logo

Genes within 1Mb (chr12:93563235:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0569 0.052 0.265 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 1.91e-01 0.0674 0.0514 0.265 B L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0454 0.0781 0.265 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.17e-02 -0.14 0.0645 0.265 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0407 0.0581 0.265 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 4.09e-02 0.104 0.0508 0.265 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 2.67e-01 0.0643 0.0577 0.265 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 2.98e-04 0.285 0.0776 0.265 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 1.50e-01 0.114 0.0792 0.265 B L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0738 0.053 0.265 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0183 0.0514 0.265 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00785 0.054 0.265 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 4.75e-01 0.0632 0.0884 0.265 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.09e-01 0.0137 0.0566 0.265 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0995 0.0506 0.265 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0662 0.0472 0.265 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 5.55e-02 0.157 0.0818 0.265 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.21e-02 0.128 0.0591 0.265 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0153 0.0686 0.265 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0208 0.0706 0.265 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.45e-01 0.121 0.0827 0.265 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 7.51e-01 0.021 0.066 0.265 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0439 0.0492 0.265 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00233 0.0614 0.265 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 3.35e-02 0.185 0.0865 0.265 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0711 0.0793 0.257 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 1.20e-01 -0.133 0.0853 0.257 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 2.49e-01 0.0881 0.0762 0.257 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0576 0.0796 0.257 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0748 0.0803 0.257 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 5.49e-01 0.0554 0.0924 0.257 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.52e-03 0.128 0.0465 0.265 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.65e-01 0.0602 0.0539 0.265 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0438 0.0995 0.265 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 2.47e-01 0.0925 0.0796 0.265 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 2.18e-01 0.0844 0.0684 0.265 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0321 0.0514 0.265 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 3.54e-01 0.0643 0.0692 0.265 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0107 0.0666 0.266 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 7.61e-01 0.019 0.0623 0.266 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.95e-01 0.0681 0.0649 0.266 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 4.06e-02 -0.19 0.0924 0.266 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0362 0.0739 0.266 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0715 0.0602 0.266 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 6.46e-01 0.0275 0.0597 0.266 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 2.74e-03 0.253 0.0836 0.266 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0215 0.0973 0.266 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0557 0.0867 0.265 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0204 0.0804 0.265 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 3.60e-01 0.0691 0.0753 0.265 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 7.35e-02 0.163 0.0906 0.265 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.48e-01 0.0796 0.0847 0.265 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0429 0.0651 0.265 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0252 0.0604 0.265 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 2.97e-02 0.155 0.0707 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 9.25e-02 0.171 0.101 0.263 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0186 0.086 0.263 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 1.56e-02 -0.257 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.81e-01 0.0634 0.0897 0.263 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.60e-01 0.156 0.111 0.263 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 7.29e-02 0.168 0.0933 0.263 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 4.73e-01 0.0776 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00372 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0825 0.0808 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.41e-01 0.0161 0.0803 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0819 0.0952 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 2.12e-01 0.111 0.0886 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 7.83e-01 -0.022 0.0795 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.87e-01 0.0219 0.081 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 6.00e-01 0.0471 0.0897 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.43e-02 0.182 0.0979 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 4.32e-01 0.0765 0.0972 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.27e-02 -0.16 0.0823 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 4.97e-01 0.0531 0.078 0.265 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 4.50e-01 0.0773 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.51e-01 0.0171 0.0911 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 6.26e-02 -0.136 0.0726 0.265 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 2.15e-01 0.0811 0.0653 0.265 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 6.01e-01 0.0437 0.0834 0.265 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 2.17e-03 0.295 0.0952 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 5.81e-01 0.0538 0.0972 0.265 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 9.76e-01 0.0023 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0604 0.079 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0973 0.099 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 2.62e-02 -0.181 0.0807 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0169 0.071 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 2.35e-01 0.0907 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 4.78e-01 0.0599 0.0843 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.70e-03 0.274 0.0862 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 8.39e-02 0.161 0.0929 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0833 0.0912 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.61e-01 0.0948 0.0842 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00211 0.0951 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.29e-02 -0.189 0.0881 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0867 0.0784 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.76e-01 0.104 0.0766 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0355 0.0667 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.50e-01 0.143 0.0992 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0956 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 7.61e-02 0.166 0.0932 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.0946 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 6.09e-01 0.0462 0.0901 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 5.10e-01 0.0603 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.11e-01 0.0933 0.092 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 9.61e-02 -0.149 0.089 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 4.55e-01 0.0684 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.34e-01 0.0487 0.102 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0494 0.0554 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000722 0.0525 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.25e-02 -0.103 0.0589 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 2.32e-01 -0.108 0.0902 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 6.11e-01 0.0327 0.0641 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 9.21e-02 -0.0895 0.0529 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0788 0.0508 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 5.61e-02 0.163 0.085 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0784 0.0771 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0303 0.0602 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 1.06e-01 0.115 0.0711 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 4.93e-04 0.332 0.0938 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 4.38e-01 0.0592 0.0762 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 6.91e-02 -0.11 0.0601 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0129 0.0582 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 3.43e-02 0.187 0.0879 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0638 0.0904 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 9.00e-01 0.00839 0.0669 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 1.98e-01 0.103 0.0798 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0249 0.0986 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 9.95e-02 -0.148 0.0894 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 7.70e-01 0.0228 0.0778 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 6.91e-01 0.0318 0.0799 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.87e-01 -0.116 0.0875 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 8.28e-02 0.138 0.079 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 2.73e-01 0.0846 0.077 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00962 0.0784 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 2.52e-01 0.109 0.0949 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 9.43e-02 0.144 0.0857 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 6.30e-01 -0.034 0.0705 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0676 0.0818 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 9.98e-04 0.305 0.0915 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 2.46e-01 0.0854 0.0734 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 1.10e-01 -0.116 0.0721 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0095 0.0812 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.0939 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0672 0.0782 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0509 0.0649 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 2.22e-01 0.0865 0.0707 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 2.88e-01 0.0962 0.0903 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0441 0.101 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 4.27e-01 -0.069 0.0866 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 9.43e-01 0.00704 0.0975 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0565 0.1 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 3.73e-01 -0.073 0.0817 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.82e-01 -0.027 0.0974 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.76e-01 0.135 0.0994 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0392 0.0966 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0894 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0942 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 5.23e-02 0.194 0.0991 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0973 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0917 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0226 0.088 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 9.60e-01 0.00462 0.0912 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0311 0.0957 0.266 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 5.52e-01 0.0519 0.087 0.266 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 1.64e-01 0.112 0.0798 0.266 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.66e-02 0.243 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0379 0.0918 0.266 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.58e-01 -0.055 0.0739 0.266 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0689 0.0906 0.266 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 7.53e-02 0.164 0.092 0.266 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.73e-01 0.0394 0.0931 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 3.50e-01 0.0813 0.0868 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 7.02e-01 0.0324 0.0846 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0857 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0596 0.0916 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 8.12e-02 0.169 0.0967 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 8.31e-03 0.254 0.0953 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0713 0.0903 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0204 0.0791 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 5.26e-01 0.0445 0.07 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.83e-01 0.0817 0.076 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 3.85e-02 -0.205 0.0982 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 7.34e-01 0.0299 0.088 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.59e-02 -0.134 0.0697 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0675 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 7.32e-03 0.249 0.092 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 7.75e-01 0.0276 0.0962 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.64e-01 0.0523 0.0905 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 8.97e-03 0.232 0.0879 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.88e-01 0.0115 0.0817 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 9.76e-01 0.00298 0.1 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.13e-01 0.0946 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0682 0.0835 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 4.91e-01 0.0646 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 4.64e-01 0.0766 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0618 0.0844 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.53e-01 0.0367 0.0813 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0386 0.0776 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 8.34e-01 0.0165 0.0787 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0876 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 6.51e-02 -0.166 0.0897 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 6.60e-01 0.0305 0.0691 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00533 0.0795 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.94e-02 0.167 0.0914 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0892 0.092 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.29e-01 0.0723 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.38e-02 0.24 0.105 0.27 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.92e-01 0.129 0.098 0.27 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.70e-01 0.0183 0.111 0.27 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0821 0.092 0.27 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.22e-01 0.125 0.0804 0.27 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 8.19e-01 0.0263 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 7.42e-01 0.0368 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 3.10e-01 0.11 0.108 0.27 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0954 0.267 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 6.20e-01 0.0434 0.0875 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0928 0.267 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.48e-01 0.131 0.0905 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 1.32e-02 0.227 0.0908 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.58e-01 0.0432 0.0737 0.267 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0319 0.0679 0.267 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.30e-01 0.0394 0.0816 0.267 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00902 0.0832 0.265 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 9.66e-01 0.00347 0.082 0.265 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 7.90e-01 0.023 0.0864 0.265 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0451 0.0998 0.265 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0278 0.0925 0.265 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 3.86e-02 -0.146 0.07 0.265 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 9.67e-01 0.00313 0.0763 0.265 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 5.74e-02 0.182 0.0952 0.265 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0617 0.0859 0.266 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0431 0.0884 0.266 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 3.54e-01 0.0907 0.0976 0.266 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 9.99e-01 -8.62e-05 0.083 0.266 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0612 0.0993 0.266 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0183 0.0864 0.266 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 5.22e-01 0.0634 0.099 0.266 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 2.27e-02 0.123 0.0537 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 4.74e-01 0.0458 0.0639 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 7.55e-01 0.0297 0.095 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.60e-01 0.0154 0.0871 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.03e-01 0.0467 0.0696 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0177 0.0546 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.33e-01 0.0361 0.0756 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.20e-01 0.0457 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 6.12e-01 0.0344 0.0677 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0497 0.104 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 8.10e-01 0.0231 0.0958 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 9.72e-01 0.00285 0.0816 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 5.93e-01 0.038 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 3.51e-01 0.0759 0.0812 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 8.71e-01 -0.019 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 2.63e-02 0.239 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0898 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 2.60e-01 -0.125 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 5.16e-01 0.072 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 7.31e-02 -0.189 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.54e-01 0.16 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.084 0.262 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.21e-01 -0.101 0.0819 0.262 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0328 0.0947 0.262 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 7.73e-01 0.0286 0.099 0.262 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0132 0.0862 0.262 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0818 0.262 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 7.73e-01 0.0256 0.0884 0.262 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.71e-01 0.0422 0.0744 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 7.41e-01 0.0205 0.0621 0.265 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0963 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.72e-01 0.0867 0.097 0.265 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 2.16e-01 0.105 0.0847 0.265 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0276 0.0828 0.265 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0425 0.0859 0.265 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0548 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0214 0.105 0.257 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 2.35e-01 0.133 0.112 0.257 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0578 0.0906 0.257 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.107 0.257 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.111 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0802 0.0671 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 9.68e-02 0.0997 0.0598 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 7.52e-01 0.0266 0.084 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0952 0.0602 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.56e-01 0.0781 0.0549 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 5.89e-01 0.0384 0.0711 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 1.44e-03 0.283 0.0878 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0937 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0748 0.0737 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 4.40e-01 0.0558 0.0721 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0611 0.0956 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 1.97e-03 -0.23 0.0735 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0885 0.0696 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0712 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 860392 sc-eQTL 3.76e-01 0.0775 0.0873 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.51e-04 0.297 0.0858 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 564017 sc-eQTL 1.29e-01 0.137 0.0901 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 5.58e-03 0.139 0.0498 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 3.92e-01 0.0514 0.06 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0206 0.0969 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 3.32e-01 0.0794 0.0817 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 4.21e-01 0.0559 0.0693 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0116 0.0523 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 3.49e-01 0.0679 0.0723 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 8.99e-02 0.113 0.0665 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 9.96e-01 0.000277 0.056 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 1.74e-01 -0.138 0.101 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 5.94e-01 0.0496 0.093 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 3.01e-01 0.0782 0.0755 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0702 0.0756 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 8.92e-01 0.0108 0.0799 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 633904 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00653 0.0684 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -6579 sc-eQTL 7.36e-01 0.0213 0.063 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -585342 sc-eQTL 3.06e-01 0.0706 0.0688 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -114140 sc-eQTL 2.08e-02 -0.224 0.0962 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -896753 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0526 0.0775 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 185352 sc-eQTL 1.69e-01 -0.085 0.0616 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 121288 sc-eQTL 7.25e-01 -0.021 0.0598 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 95747 sc-eQTL 6.49e-03 0.241 0.0877 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -8533 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0367 0.098 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 95747 eQTL 8.52e-07 0.107 0.0215 0.0 0.0 0.275
ENSG00000278916 CEP83-DT -896768 eQTL 4.11e-05 -0.159 0.0385 0.0294 0.0249 0.275

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 95747 7.46e-06 9.98e-06 1.22e-06 6.53e-06 1.69e-06 2.96e-06 9.65e-06 1.43e-06 6.77e-06 4.42e-06 1.04e-05 3.57e-06 1.26e-05 3.77e-06 2.34e-06 6.63e-06 3.84e-06 4.1e-06 2.19e-06 2.15e-06 2.89e-06 7.98e-06 5.85e-06 1.93e-06 1.28e-05 2.27e-06 4.63e-06 3.11e-06 7.05e-06 7.71e-06 4.32e-06 5.87e-07 8.1e-07 2.34e-06 4.56e-06 2.38e-06 1.2e-06 4.82e-07 1.64e-06 9.82e-07 4.48e-07 1.3e-05 1.42e-06 1.68e-07 7.28e-07 1.62e-06 1.15e-06 6.83e-07 5.05e-07
ENSG00000278916 CEP83-DT -896768 2.74e-07 1.36e-07 8.02e-08 2.35e-07 9.79e-08 9.91e-08 1.73e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.74e-08 1.55e-07 8.68e-08 1.87e-07 8.13e-08 9.33e-08 7.74e-08 3.98e-08 1.33e-07 7.18e-08 4.1e-08 1.08e-07 1.26e-07 1.44e-07 3.42e-08 1.85e-07 1.14e-07 1.18e-07 9.92e-08 1.09e-07 1.05e-07 9.92e-08 4.07e-08 3.35e-08 8.72e-08 1.69e-07 3.22e-08 4.99e-08 9.68e-08 6.71e-08 5.13e-08 5.14e-08 1.52e-07 4.83e-08 1.84e-08 4.92e-08 9.86e-09 1.22e-07 2.02e-09 5.04e-08