logo

Genes within 1Mb (chr12:93558464:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 4.89e-01 0.0685 0.0988 0.062 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 9.81e-01 0.00239 0.0981 0.062 B L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 1.49e-01 -0.214 0.148 0.062 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 3.01e-01 -0.128 0.123 0.062 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 3.06e-01 0.113 0.11 0.062 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 3.03e-02 0.21 0.0963 0.062 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 5.09e-01 0.0727 0.11 0.062 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0879 0.152 0.062 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 7.53e-01 0.0475 0.151 0.062 B L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.64e-01 -0.059 0.102 0.062 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 9.81e-01 0.00242 0.0988 0.062 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.60e-02 -0.178 0.103 0.062 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 1.51e-01 -0.244 0.169 0.062 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00641 0.109 0.062 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.50e-01 0.0587 0.098 0.062 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.50e-01 0.131 0.0906 0.062 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0457 0.158 0.062 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 2.46e-01 -0.133 0.114 0.062 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.86e-01 0.019 0.132 0.062 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 6.11e-02 -0.253 0.135 0.062 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.35e-01 -0.189 0.159 0.062 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0255 0.127 0.062 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.41e-02 0.19 0.0937 0.062 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 2.89e-01 0.125 0.118 0.062 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0208 0.168 0.062 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00445 0.15 0.063 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.02e-01 0.265 0.161 0.063 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.24e-01 -0.223 0.183 0.063 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 3.22e-01 -0.143 0.144 0.063 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0169 0.151 0.063 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 2.62e-01 0.171 0.152 0.063 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 4.39e-01 0.135 0.175 0.063 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.70e-01 0.0268 0.0914 0.062 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.90e-01 0.0145 0.104 0.062 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 7.26e-01 0.0675 0.192 0.062 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 2.37e-01 0.182 0.154 0.062 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 6.74e-01 0.0559 0.132 0.062 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 4.19e-01 0.0804 0.0993 0.062 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.58e-01 0.00706 0.134 0.062 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.12e-01 0.0838 0.128 0.062 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.86e-01 0.0172 0.119 0.062 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.04e-01 -0.202 0.124 0.062 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.63e-01 0.2 0.178 0.062 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0209 0.142 0.062 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 7.29e-02 0.207 0.115 0.062 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.03e-02 0.2 0.114 0.062 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 3.62e-01 -0.149 0.163 0.062 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0578 0.187 0.062 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 3.79e-01 0.142 0.161 0.062 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000548 0.149 0.062 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0187 0.14 0.062 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 6.73e-01 0.0716 0.169 0.062 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0755 0.158 0.062 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0957 0.121 0.062 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 6.48e-01 0.0512 0.112 0.062 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0193 0.133 0.062 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 2.33e-01 -0.216 0.181 0.069 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 4.84e-01 0.107 0.153 0.069 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0432 0.179 0.069 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0793 0.19 0.069 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0555 0.16 0.069 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 9.90e-02 0.326 0.197 0.069 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 1.47e-01 -0.242 0.166 0.069 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 1.70e-01 -0.263 0.191 0.069 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 2.00e-01 0.239 0.185 0.069 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.83e-01 0.0417 0.151 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 6.88e-01 0.0603 0.15 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0357 0.178 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.60e-01 0.00838 0.166 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 2.55e-01 0.169 0.148 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 3.24e-01 0.149 0.151 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 4.19e-01 -0.135 0.167 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0982 0.184 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 4.53e-01 0.136 0.181 0.062 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.45e-01 0.0499 0.153 0.062 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.70e-01 -0.197 0.143 0.062 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 4.72e-01 -0.136 0.188 0.062 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 3.52e-02 -0.352 0.166 0.062 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.26e-01 0.108 0.135 0.062 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.82e-02 0.212 0.12 0.062 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 3.09e-01 0.156 0.153 0.062 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 7.85e-01 0.0489 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 7.76e-01 -0.051 0.179 0.062 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 3.24e-01 0.142 0.143 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0193 0.149 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.22e-01 -0.229 0.187 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 7.48e-01 0.0497 0.154 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 2.96e-01 0.14 0.134 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 5.47e-02 0.276 0.143 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 1.97e-01 -0.205 0.159 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 3.69e-02 -0.346 0.165 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 4.29e-01 -0.14 0.176 0.062 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.58e-01 0.102 0.173 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 2.10e-01 -0.2 0.159 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 9.13e-01 0.0198 0.18 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0207 0.169 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.78e-01 0.0228 0.149 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.74e-02 0.257 0.145 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 8.63e-01 0.0219 0.127 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 4.58e-01 0.14 0.189 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 7.29e-01 0.0629 0.181 0.062 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 1.01e-02 -0.466 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 4.87e-01 0.128 0.183 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 3.31e-01 0.17 0.175 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0727 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.48e-01 -0.258 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.59e-02 0.298 0.173 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 3.97e-01 0.15 0.177 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.71e-01 0.00712 0.198 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.93e-01 0.0282 0.108 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000599 0.102 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0672 0.115 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 3.80e-01 -0.154 0.175 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 6.22e-01 0.0614 0.124 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00632 0.103 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 3.99e-01 0.0836 0.0989 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0935 0.166 0.062 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 3.76e-01 -0.132 0.148 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 6.07e-02 0.216 0.115 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 3.78e-02 -0.284 0.136 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 5.15e-02 -0.36 0.184 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0926 0.146 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.64e-02 0.199 0.116 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.13e-01 0.177 0.111 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0998 0.171 0.062 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.24e-02 -0.321 0.171 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0556 0.128 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.79e-01 -0.205 0.152 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.96e-01 -0.197 0.188 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 7.86e-01 0.0467 0.172 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 1.09e-01 0.237 0.148 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0789 0.152 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 1.15e-01 0.263 0.167 0.062 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0714 0.153 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 9.86e-01 0.00259 0.149 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 6.95e-02 -0.273 0.15 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 4.74e-01 0.132 0.183 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.07e-02 -0.281 0.165 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 1.43e-01 0.199 0.135 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0541 0.158 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.21e-01 0.116 0.181 0.062 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0568 0.144 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.88e-02 0.24 0.141 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 3.22e-01 -0.157 0.158 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.12e-02 -0.42 0.181 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.09e-01 0.244 0.152 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 1.97e-01 0.163 0.126 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.41e-01 0.0279 0.138 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 4.38e-01 -0.137 0.176 0.062 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.44e-01 0.112 0.185 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 5.19e-01 -0.103 0.159 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 2.19e-01 -0.219 0.178 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 6.86e-02 -0.342 0.187 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 5.39e-01 -0.113 0.183 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.43e-01 0.115 0.15 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.03e-01 0.0445 0.178 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 3.01e-02 -0.394 0.18 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.17e-01 0.0686 0.189 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 1.44e-01 0.257 0.175 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.17e-01 -0.12 0.185 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0634 0.196 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.86e-01 -0.252 0.19 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.81e-01 -0.127 0.18 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 6.35e-01 0.0821 0.172 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 8.36e-01 0.037 0.179 0.064 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.30e-01 0.0896 0.186 0.063 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0369 0.169 0.063 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0294 0.156 0.063 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 9.83e-01 0.00432 0.198 0.063 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0525 0.179 0.063 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.74e-01 -0.081 0.144 0.063 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.08e-02 0.318 0.175 0.063 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00754 0.18 0.063 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 9.64e-01 0.0079 0.175 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.23e-01 0.0365 0.163 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 3.52e-02 -0.333 0.157 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 5.97e-01 -0.102 0.193 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 6.82e-02 -0.293 0.16 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 7.64e-01 0.0518 0.172 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 4.74e-01 0.131 0.183 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.21e-01 -0.117 0.182 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 1.22e-01 0.262 0.169 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 3.72e-01 0.134 0.15 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 9.18e-01 0.0138 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 4.34e-01 -0.113 0.145 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 8.31e-01 0.0402 0.189 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0127 0.167 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 6.31e-02 0.248 0.133 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.05e-01 0.207 0.128 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0675 0.178 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0648 0.183 0.062 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0069 0.183 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 5.69e-01 -0.103 0.18 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.94e-01 0.088 0.165 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 1.69e-01 0.278 0.201 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.70e-01 0.26 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0895 0.169 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 4.63e-01 -0.139 0.189 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 3.98e-01 -0.179 0.211 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0777 0.171 0.059 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 4.24e-01 -0.124 0.155 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.34e-01 -0.031 0.148 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.24e-01 -0.23 0.149 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 8.78e-03 0.436 0.165 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 8.99e-01 0.0218 0.172 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 2.24e-01 0.16 0.131 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 2.06e-01 0.191 0.151 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0692 0.175 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0293 0.175 0.062 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0733 0.237 0.056 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 6.09e-01 0.114 0.221 0.056 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 3.60e-01 -0.187 0.204 0.056 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 4.85e-01 0.161 0.23 0.056 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.66e-01 0.11 0.191 0.056 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0352 0.168 0.056 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0729 0.237 0.056 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0238 0.231 0.056 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 4.05e-01 -0.187 0.224 0.056 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 8.86e-01 0.026 0.181 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 8.24e-01 0.0369 0.166 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 2.47e-01 0.204 0.176 0.063 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 6.98e-01 -0.067 0.172 0.063 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000596 0.175 0.063 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.18e-01 -0.113 0.139 0.063 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.76e-01 0.0366 0.129 0.063 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 5.48e-01 -0.093 0.155 0.063 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0359 0.163 0.062 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 2.38e-01 0.189 0.16 0.062 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 6.16e-01 0.0848 0.169 0.062 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 9.74e-01 0.00635 0.195 0.062 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 5.89e-01 -0.098 0.181 0.062 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0192 0.138 0.062 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 2.15e-01 0.185 0.149 0.062 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 1.76e-01 -0.254 0.187 0.062 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0992 0.159 0.066 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 2.85e-02 0.356 0.161 0.066 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.86e-01 -0.193 0.18 0.066 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0354 0.153 0.066 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0999 0.183 0.066 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 3.85e-01 0.139 0.159 0.066 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 4.14e-01 -0.15 0.183 0.066 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0548 0.105 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00137 0.124 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 3.93e-01 0.157 0.184 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 4.35e-01 0.132 0.169 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 1.38e-01 0.2 0.134 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.53e-01 0.151 0.105 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 9.94e-01 -0.0011 0.147 0.062 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0635 0.136 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 7.77e-01 0.0368 0.13 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 3.14e-01 -0.2 0.198 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.94e-01 0.238 0.183 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 2.78e-01 0.169 0.156 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 5.22e-01 -0.087 0.136 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0378 0.156 0.062 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0667 0.227 0.058 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 1.30e-01 -0.318 0.209 0.058 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.85e-01 0.121 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 4.43e-01 0.166 0.216 0.058 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.90e-01 0.282 0.214 0.058 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 5.47e-01 -0.124 0.205 0.058 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 6.95e-01 0.0882 0.225 0.058 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 2.84e-01 -0.235 0.219 0.058 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.52e-01 0.096 0.161 0.062 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.77e-01 0.0877 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0601 0.181 0.062 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 2.63e-01 -0.212 0.188 0.062 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0341 0.165 0.062 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 7.34e-01 0.0534 0.157 0.062 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 7.01e-01 0.0649 0.169 0.062 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 2.23e-01 0.173 0.142 0.061 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 7.32e-01 0.0407 0.119 0.061 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 1.27e-01 0.281 0.184 0.061 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 5.46e-01 0.112 0.185 0.061 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 8.56e-02 -0.278 0.161 0.061 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 9.38e-01 0.0123 0.158 0.061 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 4.17e-01 -0.133 0.164 0.061 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 3.69e-01 0.17 0.188 0.071 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.91e-01 0.0982 0.182 0.071 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 5.28e-01 -0.117 0.184 0.071 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.32e-01 -0.295 0.195 0.071 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 6.13e-01 0.0804 0.159 0.071 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0471 0.188 0.071 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 2.19e-02 0.443 0.191 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0505 0.127 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 3.51e-01 -0.106 0.114 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 4.94e-01 0.133 0.193 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 1.63e-01 -0.221 0.158 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 4.72e-01 0.0823 0.114 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.57e-01 0.147 0.104 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 8.76e-01 0.021 0.134 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0711 0.17 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 4.66e-01 0.129 0.177 0.062 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 1.07e-01 0.224 0.138 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 4.20e-01 -0.11 0.136 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.85e-01 -0.193 0.18 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 7.19e-01 0.0512 0.142 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 2.35e-01 0.156 0.131 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 1.94e-02 0.314 0.133 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 855621 sc-eQTL 2.36e-01 -0.196 0.164 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 1.52e-01 -0.238 0.165 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 559246 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0987 0.171 0.062 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0624 0.0977 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 8.05e-01 0.0287 0.116 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 9.67e-01 0.00778 0.187 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 2.01e-01 0.202 0.157 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 9.84e-02 0.221 0.133 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 5.32e-01 0.0629 0.101 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0241 0.14 0.062 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 2.03e-01 0.167 0.131 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 5.66e-01 0.0632 0.11 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 2.06e-01 0.251 0.198 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0325 0.183 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 7.73e-02 -0.262 0.147 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 8.18e-01 0.0342 0.149 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 8.28e-01 0.0341 0.157 0.06 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 629133 sc-eQTL 5.74e-01 0.0736 0.131 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 sc-eQTL 7.90e-01 0.0322 0.121 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -590113 sc-eQTL 1.70e-01 -0.181 0.131 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -118911 sc-eQTL 1.91e-01 0.244 0.186 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -901524 sc-eQTL 5.91e-01 0.0799 0.148 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 180581 sc-eQTL 6.06e-02 0.221 0.117 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 116517 sc-eQTL 6.29e-02 0.212 0.114 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 90976 sc-eQTL 2.76e-01 -0.186 0.17 0.062 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -13304 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0508 0.188 0.062 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 eQTL 0.0473 0.104 0.0523 0.00105 0.0 0.0564

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120833 SOCS2 -11350 3.39e-05 2.79e-05 6.54e-06 1.55e-05 6.33e-06 1.63e-05 4.33e-05 4.94e-06 2.95e-05 1.47e-05 3.55e-05 1.63e-05 4.8e-05 1.28e-05 6.98e-06 1.88e-05 1.63e-05 2.71e-05 9e-06 8.12e-06 1.76e-05 3.17e-05 3.06e-05 1.15e-05 4.33e-05 8.89e-06 1.41e-05 1.24e-05 3.15e-05 3.51e-05 1.87e-05 2.34e-06 4.23e-06 8.56e-06 1.24e-05 7.68e-06 4.28e-06 3.76e-06 6.49e-06 4.14e-06 2.01e-06 3.54e-05 3.58e-06 5.7e-07 3.11e-06 4.6e-06 4.55e-06 2.22e-06 1.63e-06
ENSG00000177889 \N 116517 4.39e-06 4.05e-06 7.8e-07 2.04e-06 1.2e-06 1.19e-06 3.15e-06 1.01e-06 3.32e-06 1.7e-06 3.8e-06 2.51e-06 6.47e-06 1.33e-06 1.26e-06 2.43e-06 1.77e-06 2.81e-06 1.36e-06 9.17e-07 2.12e-06 3.92e-06 3.42e-06 1.6e-06 4.78e-06 1.36e-06 1.87e-06 1.43e-06 4.15e-06 4.13e-06 2.01e-06 5.93e-07 7.93e-07 1.79e-06 1.81e-06 9.43e-07 9.24e-07 4.76e-07 9.86e-07 3.58e-07 6.45e-07 4.75e-06 3.97e-07 1.81e-07 5.95e-07 3.33e-07 7.92e-07 2.41e-07 3.4e-07
ENSG00000186076 \N -83122 5.61e-06 5.11e-06 6.38e-07 3.42e-06 1.51e-06 1.52e-06 7.6e-06 1.17e-06 4.83e-06 2.82e-06 6.49e-06 3.36e-06 8.72e-06 1.75e-06 1.02e-06 3.98e-06 1.98e-06 3.74e-06 1.56e-06 1.4e-06 2.82e-06 5.42e-06 4.79e-06 2.01e-06 8.57e-06 2.13e-06 2.25e-06 1.55e-06 5.37e-06 6.66e-06 2.64e-06 4.9e-07 8.05e-07 2.53e-06 2e-06 1.39e-06 1.12e-06 5.58e-07 1.41e-06 7.55e-07 1.02e-06 7.37e-06 6.61e-07 1.56e-07 7.64e-07 1.32e-06 1.03e-06 6.58e-07 5.81e-07