logo

Genes within 1Mb (chr12:93556496:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0569 0.052 0.265 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 1.91e-01 0.0674 0.0514 0.265 B L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0454 0.0781 0.265 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.17e-02 -0.14 0.0645 0.265 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0407 0.0581 0.265 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 4.09e-02 0.104 0.0508 0.265 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 2.67e-01 0.0643 0.0577 0.265 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 2.98e-04 0.285 0.0776 0.265 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 1.50e-01 0.114 0.0792 0.265 B L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0738 0.053 0.265 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0183 0.0514 0.265 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00785 0.054 0.265 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 4.75e-01 0.0632 0.0884 0.265 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.09e-01 0.0137 0.0566 0.265 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.06e-02 -0.0995 0.0506 0.265 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0662 0.0472 0.265 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 5.55e-02 0.157 0.0818 0.265 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.21e-02 0.128 0.0591 0.265 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0153 0.0686 0.265 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0208 0.0706 0.265 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.45e-01 0.121 0.0827 0.265 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 7.51e-01 0.021 0.066 0.265 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0439 0.0492 0.265 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00233 0.0614 0.265 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 3.35e-02 0.185 0.0865 0.265 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0711 0.0793 0.257 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 1.20e-01 -0.133 0.0853 0.257 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 9.02e-01 -0.012 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 2.49e-01 0.0881 0.0762 0.257 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0576 0.0796 0.257 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0748 0.0803 0.257 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 5.49e-01 0.0554 0.0924 0.257 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.52e-03 0.128 0.0465 0.265 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.65e-01 0.0602 0.0539 0.265 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0438 0.0995 0.265 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 2.47e-01 0.0925 0.0796 0.265 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 2.18e-01 0.0844 0.0684 0.265 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0321 0.0514 0.265 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 3.54e-01 0.0643 0.0692 0.265 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0107 0.0666 0.266 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 7.61e-01 0.019 0.0623 0.266 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.95e-01 0.0681 0.0649 0.266 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 4.06e-02 -0.19 0.0924 0.266 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0362 0.0739 0.266 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0715 0.0602 0.266 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 6.46e-01 0.0275 0.0597 0.266 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 2.74e-03 0.253 0.0836 0.266 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0215 0.0973 0.266 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0557 0.0867 0.265 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0204 0.0804 0.265 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 3.60e-01 0.0691 0.0753 0.265 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 7.35e-02 0.163 0.0906 0.265 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.48e-01 0.0796 0.0847 0.265 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0429 0.0651 0.265 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0252 0.0604 0.265 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 2.97e-02 0.155 0.0707 0.265 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 9.25e-02 0.171 0.101 0.263 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0186 0.086 0.263 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.44e-01 -0.147 0.1 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 1.56e-02 -0.257 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.81e-01 0.0634 0.0897 0.263 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.60e-01 0.156 0.111 0.263 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 7.29e-02 0.168 0.0933 0.263 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 4.73e-01 0.0776 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00372 0.105 0.263 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0825 0.0808 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.41e-01 0.0161 0.0803 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0819 0.0952 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 2.12e-01 0.111 0.0886 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 7.83e-01 -0.022 0.0795 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.87e-01 0.0219 0.081 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 6.00e-01 0.0471 0.0897 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.43e-02 0.182 0.0979 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 4.32e-01 0.0765 0.0972 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.27e-02 -0.16 0.0823 0.265 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 4.97e-01 0.0531 0.078 0.265 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 4.50e-01 0.0773 0.102 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.51e-01 0.0171 0.0911 0.265 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 6.26e-02 -0.136 0.0726 0.265 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 2.15e-01 0.0811 0.0653 0.265 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 6.01e-01 0.0437 0.0834 0.265 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 2.17e-03 0.295 0.0952 0.265 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 5.81e-01 0.0538 0.0972 0.265 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 9.76e-01 0.0023 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0604 0.079 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0973 0.099 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 2.62e-02 -0.181 0.0807 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0169 0.071 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 2.35e-01 0.0907 0.0761 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 4.78e-01 0.0599 0.0843 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.70e-03 0.274 0.0862 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 8.39e-02 0.161 0.0929 0.265 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0833 0.0912 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.61e-01 0.0948 0.0842 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00211 0.0951 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.29e-02 -0.189 0.0881 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0867 0.0784 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.76e-01 0.104 0.0766 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0355 0.0667 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.50e-01 0.143 0.0992 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0956 0.266 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 7.61e-02 0.166 0.0932 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.0946 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 6.09e-01 0.0462 0.0901 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 5.10e-01 0.0603 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.11e-01 0.0933 0.092 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 9.61e-02 -0.149 0.089 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 4.55e-01 0.0684 0.0914 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.34e-01 0.0487 0.102 0.264 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0494 0.0554 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 9.89e-01 -0.000722 0.0525 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.25e-02 -0.103 0.0589 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 2.32e-01 -0.108 0.0902 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 6.11e-01 0.0327 0.0641 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 9.21e-02 -0.0895 0.0529 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0788 0.0508 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 5.61e-02 0.163 0.085 0.265 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0784 0.0771 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0303 0.0602 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 1.06e-01 0.115 0.0711 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 4.93e-04 0.332 0.0938 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 4.38e-01 0.0592 0.0762 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 6.91e-02 -0.11 0.0601 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0129 0.0582 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 3.43e-02 0.187 0.0879 0.265 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0638 0.0904 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 9.00e-01 0.00839 0.0669 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 1.98e-01 0.103 0.0798 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0249 0.0986 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 9.95e-02 -0.148 0.0894 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 7.70e-01 0.0228 0.0778 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 6.91e-01 0.0318 0.0799 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.87e-01 -0.116 0.0875 0.265 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 8.28e-02 0.138 0.079 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 2.73e-01 0.0846 0.077 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00962 0.0784 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 2.52e-01 0.109 0.0949 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 9.43e-02 0.144 0.0857 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 6.30e-01 -0.034 0.0705 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0676 0.0818 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 9.98e-04 0.305 0.0915 0.265 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 2.46e-01 0.0854 0.0734 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 1.10e-01 -0.116 0.0721 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0095 0.0812 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0202 0.0939 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0672 0.0782 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0509 0.0649 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 2.22e-01 0.0865 0.0707 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 2.88e-01 0.0962 0.0903 0.265 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0441 0.101 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 4.27e-01 -0.069 0.0866 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 9.43e-01 0.00704 0.0975 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.41e-01 0.151 0.102 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0565 0.1 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 3.73e-01 -0.073 0.0817 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.82e-01 -0.027 0.0974 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.76e-01 0.135 0.0994 0.262 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0392 0.0966 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0894 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.82e-01 -0.102 0.0942 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 5.23e-02 0.194 0.0991 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0973 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 1.86e-01 -0.122 0.0917 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0226 0.088 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 9.60e-01 0.00462 0.0912 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0311 0.0957 0.266 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 5.52e-01 0.0519 0.087 0.266 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 1.64e-01 0.112 0.0798 0.266 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.66e-02 0.243 0.101 0.266 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0379 0.0918 0.266 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.58e-01 -0.055 0.0739 0.266 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0689 0.0906 0.266 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 7.53e-02 0.164 0.092 0.266 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.73e-01 0.0394 0.0931 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 3.50e-01 0.0813 0.0868 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 7.02e-01 0.0324 0.0846 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 8.77e-01 0.016 0.103 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0857 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0596 0.0916 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 8.12e-02 0.169 0.0967 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 8.31e-03 0.254 0.0953 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0713 0.0903 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0204 0.0791 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 5.26e-01 0.0445 0.07 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.83e-01 0.0817 0.076 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 3.85e-02 -0.205 0.0982 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 7.34e-01 0.0299 0.088 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.59e-02 -0.134 0.0697 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 6.25e-01 0.0331 0.0675 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 7.32e-03 0.249 0.092 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 7.75e-01 0.0276 0.0962 0.267 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.64e-01 0.0523 0.0905 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 8.97e-03 0.232 0.0879 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.88e-01 0.0115 0.0817 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 9.76e-01 0.00298 0.1 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.13e-01 0.0946 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0682 0.0835 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 4.91e-01 0.0646 0.0936 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 4.64e-01 0.0766 0.104 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0618 0.0844 0.272 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.53e-01 0.0367 0.0813 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0386 0.0776 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 8.34e-01 0.0165 0.0787 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 2.33e-01 -0.105 0.0876 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 6.51e-02 -0.166 0.0897 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 6.60e-01 0.0305 0.0691 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00533 0.0795 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.94e-02 0.167 0.0914 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0892 0.092 0.267 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.29e-01 0.0723 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.38e-02 0.24 0.105 0.27 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.92e-01 0.129 0.098 0.27 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.70e-01 0.0183 0.111 0.27 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0821 0.092 0.27 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.22e-01 0.125 0.0804 0.27 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 8.19e-01 0.0263 0.115 0.27 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 7.42e-01 0.0368 0.112 0.27 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 3.10e-01 0.11 0.108 0.27 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0246 0.0954 0.267 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 6.20e-01 0.0434 0.0875 0.267 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.12e-01 -0.116 0.0928 0.267 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.48e-01 0.131 0.0905 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 1.32e-02 0.227 0.0908 0.267 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.58e-01 0.0432 0.0737 0.267 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0319 0.0679 0.267 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.30e-01 0.0394 0.0816 0.267 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00902 0.0832 0.265 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 9.66e-01 0.00347 0.082 0.265 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 7.90e-01 0.023 0.0864 0.265 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0451 0.0998 0.265 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0278 0.0925 0.265 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 3.86e-02 -0.146 0.07 0.265 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 9.67e-01 0.00313 0.0763 0.265 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 5.74e-02 0.182 0.0952 0.265 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0617 0.0859 0.266 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0431 0.0884 0.266 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 3.54e-01 0.0907 0.0976 0.266 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 9.99e-01 -8.62e-05 0.083 0.266 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0612 0.0993 0.266 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0183 0.0864 0.266 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 5.22e-01 0.0634 0.099 0.266 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 2.27e-02 0.123 0.0537 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 4.74e-01 0.0458 0.0639 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 7.55e-01 0.0297 0.095 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.60e-01 0.0154 0.0871 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.03e-01 0.0467 0.0696 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0177 0.0546 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.33e-01 0.0361 0.0756 0.265 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.20e-01 0.0457 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 6.12e-01 0.0344 0.0677 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0497 0.104 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 8.10e-01 0.0231 0.0958 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 9.72e-01 0.00285 0.0816 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 5.93e-01 0.038 0.0709 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 3.51e-01 0.0759 0.0812 0.265 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 8.71e-01 -0.019 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 2.63e-02 0.239 0.106 0.264 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0898 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 2.60e-01 -0.125 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 5.16e-01 0.072 0.111 0.264 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 7.31e-02 -0.189 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.54e-01 0.16 0.112 0.264 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 1.27e-01 0.129 0.084 0.262 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.21e-01 -0.101 0.0819 0.262 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0328 0.0947 0.262 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 7.73e-01 0.0286 0.099 0.262 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0132 0.0862 0.262 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0818 0.262 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 7.73e-01 0.0256 0.0884 0.262 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.71e-01 0.0422 0.0744 0.265 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 7.41e-01 0.0205 0.0621 0.265 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.69e-01 -0.133 0.0963 0.265 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.72e-01 0.0867 0.097 0.265 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 2.16e-01 0.105 0.0847 0.265 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0276 0.0828 0.265 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0425 0.0859 0.265 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0548 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0214 0.105 0.257 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 2.35e-01 0.133 0.112 0.257 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0578 0.0906 0.257 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.107 0.257 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 9.20e-01 0.0111 0.111 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0802 0.0671 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 9.68e-02 0.0997 0.0598 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.66e-01 -0.142 0.102 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 7.52e-01 0.0266 0.084 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0952 0.0602 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.56e-01 0.0781 0.0549 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 5.89e-01 0.0384 0.0711 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 1.44e-03 0.283 0.0878 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0937 0.265 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0748 0.0737 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 4.40e-01 0.0558 0.0721 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0611 0.0956 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 1.97e-03 -0.23 0.0735 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0885 0.0696 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 1.24e-01 0.11 0.0712 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 853653 sc-eQTL 3.76e-01 0.0775 0.0873 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.51e-04 0.297 0.0858 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 557278 sc-eQTL 1.29e-01 0.137 0.0901 0.265 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 5.58e-03 0.139 0.0498 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 3.92e-01 0.0514 0.06 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0206 0.0969 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 3.32e-01 0.0794 0.0817 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 4.21e-01 0.0559 0.0693 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0116 0.0523 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 3.49e-01 0.0679 0.0723 0.265 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 8.99e-02 0.113 0.0665 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 9.96e-01 0.000277 0.056 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 1.74e-01 -0.138 0.101 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 5.94e-01 0.0496 0.093 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 3.01e-01 0.0782 0.0755 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0702 0.0756 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 8.92e-01 0.0108 0.0799 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 627165 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00653 0.0684 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -13318 sc-eQTL 7.36e-01 0.0213 0.063 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -592081 sc-eQTL 3.06e-01 0.0706 0.0688 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -120879 sc-eQTL 2.08e-02 -0.224 0.0962 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -903492 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0526 0.0775 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 178613 sc-eQTL 1.69e-01 -0.085 0.0616 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 114549 sc-eQTL 7.25e-01 -0.021 0.0598 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 89008 sc-eQTL 6.49e-03 0.241 0.0877 0.267 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -15272 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0367 0.098 0.267 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000198015 MRPL42 89008 eQTL 4.75e-07 0.11 0.0217 0.0 0.0 0.275
ENSG00000278916 CEP83-DT -903507 eQTL 4.94e-05 -0.159 0.0389 0.025 0.0211 0.275

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 89008 8.84e-06 9.98e-06 8.44e-07 4.96e-06 1.82e-06 4.19e-06 1.04e-05 1.28e-06 6.39e-06 4.05e-06 1.06e-05 4.89e-06 1.22e-05 3.85e-06 1.87e-06 5.94e-06 3.71e-06 5.81e-06 2.25e-06 1.71e-06 3.46e-06 7.49e-06 6.92e-06 2.06e-06 1.42e-05 2.46e-06 3.87e-06 2.61e-06 8.26e-06 6.94e-06 4.49e-06 7.78e-07 7.92e-07 2.77e-06 3.16e-06 1.55e-06 1.07e-06 5.41e-07 1.4e-06 7.33e-07 5.7e-07 1.14e-05 1.29e-06 1.64e-07 7.85e-07 9.44e-07 1.05e-06 6.19e-07 4.23e-07
ENSG00000278916 CEP83-DT -903507 2.91e-07 1.5e-07 5.93e-08 2.24e-07 9.24e-08 8.21e-08 1.73e-07 5.4e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.55e-07 1.01e-07 1.87e-07 7.64e-08 5.43e-08 7.23e-08 3.87e-08 1.44e-07 6.32e-08 5.04e-08 1.26e-07 1.24e-07 1.44e-07 2.87e-08 1.65e-07 1.21e-07 1.12e-07 9.74e-08 1.2e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.78e-08 3.96e-08 9.8e-08 3.51e-08 3.22e-08 4.07e-08 8.63e-08 6.41e-08 4.47e-08 5.37e-08 1.46e-07 3.18e-08 7.47e-09 3.84e-08 1.8e-08 1.21e-07 1.9e-09 4.85e-08