Genes within 1Mb (chr12:93604827:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.34e-01 0.0134 0.0639 0.19 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.44e-01 0.0385 0.0633 0.19 B L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0203 0.0959 0.19 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 7.87e-01 0.0216 0.08 0.19 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.19e-01 -0.046 0.0713 0.19 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0148 0.0629 0.19 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 2.45e-01 0.0825 0.0708 0.19 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0947 0.098 0.19 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0728 0.0976 0.19 B L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0545 0.0652 0.19 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 8.58e-01 0.0113 0.0632 0.19 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0416 0.0663 0.19 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 2.55e-01 0.124 0.108 0.19 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 5.24e-01 0.0443 0.0694 0.19 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 4.02e-01 0.0526 0.0626 0.19 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 7.28e-01 0.0203 0.0582 0.19 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0138 0.101 0.19 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0154 0.0736 0.19 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 1.31e-01 0.127 0.0841 0.19 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.30e-02 -0.168 0.0862 0.19 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 3.70e-01 0.0918 0.102 0.19 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 1.60e-01 0.114 0.0809 0.19 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.23e-02 0.113 0.0602 0.19 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 4.47e-01 0.0575 0.0755 0.19 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.51e-01 -0.155 0.107 0.19 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.83e-01 0.0142 0.0963 0.198 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0539 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.47e-01 0.0226 0.117 0.198 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.44e-01 0.00654 0.0927 0.198 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.33e-01 0.0602 0.0965 0.198 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 7.38e-01 0.0326 0.0975 0.198 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 9.15e-01 -0.012 0.112 0.198 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0303 0.0572 0.19 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0335 0.0653 0.19 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0851 0.12 0.19 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0882 0.0963 0.19 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 3.67e-02 -0.172 0.082 0.19 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 3.59e-01 0.057 0.0621 0.19 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0318 0.0837 0.19 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 3.98e-01 0.0688 0.0813 0.189 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 5.73e-01 -0.043 0.0761 0.189 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.07e-02 -0.162 0.0787 0.189 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0936 0.114 0.189 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0398 0.0903 0.189 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00422 0.0739 0.189 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0424 0.073 0.189 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 4.55e-01 0.078 0.104 0.189 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0864 0.119 0.189 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 2.92e-01 0.11 0.104 0.19 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 3.06e-01 0.0992 0.0966 0.19 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 6.12e-02 0.17 0.0901 0.19 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.37e-01 -0.068 0.11 0.19 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00312 0.102 0.19 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 7.25e-01 0.0277 0.0784 0.19 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.95e-01 0.00958 0.0727 0.19 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 8.76e-01 0.0134 0.086 0.19 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.60e-02 0.23 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0166 0.102 0.194 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 1.78e-01 -0.16 0.119 0.194 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 2.43e-01 -0.148 0.126 0.194 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.19e-01 0.0244 0.106 0.194 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0833 0.132 0.194 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.194 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.99e-01 -0.108 0.128 0.194 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 9.87e-01 -0.002 0.124 0.194 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 2.51e-01 0.11 0.0957 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 1.62e-01 0.133 0.0946 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0633 0.113 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.39e-01 0.101 0.105 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.24e-01 0.0463 0.0942 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 2.31e-01 0.115 0.0956 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 2.17e-01 0.131 0.106 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 2.20e-01 -0.143 0.116 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0552 0.115 0.191 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 1.93e-01 0.126 0.0967 0.192 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.76e-01 0.0651 0.0912 0.192 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.20e-02 -0.207 0.119 0.192 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0193 0.107 0.192 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.34e-01 0.0179 0.0856 0.192 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0678 0.0764 0.192 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 8.52e-01 0.0182 0.0975 0.192 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0124 0.114 0.192 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 2.71e-01 -0.125 0.113 0.192 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 9.30e-01 0.00812 0.0918 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.50e-01 -0.072 0.0952 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.19e-01 0.0968 0.119 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.62e-01 0.00473 0.0984 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0969 0.0854 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0917 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 8.66e-03 0.265 0.1 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.20e-02 -0.265 0.105 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 5.60e-01 0.0657 0.113 0.19 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0238 0.11 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.78e-01 0.111 0.102 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0582 0.115 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00228 0.108 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.45e-01 0.0438 0.095 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 1.64e-01 0.129 0.0925 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0749 0.0805 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.01e-01 -0.197 0.12 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 5.48e-01 0.0695 0.116 0.191 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 9.55e-01 0.00664 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 1.60e-01 0.165 0.117 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0646 0.112 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0148 0.114 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 6.37e-01 0.0542 0.115 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 1.71e-01 0.153 0.111 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.90e-02 -0.206 0.113 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 5.70e-01 0.0722 0.127 0.186 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0417 0.069 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 2.72e-01 0.0717 0.065 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0331 0.0737 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.79e-01 0.0797 0.112 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 7.80e-01 0.0223 0.0797 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.43e-01 0.0403 0.0661 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0691 0.0633 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0244 0.107 0.19 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.13e-01 0.0625 0.0954 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0342 0.0743 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 1.78e-01 -0.119 0.0879 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.33e-01 0.0934 0.119 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 2.71e-01 -0.104 0.0939 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 1.25e-01 0.115 0.0743 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 2.18e-02 0.164 0.071 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00837 0.11 0.19 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 2.62e-01 -0.122 0.109 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 3.77e-01 0.0711 0.0803 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 1.73e-01 0.131 0.096 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 9.33e-01 0.00993 0.119 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.50e-02 0.209 0.0925 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.15e-01 0.0484 0.0961 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 5.41e-01 0.0646 0.106 0.19 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0618 0.0992 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 3.11e-02 0.207 0.0953 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.60e-01 -0.11 0.0975 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.26e-01 0.0753 0.119 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.45e-01 0.102 0.107 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 7.25e-01 0.031 0.088 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00896 0.102 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0371 0.117 0.19 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0873 0.0908 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0202 0.0896 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 1.06e-01 -0.162 0.0997 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0407 0.116 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.31e-01 0.0941 0.0966 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.85e-01 0.0439 0.0803 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0155 0.0876 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.27e-01 -0.11 0.112 0.19 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 6.24e-02 0.223 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 7.87e-01 -0.028 0.103 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 8.14e-01 0.0273 0.116 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.75e-01 0.0689 0.123 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 8.27e-01 -0.026 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0171 0.0975 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 7.10e-01 0.0431 0.116 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 6.93e-01 -0.047 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.10e-01 0.0289 0.12 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 4.21e-01 0.0899 0.111 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.25e-01 -0.143 0.117 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 9.11e-01 0.0139 0.125 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 2.43e-01 0.142 0.121 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 1.14e-01 0.181 0.114 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0483 0.11 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.46e-02 -0.276 0.112 0.189 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 3.83e-01 0.104 0.119 0.19 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 5.40e-01 0.0663 0.108 0.19 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.37e-01 0.118 0.0993 0.19 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0292 0.127 0.19 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 6.02e-01 0.0595 0.114 0.19 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.61e-01 0.103 0.0916 0.19 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0926 0.113 0.19 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.60e-01 0.105 0.115 0.19 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 6.62e-01 0.0491 0.112 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0775 0.105 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 8.38e-01 0.0209 0.102 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0663 0.124 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 4.47e-01 0.0786 0.103 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0491 0.11 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.44e-01 0.0231 0.117 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0583 0.117 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 8.77e-01 0.0169 0.109 0.189 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0888 0.0967 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0626 0.0856 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.95e-02 -0.182 0.0924 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0942 0.121 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0713 0.108 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0125 0.0861 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0475 0.0826 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 5.76e-01 0.0641 0.114 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 3.63e-01 -0.107 0.118 0.19 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 4.92e-01 0.0779 0.113 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0259 0.112 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 7.13e-01 0.0377 0.102 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 1.58e-02 -0.301 0.124 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0582 0.117 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 3.30e-01 0.102 0.105 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0581 0.117 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.09e-01 -0.21 0.13 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 1.38e-01 -0.157 0.105 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 1.15e-01 0.157 0.099 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0144 0.095 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.80e-02 -0.211 0.0953 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.82e-01 0.0593 0.108 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0218 0.111 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0258 0.0846 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0826 0.0972 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.86e-01 0.0978 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0172 0.113 0.19 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 6.51e-01 0.0675 0.149 0.174 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0215 0.139 0.174 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 7.85e-01 0.0351 0.128 0.174 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 4.06e-01 0.121 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.95e-01 0.0159 0.12 0.174 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 3.64e-01 0.096 0.105 0.174 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 4.70e-01 -0.108 0.149 0.174 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 2.45e-01 0.169 0.144 0.174 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 3.74e-01 0.125 0.14 0.174 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.96e-01 0.0155 0.119 0.187 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 7.71e-01 0.0317 0.109 0.187 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0836 0.116 0.187 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.02e-02 -0.197 0.112 0.187 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.13e-01 -0.116 0.114 0.187 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 4.12e-01 0.0753 0.0916 0.187 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 3.85e-01 0.0735 0.0844 0.187 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 8.61e-01 0.0178 0.102 0.187 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 9.30e-01 -0.009 0.103 0.19 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 5.08e-01 0.0672 0.101 0.19 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.12e-01 -0.133 0.107 0.19 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0393 0.123 0.19 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.37e-02 0.191 0.114 0.19 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.87e-01 0.0352 0.0875 0.19 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.39e-01 0.0192 0.0944 0.19 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.43e-01 0.113 0.119 0.19 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0775 0.102 0.205 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0313 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0549 0.116 0.205 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 2.47e-01 0.114 0.0984 0.205 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0183 0.118 0.205 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.84e-01 0.015 0.103 0.205 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 7.93e-01 0.031 0.118 0.205 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00873 0.0663 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0161 0.078 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0673 0.116 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 2.76e-01 -0.116 0.106 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0676 0.0848 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 9.44e-01 0.00472 0.0665 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0154 0.0922 0.19 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 4.84e-01 0.059 0.0842 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0927 0.0802 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 3.25e-01 -0.121 0.123 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.31e-01 0.0098 0.114 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0965 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 2.20e-01 0.103 0.084 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0685 0.0966 0.19 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0814 0.141 0.209 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0547 0.131 0.209 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.62e-01 0.0796 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 9.91e-01 0.00146 0.135 0.209 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0295 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0731 0.128 0.209 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 1.86e-02 0.327 0.137 0.209 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.31e-01 -0.206 0.135 0.209 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 1.14e-01 -0.16 0.101 0.196 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 3.07e-01 -0.101 0.0988 0.196 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 6.63e-02 -0.209 0.113 0.196 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.83e-01 0.104 0.119 0.196 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.36e-01 0.123 0.103 0.196 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0247 0.0989 0.196 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0774 0.106 0.196 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 6.18e-01 0.044 0.088 0.192 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0467 0.0734 0.192 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.06e-01 0.0951 0.114 0.192 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 5.89e-01 0.0621 0.115 0.192 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 1.30e-01 -0.152 0.0999 0.192 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.25e-01 0.0479 0.0979 0.192 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 2.40e-01 -0.119 0.101 0.192 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 1.69e-02 0.296 0.123 0.201 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 2.80e-01 -0.13 0.12 0.201 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 2.95e-01 0.128 0.122 0.201 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.55e-01 0.12 0.129 0.201 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 2.83e-01 0.113 0.105 0.201 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.03e-01 0.0648 0.124 0.201 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0126 0.129 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 1.73e-01 0.11 0.0806 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 5.20e-01 0.0465 0.0723 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 1.92e-01 -0.161 0.123 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00778 0.101 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00429 0.0728 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00879 0.0664 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 4.15e-01 0.0697 0.0854 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.108 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 2.13e-01 -0.14 0.112 0.19 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0127 0.0895 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 9.00e-01 -0.011 0.0875 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 8.39e-01 0.0236 0.116 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00772 0.0912 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0572 0.0846 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0217 0.0868 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 901984 sc-eQTL 3.53e-02 0.222 0.105 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.74e-02 -0.222 0.106 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 605609 sc-eQTL 5.97e-01 0.0581 0.11 0.19 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0189 0.0613 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0493 0.0726 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0883 0.117 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 1.52e-01 -0.142 0.0985 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 6.75e-02 -0.153 0.0832 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 2.65e-01 0.0703 0.063 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00734 0.0875 0.19 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0801 0.0819 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0336 0.0687 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00644 0.124 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 3.73e-01 0.102 0.114 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0935 0.0927 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 8.65e-01 0.0159 0.093 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 1.11e-01 -0.156 0.0975 0.19 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 675496 sc-eQTL 6.49e-01 0.038 0.0834 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 35013 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0147 0.077 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -543750 sc-eQTL 1.34e-02 -0.207 0.0829 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -72548 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0769 0.119 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -855161 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0694 0.0945 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 226944 sc-eQTL 8.46e-01 0.0147 0.0755 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 162880 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0347 0.073 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 137339 sc-eQTL 3.52e-01 0.101 0.109 0.19 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 33059 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0689 0.12 0.19 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -72548 pQTL 0.0125 -0.0297 0.0119 0.0 0.0 0.18


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000169372 CRADD -72548 8.12e-06 1.52e-05 4.41e-06 6.9e-06 2.38e-06 4.34e-06 2.29e-05 2.45e-06 1.62e-05 7.53e-06 3.61e-05 9.35e-06 3.51e-05 4.54e-06 5.09e-06 8.14e-06 7.72e-06 1.16e-05 2.97e-06 2.83e-06 6.92e-06 1.6e-05 1.42e-05 3.27e-06 2.4e-05 3.68e-06 6.39e-06 5.42e-06 1.83e-05 1e-05 1.69e-05 7.91e-07 1.28e-06 2.92e-06 3.69e-06 3e-06 1.67e-06 2e-06 2.02e-06 1.18e-06 9.75e-07 8.09e-05 2.6e-06 1.65e-07 1.27e-06 3.23e-06 9.2e-07 6.88e-07 4.52e-07