Genes within 1Mb (chr12:93539737:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.45e-01 -0.109 0.0747 0.109 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00302 0.0744 0.109 B L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.49e-01 0.163 0.112 0.109 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 3.35e-01 0.0906 0.0938 0.109 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.97e-02 -0.138 0.0833 0.109 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00953 0.0739 0.109 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 5.72e-02 -0.158 0.0827 0.109 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.44e-03 -0.364 0.113 0.109 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 3.56e-01 0.106 0.115 0.109 B L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0432 0.0763 0.109 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0255 0.0738 0.109 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.97e-01 0.1 0.0772 0.109 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.02e-01 0.208 0.126 0.109 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0667 0.0811 0.109 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 5.98e-01 0.0387 0.0733 0.109 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0157 0.0681 0.109 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 2.24e-03 -0.358 0.116 0.109 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 4.98e-02 0.168 0.0851 0.109 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 3.32e-01 0.0956 0.0983 0.109 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.64e-01 0.141 0.101 0.109 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 7.61e-01 0.0363 0.119 0.109 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0758 0.0946 0.109 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0529 0.0707 0.109 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.57e-01 0.0656 0.0881 0.109 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 2.95e-05 -0.515 0.121 0.109 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 3.18e-01 0.115 0.115 0.108 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.39e-01 0.183 0.123 0.108 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 7.13e-01 0.0516 0.14 0.108 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0723 0.11 0.108 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0568 0.115 0.108 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.70e-01 0.0496 0.116 0.108 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 4.47e-01 -0.102 0.133 0.108 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0711 0.068 0.109 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0167 0.0779 0.109 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.28e-01 0.218 0.143 0.109 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0496 0.115 0.109 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0285 0.0988 0.109 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 3.34e-01 0.0717 0.074 0.109 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 6.62e-02 -0.183 0.099 0.109 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 2.58e-01 0.109 0.0964 0.107 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 4.69e-01 0.0655 0.0902 0.107 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0372 0.0943 0.107 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0291 0.135 0.107 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.67e-01 -0.119 0.107 0.107 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0554 0.0876 0.107 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0468 0.0867 0.107 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 2.51e-02 -0.276 0.122 0.107 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 9.01e-01 0.0176 0.141 0.107 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 4.94e-01 0.0845 0.123 0.109 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.46e-01 0.0222 0.114 0.109 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.08e-02 0.231 0.106 0.109 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0145 0.13 0.109 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0731 0.121 0.109 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.44e-01 0.0429 0.0927 0.109 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00542 0.086 0.109 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 4.43e-02 -0.204 0.101 0.109 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00878 0.14 0.112 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.68e-01 -0.106 0.118 0.112 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.36e-02 0.339 0.136 0.112 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 1.06e-01 -0.237 0.146 0.112 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.65e-01 0.0369 0.123 0.112 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 2.71e-01 -0.168 0.152 0.112 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0644 0.129 0.112 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.44e-01 -0.216 0.148 0.112 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0802 0.144 0.112 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0227 0.114 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 5.56e-01 0.0663 0.112 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.44e-01 0.00935 0.134 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 4.71e-01 -0.09 0.125 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 1.83e-01 -0.148 0.111 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 8.83e-01 0.0167 0.114 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 3.58e-01 -0.116 0.126 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0359 0.138 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 9.00e-01 0.0171 0.136 0.109 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.75e-01 0.0334 0.117 0.11 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0745 0.11 0.11 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 4.40e-03 0.406 0.141 0.11 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 7.40e-01 0.0426 0.128 0.11 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00882 0.103 0.11 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0548 0.092 0.11 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 1.05e-01 -0.189 0.117 0.11 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.36e-02 -0.335 0.135 0.11 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 4.47e-01 0.104 0.136 0.11 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.29e-01 -0.165 0.108 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.24e-01 0.112 0.113 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.16e-01 0.142 0.142 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.76e-01 0.0654 0.117 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 1.59e-01 -0.143 0.101 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0767 0.109 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00149 0.121 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.17e-02 -0.27 0.125 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 5.33e-01 0.0835 0.134 0.109 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0332 0.132 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.99e-01 0.103 0.121 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 6.48e-02 -0.252 0.136 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 7.20e-01 0.046 0.128 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0182 0.113 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 3.89e-01 0.0955 0.111 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 4.24e-01 0.077 0.0961 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.25e-01 -0.22 0.143 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 5.37e-01 0.0851 0.138 0.109 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 4.45e-01 0.103 0.135 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 9.58e-01 0.00726 0.136 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0427 0.13 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 5.05e-01 0.088 0.132 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0271 0.133 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0632 0.129 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.67e-01 0.0754 0.132 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.10e-01 -0.15 0.147 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.58e-01 -0.114 0.0803 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00257 0.0762 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.89e-01 0.113 0.0858 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.42e-01 0.193 0.131 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 1.09e-01 -0.149 0.0926 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 3.87e-01 0.0669 0.0771 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0382 0.0741 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 7.38e-03 -0.331 0.122 0.109 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 8.16e-01 0.026 0.112 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0395 0.0871 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.75e-01 0.14 0.103 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0935 0.139 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00413 0.11 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0102 0.0876 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00781 0.0842 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.07e-02 -0.326 0.126 0.109 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 4.92e-01 0.0873 0.127 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 2.15e-01 -0.116 0.0934 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 5.08e-01 0.0744 0.112 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.15e-01 0.139 0.138 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0298 0.126 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0797 0.109 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0632 0.112 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.11e-01 -0.196 0.122 0.109 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.55e-02 0.206 0.116 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 3.36e-01 -0.109 0.113 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00685 0.115 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 8.01e-01 0.0351 0.139 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.52e-01 -0.145 0.126 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 1.23e-01 -0.159 0.103 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 3.44e-01 0.114 0.12 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 5.44e-03 -0.379 0.135 0.109 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.30e-01 0.161 0.106 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.20e-01 0.0239 0.105 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.01e-01 0.192 0.116 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 2.89e-01 0.144 0.135 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00956 0.113 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 8.11e-01 0.0225 0.0938 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.65e-01 -0.059 0.102 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 6.24e-04 -0.441 0.127 0.109 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.35e-02 0.337 0.135 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.16e-01 0.0276 0.118 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.81e-01 -0.116 0.132 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000319 0.14 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 6.66e-01 -0.059 0.136 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 1.40e-01 0.164 0.111 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.10e-01 0.109 0.132 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 7.32e-02 -0.243 0.135 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 9.91e-01 0.0015 0.139 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0744 0.129 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.26e-02 0.289 0.134 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.13e-01 0.227 0.143 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.06e-01 -0.177 0.139 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 4.52e-01 0.0997 0.132 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.43e-01 0.0587 0.126 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.13e-01 -0.132 0.131 0.112 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.27e-01 0.0473 0.136 0.11 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 2.39e-01 0.145 0.123 0.11 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 2.93e-02 0.247 0.112 0.11 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.94e-01 0.00112 0.145 0.11 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.25e-01 -0.158 0.13 0.11 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.35e-01 0.0355 0.105 0.11 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 1.29e-01 -0.195 0.128 0.11 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.76e-02 -0.31 0.13 0.11 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 3.33e-01 0.128 0.132 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 4.63e-01 0.0909 0.123 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 2.33e-01 0.144 0.12 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.50e-01 0.211 0.146 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 9.28e-01 0.0111 0.122 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 3.99e-01 -0.11 0.13 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0607 0.138 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.37e-01 -0.205 0.137 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0355 0.129 0.107 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 4.57e-01 0.0854 0.115 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.29e-01 0.0219 0.102 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0988 0.11 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.13e-01 0.0157 0.144 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.96e-01 -0.133 0.127 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 8.91e-01 0.014 0.102 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0703 0.0978 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 8.84e-03 -0.353 0.133 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 5.18e-01 0.0902 0.139 0.106 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 6.41e-02 -0.249 0.134 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.25e-01 0.0296 0.133 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0464 0.122 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 4.32e-01 0.117 0.149 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0096 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.88e-01 0.0336 0.125 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 7.62e-01 0.0424 0.14 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 9.60e-01 0.00785 0.156 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0438 0.126 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 5.00e-02 0.231 0.117 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 4.23e-01 0.0903 0.113 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0438 0.114 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.74e-01 -0.114 0.127 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0849 0.131 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.16e-01 0.0366 0.1 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0514 0.115 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0973 0.134 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0588 0.134 0.106 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 6.87e-02 -0.327 0.178 0.1 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 5.30e-01 0.106 0.168 0.1 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 5.23e-01 0.0995 0.155 0.1 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 3.97e-01 -0.149 0.175 0.1 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00731 0.145 0.1 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.85e-01 0.0024 0.128 0.1 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 4.58e-01 0.134 0.18 0.1 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0605 0.176 0.1 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 2.96e-01 0.178 0.17 0.1 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00154 0.14 0.109 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 7.61e-01 0.0392 0.129 0.109 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 2.74e-01 -0.15 0.137 0.109 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 5.36e-01 0.0829 0.134 0.109 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 8.98e-01 0.0174 0.136 0.109 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 7.74e-01 0.0312 0.108 0.109 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.25e-01 0.0797 0.0998 0.109 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0157 0.12 0.109 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0718 0.12 0.109 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0154 0.118 0.109 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0596 0.124 0.109 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.91e-01 0.123 0.143 0.109 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 7.81e-01 0.0371 0.133 0.109 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 1.20e-01 0.158 0.101 0.109 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 7.31e-01 0.0378 0.11 0.109 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 6.05e-02 -0.258 0.137 0.109 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 1.08e-01 0.202 0.125 0.11 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.54e-02 0.272 0.128 0.11 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 6.89e-01 0.0575 0.143 0.11 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.61e-01 0.137 0.121 0.11 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0091 0.146 0.11 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0158 0.127 0.11 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 1.26e-01 -0.222 0.144 0.11 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0398 0.0791 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0963 0.0929 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 6.79e-01 0.0573 0.138 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 3.87e-01 -0.11 0.127 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 3.75e-01 0.09 0.101 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0037 0.0795 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 4.62e-02 -0.219 0.109 0.109 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 9.11e-01 0.0115 0.103 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 6.08e-01 0.0503 0.098 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.35e-02 0.251 0.149 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 4.25e-01 0.111 0.139 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0569 0.118 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 2.24e-01 0.125 0.102 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.50e-01 -0.11 0.118 0.109 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.26e-01 0.0583 0.166 0.112 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 3.43e-01 -0.146 0.153 0.112 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 1.09e-01 0.257 0.159 0.112 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.02e-01 -0.163 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0798 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0634 0.15 0.112 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 7.35e-01 0.0556 0.164 0.112 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 7.27e-02 -0.286 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 2.41e-01 -0.146 0.124 0.109 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 2.99e-01 0.126 0.121 0.109 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.21e-01 0.216 0.139 0.109 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0569 0.146 0.109 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.20e-01 0.0128 0.127 0.109 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 4.88e-01 0.0839 0.121 0.109 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0745 0.13 0.109 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0559 0.105 0.109 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 8.79e-01 0.0134 0.088 0.109 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00654 0.137 0.109 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0778 0.138 0.109 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0893 0.12 0.109 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 1.35e-01 0.175 0.117 0.109 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.78e-01 -0.107 0.121 0.109 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.64e-01 -0.047 0.156 0.105 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 9.77e-02 0.249 0.149 0.105 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0737 0.152 0.105 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0798 0.162 0.105 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.88e-01 0.0527 0.131 0.105 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.95e-01 0.0828 0.155 0.105 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 2.05e-01 -0.204 0.16 0.105 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0326 0.0957 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 6.83e-01 -0.035 0.0856 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 1.12e-02 0.367 0.143 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 7.57e-01 -0.037 0.119 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0699 0.086 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00416 0.0785 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 7.00e-02 -0.183 0.1 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.87e-02 -0.263 0.127 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 4.79e-01 0.0943 0.133 0.109 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 3.16e-01 -0.107 0.106 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 2.26e-01 0.126 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0233 0.138 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 5.67e-01 0.062 0.108 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 2.77e-01 -0.109 0.1 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00131 0.103 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 836894 sc-eQTL 6.76e-01 0.0527 0.126 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 9.77e-03 -0.326 0.125 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 540519 sc-eQTL 3.29e-01 0.127 0.13 0.109 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0207 0.0731 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0814 0.0864 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 2.05e-01 0.177 0.139 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0856 0.118 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.46e-01 0.00679 0.1 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 6.77e-01 0.0314 0.0753 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 8.48e-02 -0.179 0.104 0.109 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0981 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 3.06e-01 0.0842 0.0822 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 3.44e-01 0.141 0.149 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 8.52e-01 0.0255 0.137 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0525 0.111 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 3.15e-01 0.112 0.111 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 3.89e-01 -0.101 0.117 0.108 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 610406 sc-eQTL 3.10e-01 0.101 0.0991 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -30077 sc-eQTL 4.12e-01 0.0752 0.0915 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -608840 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0721 0.1 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -137638 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0205 0.142 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -920251 sc-eQTL 2.56e-01 -0.128 0.112 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 161854 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00104 0.0899 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 97790 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0475 0.0869 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 72249 sc-eQTL 4.12e-02 -0.264 0.129 0.106 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -32031 sc-eQTL 8.66e-01 0.0242 0.143 0.106 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000177889 UBE2N 97790 eQTL 0.064 0.0398 0.0215 0.00112 0.0 0.0834
ENSG00000198015 MRPL42 72249 eQTL 2.46e-06 -0.174 0.0367 0.0 0.0 0.0834
ENSG00000257322 AC138123.1 324058 eQTL 0.0374 -0.0995 0.0477 0.0 0.0 0.0834


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000198015 MRPL42 72249 5.35e-05 2.51e-05 2.57e-06 5.03e-06 2.26e-06 6.22e-06 1.87e-05 1.12e-06 1.07e-05 5.05e-06 1.36e-05 4.46e-06 2.17e-05 3.77e-06 3.35e-06 7.94e-06 5.38e-06 8.03e-06 2.56e-06 2.52e-06 5.84e-06 1.26e-05 1.66e-05 3.03e-06 1.53e-05 3.9e-06 4.87e-06 4.41e-06 1.73e-05 7.95e-06 6.13e-06 8.07e-07 7.03e-07 2.86e-06 4.87e-06 1.46e-06 1.27e-06 1.14e-06 1.38e-06 1.01e-06 4.03e-07 4.15e-05 1.69e-06 1.51e-07 7.72e-07 2.04e-06 1.73e-06 4.41e-07 5.01e-07