Genes within 1Mb (chr12:93602259:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.78e-01 0.0861 0.0638 0.169 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.88e-02 -0.108 0.063 0.169 B L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.23e-01 0.095 0.0959 0.169 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 9.10e-02 -0.135 0.0796 0.169 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 9.47e-02 0.119 0.071 0.169 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 7.94e-02 0.11 0.0626 0.169 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0608 0.071 0.169 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 3.89e-02 -0.202 0.0974 0.169 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 5.49e-01 0.0588 0.0978 0.169 B L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 2.44e-01 0.0754 0.0645 0.169 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 2.44e-01 0.0729 0.0624 0.169 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0984 0.0654 0.169 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.12e-01 -0.109 0.107 0.169 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0366 0.0688 0.169 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0576 0.062 0.169 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0252 0.0577 0.169 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 9.89e-02 -0.165 0.0997 0.169 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0539 0.072 0.169 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0355 0.0828 0.169 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 9.57e-01 0.00458 0.0853 0.169 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.60e-01 0.0585 0.1 0.169 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0689 0.0795 0.169 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0955 0.0591 0.169 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 9.47e-01 0.00495 0.0741 0.169 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0467 0.105 0.169 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.89e-01 -0.126 0.0957 0.169 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.44e-01 0.048 0.104 0.169 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.22e-01 0.0751 0.117 0.169 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0921 0.169 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.23e-01 0.148 0.0958 0.169 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0155 0.0974 0.169 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00142 0.112 0.169 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 8.64e-02 0.0965 0.056 0.169 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 2.29e-01 0.0775 0.0642 0.169 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 4.34e-01 0.0928 0.118 0.169 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 4.54e-01 0.0713 0.0951 0.169 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.10e-01 0.0539 0.0817 0.169 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0177 0.0613 0.169 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0868 0.0823 0.169 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0416 0.0807 0.17 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 8.00e-01 0.0192 0.0755 0.17 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.96e-01 0.0104 0.0788 0.17 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 6.44e-01 0.0523 0.113 0.17 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 7.89e-01 -0.024 0.0896 0.17 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0578 0.0731 0.17 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0117 0.0724 0.17 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 3.06e-01 -0.106 0.103 0.17 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 1.26e-02 -0.293 0.116 0.17 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 8.19e-01 0.0235 0.102 0.169 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 1.74e-01 0.129 0.0943 0.169 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 9.33e-01 0.00749 0.0889 0.169 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.79e-01 0.0303 0.107 0.169 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 3.04e-01 -0.103 0.0998 0.169 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 3.90e-01 0.066 0.0766 0.169 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0285 0.0711 0.169 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.48e-01 0.0161 0.0842 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.52e-01 0.178 0.123 0.163 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 2.07e-04 -0.381 0.101 0.163 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.25e-01 0.0782 0.123 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0236 0.13 0.163 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.69e-01 0.121 0.109 0.163 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0512 0.136 0.163 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 3.65e-03 0.33 0.112 0.163 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 1.75e-01 0.178 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 4.47e-01 0.0971 0.127 0.163 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.64e-01 0.134 0.0957 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0452 0.0952 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0188 0.113 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.51e-01 0.0477 0.105 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.12e-01 0.118 0.094 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 9.64e-01 0.0043 0.096 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0812 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.60e-01 -0.132 0.117 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0892 0.115 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.72e-01 0.0887 0.0992 0.168 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0347 0.0935 0.168 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.50e-02 0.257 0.121 0.168 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 7.47e-01 0.0353 0.109 0.168 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.52e-01 0.125 0.0872 0.168 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 1.49e-04 0.293 0.0757 0.168 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 2.15e-01 -0.124 0.0995 0.168 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.88e-01 -0.124 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 6.71e-01 0.0494 0.116 0.168 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.65e-01 0.0843 0.0929 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0151 0.0967 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.43e-01 0.0399 0.121 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 1.70e-01 -0.137 0.0994 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.23e-01 0.0696 0.0867 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 3.86e-01 0.0811 0.0932 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 1.74e-01 0.14 0.103 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 5.73e-02 -0.204 0.107 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 6.03e-01 0.0595 0.114 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 4.00e-01 0.0948 0.113 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0398 0.104 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.56e-01 0.0692 0.117 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 1.66e-01 -0.152 0.109 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.50e-01 0.139 0.0965 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 1.72e-01 0.13 0.0945 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0431 0.0823 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.30e-01 0.0265 0.123 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 2.73e-01 0.129 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.55e-01 0.107 0.116 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0756 0.117 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.06e-01 -0.18 0.111 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.54e-01 0.105 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0874 0.114 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.48e-01 0.0666 0.11 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 5.78e-01 0.0628 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 7.47e-01 0.0407 0.126 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 7.80e-01 0.019 0.0678 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 2.74e-01 0.07 0.0639 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.95e-02 -0.123 0.0719 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 2.58e-01 -0.125 0.11 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0503 0.0783 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0483 0.0649 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00884 0.0624 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 1.77e-01 -0.141 0.104 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 2.89e-01 0.101 0.0946 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 2.42e-01 0.0865 0.0737 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0959 0.0875 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.37e-01 0.0732 0.118 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 7.07e-01 0.0352 0.0935 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0613 0.0742 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 9.97e-01 0.00025 0.0714 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 1.19e-01 -0.169 0.108 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 8.84e-01 0.0159 0.109 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0767 0.0801 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0248 0.0961 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 8.83e-01 0.0174 0.118 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0498 0.108 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.89e-02 -0.183 0.0925 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 3.97e-01 0.0812 0.0957 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.92e-01 -0.111 0.105 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0645 0.0974 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00647 0.0946 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 3.40e-01 0.0917 0.0958 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.59e-01 0.0358 0.117 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 2.43e-01 0.123 0.105 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0802 0.0863 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0932 0.1 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0383 0.115 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 9.88e-01 0.00133 0.0888 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0692 0.0873 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0876 0.0977 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.46e-01 0.0367 0.113 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0953 0.0942 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0995 0.078 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0351 0.0854 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.95e-01 -0.114 0.109 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0065 0.118 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0452 0.101 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.30e-01 -0.172 0.113 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.99e-01 0.0633 0.12 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 9.38e-01 0.00917 0.117 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0638 0.0955 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.09e-01 0.0274 0.114 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0838 0.116 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.07e-01 0.0605 0.117 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0133 0.109 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0494 0.115 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0294 0.122 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 2.13e-01 -0.148 0.118 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0613 0.112 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 5.63e-01 0.062 0.107 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.56e-01 0.0202 0.111 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 4.94e-01 0.08 0.117 0.171 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 6.19e-01 0.0528 0.106 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.44e-01 0.0453 0.0978 0.171 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.78e-01 0.11 0.124 0.171 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0785 0.112 0.171 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.16e-01 0.112 0.0899 0.171 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00853 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.171 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0568 0.111 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0568 0.104 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0778 0.101 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0563 0.123 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0405 0.102 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0177 0.109 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 3.41e-01 0.11 0.116 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 3.73e-01 -0.103 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0895 0.108 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0275 0.0957 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 5.03e-01 0.0568 0.0846 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 9.14e-01 0.00991 0.0921 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000511 0.12 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.31e-02 -0.184 0.106 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0298 0.085 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 5.90e-01 -0.044 0.0817 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.84e-01 0.0165 0.113 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 5.28e-02 -0.225 0.115 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 5.07e-01 0.0734 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 5.53e-02 0.209 0.108 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00367 0.0998 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 3.96e-02 0.251 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 1.71e-01 0.157 0.114 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 8.89e-01 0.0143 0.102 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0784 0.114 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.80e-01 0.0192 0.128 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 1.85e-01 0.137 0.103 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0318 0.098 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00339 0.0936 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 5.09e-01 0.0627 0.0948 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0466 0.106 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 3.91e-01 0.0935 0.109 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0685 0.0832 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 5.75e-01 0.0537 0.0957 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 7.58e-02 -0.197 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 5.74e-02 -0.21 0.11 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 7.14e-01 0.0554 0.15 0.159 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.80e-02 0.329 0.137 0.159 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 1.64e-01 0.18 0.129 0.159 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.05e-02 -0.273 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 3.32e-01 0.118 0.121 0.159 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 1.75e-02 0.251 0.104 0.159 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 4.95e-01 0.103 0.15 0.159 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 4.16e-02 -0.297 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 6.75e-01 0.0597 0.142 0.159 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.32e-01 0.11 0.114 0.172 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 6.45e-02 0.193 0.104 0.172 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.01e-01 0.0581 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.28e-01 0.0378 0.109 0.172 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0461 0.11 0.172 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0443 0.0879 0.172 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0103 0.0811 0.172 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 7.34e-01 0.0332 0.0974 0.172 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.43e-01 0.0974 0.103 0.169 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 7.63e-01 0.0306 0.101 0.169 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 3.55e-01 0.0987 0.107 0.169 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.43e-01 0.0751 0.123 0.169 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 2.21e-01 -0.14 0.114 0.169 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0508 0.0873 0.169 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 2.20e-01 -0.116 0.0939 0.169 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.64e-01 -0.132 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0419 0.104 0.166 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0302 0.107 0.166 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.118 0.166 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0153 0.1 0.166 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.67e-01 0.133 0.119 0.166 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.20e-01 0.0237 0.104 0.166 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 9.58e-01 0.00629 0.12 0.166 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 7.77e-02 0.115 0.065 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.00e-01 0.126 0.0766 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.40e-01 0.0381 0.115 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.59e-01 0.0187 0.105 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0177 0.0839 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0119 0.0658 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 6.55e-01 0.0408 0.0912 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0133 0.0844 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.99e-01 0.0103 0.0807 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 2.65e-01 0.138 0.123 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0227 0.114 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0493 0.097 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0138 0.0845 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 6.18e-02 -0.181 0.0961 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.29e-01 0.066 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 9.21e-02 0.213 0.125 0.173 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 3.40e-01 0.126 0.132 0.173 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 1.13e-01 -0.206 0.129 0.173 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0581 0.129 0.173 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 3.15e-01 -0.124 0.123 0.173 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0384 0.135 0.173 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 2.43e-02 0.295 0.13 0.173 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.15e-01 0.165 0.104 0.164 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 2.90e-01 0.108 0.102 0.164 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 2.10e-01 0.147 0.117 0.164 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 7.47e-01 0.0397 0.123 0.164 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.02e-01 -0.174 0.106 0.164 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 3.10e-01 -0.103 0.101 0.164 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0217 0.109 0.164 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 9.08e-02 -0.148 0.0872 0.165 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 6.06e-01 0.0378 0.0732 0.165 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0059 0.114 0.165 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0175 0.115 0.165 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 1.94e-02 0.233 0.0988 0.165 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 2.48e-01 -0.113 0.0973 0.165 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 7.15e-01 0.037 0.101 0.165 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.16e-01 -0.196 0.124 0.161 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.15e-01 0.19 0.12 0.161 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 4.35e-01 0.0954 0.122 0.161 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 5.00e-02 0.253 0.128 0.161 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 8.94e-01 0.014 0.105 0.161 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 2.02e-01 -0.159 0.124 0.161 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 3.82e-01 -0.113 0.128 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.68e-01 0.112 0.0807 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.29e-01 -0.11 0.0721 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 1.51e-01 0.177 0.123 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 5.93e-01 0.0541 0.101 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 9.51e-02 0.121 0.0725 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 4.94e-02 0.13 0.0659 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 1.85e-01 -0.114 0.0853 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 6.78e-02 -0.197 0.107 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 6.90e-01 -0.045 0.113 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.27e-01 0.0885 0.0901 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 8.24e-01 0.0196 0.0882 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.38e-01 0.072 0.117 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 4.15e-02 -0.187 0.0911 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 4.25e-01 0.0682 0.0852 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 1.17e-01 0.137 0.087 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 899416 sc-eQTL 2.20e-01 0.131 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 1.12e-01 -0.171 0.107 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 603041 sc-eQTL 4.06e-01 0.0921 0.111 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 1.58e-01 0.0849 0.0599 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 3.16e-01 0.0716 0.0712 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 4.59e-01 0.0853 0.115 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 5.37e-01 0.06 0.0971 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 7.46e-01 0.0267 0.0824 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 9.55e-01 0.00347 0.0621 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 5.08e-01 -0.057 0.0859 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 3.70e-01 0.0733 0.0817 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 1.02e-01 0.112 0.068 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 5.49e-01 0.0743 0.124 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 8.59e-01 0.0203 0.114 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 5.50e-01 0.0554 0.0925 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 8.92e-02 -0.157 0.092 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0208 0.0977 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 672928 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0343 0.0829 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 32445 sc-eQTL 6.57e-01 0.034 0.0764 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -546318 sc-eQTL 9.40e-01 0.00633 0.0836 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -75116 sc-eQTL 7.05e-01 0.0448 0.118 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -857729 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0446 0.094 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 224376 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0848 0.0748 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 160312 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0317 0.0725 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 134771 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0896 0.108 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 30491 sc-eQTL 1.56e-02 -0.286 0.117 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000169372 CRADD -75116 eQTL 0.0208 -0.0399 0.0172 0.00279 0.0 0.177
ENSG00000258365 AC073655.2 -680585 eQTL 0.0225 0.0964 0.0422 0.0 0.0 0.177
ENSG00000278916 CEP83-DT -857744 eQTL 0.0137 -0.11 0.0445 0.0 0.0 0.177


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 \N 224376 1.86e-06 2.24e-06 2.74e-07 1.42e-06 3.55e-07 6.22e-07 1.25e-06 4.13e-07 1.73e-06 7.15e-07 1.89e-06 1.3e-06 2.89e-06 6.9e-07 3.88e-07 9.55e-07 1.12e-06 1.17e-06 5.99e-07 4.74e-07 7.74e-07 1.98e-06 1.42e-06 5.94e-07 2.49e-06 7.46e-07 1.02e-06 8.57e-07 1.72e-06 1.48e-06 7.32e-07 2.62e-07 3.32e-07 5.79e-07 8.69e-07 5.15e-07 7.32e-07 3.6e-07 5.01e-07 2.22e-07 3.53e-07 2.32e-06 3.51e-07 1.41e-07 2.83e-07 2.29e-07 2.3e-07 1.4e-07 1.55e-07