Genes within 1Mb (chr12:93547722:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0946 0.068 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.96e-01 0.0796 0.0937 0.068 B L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 3.08e-01 0.145 0.142 0.068 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.04e-01 0.15 0.118 0.068 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00397 0.106 0.068 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0804 0.093 0.068 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 1.43e-02 -0.256 0.104 0.068 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 3.25e-02 -0.31 0.144 0.068 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 1.62e-01 0.202 0.144 0.068 B L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0342 0.0974 0.068 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0858 0.094 0.068 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.68e-02 0.181 0.0981 0.068 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.09e-01 0.0831 0.162 0.068 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.20e-01 -0.127 0.103 0.068 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 3.50e-01 0.0874 0.0934 0.068 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0464 0.0868 0.068 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0904 0.151 0.068 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.30e-01 0.0861 0.109 0.068 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 8.20e-01 0.0285 0.125 0.068 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 4.32e-01 0.101 0.129 0.068 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.54e-01 -0.216 0.151 0.068 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 8.08e-02 -0.21 0.12 0.068 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0214 0.09 0.068 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 7.94e-01 0.0292 0.112 0.068 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 8.51e-02 -0.274 0.159 0.068 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.17e-01 0.0728 0.146 0.07 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 1.89e-01 0.206 0.157 0.07 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 5.19e-01 -0.115 0.177 0.07 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0097 0.14 0.07 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 4.37e-01 -0.114 0.146 0.07 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.41e-01 0.0903 0.147 0.07 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 1.32e-01 -0.255 0.168 0.07 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0775 0.0862 0.068 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.47e-01 0.0927 0.0984 0.068 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 7.67e-01 0.0537 0.181 0.068 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 4.14e-01 -0.119 0.145 0.068 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0698 0.125 0.068 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.10e-01 0.0774 0.0937 0.068 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0248 0.126 0.068 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 1.31e-01 0.186 0.123 0.069 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 1.21e-01 0.178 0.115 0.069 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.49e-01 0.113 0.12 0.069 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.12e-01 -0.274 0.172 0.069 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0734 0.137 0.069 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0344 0.112 0.069 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 1.73e-01 -0.151 0.11 0.069 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0863 0.158 0.069 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 3.40e-02 0.38 0.178 0.069 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 8.36e-01 -0.032 0.154 0.068 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 4.19e-01 -0.116 0.143 0.068 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00374 0.134 0.068 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 9.13e-01 0.0178 0.162 0.068 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.18e-01 -0.186 0.151 0.068 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0199 0.116 0.068 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 3.14e-01 -0.108 0.107 0.068 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0948 0.127 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 2.55e-01 -0.204 0.178 0.069 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.42e-01 0.03 0.151 0.069 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.59e-01 0.249 0.176 0.069 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 1.69e-01 -0.258 0.186 0.069 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0179 0.157 0.069 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.60e-01 -0.144 0.195 0.069 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 5.18e-01 -0.107 0.165 0.069 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 2.90e-01 -0.201 0.189 0.069 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 4.42e-01 -0.141 0.183 0.069 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.90e-01 0.0579 0.145 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.54e-01 0.133 0.143 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.48e-01 -0.197 0.17 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 1.99e-01 -0.204 0.158 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0573 0.142 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 3.30e-02 -0.307 0.143 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0716 0.16 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 5.15e-01 0.115 0.176 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0383 0.174 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.22e-01 -0.118 0.147 0.069 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0125 0.139 0.069 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 3.87e-03 0.519 0.178 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00272 0.162 0.069 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.51e-01 0.0775 0.13 0.069 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 9.60e-01 0.00583 0.116 0.069 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 2.66e-02 -0.327 0.146 0.069 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.61e-02 -0.287 0.172 0.069 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 7.43e-01 0.0566 0.173 0.069 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 2.18e-01 -0.17 0.138 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0222 0.143 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 3.82e-01 0.157 0.18 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.99e-01 0.125 0.148 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0521 0.129 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0711 0.138 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 2.62e-01 -0.171 0.153 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.06e-01 -0.133 0.16 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 9.43e-01 0.0122 0.17 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.30e-01 -0.105 0.167 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.84e-01 0.135 0.155 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.99e-01 -0.181 0.174 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.90e-01 0.141 0.163 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 3.01e-01 0.149 0.144 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 8.03e-01 0.0352 0.141 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 8.23e-01 0.0274 0.122 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.71e-02 -0.303 0.182 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 1.36e-01 0.261 0.175 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.46e-01 0.0787 0.171 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 7.42e-01 0.0569 0.173 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.69e-01 -0.148 0.164 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.37e-01 -0.197 0.166 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.21e-01 0.0832 0.168 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.58e-01 0.0503 0.163 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.76e-01 -0.182 0.166 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 7.98e-01 0.0478 0.186 0.068 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.68e-01 -0.044 0.102 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 2.99e-01 -0.101 0.0966 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 5.77e-02 0.207 0.109 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.75e-01 0.182 0.167 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 1.28e-01 -0.18 0.118 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 4.60e-01 0.0727 0.0981 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0676 0.0942 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.82e-01 -0.111 0.158 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0339 0.143 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 9.25e-01 0.0105 0.111 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.25e-01 0.13 0.132 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.55e-01 -0.203 0.177 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0618 0.141 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.26e-01 0.0104 0.112 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0479 0.107 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0735 0.164 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 9.17e-01 0.0169 0.162 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 1.47e-01 -0.173 0.119 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0212 0.144 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.69e-01 0.0757 0.177 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.69e-01 -0.092 0.161 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0808 0.139 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.12e-01 -0.179 0.143 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0847 0.157 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.03e-01 0.0767 0.147 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 3.84e-01 -0.124 0.143 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.86e-01 0.0587 0.145 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0804 0.176 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.03e-02 -0.299 0.159 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0711 0.131 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 7.39e-01 0.0506 0.152 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 2.41e-01 -0.204 0.173 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.02e-01 0.0903 0.134 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0128 0.132 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 2.04e-01 0.188 0.148 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 4.04e-01 -0.143 0.171 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 4.89e-01 -0.099 0.143 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.119 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 3.88e-01 -0.112 0.129 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 2.23e-01 -0.201 0.165 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 2.42e-02 0.388 0.171 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 5.49e-01 0.0893 0.149 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0714 0.167 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.65e-01 -0.197 0.176 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.03e-01 -0.218 0.171 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.19e-02 0.252 0.139 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.01e-01 0.113 0.167 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 2.56e-01 -0.194 0.17 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0462 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0253 0.163 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0594 0.171 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 3.08e-01 0.185 0.181 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.94e-02 -0.333 0.175 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.44e-01 -0.101 0.167 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.35e-01 0.0759 0.16 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.59e-01 -0.123 0.165 0.071 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0905 0.171 0.069 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.069 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.23e-01 0.0706 0.143 0.069 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.92e-01 -0.238 0.182 0.069 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.02e-01 -0.11 0.164 0.069 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.64e-01 0.00604 0.132 0.069 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.26e-01 -0.197 0.162 0.069 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 7.98e-02 -0.29 0.165 0.069 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.88e-01 0.0923 0.17 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 1.28e-01 0.241 0.158 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 1.77e-01 0.209 0.154 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.75e-01 0.255 0.187 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 8.30e-01 0.0336 0.157 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.38e-01 -0.103 0.167 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.58e-01 -0.201 0.177 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0332 0.177 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0618 0.165 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 2.14e-01 0.181 0.145 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 3.57e-01 0.119 0.129 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.35e-01 0.0292 0.14 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.39e-01 -0.215 0.182 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00688 0.162 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.67e-01 0.0742 0.129 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0734 0.124 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.00e-02 -0.353 0.171 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 1.04e-02 0.451 0.175 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 1.69e-01 -0.236 0.171 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0307 0.169 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.25e-01 0.0342 0.155 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.92e-01 0.247 0.189 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0701 0.178 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.47e-01 0.0513 0.159 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.17e-01 -0.115 0.177 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00593 0.198 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 9.61e-01 -0.0079 0.16 0.066 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 9.71e-02 0.248 0.149 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 1.14e-01 0.225 0.142 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 4.21e-01 0.117 0.145 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 4.87e-01 -0.112 0.162 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 4.26e-01 -0.132 0.166 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 8.57e-01 0.0229 0.127 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.92e-01 -0.058 0.146 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.77e-01 0.0707 0.169 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 3.25e-01 0.167 0.169 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 2.48e-01 -0.267 0.23 0.059 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 5.80e-01 0.12 0.215 0.059 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0829 0.199 0.059 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.84e-01 -0.196 0.224 0.059 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 4.77e-01 -0.132 0.186 0.059 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0543 0.164 0.059 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 5.55e-01 0.136 0.23 0.059 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0549 0.225 0.059 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 1.26e-01 0.333 0.216 0.059 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.58e-01 0.134 0.181 0.067 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0093 0.166 0.067 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.22e-01 -0.175 0.176 0.067 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.35e-01 0.258 0.172 0.067 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.51e-01 -0.104 0.175 0.067 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.37e-01 0.0111 0.14 0.067 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.56e-01 0.0574 0.129 0.067 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 3.76e-01 0.137 0.154 0.067 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0957 0.151 0.068 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 9.24e-01 0.0142 0.149 0.068 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 1.96e-01 0.203 0.157 0.068 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0358 0.182 0.068 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.03e-01 0.174 0.168 0.068 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 3.27e-02 0.274 0.127 0.068 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.76e-02 0.274 0.138 0.068 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0164 0.175 0.068 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 3.25e-01 0.154 0.156 0.073 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 2.21e-01 0.197 0.16 0.073 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 3.83e-01 -0.155 0.178 0.073 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.16e-01 0.151 0.151 0.073 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.84e-01 0.00361 0.181 0.073 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0978 0.157 0.073 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 2.63e-01 -0.202 0.18 0.073 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0653 0.0997 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 3.34e-01 -0.113 0.117 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 4.47e-01 -0.133 0.174 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.58e-01 -0.181 0.159 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 5.50e-01 0.0765 0.128 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0726 0.1 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00146 0.139 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000477 0.129 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.25e-02 0.213 0.122 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 5.95e-01 0.1 0.188 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 2.53e-01 0.199 0.173 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 3.45e-01 -0.14 0.148 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 1.82e-01 0.172 0.128 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0594 0.148 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.60e-01 0.0932 0.212 0.07 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 4.17e-01 -0.159 0.196 0.07 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 4.04e-01 0.171 0.205 0.07 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0769 0.201 0.07 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0946 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 3.70e-01 -0.172 0.191 0.07 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 9.17e-01 0.0219 0.21 0.07 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 1.83e-01 -0.271 0.203 0.07 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0199 0.156 0.071 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 4.81e-02 0.298 0.15 0.071 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.61e-01 0.196 0.174 0.071 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.08e-01 -0.186 0.182 0.071 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.38e-01 0.0123 0.159 0.071 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.74e-01 0.165 0.151 0.071 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 1.62e-01 -0.227 0.162 0.071 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.22e-01 -0.109 0.135 0.068 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.66e-02 0.193 0.112 0.068 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 5.04e-01 0.118 0.176 0.068 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.00e-01 -0.119 0.177 0.068 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 6.81e-01 0.0636 0.155 0.068 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0965 0.151 0.068 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.62e-01 0.0684 0.156 0.068 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.96e-01 -0.129 0.188 0.071 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 2.73e-01 0.199 0.181 0.071 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0943 0.184 0.071 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0198 0.196 0.071 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.60e-01 0.0485 0.158 0.071 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 2.26e-01 0.227 0.187 0.071 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0926 0.194 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 6.76e-01 -0.051 0.122 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 5.63e-01 0.063 0.109 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.05e-01 0.3 0.184 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.18e-01 -0.152 0.152 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.11 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0963 0.0996 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 7.03e-02 -0.232 0.128 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.96e-01 -0.111 0.163 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 8.15e-01 0.0396 0.169 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 4.43e-01 -0.103 0.134 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.09e-01 0.0674 0.131 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 8.59e-01 0.0309 0.174 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 3.19e-01 0.137 0.137 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.60e-01 0.00633 0.127 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0109 0.13 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 844879 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0719 0.159 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 1.34e-01 -0.24 0.16 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 548504 sc-eQTL 1.73e-01 0.225 0.164 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0299 0.0922 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0172 0.109 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0756 0.176 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0725 0.149 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 1.00e+00 -4.73e-05 0.126 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 6.60e-01 0.0418 0.0949 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0151 0.132 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 3.96e-01 -0.108 0.127 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 6.26e-03 0.288 0.104 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 2.99e-01 0.199 0.191 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0651 0.176 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0135 0.143 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00697 0.144 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 4.26e-01 -0.121 0.151 0.069 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 618391 sc-eQTL 1.94e-01 0.165 0.126 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -22092 sc-eQTL 1.53e-01 0.167 0.116 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -600855 sc-eQTL 5.46e-01 0.0772 0.128 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -129653 sc-eQTL 1.75e-01 -0.245 0.18 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -912266 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0902 0.144 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 169839 sc-eQTL 7.93e-01 0.0301 0.115 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 105775 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0875 0.111 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 80234 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0848 0.166 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -24046 sc-eQTL 2.42e-02 0.408 0.18 0.067 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000257322 AC138123.1 332043 eQTL 0.0438 -0.114 0.0563 0.0 0.0 0.0545


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina