logo

Genes within 1Mb (chr12:93558578:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0392 0.078 0.13 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0752 0.0772 0.13 B L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0307 0.117 0.13 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 5.37e-01 0.0604 0.0976 0.13 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 3.45e-01 0.0823 0.0869 0.13 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 9.86e-02 -0.127 0.0763 0.13 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0633 0.0866 0.13 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 9.68e-01 0.00477 0.12 0.13 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 3.32e-01 -0.116 0.119 0.13 B L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 8.05e-02 0.141 0.0801 0.13 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0834 0.0778 0.13 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0855 0.0817 0.13 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0366 0.134 0.13 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.52e-01 0.0388 0.0858 0.13 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.38e-01 -0.006 0.0775 0.13 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 6.81e-01 0.0297 0.0719 0.13 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.54e-01 0.023 0.125 0.13 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 1.48e-01 0.131 0.0899 0.13 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 1.74e-01 0.141 0.103 0.13 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 6.91e-01 0.0425 0.107 0.13 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00129 0.126 0.13 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 2.10e-01 -0.125 0.0994 0.13 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0243 0.0745 0.13 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 2.79e-01 -0.1 0.0925 0.13 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.31e-01 0.0283 0.132 0.13 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0591 0.122 0.126 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.00e-01 0.136 0.131 0.126 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.44e-01 0.141 0.148 0.126 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 3.24e-01 -0.116 0.117 0.126 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 3.79e-01 -0.107 0.122 0.126 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0901 0.123 0.126 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 4.74e-01 0.102 0.142 0.126 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0677 0.0715 0.13 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0436 0.0818 0.13 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 4.21e-01 -0.121 0.15 0.13 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0592 0.121 0.13 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 8.30e-02 -0.18 0.103 0.13 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0833 0.0777 0.13 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 2.39e-01 0.123 0.105 0.13 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0941 0.0998 0.129 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 4.27e-02 -0.189 0.0926 0.129 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0431 0.0976 0.129 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.40e-01 0.0467 0.14 0.129 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 3.22e-01 -0.11 0.111 0.129 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.58e-01 0.0673 0.0906 0.129 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0166 0.0898 0.129 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 3.41e-01 0.122 0.128 0.129 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 5.36e-01 0.0906 0.146 0.129 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0312 0.128 0.13 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0602 0.119 0.13 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0696 0.111 0.13 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.56e-01 -0.042 0.135 0.13 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 1.19e-01 -0.195 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.04e-01 0.0116 0.0962 0.13 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 1.92e-01 -0.116 0.0889 0.13 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.57e-01 0.019 0.106 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 3.45e-01 -0.137 0.144 0.143 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0898 0.122 0.143 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 2.01e-01 0.183 0.142 0.143 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 4.33e-01 0.119 0.151 0.143 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0661 0.127 0.143 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.01e-02 -0.285 0.156 0.143 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 7.93e-01 -0.035 0.133 0.143 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 6.89e-01 0.0613 0.153 0.143 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 9.95e-01 0.000901 0.148 0.143 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 5.28e-01 0.0763 0.121 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.21e-01 -0.119 0.119 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0143 0.142 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 1.87e-01 0.175 0.132 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 1.31e-01 -0.179 0.118 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0865 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 5.81e-01 0.0739 0.134 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 2.85e-01 -0.157 0.147 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 4.65e-01 -0.106 0.145 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.61e-01 0.0889 0.12 0.127 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 8.55e-01 0.0208 0.114 0.127 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 4.48e-02 -0.297 0.147 0.127 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 7.80e-01 0.037 0.132 0.127 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 1.52e-01 0.152 0.106 0.127 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0641 0.0951 0.127 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 2.47e-01 -0.14 0.121 0.127 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 1.07e-01 -0.228 0.141 0.127 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 4.27e-01 0.112 0.141 0.127 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 3.37e-01 -0.109 0.113 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0542 0.117 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.31e-01 0.144 0.147 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0621 0.121 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 8.48e-01 0.0203 0.106 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 3.38e-02 -0.24 0.112 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0108 0.125 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.16e-01 0.0477 0.131 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0948 0.139 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0164 0.134 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 6.20e-01 -0.069 0.139 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0243 0.13 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.86e-01 0.00206 0.115 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0376 0.113 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 5.36e-01 0.0606 0.0976 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 9.25e-01 0.0138 0.146 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 1.52e-01 -0.2 0.139 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0821 0.142 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 2.02e-01 -0.182 0.142 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 7.08e-02 -0.245 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.02e-01 0.142 0.138 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.87e-01 0.0561 0.139 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 3.67e-01 -0.122 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.38e-01 0.0462 0.138 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 1.41e-01 0.227 0.153 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 1.12e-01 0.136 0.0852 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 7.36e-02 -0.144 0.0803 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0689 0.0914 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 4.07e-01 -0.116 0.139 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0383 0.099 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0012 0.0821 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000363 0.0788 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.84e-01 0.0193 0.132 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 2.22e-01 0.145 0.119 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 6.35e-01 -0.044 0.0926 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0837 0.11 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00292 0.148 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.37e-01 0.0554 0.117 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 8.97e-01 0.012 0.0931 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.11e-01 0.0737 0.0894 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.01e-01 0.0526 0.137 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00869 0.138 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0554 0.102 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0386 0.122 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 8.23e-01 0.0335 0.15 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 5.58e-01 0.0801 0.137 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00902 0.118 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0371 0.121 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 4.31e-01 0.105 0.133 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0209 0.121 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 5.45e-01 0.0711 0.117 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 9.77e-01 0.00344 0.119 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0337 0.145 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 9.24e-01 0.0125 0.131 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00963 0.107 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 6.01e-01 0.0651 0.124 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0171 0.143 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 7.12e-02 0.204 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 5.50e-01 0.0668 0.112 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0904 0.125 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0532 0.145 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 1.34e-01 -0.181 0.12 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 2.82e-01 -0.108 0.0999 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 1.27e-01 -0.167 0.109 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 6.71e-01 0.0593 0.139 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.61e-01 0.113 0.153 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 2.42e-01 -0.154 0.131 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.33e-01 0.116 0.148 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 4.74e-01 0.112 0.156 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 4.94e-01 0.104 0.152 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 2.41e-01 -0.145 0.124 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 1.67e-01 -0.204 0.147 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 5.54e-02 0.289 0.15 0.12 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.92e-01 -0.103 0.15 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0584 0.14 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 1.75e-01 0.2 0.146 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.83e-01 -0.136 0.156 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 4.32e-01 -0.119 0.152 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 5.23e-01 0.0918 0.143 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.08e-01 -0.113 0.137 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0219 0.142 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 6.69e-01 0.0605 0.142 0.13 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0683 0.129 0.13 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 9.93e-02 -0.195 0.118 0.13 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00493 0.151 0.13 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 4.76e-01 -0.097 0.136 0.13 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0705 0.109 0.13 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 1.53e-01 -0.192 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.76e-01 0.0391 0.137 0.13 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 3.55e-01 -0.132 0.142 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 3.27e-02 -0.282 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.42e-01 -0.151 0.129 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0907 0.157 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 4.31e-01 0.103 0.131 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.43e-01 0.107 0.14 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 5.64e-01 0.0859 0.149 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 5.53e-01 -0.088 0.148 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 2.85e-01 0.148 0.138 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.27e-01 -0.096 0.121 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 1.23e-01 -0.165 0.106 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0403 0.116 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 1.76e-01 0.205 0.151 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0301 0.134 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 1.49e-01 0.155 0.107 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 5.76e-02 -0.195 0.102 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 2.99e-01 0.148 0.143 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 6.77e-01 0.0614 0.147 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 1.22e-01 0.214 0.138 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 1.42e-01 -0.201 0.136 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.47e-01 0.0952 0.125 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 1.42e-01 -0.225 0.153 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 2.13e-01 -0.179 0.143 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.84e-01 0.00253 0.128 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0104 0.144 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 5.01e-01 -0.108 0.16 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 6.86e-01 0.0524 0.13 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00312 0.122 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 1.38e-01 -0.172 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0796 0.118 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.87e-01 0.00213 0.132 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 3.47e-01 0.127 0.135 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0744 0.103 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 3.08e-01 -0.121 0.119 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 8.13e-01 0.0327 0.138 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00591 0.138 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 7.25e-01 0.0552 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 6.97e-02 -0.264 0.144 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 9.92e-01 0.00129 0.135 0.156 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 5.30e-01 0.0955 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.21e-01 0.0125 0.126 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.05e-02 -0.2 0.109 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 7.31e-01 0.0538 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 3.06e-01 -0.156 0.152 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 2.19e-01 -0.181 0.147 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 5.39e-01 0.0913 0.148 0.128 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 1.79e-01 -0.183 0.136 0.128 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.77e-01 0.0809 0.145 0.128 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 4.01e-02 -0.289 0.14 0.128 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 3.60e-01 -0.131 0.143 0.128 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.08e-01 -0.095 0.114 0.128 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 1.72e-01 -0.144 0.105 0.128 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00266 0.127 0.128 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 1.29e-01 0.189 0.124 0.13 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 2.18e-01 -0.151 0.122 0.13 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0737 0.129 0.13 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0706 0.149 0.13 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 3.91e-01 0.119 0.138 0.13 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 8.79e-01 0.0162 0.106 0.13 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.99e-01 0.0774 0.114 0.13 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 1.81e-01 -0.192 0.143 0.13 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0532 0.129 0.127 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.43e-01 -0.126 0.133 0.127 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0281 0.147 0.127 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 1.87e-01 -0.164 0.124 0.127 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.70e-01 0.00558 0.149 0.127 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.96e-01 0.0335 0.13 0.127 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.10e-01 0.0553 0.149 0.127 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0909 0.0824 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0816 0.0971 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0495 0.145 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0225 0.132 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 1.80e-03 -0.327 0.103 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0794 0.0828 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.02e-01 0.0441 0.115 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 6.36e-01 0.0513 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0911 0.103 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0884 0.158 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 9.82e-01 0.00338 0.146 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 6.88e-01 0.0501 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0823 0.108 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.05e-01 0.0471 0.124 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 1.01e-01 -0.319 0.193 0.106 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 9.20e-01 0.0181 0.18 0.106 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 9.95e-01 0.00107 0.189 0.106 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0329 0.185 0.106 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 2.72e-01 -0.203 0.184 0.106 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.97e-01 -0.12 0.176 0.106 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 5.98e-01 0.102 0.193 0.106 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0635 0.188 0.106 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.01e-01 -0.111 0.132 0.129 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.69e-01 0.142 0.128 0.129 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.29e-01 -0.145 0.148 0.129 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0323 0.155 0.129 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0825 0.135 0.129 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0469 0.128 0.129 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0461 0.138 0.129 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0877 0.114 0.129 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.61e-01 0.107 0.0952 0.129 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0264 0.149 0.129 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 5.62e-01 0.0867 0.149 0.129 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0633 0.131 0.129 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 9.53e-01 0.00755 0.127 0.129 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 4.45e-01 0.101 0.132 0.129 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0473 0.159 0.124 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 2.45e-02 0.343 0.151 0.124 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 2.67e-02 0.342 0.153 0.124 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0153 0.165 0.124 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0145 0.134 0.124 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 2.03e-01 -0.202 0.158 0.124 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.11e-01 0.0607 0.164 0.124 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 8.77e-01 0.0156 0.101 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0503 0.0903 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 2.64e-01 -0.172 0.153 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 1.58e-01 0.178 0.126 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 7.38e-01 0.0304 0.0909 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0748 0.0827 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0715 0.107 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 4.22e-01 -0.108 0.135 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 8.98e-01 0.018 0.141 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0829 0.11 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0896 0.107 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 6.36e-01 0.0676 0.142 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0588 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 6.01e-01 0.0544 0.104 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.83e-02 -0.187 0.106 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 855735 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0747 0.13 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 7.10e-01 0.0488 0.131 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 559360 sc-eQTL 1.49e-01 -0.195 0.134 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0616 0.0765 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 3.49e-01 -0.085 0.0905 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0481 0.146 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0683 0.124 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 7.78e-03 -0.277 0.103 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0888 0.0787 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 6.00e-01 0.0573 0.109 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 2.32e-01 -0.125 0.104 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 1.57e-01 0.124 0.087 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.84e-01 -0.138 0.158 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 8.84e-01 0.0213 0.145 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0422 0.118 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0449 0.118 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 4.67e-01 0.0907 0.125 0.129 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629247 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0591 0.102 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -11236 sc-eQTL 7.71e-02 -0.167 0.0938 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -589999 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0399 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118797 sc-eQTL 3.72e-01 0.13 0.146 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901410 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0558 0.116 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180695 sc-eQTL 4.57e-01 0.069 0.0926 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116631 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0554 0.0896 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 91090 sc-eQTL 3.69e-01 0.12 0.134 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13190 sc-eQTL 7.20e-01 0.0527 0.147 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000258172 \N -718617 2.8e-07 1.27e-07 4.48e-08 1.9e-07 9.16e-08 9.48e-08 1.67e-07 5.43e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.37e-08 6.18e-08 7.36e-08 3.93e-08 1.33e-07 5.97e-08 4.31e-08 1.19e-07 1.27e-07 1.45e-07 2.64e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.1e-07 9.65e-08 1.16e-07 9.49e-08 9.92e-08 2.9e-08 3.61e-08 8.11e-08 6.34e-08 3.62e-08 5.11e-08 9.26e-08 6.37e-08 3.86e-08 5.14e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.55e-08 4.25e-08 1.83e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.04e-08