logo

Genes within 1Mb (chr12:93605007:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0771 0.0586 0.207 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.34e-01 0.0457 0.0583 0.207 B L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 3.86e-01 0.0766 0.0882 0.207 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 2.78e-01 0.0799 0.0735 0.207 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0128 0.0657 0.207 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00556 0.058 0.207 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0947 0.0651 0.207 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0267 0.0904 0.207 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 6.93e-01 0.0356 0.09 0.207 B L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0684 0.0606 0.207 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0276 0.0588 0.207 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.67e-01 0.0353 0.0617 0.207 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 9.76e-01 0.00309 0.101 0.207 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0153 0.0647 0.207 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.45e-01 0.0114 0.0584 0.207 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 9.01e-01 0.00673 0.0542 0.207 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0855 0.0941 0.207 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0367 0.0685 0.207 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0994 0.0784 0.207 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.77e-01 0.0577 0.081 0.207 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 9.12e-01 0.0105 0.0954 0.207 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0205 0.0757 0.207 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 2.84e-01 0.0606 0.0564 0.207 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0243 0.0704 0.207 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0205 0.1 0.207 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 6.03e-02 0.169 0.0893 0.214 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0718 0.0972 0.214 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.38e-01 -0.129 0.109 0.214 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.37e-01 -0.041 0.0866 0.214 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 7.06e-02 -0.163 0.0896 0.214 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.13e-01 -0.092 0.091 0.214 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 6.97e-01 0.0408 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 4.66e-01 0.0391 0.0536 0.207 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 1.36e-01 0.0912 0.061 0.207 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 5.14e-01 0.0738 0.113 0.207 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 4.71e-01 0.0653 0.0905 0.207 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0343 0.0778 0.207 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 6.70e-01 0.0249 0.0584 0.207 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0131 0.0786 0.207 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 9.38e-01 0.00592 0.0761 0.208 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 7.02e-01 0.0272 0.0711 0.208 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.00e-01 0.0501 0.0742 0.208 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 8.59e-01 0.0189 0.107 0.208 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0907 0.0841 0.208 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 9.61e-01 0.0034 0.069 0.208 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0946 0.0679 0.208 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.76e-01 -0.132 0.0971 0.208 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 9.51e-01 0.0069 0.111 0.208 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000779 0.0961 0.207 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 1.34e-01 -0.133 0.0886 0.207 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0961 0.0833 0.207 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 1.99e-01 -0.13 0.101 0.207 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0347 0.094 0.207 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 2.39e-01 0.085 0.0719 0.207 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0371 0.0669 0.207 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0636 0.079 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.04e-01 -0.12 0.116 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.16e-01 0.0798 0.0979 0.204 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 1.49e-02 0.278 0.113 0.204 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 4.61e-01 0.09 0.122 0.204 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0615 0.102 0.204 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 8.40e-02 -0.219 0.126 0.204 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.204 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0426 0.123 0.204 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0626 0.119 0.204 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 1.88e-01 -0.117 0.0889 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00363 0.0885 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0787 0.105 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 3.45e-02 -0.206 0.097 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0349 0.0876 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0889 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0863 0.0987 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00838 0.109 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 8.36e-01 0.0223 0.107 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0461 0.0918 0.207 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 6.76e-01 0.0362 0.0864 0.207 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0175 0.113 0.207 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.91e-03 0.266 0.0991 0.207 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.40e-01 0.0496 0.0809 0.207 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0114 0.0724 0.207 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0939 0.092 0.207 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.69e-01 -0.148 0.107 0.207 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0503 0.107 0.207 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.33e-01 0.0182 0.0859 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.44e-01 0.0682 0.0891 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.52e-01 0.128 0.112 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 1.39e-01 0.136 0.0916 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 7.52e-01 0.0254 0.0801 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.00e-02 0.186 0.0852 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 4.21e-02 -0.193 0.0943 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0992 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 7.62e-01 -0.032 0.105 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 2.92e-01 0.111 0.105 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 7.29e-01 0.0338 0.0973 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 3.32e-01 -0.106 0.109 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0702 0.103 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 4.95e-01 0.0619 0.0906 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0521 0.0886 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 5.00e-01 0.052 0.0769 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0415 0.115 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 3.78e-01 0.0974 0.11 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0449 0.109 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0518 0.11 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.19e-01 0.129 0.104 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 9.91e-01 0.00117 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 1.04e-01 0.174 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 1.68e-01 -0.143 0.104 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.78e-01 -0.143 0.106 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 9.10e-01 0.0135 0.119 0.207 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0658 0.0645 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0285 0.061 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.81e-01 0.0744 0.0688 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0271 0.105 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.06e-01 0.0386 0.0746 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 4.64e-01 0.0454 0.0619 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.39e-01 0.0569 0.0593 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0621 0.0997 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0606 0.0888 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 9.12e-01 0.00763 0.0692 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 7.08e-01 0.0309 0.0822 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 3.57e-01 -0.102 0.111 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0954 0.0874 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0282 0.0695 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0522 0.0668 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0848 0.102 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00558 0.102 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0242 0.0752 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0627 0.09 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.68e-01 0.123 0.111 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00998 0.101 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.95e-01 0.0116 0.0875 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 7.92e-01 0.0237 0.0898 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0622 0.0987 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 5.28e-01 0.0587 0.0928 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 3.75e-02 -0.187 0.0893 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.35e-01 0.0569 0.0915 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0424 0.111 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 5.52e-01 0.0601 0.101 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 2.14e-01 0.102 0.0821 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 6.76e-01 0.04 0.0956 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 6.45e-01 -0.039 0.0847 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 9.13e-01 0.00908 0.0834 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.95e-01 0.0977 0.0931 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.90e-01 0.114 0.108 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 5.98e-01 0.0475 0.09 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 4.08e-02 0.152 0.074 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0396 0.0815 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 5.63e-01 0.0603 0.104 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.41e-01 0.0224 0.112 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 7.86e-01 0.026 0.0958 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 3.28e-01 0.105 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 6.67e-01 -0.049 0.114 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0443 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 9.99e-01 0.000169 0.0904 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.65e-01 0.149 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.39e-01 -0.163 0.11 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 6.36e-01 0.0532 0.112 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0918 0.104 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.67e-01 0.0799 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 1.61e-01 0.163 0.116 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.49e-01 0.0516 0.113 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.77e-01 0.0728 0.102 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.41e-01 0.0213 0.106 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.61e-01 0.0188 0.107 0.206 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0926 0.0976 0.206 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0723 0.0899 0.206 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.44e-01 -0.133 0.114 0.206 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.206 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 1.39e-01 0.123 0.0826 0.206 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0978 0.102 0.206 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0798 0.104 0.206 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.55e-01 0.097 0.105 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 3.91e-01 0.084 0.0977 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 1.15e-01 0.15 0.0947 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 7.66e-01 0.0346 0.116 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.80e-01 0.027 0.0965 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.60e-01 0.0183 0.103 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.00e-02 -0.28 0.108 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0831 0.109 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 6.67e-01 0.0438 0.102 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 9.60e-01 0.00455 0.0911 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 3.42e-01 0.0765 0.0804 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.10e-01 0.0578 0.0876 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000726 0.114 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00278 0.101 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.83e-01 0.0444 0.0809 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0957 0.0774 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0539 0.111 0.207 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 2.92e-02 -0.229 0.104 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 1.46e-01 -0.151 0.103 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 7.45e-01 0.0309 0.095 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.65e-01 0.13 0.116 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 5.32e-01 0.0682 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0531 0.0973 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.99e-01 -0.14 0.109 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.122 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 9.42e-01 0.00714 0.0983 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 4.18e-01 0.0751 0.0925 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 8.57e-01 0.016 0.0884 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.65e-01 0.0517 0.0896 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 8.76e-01 0.0156 0.1 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 1.07e-01 -0.166 0.102 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 4.80e-01 0.0556 0.0787 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0629 0.0905 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0501 0.105 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 5.68e-01 0.06 0.105 0.207 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0498 0.134 0.207 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.34e-01 0.078 0.125 0.207 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 5.73e-01 0.0652 0.115 0.207 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0679 0.13 0.207 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 4.26e-01 0.086 0.108 0.207 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 2.64e-01 -0.106 0.0945 0.207 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 9.07e-01 0.0157 0.134 0.207 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 5.38e-01 0.0806 0.13 0.207 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 1.52e-01 0.181 0.126 0.207 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.50e-01 0.0204 0.108 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 2.04e-01 -0.125 0.0985 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0871 0.105 0.211 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 4.11e-01 0.0844 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 3.93e-01 0.089 0.104 0.211 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0742 0.0831 0.211 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 2.59e-01 0.0866 0.0765 0.211 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 4.33e-02 0.186 0.0913 0.211 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0887 0.0951 0.207 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 4.31e-01 -0.074 0.0938 0.207 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0101 0.099 0.207 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 4.24e-01 0.0915 0.114 0.207 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 8.46e-01 0.0206 0.106 0.207 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 7.85e-01 0.0221 0.081 0.207 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0707 0.0873 0.207 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 9.66e-02 -0.182 0.109 0.207 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.87e-02 0.202 0.0967 0.205 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 8.04e-01 0.025 0.101 0.205 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0934 0.111 0.205 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0147 0.0944 0.205 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0717 0.113 0.205 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0899 0.0981 0.205 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0497 0.113 0.205 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.84e-01 0.0545 0.0624 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 7.06e-01 0.0277 0.0735 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0566 0.109 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 8.53e-01 0.0186 0.1 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0533 0.08 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 5.44e-01 0.0381 0.0627 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.23e-01 -0.134 0.0865 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 5.27e-01 0.0513 0.0809 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 1.69e-02 0.184 0.0764 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 9.90e-01 0.00141 0.118 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0441 0.109 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00815 0.0932 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 6.19e-01 0.0403 0.081 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.25e-01 0.0206 0.093 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0174 0.132 0.218 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 1.13e-01 -0.194 0.122 0.218 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.42e-01 -0.15 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.43e-01 -0.147 0.125 0.218 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 1.46e-01 -0.182 0.125 0.218 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 2.14e-01 0.149 0.119 0.218 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.01e-01 -0.135 0.131 0.218 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 8.21e-01 0.0289 0.128 0.218 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 8.76e-01 0.0154 0.0981 0.207 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.52e-02 0.213 0.0942 0.207 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.99e-01 0.114 0.11 0.207 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0055 0.115 0.207 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.16e-01 0.0234 0.1 0.207 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0947 0.207 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 6.74e-01 0.0432 0.103 0.207 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0646 0.0836 0.21 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.75e-01 0.0392 0.0698 0.21 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 2.92e-02 0.236 0.107 0.21 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.08e-02 0.197 0.108 0.21 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00695 0.0955 0.21 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0722 0.093 0.21 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.77e-01 0.13 0.0961 0.21 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0946 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.81e-01 0.0838 0.119 0.201 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0422 0.12 0.201 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 5.60e-02 -0.243 0.126 0.201 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 2.05e-01 -0.131 0.103 0.201 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 3.01e-01 0.127 0.122 0.201 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 7.32e-01 0.0435 0.127 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0937 0.0748 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 9.38e-01 0.00523 0.0671 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 7.14e-01 0.0419 0.114 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.38e-01 0.0313 0.0937 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 8.25e-01 -0.015 0.0675 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0455 0.0615 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0633 0.0792 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0916 0.1 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00528 0.105 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 5.26e-01 0.0531 0.0835 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 4.05e-01 0.068 0.0815 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 5.72e-01 0.0612 0.108 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 4.40e-01 0.0658 0.085 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 5.76e-01 0.0442 0.079 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 2.96e-01 0.0847 0.0808 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 902164 sc-eQTL 1.63e-01 -0.138 0.0985 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 6.76e-01 0.0417 0.0997 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 605789 sc-eQTL 9.13e-01 0.0112 0.103 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 2.75e-01 0.0631 0.0577 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 2.15e-01 0.0849 0.0683 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0786 0.11 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0254 0.0934 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0368 0.0791 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 5.38e-01 0.0367 0.0595 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0922 0.0823 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0695 0.0767 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 1.48e-01 0.0929 0.064 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 1.07e-02 0.295 0.114 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 1.18e-01 0.167 0.106 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 6.95e-01 0.0341 0.0869 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 8.63e-01 0.015 0.087 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 1.27e-01 0.14 0.0913 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675676 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0213 0.0781 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 35193 sc-eQTL 7.96e-01 0.0186 0.072 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543570 sc-eQTL 5.26e-01 0.05 0.0787 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72368 sc-eQTL 8.01e-01 0.0281 0.111 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -854981 sc-eQTL 2.37e-01 -0.105 0.0883 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 227124 sc-eQTL 7.92e-01 0.0186 0.0706 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 163060 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0907 0.068 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137519 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.207 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33239 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0249 0.112 0.207 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 \N 137519 4.26e-06 4.19e-06 5.59e-07 1.93e-06 6.82e-07 9.87e-07 2.51e-06 8.99e-07 2.74e-06 1.61e-06 3.5e-06 1.98e-06 5.37e-06 1.28e-06 1e-06 2.08e-06 1.58e-06 2.12e-06 1.46e-06 1.26e-06 1.56e-06 3.51e-06 3.37e-06 1.64e-06 4.11e-06 1.09e-06 1.57e-06 1.74e-06 2.85e-06 3.08e-06 1.96e-06 3.78e-07 6.45e-07 1.43e-06 1.74e-06 8.93e-07 8.91e-07 4.66e-07 1.2e-06 3.28e-07 2.89e-07 4.1e-06 5.11e-07 1.99e-07 3.12e-07 3.42e-07 8.5e-07 2.46e-07 1.53e-07
ENSG00000257345 \N 605789 3.27e-07 1.7e-07 6.15e-08 2.26e-07 1.03e-07 8.4e-08 2.24e-07 5.78e-08 1.71e-07 1.03e-07 1.66e-07 1.31e-07 2.29e-07 8e-08 5.97e-08 8.08e-08 4.35e-08 1.72e-07 7.36e-08 5.61e-08 1.24e-07 1.7e-07 1.68e-07 3.68e-08 1.98e-07 1.26e-07 1.2e-07 1.12e-07 1.31e-07 1.39e-07 1.14e-07 4.32e-08 4.37e-08 9.3e-08 3.36e-08 2.74e-08 6.24e-08 5.71e-08 6.29e-08 5.56e-08 5.42e-08 1.55e-07 3.37e-08 1.43e-08 3.32e-08 6.39e-09 7.61e-08 2.1e-09 4.69e-08