logo

Genes within 1Mb (chr12:93527587:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0746 0.0518 0.284 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0313 0.0516 0.284 B L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0781 0.078 0.284 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 1.89e-01 0.0855 0.0649 0.284 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0117 0.0581 0.284 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0549 0.0511 0.284 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 4.40e-01 0.0447 0.0578 0.284 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.36e-26 0.751 0.061 0.284 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 9.50e-01 0.00504 0.0796 0.284 B L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 4.87e-01 0.0381 0.0547 0.284 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 6.98e-01 0.0205 0.0529 0.284 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 7.06e-01 0.021 0.0556 0.284 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0911 0.284 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00988 0.0582 0.284 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 8.68e-01 0.00873 0.0526 0.284 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.61e-01 0.00238 0.0488 0.284 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.19e-33 0.872 0.06 0.284 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.00e-01 0.0997 0.0604 0.284 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0384 0.0697 0.284 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.39e-01 0.0687 0.0717 0.284 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0536 0.0845 0.284 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0556 0.067 0.284 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0105 0.0501 0.284 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.51e-01 0.00383 0.0624 0.284 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.32e-20 0.742 0.0728 0.284 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 4.18e-01 0.0636 0.0783 0.279 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 7.41e-02 -0.151 0.0841 0.279 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 6.44e-01 0.0443 0.0956 0.279 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0282 0.0755 0.279 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.24e-01 0.0776 0.0785 0.279 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.87e-02 -0.139 0.0788 0.279 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.17e-04 0.346 0.0879 0.279 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.42e-01 0.0219 0.047 0.284 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 1.68e-01 0.0739 0.0534 0.284 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0382 0.0987 0.284 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.46e-01 -0.048 0.0792 0.284 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.46e-01 0.0642 0.068 0.284 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.62e-01 0.00243 0.0511 0.284 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.65e-11 0.431 0.0621 0.284 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0906 0.0673 0.285 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.96e-01 0.0335 0.0631 0.285 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 1.74e-01 0.0895 0.0657 0.285 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0943 0.285 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0159 0.0749 0.285 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0345 0.0612 0.285 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0412 0.0606 0.285 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.91e-12 0.576 0.0769 0.285 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 3.04e-01 0.102 0.0985 0.285 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 4.04e-01 0.0711 0.085 0.284 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0607 0.0788 0.284 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0589 0.0739 0.284 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.30e-02 0.19 0.0886 0.284 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0146 0.0833 0.284 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0706 0.0638 0.284 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0388 0.0592 0.284 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 5.62e-05 0.277 0.0675 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0228 0.103 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 8.00e-01 0.0222 0.0871 0.276 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0286 0.102 0.276 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.21e-02 -0.182 0.108 0.276 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.16e-01 -0.112 0.0906 0.276 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 2.66e-02 0.249 0.111 0.276 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 6.35e-01 0.0453 0.0954 0.276 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.37e-02 0.268 0.108 0.276 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 8.81e-01 -0.016 0.106 0.276 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.86e-02 -0.186 0.0784 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 9.70e-02 -0.13 0.0782 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0932 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 6.76e-01 0.0364 0.0871 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0451 0.0779 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 1.33e-02 -0.195 0.0782 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 5.70e-01 -0.05 0.0879 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.44e-08 0.528 0.0896 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 3.95e-01 0.0812 0.0952 0.285 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.51e-02 -0.146 0.0787 0.284 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 6.18e-01 0.0373 0.0747 0.284 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.91e-01 0.0526 0.0977 0.284 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.67e-01 0.00361 0.0871 0.284 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0743 0.0698 0.284 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0609 0.0625 0.284 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 5.60e-01 0.0466 0.0797 0.284 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.54e-03 0.291 0.0908 0.284 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 7.21e-01 0.0332 0.093 0.284 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 9.13e-01 0.00818 0.0748 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0777 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0972 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 2.11e-01 0.1 0.08 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.42e-01 0.0817 0.0696 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0279 0.0751 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 5.00e-01 -0.056 0.0829 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.01e-17 0.684 0.0728 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0477 0.0919 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 2.54e-01 -0.103 0.0899 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0205 0.0833 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 9.03e-01 0.0115 0.0938 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.13e-02 0.148 0.0873 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.44e-02 -0.149 0.0769 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 2.35e-02 -0.171 0.075 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0187 0.0659 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.66e-11 0.616 0.0887 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0694 0.0943 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 5.26e-01 0.0593 0.0933 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 7.58e-01 0.0291 0.094 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.49e-01 0.084 0.0894 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.15e-01 0.143 0.0904 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 2.85e-01 0.0979 0.0914 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0983 0.0888 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 3.48e-01 0.0853 0.0907 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.52e-01 0.146 0.101 0.286 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 3.62e-01 0.0527 0.0577 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00559 0.0546 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 8.75e-01 0.0097 0.0617 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 2.21e-01 -0.115 0.0939 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0194 0.0668 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00287 0.0554 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 5.06e-01 0.0354 0.0531 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 9.23e-30 0.876 0.0658 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 4.59e-01 0.0579 0.0781 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 3.29e-01 0.0595 0.0608 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 8.44e-01 0.0142 0.0723 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.37e-01 0.145 0.0971 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0074 0.0771 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0507 0.0611 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0462 0.0588 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 5.09e-20 0.748 0.0736 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.26e-01 0.0433 0.0888 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.49e-01 0.0393 0.0656 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0443 0.0786 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.92e-01 0.0829 0.0966 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.67e-01 0.0506 0.0882 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.28e-01 0.0921 0.0761 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0393 0.0784 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.66e-06 0.386 0.082 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 9.92e-01 0.000761 0.0794 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0388 0.077 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.22e-01 0.0774 0.078 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0917 0.0948 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.02e-01 0.0106 0.0861 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0094 0.0704 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0179 0.0817 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.44e-09 0.544 0.0859 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.63e-02 0.18 0.0744 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.59e-01 0.0434 0.0742 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 4.64e-01 0.0609 0.083 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 2.79e-01 -0.104 0.0959 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0145 0.0802 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00624 0.0665 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 5.52e-01 0.0433 0.0725 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.20e-13 0.633 0.0818 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 2.57e-01 -0.11 0.0972 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 4.59e-01 0.0621 0.0836 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.88e-02 0.177 0.0932 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 2.37e-01 0.117 0.0991 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 4.61e-01 0.0713 0.0965 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 1.71e-01 -0.108 0.0786 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.76e-01 0.0268 0.094 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 5.50e-05 0.381 0.0923 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 7.31e-01 0.0334 0.0969 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 6.71e-01 0.0383 0.09 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.37e-01 0.0585 0.0947 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 7.70e-01 0.0295 0.1 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 9.50e-02 -0.163 0.0971 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0593 0.0924 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.53e-01 0.00517 0.0883 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 7.06e-05 0.357 0.0879 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 3.26e-01 0.0923 0.0938 0.288 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0475 0.0855 0.288 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 4.08e-02 -0.161 0.078 0.288 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 2.54e-01 0.114 0.0998 0.288 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0966 0.0899 0.288 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.36e-02 -0.164 0.0718 0.288 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00946 0.0891 0.288 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 3.18e-03 0.266 0.0891 0.288 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.04e-01 -0.153 0.0939 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 3.39e-01 0.0845 0.088 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 2.95e-01 0.09 0.0857 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 4.02e-01 0.0876 0.104 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 3.73e-01 0.0775 0.0869 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 9.05e-01 0.0111 0.0931 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00775 0.0988 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 7.93e-05 0.382 0.0947 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 3.86e-01 0.0796 0.0916 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0296 0.0795 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 4.66e-01 0.0513 0.0703 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.17e-02 0.164 0.0757 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.30e-01 0.0971 0.0996 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.10e-01 0.0583 0.0884 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0638 0.0706 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 5.90e-01 0.0366 0.0679 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 7.77e-07 0.452 0.0887 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 2.98e-01 0.101 0.0965 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.30e-01 0.0441 0.0915 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.80e-01 0.05 0.0903 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 2.92e-01 0.0869 0.0824 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.16e-01 0.0658 0.101 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 7.16e-01 0.0345 0.0948 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 1.24e-01 -0.13 0.0841 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0172 0.0948 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.02e-04 0.404 0.102 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0115 0.0855 0.281 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 3.75e-02 -0.171 0.0819 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0492 0.0789 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0282 0.08 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.74e-01 0.121 0.089 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.75e-02 -0.157 0.0913 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.42e-01 0.0429 0.0702 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 2.41e-02 -0.181 0.0799 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 2.08e-03 0.285 0.0916 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 7.67e-01 0.0278 0.0936 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0245 0.116 0.311 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.69e-01 0.0977 0.108 0.311 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.67e-01 0.0575 0.1 0.311 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 4.96e-01 0.0771 0.113 0.311 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0791 0.0934 0.311 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 5.69e-01 0.0471 0.0824 0.311 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00595 0.116 0.311 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 9.71e-02 0.187 0.112 0.311 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.11 0.311 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0739 0.0964 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0876 0.0883 0.283 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00319 0.0942 0.283 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0111 0.092 0.283 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.90e-02 0.176 0.0925 0.283 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0318 0.0746 0.283 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0953 0.0684 0.283 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.96e-01 0.0562 0.0825 0.283 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0371 0.0845 0.284 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 7.71e-01 0.0243 0.0833 0.284 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 1.74e-01 0.119 0.0875 0.284 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 8.95e-01 0.0134 0.101 0.284 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.71e-01 0.0153 0.094 0.284 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.60e-01 -0.081 0.0717 0.284 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0201 0.0775 0.284 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 5.69e-07 0.474 0.0919 0.284 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 7.66e-02 0.146 0.082 0.285 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 6.11e-02 -0.159 0.0842 0.285 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 8.75e-01 0.0148 0.094 0.285 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.47e-01 -0.048 0.0796 0.285 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.81e-02 0.18 0.0946 0.285 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0184 0.0831 0.285 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.81e-03 0.266 0.0932 0.285 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00399 0.0545 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 6.84e-01 0.0261 0.0641 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.34e-01 0.0593 0.0953 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0554 0.0873 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00999 0.0699 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0236 0.0547 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 2.95e-06 0.346 0.0721 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0135 0.0693 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 1.74e-01 0.0899 0.0659 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0627 0.101 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0843 0.0934 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 7.68e-01 0.0235 0.0797 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.28e-01 0.0242 0.0693 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.75e-09 0.448 0.0733 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 3.73e-01 0.101 0.113 0.282 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 7.98e-01 -0.027 0.105 0.282 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 3.41e-01 0.105 0.11 0.282 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 4.04e-01 0.0901 0.108 0.282 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 2.62e-01 -0.121 0.107 0.282 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.82e-01 0.11 0.102 0.282 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 1.73e-01 -0.153 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 2.80e-01 0.118 0.109 0.282 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 2.89e-01 0.0896 0.0842 0.282 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.84e-01 0.045 0.0821 0.282 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 8.74e-01 -0.015 0.0947 0.282 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0745 0.0988 0.282 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.05e-01 0.0883 0.086 0.282 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 7.30e-01 0.0284 0.0821 0.282 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.02e-01 0.144 0.0878 0.282 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 5.54e-01 0.0434 0.0732 0.287 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 5.16e-01 0.0397 0.061 0.287 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0857 0.095 0.287 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 1.97e-01 0.123 0.0952 0.287 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.96e-01 0.0444 0.0835 0.287 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 2.48e-01 0.0941 0.0812 0.287 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.25e-03 0.27 0.0823 0.287 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.75e-01 -0.136 0.0998 0.288 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 7.14e-02 -0.174 0.0959 0.288 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00693 0.0981 0.288 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0232 0.104 0.288 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0807 0.0841 0.288 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.81e-02 -0.165 0.0991 0.288 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 9.27e-03 0.267 0.101 0.288 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 2.63e-02 -0.148 0.0659 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0218 0.0596 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.92e-01 -0.132 0.101 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 7.47e-01 0.0269 0.0832 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0611 0.0599 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 4.53e-02 -0.109 0.0542 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 9.48e-01 0.00462 0.0705 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.24e-11 0.573 0.0799 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 3.87e-01 0.0803 0.0927 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0287 0.0726 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0485 0.0709 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0783 0.094 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 7.19e-02 0.133 0.0734 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00177 0.0687 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 1.02e-01 -0.115 0.07 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 824744 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0914 0.0858 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.26e-24 0.789 0.0676 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 528369 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0577 0.089 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 6.41e-01 0.0236 0.0504 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 2.47e-01 0.0692 0.0596 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 8.84e-01 0.0141 0.0964 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.15e-01 -0.053 0.0814 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 7.19e-01 0.0248 0.069 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00509 0.052 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.47e-10 0.43 0.0657 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 2.99e-01 0.0704 0.0676 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 4.99e-01 0.0384 0.0566 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.90e-01 -0.134 0.102 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0575 0.0941 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 2.54e-01 0.0874 0.0764 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 3.09e-01 0.078 0.0765 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 4.32e-04 0.281 0.0786 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 598256 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0891 0.0687 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -42227 sc-eQTL 9.18e-01 0.00657 0.0637 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -620990 sc-eQTL 1.04e-01 0.113 0.0692 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -149788 sc-eQTL 1.33e-01 0.148 0.0978 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932401 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0184 0.0783 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149704 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0373 0.0624 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85640 sc-eQTL 3.81e-01 -0.053 0.0603 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 60099 sc-eQTL 1.58e-10 0.55 0.0817 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44181 sc-eQTL 3.44e-01 0.0937 0.0988 0.284 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 149704 eQTL 0.0252 0.0457 0.0204 0.0 0.0 0.287
ENSG00000177889 UBE2N 85640 eQTL 0.0208 -0.0289 0.0125 0.0 0.0 0.287
ENSG00000198015 MRPL42 60099 eQTL 5.61e-72 0.357 0.0182 0.0 0.00939 0.287

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 UBE2N 85640 7.05e-06 9.64e-06 9.73e-07 4.56e-06 1.89e-06 2.6e-06 9.56e-06 1.69e-06 7.74e-06 4.42e-06 1.06e-05 4.49e-06 1.24e-05 3.87e-06 1.69e-06 5.34e-06 3.79e-06 4.46e-06 2.19e-06 2.44e-06 3.37e-06 7.64e-06 6.29e-06 1.91e-06 1.14e-05 2.45e-06 4.16e-06 2.82e-06 7.04e-06 7.44e-06 4.58e-06 5.67e-07 7.68e-07 2.53e-06 2.82e-06 1.7e-06 1.19e-06 1.06e-06 1.3e-06 8.74e-07 7.54e-07 1.19e-05 8.75e-07 1.67e-07 7.87e-07 9.83e-07 9.59e-07 6.58e-07 5.8e-07
ENSG00000198015 MRPL42 60099 9.86e-06 1.26e-05 1.31e-06 6.84e-06 2.36e-06 4.34e-06 1.17e-05 2.15e-06 1.06e-05 5.32e-06 1.41e-05 5.74e-06 1.88e-05 3.99e-06 3.17e-06 6.57e-06 5.03e-06 8.03e-06 2.7e-06 2.79e-06 5.1e-06 1.04e-05 8.99e-06 3.36e-06 1.65e-05 3.98e-06 5.62e-06 4.64e-06 1.1e-05 8.34e-06 7.11e-06 1.06e-06 1.13e-06 2.93e-06 4.73e-06 2.53e-06 1.79e-06 1.84e-06 2.13e-06 1e-06 9.82e-07 1.58e-05 1.43e-06 2.01e-07 7.73e-07 1.78e-06 1.35e-06 6.93e-07 4.14e-07