Genes within 1Mb (chr12:93563738:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0569 0.052 0.265 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 1.91e-01 0.0674 0.0514 0.265 B L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0454 0.0781 0.265 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.17e-02 -0.14 0.0645 0.265 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0407 0.0581 0.265 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 4.09e-02 0.104 0.0508 0.265 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 2.67e-01 0.0643 0.0577 0.265 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 2.98e-04 0.285 0.0776 0.265 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 1.50e-01 0.114 0.0792 0.265 B L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0738 0.053 0.265 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0183 0.0514 0.265 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00785 0.054 0.265 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 4.75e-01 0.0632 0.0884 0.265 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.09e-01 0.0137 0.0566 0.265 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0995 0.0506 0.265 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0662 0.0472 0.265 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 5.55e-02 0.157 0.0818 0.265 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.21e-02 0.128 0.0591 0.265 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0153 0.0686 0.265 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0208 0.0706 0.265 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.45e-01 0.121 0.0827 0.265 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 7.51e-01 0.021 0.066 0.265 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0439 0.0492 0.265 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00233 0.0614 0.265 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 3.35e-02 0.185 0.0865 0.265 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0711 0.0793 0.257 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 1.20e-01 -0.133 0.0853 0.257 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 2.49e-01 0.0881 0.0762 0.257 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0576 0.0796 0.257 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0748 0.0803 0.257 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 5.49e-01 0.0554 0.0924 0.257 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.52e-03 0.128 0.0465 0.265 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.65e-01 0.0602 0.0539 0.265 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0438 0.0995 0.265 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 2.47e-01 0.0925 0.0796 0.265 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 2.18e-01 0.0844 0.0684 0.265 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0321 0.0514 0.265 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 3.54e-01 0.0643 0.0692 0.265 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0107 0.0666 0.266 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 7.61e-01 0.019 0.0623 0.266 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.95e-01 0.0681 0.0649 0.266 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 4.06e-02 -0.19 0.0924 0.266 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0362 0.0739 0.266 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0715 0.0602 0.266 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 6.46e-01 0.0275 0.0597 0.266 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 2.74e-03 0.253 0.0836 0.266 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0215 0.0973 0.266 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0557 0.0867 0.265 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0204 0.0804 0.265 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 3.60e-01 0.0691 0.0753 0.265 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 7.35e-02 0.163 0.0906 0.265 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.48e-01 0.0796 0.0847 0.265 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0429 0.0651 0.265 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0252 0.0604 0.265 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 2.97e-02 0.155 0.0707 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 9.25e-02 0.171 0.101 0.263 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0186 0.086 0.263 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 1.56e-02 -0.257 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.81e-01 0.0634 0.0897 0.263 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.60e-01 0.156 0.111 0.263 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 7.29e-02 0.168 0.0933 0.263 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 4.73e-01 0.0776 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00372 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0825 0.0808 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.41e-01 0.0161 0.0803 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0819 0.0952 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 2.12e-01 0.111 0.0886 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 7.83e-01 -0.022 0.0795 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.87e-01 0.0219 0.081 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 6.00e-01 0.0471 0.0897 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.43e-02 0.182 0.0979 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 4.32e-01 0.0765 0.0972 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.27e-02 -0.16 0.0823 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 4.97e-01 0.0531 0.078 0.265 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 4.50e-01 0.0773 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.51e-01 0.0171 0.0911 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 6.26e-02 -0.136 0.0726 0.265 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 2.15e-01 0.0811 0.0653 0.265 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 6.01e-01 0.0437 0.0834 0.265 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 2.17e-03 0.295 0.0952 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 5.81e-01 0.0538 0.0972 0.265 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 9.76e-01 0.0023 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0604 0.079 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0973 0.099 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 2.62e-02 -0.181 0.0807 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0169 0.071 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 2.35e-01 0.0907 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 4.78e-01 0.0599 0.0843 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.70e-03 0.274 0.0862 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 8.39e-02 0.161 0.0929 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0833 0.0912 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.61e-01 0.0948 0.0842 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00211 0.0951 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.29e-02 -0.189 0.0881 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0867 0.0784 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.76e-01 0.104 0.0766 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0355 0.0667 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.50e-01 0.143 0.0992 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0956 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 7.61e-02 0.166 0.0932 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.0946 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 6.09e-01 0.0462 0.0901 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 5.10e-01 0.0603 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.11e-01 0.0933 0.092 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 9.61e-02 -0.149 0.089 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 4.55e-01 0.0684 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.34e-01 0.0487 0.102 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0494 0.0554 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000722 0.0525 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.25e-02 -0.103 0.0589 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 2.32e-01 -0.108 0.0902 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 6.11e-01 0.0327 0.0641 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 9.21e-02 -0.0895 0.0529 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0788 0.0508 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 5.61e-02 0.163 0.085 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0784 0.0771 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0303 0.0602 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 1.06e-01 0.115 0.0711 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 4.93e-04 0.332 0.0938 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 4.38e-01 0.0592 0.0762 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 6.91e-02 -0.11 0.0601 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0129 0.0582 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 3.43e-02 0.187 0.0879 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0638 0.0904 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 9.00e-01 0.00839 0.0669 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 1.98e-01 0.103 0.0798 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0249 0.0986 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 9.95e-02 -0.148 0.0894 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 7.70e-01 0.0228 0.0778 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 6.91e-01 0.0318 0.0799 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.87e-01 -0.116 0.0875 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 8.28e-02 0.138 0.079 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 2.73e-01 0.0846 0.077 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00962 0.0784 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 2.52e-01 0.109 0.0949 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 9.43e-02 0.144 0.0857 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 6.30e-01 -0.034 0.0705 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0676 0.0818 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 9.98e-04 0.305 0.0915 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 2.46e-01 0.0854 0.0734 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 1.10e-01 -0.116 0.0721 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0095 0.0812 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.0939 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0672 0.0782 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0509 0.0649 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 2.22e-01 0.0865 0.0707 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 2.88e-01 0.0962 0.0903 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0441 0.101 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 4.27e-01 -0.069 0.0866 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 9.43e-01 0.00704 0.0975 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0565 0.1 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 3.73e-01 -0.073 0.0817 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.82e-01 -0.027 0.0974 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.76e-01 0.135 0.0994 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0392 0.0966 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0894 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0942 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 5.23e-02 0.194 0.0991 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0973 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0917 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0226 0.088 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 9.60e-01 0.00462 0.0912 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0311 0.0957 0.266 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 5.52e-01 0.0519 0.087 0.266 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 1.64e-01 0.112 0.0798 0.266 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.66e-02 0.243 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0379 0.0918 0.266 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.58e-01 -0.055 0.0739 0.266 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0689 0.0906 0.266 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 7.53e-02 0.164 0.092 0.266 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.73e-01 0.0394 0.0931 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 3.50e-01 0.0813 0.0868 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 7.02e-01 0.0324 0.0846 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0857 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0596 0.0916 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 8.12e-02 0.169 0.0967 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 8.31e-03 0.254 0.0953 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0713 0.0903 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0204 0.0791 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 5.26e-01 0.0445 0.07 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.83e-01 0.0817 0.076 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 3.85e-02 -0.205 0.0982 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 7.34e-01 0.0299 0.088 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.59e-02 -0.134 0.0697 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0675 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 7.32e-03 0.249 0.092 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 7.75e-01 0.0276 0.0962 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.64e-01 0.0523 0.0905 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 8.97e-03 0.232 0.0879 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.88e-01 0.0115 0.0817 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 9.76e-01 0.00298 0.1 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.13e-01 0.0946 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0682 0.0835 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 4.91e-01 0.0646 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 4.64e-01 0.0766 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0618 0.0844 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.53e-01 0.0367 0.0813 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0386 0.0776 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 8.34e-01 0.0165 0.0787 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0876 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 6.51e-02 -0.166 0.0897 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 6.60e-01 0.0305 0.0691 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00533 0.0795 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.94e-02 0.167 0.0914 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0892 0.092 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.29e-01 0.0723 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.38e-02 0.24 0.105 0.27 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.92e-01 0.129 0.098 0.27 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.70e-01 0.0183 0.111 0.27 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0821 0.092 0.27 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.22e-01 0.125 0.0804 0.27 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 8.19e-01 0.0263 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 7.42e-01 0.0368 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 3.10e-01 0.11 0.108 0.27 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0954 0.267 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 6.20e-01 0.0434 0.0875 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0928 0.267 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.48e-01 0.131 0.0905 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 1.32e-02 0.227 0.0908 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.58e-01 0.0432 0.0737 0.267 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0319 0.0679 0.267 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.30e-01 0.0394 0.0816 0.267 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00902 0.0832 0.265 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 9.66e-01 0.00347 0.082 0.265 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 7.90e-01 0.023 0.0864 0.265 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0451 0.0998 0.265 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0278 0.0925 0.265 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 3.86e-02 -0.146 0.07 0.265 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 9.67e-01 0.00313 0.0763 0.265 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 5.74e-02 0.182 0.0952 0.265 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0617 0.0859 0.266 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0431 0.0884 0.266 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 3.54e-01 0.0907 0.0976 0.266 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 9.99e-01 -8.62e-05 0.083 0.266 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0612 0.0993 0.266 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0183 0.0864 0.266 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 5.22e-01 0.0634 0.099 0.266 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 2.27e-02 0.123 0.0537 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 4.74e-01 0.0458 0.0639 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 7.55e-01 0.0297 0.095 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.60e-01 0.0154 0.0871 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.03e-01 0.0467 0.0696 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0177 0.0546 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.33e-01 0.0361 0.0756 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.20e-01 0.0457 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 6.12e-01 0.0344 0.0677 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0497 0.104 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 8.10e-01 0.0231 0.0958 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 9.72e-01 0.00285 0.0816 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 5.93e-01 0.038 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 3.51e-01 0.0759 0.0812 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 8.71e-01 -0.019 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 2.63e-02 0.239 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0898 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 2.60e-01 -0.125 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 5.16e-01 0.072 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 7.31e-02 -0.189 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.54e-01 0.16 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.084 0.262 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.21e-01 -0.101 0.0819 0.262 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0328 0.0947 0.262 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 7.73e-01 0.0286 0.099 0.262 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0132 0.0862 0.262 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0818 0.262 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 7.73e-01 0.0256 0.0884 0.262 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.71e-01 0.0422 0.0744 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 7.41e-01 0.0205 0.0621 0.265 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0963 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.72e-01 0.0867 0.097 0.265 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 2.16e-01 0.105 0.0847 0.265 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0276 0.0828 0.265 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0425 0.0859 0.265 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0548 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0214 0.105 0.257 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 2.35e-01 0.133 0.112 0.257 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0578 0.0906 0.257 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.107 0.257 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.111 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0802 0.0671 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 9.68e-02 0.0997 0.0598 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 7.52e-01 0.0266 0.084 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0952 0.0602 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.56e-01 0.0781 0.0549 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 5.89e-01 0.0384 0.0711 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 1.44e-03 0.283 0.0878 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0937 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0748 0.0737 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 4.40e-01 0.0558 0.0721 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0611 0.0956 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 1.97e-03 -0.23 0.0735 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0885 0.0696 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0712 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 860895 sc-eQTL 3.76e-01 0.0775 0.0873 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.51e-04 0.297 0.0858 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 564520 sc-eQTL 1.29e-01 0.137 0.0901 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 5.58e-03 0.139 0.0498 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 3.92e-01 0.0514 0.06 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0206 0.0969 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 3.32e-01 0.0794 0.0817 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 4.21e-01 0.0559 0.0693 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0116 0.0523 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 3.49e-01 0.0679 0.0723 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 8.99e-02 0.113 0.0665 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 9.96e-01 0.000277 0.056 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 1.74e-01 -0.138 0.101 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 5.94e-01 0.0496 0.093 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 3.01e-01 0.0782 0.0755 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0702 0.0756 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 8.92e-01 0.0108 0.0799 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 634407 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00653 0.0684 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -6076 sc-eQTL 7.36e-01 0.0213 0.063 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -584839 sc-eQTL 3.06e-01 0.0706 0.0688 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -113637 sc-eQTL 2.08e-02 -0.224 0.0962 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896250 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0526 0.0775 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185855 sc-eQTL 1.69e-01 -0.085 0.0616 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121791 sc-eQTL 7.25e-01 -0.021 0.0598 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 96250 sc-eQTL 6.49e-03 0.241 0.0877 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8030 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0367 0.098 0.267 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 96250 eQTL 7.69e-07 0.107 0.0215 0.0 0.0 0.275
ENSG00000278916 CEP83-DT -896265 eQTL 3.88e-05 -0.159 0.0385 0.0309 0.0264 0.275


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 96250 4.03e-06 5.16e-06 7.29e-07 3.1e-06 1.06e-06 8.44e-07 2.41e-06 9.28e-07 4.55e-06 2.01e-06 4.16e-06 3.36e-06 6.58e-06 2.16e-06 1.31e-06 3.71e-06 1.92e-06 2.72e-06 1.65e-06 9.53e-07 2.98e-06 4.49e-06 3.31e-06 1.36e-06 6.72e-06 1.65e-06 2.53e-06 1.43e-06 4.3e-06 4.23e-06 1.95e-06 5.58e-07 5.88e-07 1.75e-06 1.95e-06 9.53e-07 9.54e-07 4.24e-07 1.06e-06 4.16e-07 1.98e-07 5.47e-06 4e-07 2.1e-07 2.88e-07 3.52e-07 8.08e-07 2.21e-07 3.29e-07
ENSG00000278916 CEP83-DT -896265 2.66e-07 1.08e-07 3.69e-08 1.78e-07 1.02e-07 9.05e-08 1.39e-07 5.21e-08 1.37e-07 4.23e-08 1.61e-07 7.58e-08 1.23e-07 6.07e-08 4.89e-08 7.87e-08 5.1e-08 1.07e-07 5.19e-08 3.59e-08 1.06e-07 1.31e-07 1.29e-07 4.99e-08 1.32e-07 1.13e-07 1.13e-07 8.45e-08 1.03e-07 1.11e-07 9.75e-08 3.72e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.27e-08 3.9e-08 4.91e-08 9.49e-08 8.3e-08 3.69e-08 3.77e-08 1.37e-07 4.12e-08 1.66e-08 1.09e-07 1.75e-08 1.37e-07 4.82e-09 4.85e-08