991 0.062 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0823 0.134 0.062 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.35e-01 0.101 0.129 0.06 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 3.61e-01 0.11 0.121 0.06 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.21e-01 -0.155 0.126 0.06 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0304 0.181 0.06 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.62e-01 -0.161 0.143 0.06 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 4.36e-02 0.236 0.116 0.06 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.02e-01 0.189 0.115 0.06 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.45e-01 -0.1 0.166 0.06 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 7.44e-01 0.0618 0.189 0.06 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 7.77e-01 0.0463 0.163 0.062 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0464 0.151 0.062 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.09e-01 -0.226 0.141 0.062 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.55e-01 -0.158 0.171 0.062 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0168 0.159 0.062 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 1.68e-01 -0.168 0.122 0.062 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0363 0.113 0.062 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.58e-02 -0.223 0.133 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0733 0.191 0.066 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 5.99e-02 -0.301 0.159 0.066 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 2.01e-01 0.241 0.188 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.90e-01 0.0277 0.2 0.066 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.93e-01 0.143 0.168 0.066 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 4.24e-01 -0.167 0.208 0.066 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 3.07e-02 0.379 0.174 0.066 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 1.53e-01 -0.288 0.201 0.066 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 1.94e-01 0.254 0.195 0.066 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.47e-01 0.219 0.15 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 3.07e-01 -0.153 0.149 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 1.12e-01 0.283 0.177 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 3.96e-01 0.141 0.166 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.06e-01 0.152 0.148 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.97e-01 0.158 0.151 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 9.53e-01 0.00985 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.68e-01 -0.204 0.184 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 3.07e-01 0.185 0.181 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.64e-01 0.215 0.154 0.06 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 8.60e-01 0.0258 0.146 0.06 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 5.13e-01 -0.125 0.19 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 9.34e-01 0.0141 0.17 0.06 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.11e-01 0.171 0.136 0.06 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 3.63e-01 0.111 0.122 0.06 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 6.03e-01 0.081 0.156 0.06 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.28e-01 -0.115 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 8.56e-01 0.033 0.181 0.06 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0996 0.144 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.46e-01 -0.174 0.149 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.37e-01 0.0387 0.188 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0436 0.155 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0364 0.134 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 8.53e-01 0.0268 0.145 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0777 0.16 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.14e-01 -0.109 0.167 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0428 0.177 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 5.09e-01 -0.114 0.172 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.19e-01 -0.196 0.159 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.80e-01 -0.158 0.179 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 4.39e-01 -0.13 0.168 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.66e-01 -0.134 0.148 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.50e-01 0.209 0.145 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 2.06e-01 0.16 0.126 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 7.47e-01 0.0609 0.188 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 7.86e-01 0.0491 0.181 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.68e-01 0.129 0.177 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 6.99e-01 0.0691 0.178 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.96e-02 -0.394 0.168 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0757 0.172 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0935 0.174 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.89e-01 0.179 0.168 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 9.21e-01 -0.017 0.172 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.60e-01 0.217 0.192 0.066 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 2.39e-01 0.129 0.109 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0237 0.103 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.11e-01 0.146 0.116 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.45e-01 0.0349 0.178 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.46e-01 0.146 0.126 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.27e-01 0.126 0.104 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0527 0.1 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0812 0.169 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 7.69e-01 0.0441 0.15 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0234 0.117 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 7.09e-01 0.0518 0.139 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 2.82e-01 -0.201 0.187 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.55e-01 0.027 0.148 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0485 0.117 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 8.32e-01 -0.024 0.113 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 3.50e-01 0.161 0.172 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0809 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 2.51e-01 -0.145 0.126 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0183 0.151 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 2.80e-02 0.407 0.184 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0176 0.17 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 1.90e-01 -0.192 0.146 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 8.63e-01 0.026 0.151 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0147 0.166 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.89e-01 0.202 0.153 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 8.43e-02 0.257 0.148 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 5.44e-02 -0.29 0.15 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.34e-01 -0.178 0.183 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 6.80e-01 0.0687 0.167 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 1.72e-01 0.186 0.136 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0421 0.158 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0426 0.181 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.69e-01 0.196 0.142 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 9.42e-01 0.0102 0.14 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 6.63e-02 0.288 0.156 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 5.87e-01 0.0987 0.182 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 3.75e-01 -0.135 0.151 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.81e-01 0.11 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 8.63e-01 0.0236 0.137 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.39e-01 -0.108 0.175 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 3.20e-01 0.185 0.185 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 7.50e-01 -0.051 0.16 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.22e-01 -0.277 0.178 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 1.03e-01 0.309 0.188 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.33e-01 0.219 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.02e-01 0.0786 0.151 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 6.27e-01 0.0873 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0642 0.184 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 3.94e-01 0.16 0.187 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0948 0.174 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0503 0.183 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.65e-01 0.033 0.194 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 3.80e-01 -0.166 0.188 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00742 0.178 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0559 0.17 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0911 0.176 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.10e-01 -0.148 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 7.03e-01 0.0625 0.164 0.063 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.88e-01 -0.198 0.15 0.063 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0125 0.192 0.063 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0269 0.173 0.063 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.39e-02 -0.313 0.137 0.063 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 5.63e-01 0.0988 0.17 0.063 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 1.45e-01 -0.254 0.173 0.063 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0847 0.179 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 8.93e-01 0.0226 0.168 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 6.97e-02 -0.295 0.162 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0726 0.198 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 9.95e-02 -0.272 0.164 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 3.53e-01 0.164 0.176 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 6.90e-02 0.34 0.186 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00593 0.187 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 2.00e-01 0.223 0.174 0.058 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 5.74e-01 0.086 0.153 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 6.47e-01 0.062 0.135 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.147 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0829 0.192 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0317 0.17 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.22e-03 0.412 0.133 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0341 0.131 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0712 0.181 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 4.77e-01 0.132 0.186 0.06 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 6.03e-01 0.0974 0.187 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 5.07e-01 -0.123 0.185 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0553 0.169 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 9.50e-01 0.0129 0.207 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 6.68e-01 0.0833 0.194 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0791 0.173 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 5.73e-01 0.109 0.194 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.57e-01 0.0116 0.216 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 3.84e-01 -0.152 0.175 0.062 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 5.37e-01 0.101 0.163 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 3.06e-01 0.16 0.156 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 3.99e-01 -0.133 0.158 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.23e-01 0.175 0.176 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.71e-01 0.0296 0.182 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 4.59e-01 0.103 0.139 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.50e-01 0.184 0.159 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.30e-01 -0.116 0.185 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 2.09e-01 -0.233 0.185 0.06 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 3.77e-01 0.21 0.237 0.067 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 3.78e-01 0.195 0.221 0.067 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.77e-01 -0.181 0.204 0.067 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 5.80e-01 -0.128 0.23 0.067 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.12e-01 -0.238 0.19 0.067 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 4.90e-01 0.116 0.168 0.067 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 5.86e-01 0.129 0.237 0.067 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.75e-01 0.252 0.23 0.067 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 1.46e-02 -0.542 0.218 0.067 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 7.26e-01 0.0663 0.189 0.061 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0154 0.173 0.061 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 4.12e-01 -0.152 0.184 0.061 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0814 0.18 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.38e-01 0.215 0.182 0.061 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0196 0.146 0.061 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 3.25e-01 0.133 0.134 0.061 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 1.97e-01 -0.209 0.161 0.061 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 2.37e-01 0.188 0.159 0.062 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 5.24e-01 0.1 0.157 0.062 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 6.15e-01 0.0832 0.165 0.062 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 5.20e-01 -0.123 0.191 0.062 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 7.51e-01 0.0561 0.177 0.062 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 5.38e-02 0.26 0.134 0.062 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.22e-01 0.178 0.145 0.062 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 1.33e-01 -0.275 0.183 0.062 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0243 0.167 0.056 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0066 0.172 0.056 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.65e-01 0.0824 0.19 0.056 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 4.54e-01 0.121 0.161 0.056 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 1.12e-01 0.307 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.99e-01 0.216 0.167 0.056 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.89e-01 -0.204 0.192 0.056 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0617 0.105 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 8.12e-01 0.0295 0.124 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.67e-01 0.0792 0.184 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 4.62e-01 0.124 0.168 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0221 0.135 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 9.52e-01 0.00631 0.105 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 3.83e-01 -0.127 0.146 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 4.26e-01 -0.109 0.137 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 4.68e-01 0.0951 0.131 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 6.82e-01 0.0822 0.201 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.83e-01 -0.199 0.185 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 9.88e-01 0.00246 0.158 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 4.88e-01 0.0952 0.137 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 3.24e-01 -0.155 0.157 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 8.29e-01 0.0494 0.228 0.058 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0982 0.211 0.058 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 9.24e-01 -0.021 0.221 0.058 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 7.88e-02 -0.38 0.214 0.058 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 7.77e-01 0.0612 0.216 0.058 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 4.38e-01 0.16 0.206 0.058 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.82e-01 -0.242 0.225 0.058 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.83e-01 -0.236 0.219 0.058 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00163 0.167 0.058 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0317 0.162 0.058 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0697 0.187 0.058 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.58e-01 0.035 0.195 0.058 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 5.76e-01 0.0952 0.17 0.058 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 2.32e-01 0.193 0.161 0.058 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 1.37e-01 -0.259 0.173 0.058 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 8.86e-01 -0.021 0.146 0.057 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.52e-01 0.174 0.121 0.057 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 5.02e-01 -0.127 0.189 0.057 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0321 0.19 0.057 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0594 0.166 0.057 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 4.88e-01 0.112 0.162 0.057 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 7.47e-01 0.0543 0.168 0.057 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0234 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.46e-01 0.286 0.196 0.056 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.88e-01 -0.172 0.199 0.056 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.48e-01 0.244 0.211 0.056 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.09e-01 0.215 0.171 0.056 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.37e-01 -0.301 0.202 0.056 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 3.55e-01 0.194 0.21 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.11e-01 0.202 0.126 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.38e-01 -0.134 0.113 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.39e-01 0.184 0.193 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 2.10e-01 0.198 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 1.25e-01 0.175 0.113 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.99e-01 0.133 0.104 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 4.02e-01 0.112 0.134 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 4.57e-01 -0.126 0.169 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 7.98e-01 0.0453 0.176 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 3.48e-01 -0.131 0.14 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 1.23e-01 -0.211 0.136 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 8.77e-01 0.0282 0.181 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 3.53e-01 -0.132 0.142 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0658 0.132 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 3.41e-01 0.129 0.135 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 905713 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0554 0.166 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 5.33e-01 -0.104 0.167 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 609338 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0702 0.172 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 1.87e-01 -0.129 0.0973 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 8.01e-01 0.0292 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 3.46e-01 0.176 0.186 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0685 0.158 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0603 0.134 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 6.53e-01 0.0454 0.101 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 2.55e-01 -0.159 0.139 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0681 0.132 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 4.23e-01 0.0885 0.11 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 2.73e-01 -0.219 0.199 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 9.91e-01 0.002 0.184 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 4.77e-01 0.106 0.149 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 1.74e-01 0.203 0.149 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 9.65e-01 0.00689 0.158 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 679225 sc-eQTL 2.76e-01 0.145 0.133 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 38742 sc-eQTL 5.10e-01 0.0809 0.123 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -540021 sc-eQTL 2.36e-01 -0.159 0.134 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -68819 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0194 0.19 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -851432 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0808 0.151 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 230673 sc-eQTL 2.80e-02 0.263 0.119 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 166609 sc-eQTL 3.34e-01 0.112 0.116 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 141068 sc-eQTL 6.87e-01 -0.07 0.174 0.06 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 36788 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0114 0.191 0.06 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -68819 eQTL 0.0329 0.0563 0.0263 0.0 0.0 0.0716
ENSG00000173588 CEP83 -851432 eQTL 0.073 -0.0865 0.0482 0.00122 0.0 0.0716
ENSG00000236349 SUCLG2P2 -939685 eQTL 0.0525 -0.0841 0.0433 0.00127 0.0 0.0716


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000102189 \N 679225 3.07e-07 1.33e-07 5.35e-08 2.26e-07 1.03e-07 8.37e-08 1.9e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.4e-08 1.67e-07 1.05e-07 1.71e-07 8.13e-08 5.72e-08 7.49e-08 4.31e-08 1.56e-07 6.32e-08 4.92e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.5e-07 2.83e-08 1.72e-07 1.25e-07 1.18e-07 1.01e-07 1.22e-07 1.03e-07 1.08e-07 5.01e-08 3.96e-08 9.8e-08 3.02e-08 3.14e-08 5.65e-08 8.2e-08 6.71e-08 3.82e-08 5.24e-08 1.46e-07 3.99e-08 1.11e-08 3.41e-08 1.71e-08 1.15e-07 1.92e-09 5.02e-08
ENSG00000136040 \N -540021 4.89e-07 2.3e-07 7e-08 2.58e-07 1.06e-07 1.25e-07 3.11e-07 5.84e-08 1.89e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.46e-07 2.94e-07 8.42e-08 6.93e-08 9.11e-08 6.63e-08 2.43e-07 7.42e-08 6.73e-08 1.33e-07 1.89e-07 1.81e-07 3.67e-08 2.86e-07 1.43e-07 1.29e-07 1.42e-07 1.36e-07 1.59e-07 1.35e-07 8.48e-08 3.65e-08 1.03e-07 8.75e-08 3.3e-08 6.04e-08 5.8e-08 5.95e-08 6.67e-08 4.47e-08 2e-07 2.89e-08 1.53e-08 4e-08 1.05e-08 7.52e-08 0.0 4.94e-08