Genes within 1Mb (chr12:93601051:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 3.06e-01 0.0677 0.0659 0.16 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.68e-02 -0.12 0.065 0.16 B L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 1.08e-01 0.159 0.0986 0.16 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 7.83e-02 -0.145 0.0821 0.16 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.07e-01 0.0929 0.0735 0.16 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.29e-01 0.0782 0.0648 0.16 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0608 0.0733 0.16 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 3.46e-02 -0.214 0.1 0.16 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 4.14e-01 0.0825 0.101 0.16 B L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.64e-01 0.0385 0.0667 0.16 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 1.33e-01 0.0969 0.0642 0.16 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0936 0.0675 0.16 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 3.11e-01 -0.113 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0308 0.071 0.16 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0771 0.0639 0.16 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0224 0.0595 0.16 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 1.97e-01 -0.134 0.103 0.16 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0416 0.0739 0.16 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0428 0.0849 0.16 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 9.63e-01 0.00402 0.0874 0.16 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.68e-01 0.0442 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0798 0.0815 0.16 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0798 0.0608 0.16 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.59e-01 0.0135 0.076 0.16 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0116 0.108 0.16 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 1.67e-01 -0.136 0.0983 0.158 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.49e-01 0.0809 0.107 0.158 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.90e-01 0.0833 0.12 0.158 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.76e-01 0.104 0.0948 0.158 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 1.88e-01 0.13 0.0986 0.158 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0286 0.1 0.158 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 7.00e-01 0.0443 0.115 0.158 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 6.86e-02 0.105 0.0574 0.16 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.18e-01 0.103 0.0657 0.16 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.48e-01 0.0556 0.122 0.16 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.29e-01 0.117 0.0973 0.16 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.63e-01 0.0366 0.0838 0.16 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0369 0.0628 0.16 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.31e-01 -0.101 0.0844 0.16 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0363 0.0826 0.161 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.81e-01 0.0317 0.0772 0.161 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 5.33e-01 0.0503 0.0806 0.161 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 7.38e-01 0.0388 0.116 0.161 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 8.25e-01 0.0203 0.0916 0.161 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0418 0.0749 0.161 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0234 0.0741 0.161 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0926 0.106 0.161 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 1.34e-02 -0.297 0.119 0.161 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.52e-01 0.062 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 1.19e-01 0.15 0.096 0.16 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 8.89e-01 0.0127 0.0906 0.16 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.35e-01 0.052 0.109 0.16 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.38e-01 -0.048 0.102 0.16 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.30e-01 0.0377 0.0782 0.16 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.58e-01 -0.013 0.0725 0.16 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.25e-01 0.00806 0.0858 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 1.01e-01 0.208 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 2.82e-03 -0.316 0.104 0.161 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.16e-01 0.0632 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.64e-01 0.00609 0.133 0.161 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.52e-01 0.104 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0818 0.139 0.161 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 4.12e-03 0.333 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.19e-01 0.166 0.134 0.161 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 5.04e-01 0.0873 0.13 0.161 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 8.85e-02 0.168 0.0984 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0104 0.0982 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0427 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 5.75e-01 0.061 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.27e-01 0.118 0.0969 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.80e-01 0.015 0.099 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0676 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.59e-01 -0.136 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0333 0.119 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.07e-01 0.0384 0.102 0.159 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0727 0.0959 0.159 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 7.58e-02 0.222 0.125 0.159 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.45e-01 0.0517 0.112 0.159 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 4.82e-01 0.0633 0.0899 0.159 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 4.93e-04 0.277 0.0782 0.159 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0851 0.102 0.159 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0507 0.12 0.159 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 9.98e-01 0.000352 0.12 0.159 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 3.94e-01 0.081 0.0949 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0663 0.0986 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.00e-01 0.104 0.124 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 1.03e-01 -0.166 0.101 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.59e-01 0.0273 0.0887 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.61e-01 0.029 0.0954 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 3.11e-01 0.107 0.105 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 7.38e-02 -0.196 0.109 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 6.19e-01 0.0581 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 4.84e-01 0.0808 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0438 0.107 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 2.96e-01 0.125 0.12 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 1.42e-01 -0.165 0.112 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.20e-01 0.0986 0.099 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.54e-02 0.185 0.0963 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0815 0.0841 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.49e-01 0.008 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 3.21e-01 0.12 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 4.85e-01 0.0833 0.119 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0579 0.12 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.86e-01 -0.151 0.114 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 5.57e-01 0.0684 0.116 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0902 0.117 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.19e-01 0.0734 0.114 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 6.01e-01 0.0607 0.116 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00907 0.13 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0278 0.0697 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 2.27e-01 0.0796 0.0656 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.27e-01 -0.113 0.074 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0786 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0397 0.0805 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0725 0.0666 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.71e-01 0.0104 0.0641 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.16e-01 -0.133 0.107 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 3.45e-01 0.0918 0.097 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 1.36e-01 0.113 0.0753 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0652 0.0898 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 5.88e-01 0.0658 0.121 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 4.57e-01 0.0713 0.0957 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0731 0.0759 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0126 0.0731 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0797 0.111 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.97e-01 0.0286 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0691 0.082 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.19e-01 -0.049 0.0984 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0279 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0582 0.11 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.36e-02 -0.184 0.0948 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 4.28e-01 0.078 0.0981 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 3.05e-01 -0.111 0.108 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0175 0.0998 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 9.62e-01 0.0046 0.0969 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 3.81e-01 0.0861 0.0981 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.64e-01 0.0519 0.119 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.20e-01 0.133 0.108 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0641 0.0884 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.15e-01 -0.127 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.31e-01 0.0103 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0555 0.0912 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0382 0.0898 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.81e-01 -0.071 0.1 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.96e-01 0.0455 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.83e-01 -0.104 0.0967 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0777 0.0803 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0135 0.0878 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0808 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.36e-01 0.041 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0467 0.104 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.32e-02 -0.236 0.116 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000773 0.124 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0552 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.49e-01 -0.113 0.0982 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.17e-01 0.0425 0.117 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0806 0.12 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.07e-01 0.0454 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00402 0.112 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0797 0.118 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0352 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 3.33e-01 -0.118 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0615 0.115 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 4.04e-01 0.0917 0.11 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 6.34e-01 0.0542 0.114 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.99e-01 0.063 0.12 0.162 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 5.19e-01 0.0704 0.109 0.162 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.10e-01 0.0513 0.1 0.162 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 2.60e-01 0.144 0.127 0.162 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0468 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.92e-01 0.0497 0.0926 0.162 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0656 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.81e-01 -0.125 0.116 0.162 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0361 0.113 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 4.56e-01 -0.079 0.106 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0802 0.103 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0746 0.125 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.24e-01 -0.01 0.104 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0301 0.112 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.10e-01 0.149 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0828 0.118 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 1.89e-01 -0.145 0.11 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0556 0.0981 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 4.64e-01 0.0636 0.0867 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.50e-01 0.0429 0.0944 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0262 0.123 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0407 0.0872 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 4.24e-01 -0.067 0.0836 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.26e-01 0.0107 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 7.02e-02 -0.216 0.118 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 4.98e-01 0.0769 0.113 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 2.83e-02 0.244 0.111 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00679 0.102 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.51e-02 0.25 0.124 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.59e-01 0.133 0.117 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.90e-01 0.0418 0.105 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0511 0.117 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 6.70e-01 0.0558 0.131 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 8.08e-02 0.184 0.105 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 8.06e-01 0.0247 0.101 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 8.76e-01 0.015 0.096 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 3.66e-01 0.0881 0.0972 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0699 0.109 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.49e-01 0.129 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0415 0.0855 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.93e-01 0.0526 0.0983 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 1.64e-01 -0.159 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 4.20e-02 -0.231 0.113 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 8.55e-01 0.0289 0.157 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 7.81e-03 0.386 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 1.16e-01 0.212 0.134 0.156 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 8.24e-02 -0.265 0.151 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.89e-01 0.134 0.126 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 3.25e-02 0.237 0.109 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 6.81e-01 0.0647 0.157 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 3.87e-02 -0.315 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 8.74e-01 0.0237 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 2.30e-01 0.14 0.116 0.163 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 2.55e-02 0.238 0.106 0.163 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.27e-01 0.0553 0.114 0.163 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.51e-01 0.0209 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0276 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0398 0.09 0.163 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.17e-01 0.0192 0.083 0.163 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 8.47e-01 0.0193 0.0997 0.163 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 6.08e-01 0.0537 0.104 0.16 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 6.17e-01 0.0516 0.103 0.16 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 2.82e-01 0.117 0.108 0.16 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 9.00e-01 0.0157 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 1.91e-01 -0.152 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0628 0.0887 0.16 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.86e-01 -0.102 0.0956 0.16 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.18e-01 -0.148 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0439 0.107 0.154 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00673 0.11 0.154 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.90e-01 0.0167 0.121 0.154 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0818 0.103 0.154 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.70e-01 0.136 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.43e-01 0.0213 0.107 0.154 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.29e-01 0.011 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.04e-02 0.121 0.0665 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 7.16e-02 0.142 0.0782 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.66e-01 0.0198 0.117 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 7.37e-01 0.0361 0.107 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0248 0.0858 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0277 0.0673 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.87e-01 0.00148 0.0933 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0331 0.0867 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 7.18e-01 0.0299 0.0828 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.44e-01 0.0971 0.127 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 7.91e-01 0.0311 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0563 0.0996 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0309 0.0867 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 8.40e-02 -0.172 0.0988 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 4.20e-01 0.114 0.14 0.167 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 1.10e-01 0.208 0.129 0.167 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.88e-01 0.0549 0.136 0.167 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 7.57e-02 -0.237 0.132 0.167 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.23e-01 0.013 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 1.89e-01 -0.167 0.126 0.167 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0587 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.75e-02 0.297 0.133 0.167 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 1.14e-01 0.169 0.107 0.156 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.86e-01 0.138 0.104 0.156 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 2.34e-01 0.143 0.12 0.156 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 7.09e-01 0.0469 0.126 0.156 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 8.86e-02 -0.186 0.109 0.156 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 1.24e-01 -0.16 0.104 0.156 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 9.19e-01 0.0114 0.112 0.156 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0764 0.0903 0.156 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.52e-01 0.034 0.0754 0.156 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0101 0.118 0.156 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.75e-01 0.00373 0.118 0.156 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.91e-02 0.212 0.102 0.156 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.79e-01 -0.109 0.1 0.156 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0219 0.104 0.156 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 1.15e-01 -0.198 0.125 0.155 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.20e-01 0.188 0.12 0.155 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 4.20e-01 0.0992 0.123 0.155 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.68e-02 0.287 0.129 0.155 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 8.79e-01 0.0161 0.106 0.155 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 2.81e-01 -0.135 0.125 0.155 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0677 0.129 0.155 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 1.37e-01 0.124 0.0832 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.94e-01 -0.097 0.0744 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 2.01e-01 0.163 0.127 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 5.39e-01 0.0641 0.104 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 2.05e-01 0.0952 0.0749 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 6.09e-02 0.128 0.068 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0959 0.0881 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 2.02e-01 -0.142 0.111 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0461 0.116 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 4.24e-01 0.0739 0.0921 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 7.74e-01 -0.026 0.0901 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 1.80e-01 0.16 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.30e-02 -0.213 0.0928 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.37e-01 0.0293 0.0872 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 1.90e-01 0.117 0.0891 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 898208 sc-eQTL 4.74e-01 0.0783 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 1.11e-01 -0.175 0.109 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 601833 sc-eQTL 3.95e-01 0.0963 0.113 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 2.10e-01 0.0772 0.0615 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 1.72e-01 0.0997 0.0728 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 6.70e-01 0.0502 0.118 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 2.34e-01 0.119 0.0993 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.89e-01 0.0226 0.0844 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0141 0.0636 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 4.01e-01 -0.074 0.0879 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 8.79e-02 0.142 0.0829 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 6.85e-02 0.127 0.0693 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 5.84e-01 0.0693 0.126 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.18e-01 0.012 0.116 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 7.02e-01 0.0361 0.0944 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 7.96e-02 -0.165 0.0939 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0175 0.0997 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 671720 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0319 0.0848 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 31237 sc-eQTL 5.31e-01 0.049 0.0781 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -547526 sc-eQTL 5.99e-01 0.045 0.0855 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -76324 sc-eQTL 8.39e-01 0.0246 0.121 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -858937 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00871 0.0962 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 223168 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0685 0.0766 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 159104 sc-eQTL 5.18e-01 -0.048 0.0741 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 133563 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0754 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 29283 sc-eQTL 1.95e-02 -0.283 0.12 0.162 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120833 SOCS2 31237 eQTL 0.0234 -0.072 0.0317 0.00141 0.0 0.168
ENSG00000169372 CRADD -76324 eQTL 0.0438 -0.0353 0.0175 0.00187 0.0 0.168
ENSG00000258365 AC073655.2 -681793 eQTL 0.0135 0.106 0.0427 0.00113 0.0 0.168
ENSG00000278916 CEP83-DT -858952 eQTL 0.00569 -0.125 0.045 0.00103 0.0 0.168


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120833 SOCS2 31237 1.57e-05 1.51e-05 2.65e-06 9.4e-06 2.69e-06 6.64e-06 1.98e-05 2.62e-06 1.51e-05 7.23e-06 1.9e-05 7.34e-06 2.49e-05 5.67e-06 4.35e-06 9.23e-06 7.91e-06 1.32e-05 3.59e-06 3.86e-06 7.43e-06 1.44e-05 1.47e-05 4.25e-06 2.44e-05 5.22e-06 7.74e-06 6.17e-06 1.53e-05 1.31e-05 1.04e-05 1e-06 1.49e-06 4.08e-06 6.2e-06 3.47e-06 1.78e-06 2.41e-06 2.46e-06 1.73e-06 1.16e-06 2.02e-05 2.55e-06 1.95e-07 1.15e-06 2.35e-06 2.51e-06 8.11e-07 6.76e-07
ENSG00000173598 \N 223168 1.2e-06 9.59e-07 3.31e-07 1.15e-06 2.66e-07 4.92e-07 1.47e-06 3.31e-07 1.41e-06 4.28e-07 1.5e-06 6.36e-07 2.01e-06 2.73e-07 5.73e-07 7.95e-07 7.87e-07 6.91e-07 5.83e-07 6.82e-07 6.13e-07 1.45e-06 8.91e-07 6.51e-07 2.11e-06 4.32e-07 8.29e-07 7.01e-07 1.19e-06 1.12e-06 6.52e-07 2.08e-07 2.3e-07 6.68e-07 5.95e-07 4.37e-07 6.1e-07 2.24e-07 3.43e-07 2.48e-07 2.72e-07 1.62e-06 9.55e-08 2.66e-08 1.86e-07 1.12e-07 2.36e-07 7.74e-08 1.06e-07