logo

Genes within 1Mb (chr12:93527318:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0731 0.0518 0.286 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0267 0.0515 0.286 B L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0616 0.0779 0.286 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 1.68e-01 0.0896 0.0648 0.286 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.96e-01 0.000296 0.058 0.286 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0514 0.0511 0.286 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 4.31e-01 0.0456 0.0577 0.286 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 7.43e-27 0.753 0.0608 0.286 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0014 0.0795 0.286 B L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.83e-01 0.0478 0.0546 0.286 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.66e-01 0.0228 0.0528 0.286 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.66e-01 0.024 0.0555 0.286 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 8.11e-01 0.0218 0.091 0.286 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0203 0.0581 0.286 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 7.96e-01 0.0136 0.0525 0.286 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.67e-01 0.00819 0.0487 0.286 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.46e-34 0.88 0.0593 0.286 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 1.26e-01 0.0929 0.0604 0.286 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0361 0.0697 0.286 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.00e-01 0.0745 0.0716 0.286 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0511 0.0844 0.286 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0521 0.067 0.286 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00361 0.0501 0.286 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.59e-01 0.00323 0.0624 0.286 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.93e-20 0.747 0.0725 0.286 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 4.63e-01 0.0577 0.0784 0.282 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 9.32e-02 -0.142 0.0842 0.282 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 6.70e-01 0.0408 0.0956 0.282 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0343 0.0754 0.282 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.31e-01 0.0764 0.0785 0.282 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.67e-02 -0.136 0.0789 0.282 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 9.64e-05 0.35 0.0879 0.282 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 5.48e-01 0.0283 0.047 0.286 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.57e-01 0.076 0.0535 0.286 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0254 0.0989 0.286 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0517 0.0794 0.286 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.39e-01 0.0804 0.068 0.286 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.54e-01 0.00294 0.0512 0.286 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.81e-11 0.44 0.0619 0.286 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0826 0.0674 0.288 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.45e-01 0.0291 0.0632 0.288 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.92e-01 0.086 0.0658 0.288 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 1.92e-01 0.124 0.0944 0.288 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.74e-01 -0.012 0.075 0.288 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0354 0.0613 0.288 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0414 0.0606 0.288 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.39e-12 0.575 0.0771 0.288 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 3.35e-01 0.0952 0.0986 0.288 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 4.58e-01 0.0632 0.0851 0.286 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0582 0.0789 0.286 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0524 0.074 0.286 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 3.96e-02 0.184 0.0887 0.286 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0233 0.0834 0.286 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0664 0.0638 0.286 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0386 0.0593 0.286 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 4.16e-05 0.282 0.0675 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00345 0.103 0.278 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 7.25e-01 0.0307 0.087 0.278 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0376 0.102 0.278 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.76e-02 -0.185 0.107 0.278 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.39e-01 -0.107 0.0906 0.278 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 2.54e-02 0.251 0.111 0.278 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 6.75e-01 0.0401 0.0953 0.278 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.21e-02 0.273 0.108 0.278 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0304 0.106 0.278 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 1.99e-02 -0.184 0.0784 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.23e-01 -0.121 0.0783 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0892 0.0933 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.0872 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0334 0.078 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 1.98e-02 -0.184 0.0784 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0469 0.0879 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.79e-09 0.552 0.0889 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 4.12e-01 0.0784 0.0953 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 6.13e-02 -0.148 0.0788 0.287 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.00e-01 0.0392 0.0747 0.287 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.82e-01 0.0688 0.0976 0.287 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 9.73e-01 0.00294 0.0872 0.287 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0633 0.0699 0.287 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0617 0.0625 0.287 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 5.58e-01 0.0468 0.0797 0.287 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.60e-03 0.278 0.0911 0.287 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 6.66e-01 0.0402 0.093 0.287 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 9.50e-01 0.00465 0.0748 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0319 0.0777 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.54e-01 -0.111 0.0972 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 1.87e-01 0.106 0.0799 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 1.94e-01 0.0907 0.0695 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0192 0.0751 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0537 0.0828 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.10e-17 0.683 0.0728 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0605 0.0918 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.55e-01 -0.102 0.0898 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0141 0.0832 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 9.09e-01 0.0108 0.0938 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.57e-02 0.156 0.0872 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.11e-02 -0.151 0.0768 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 2.54e-02 -0.169 0.0749 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0185 0.0658 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.08e-11 0.626 0.0883 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0738 0.0942 0.288 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 4.21e-01 0.0752 0.0933 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 7.28e-01 0.0328 0.094 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.41e-01 0.0854 0.0894 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0904 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 2.92e-01 0.0966 0.0914 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.67e-01 -0.099 0.0888 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 3.05e-01 0.0933 0.0907 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.51e-01 0.146 0.101 0.289 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.12e-01 0.0584 0.0576 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00235 0.0545 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 8.45e-01 0.0121 0.0616 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.76e-01 -0.103 0.0938 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0309 0.0666 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.70e-01 0.00211 0.0553 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 4.34e-01 0.0415 0.053 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 5.95e-31 0.888 0.0648 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.93e-01 0.0669 0.0781 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 4.19e-01 0.0493 0.0608 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 8.38e-01 0.0148 0.0724 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 1.37e-01 0.145 0.0971 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00776 0.0772 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0461 0.0612 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0423 0.0588 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.30e-19 0.742 0.0739 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 6.07e-01 0.0458 0.0888 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 4.85e-01 0.0459 0.0656 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0359 0.0786 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 3.52e-01 0.0901 0.0966 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 6.91e-01 0.0351 0.0883 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.34e-01 0.0908 0.0761 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0391 0.0784 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.34e-06 0.397 0.0818 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0014 0.0794 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 5.69e-01 -0.044 0.077 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 2.82e-01 0.0842 0.078 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0919 0.0949 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.69e-01 0.0142 0.0862 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0011 0.0704 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0114 0.0818 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 9.19e-10 0.55 0.0858 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.12e-02 0.173 0.0745 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 5.12e-01 0.0487 0.0742 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.54e-01 0.0623 0.083 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.70e-01 -0.106 0.0959 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0102 0.0802 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.64e-01 0.00299 0.0666 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 5.53e-01 0.0431 0.0726 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.72e-13 0.642 0.0815 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0972 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 3.91e-01 0.0718 0.0836 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.09e-02 0.192 0.0931 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.34e-01 0.118 0.0991 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.58e-01 0.0717 0.0965 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 1.68e-01 -0.109 0.0786 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.30e-01 0.0202 0.094 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 8.30e-05 0.372 0.0925 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.04e-01 0.0241 0.0969 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.01e-01 0.0472 0.09 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 5.62e-01 0.055 0.0947 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 7.13e-01 0.037 0.1 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 1.07e-01 -0.157 0.0972 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0597 0.0924 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.93e-01 0.000741 0.0883 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.16e-04 0.347 0.0881 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.60e-01 0.086 0.0938 0.29 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0415 0.0856 0.29 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 5.59e-02 -0.15 0.0781 0.29 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.64e-01 0.112 0.0999 0.29 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.0899 0.29 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.75e-02 -0.16 0.0719 0.29 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00969 0.0892 0.29 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.88e-03 0.269 0.0892 0.29 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 1.21e-01 -0.146 0.094 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 3.30e-01 0.0859 0.088 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 2.76e-01 0.0936 0.0857 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.64e-01 0.0766 0.104 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 3.53e-01 0.0808 0.0868 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.06e-01 0.0111 0.0931 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.43e-01 0.00707 0.0988 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 7.32e-05 0.383 0.0947 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 3.15e-01 0.0921 0.0915 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0179 0.0797 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 5.69e-01 0.0402 0.0705 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.46e-02 0.161 0.0759 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 3.43e-01 0.0948 0.0997 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.75e-01 0.0633 0.0886 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0646 0.0707 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 6.38e-01 0.0321 0.068 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.67e-06 0.44 0.0892 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 3.06e-01 0.0992 0.0967 0.287 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 6.62e-01 0.0401 0.0915 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 6.30e-01 0.0436 0.0904 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.17e-01 0.0826 0.0824 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.21e-01 0.0815 0.101 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.29e-01 0.0329 0.0948 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 1.32e-01 -0.127 0.0841 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0127 0.0948 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 8.31e-05 0.408 0.102 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0229 0.0855 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.61e-02 -0.173 0.0819 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0451 0.0789 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0309 0.08 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.10e-01 0.112 0.0891 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.18e-02 -0.16 0.0913 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.36e-01 0.0436 0.0702 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 2.65e-02 -0.179 0.0799 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.43e-03 0.296 0.0914 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 8.36e-01 0.0194 0.0937 0.287 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0245 0.116 0.311 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.69e-01 0.0977 0.108 0.311 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 5.67e-01 0.0575 0.1 0.311 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.96e-01 0.0771 0.113 0.311 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0791 0.0934 0.311 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 5.69e-01 0.0471 0.0824 0.311 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00595 0.116 0.311 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 9.71e-02 0.187 0.112 0.311 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0264 0.11 0.311 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0755 0.0964 0.285 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0928 0.0883 0.285 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00372 0.0942 0.285 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0209 0.092 0.285 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.16e-02 0.181 0.0924 0.285 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0358 0.0745 0.285 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0955 0.0684 0.285 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 4.24e-01 0.066 0.0825 0.285 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0142 0.0846 0.286 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 7.72e-01 0.0242 0.0833 0.286 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.96e-01 0.114 0.0875 0.286 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 9.78e-01 0.00283 0.101 0.286 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 9.41e-01 0.00701 0.094 0.286 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0776 0.0717 0.286 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00797 0.0776 0.286 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 4.67e-07 0.478 0.0918 0.286 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.44e-02 0.142 0.082 0.288 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 7.42e-02 -0.151 0.0843 0.288 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 8.73e-01 0.015 0.094 0.288 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0459 0.0797 0.288 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 6.86e-02 0.173 0.0946 0.288 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0206 0.083 0.288 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 3.48e-03 0.275 0.093 0.288 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 9.84e-01 0.0011 0.0546 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.44e-01 0.0297 0.0642 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 5.72e-01 0.054 0.0954 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0552 0.0874 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00311 0.0699 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0185 0.0548 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.00e-06 0.362 0.0718 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0105 0.0694 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.84e-01 0.0879 0.066 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0376 0.101 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 3.53e-01 -0.087 0.0936 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.75e-01 0.0448 0.0797 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 7.88e-01 0.0186 0.0694 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 7.47e-09 0.443 0.0736 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 3.87e-01 0.0985 0.113 0.285 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0331 0.105 0.285 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 3.36e-01 0.106 0.11 0.285 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.20e-01 0.0874 0.108 0.285 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.285 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.28e-01 0.124 0.102 0.285 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 1.68e-01 -0.155 0.112 0.285 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.60e-01 0.124 0.109 0.285 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.62e-01 0.0949 0.0843 0.284 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 6.63e-01 0.0358 0.0823 0.284 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0169 0.0948 0.284 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0678 0.099 0.284 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.19e-01 0.0859 0.0861 0.284 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 8.70e-01 0.0134 0.0822 0.284 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.00e-01 0.145 0.0879 0.284 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 4.63e-01 0.0539 0.0734 0.29 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.38e-01 0.0476 0.0612 0.29 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.26e-01 -0.076 0.0953 0.29 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 2.14e-01 0.119 0.0955 0.29 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 4.83e-01 0.0589 0.0838 0.29 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 2.08e-01 0.103 0.0814 0.29 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 8.68e-04 0.279 0.0824 0.29 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 1.34e-01 -0.15 0.0997 0.291 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.38e-02 -0.195 0.0958 0.291 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0982 0.291 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0425 0.104 0.291 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0766 0.0842 0.291 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0993 0.291 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 1.16e-02 0.259 0.101 0.291 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.86e-02 -0.145 0.066 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0177 0.0597 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.68e-01 -0.112 0.101 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 7.66e-01 0.0248 0.0833 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0526 0.0599 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 4.46e-02 -0.109 0.0542 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 9.61e-01 0.00348 0.0705 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 9.43e-12 0.576 0.0799 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 3.88e-01 0.0803 0.0927 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0317 0.0726 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0442 0.0709 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0643 0.094 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.79e-02 0.14 0.0733 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 9.30e-01 0.006 0.0687 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 1.28e-01 -0.107 0.07 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 824475 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0897 0.0858 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 8.09e-25 0.791 0.0674 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 528100 sc-eQTL 4.20e-01 -0.072 0.089 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 5.92e-01 0.0271 0.0504 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 2.32e-01 0.0715 0.0596 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 7.82e-01 0.0267 0.0964 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0573 0.0814 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.71e-01 0.0391 0.069 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00296 0.052 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.08e-10 0.437 0.0655 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.41e-01 0.0796 0.0677 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 4.78e-01 0.0403 0.0568 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 2.21e-01 -0.126 0.102 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0612 0.0943 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 2.11e-01 0.0961 0.0765 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 3.02e-01 0.0794 0.0767 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 3.02e-04 0.289 0.0786 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 597987 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0806 0.0689 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -42496 sc-eQTL 9.75e-01 0.00202 0.0638 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -621259 sc-eQTL 1.18e-01 0.109 0.0693 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -150057 sc-eQTL 1.31e-01 0.149 0.098 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -932670 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0144 0.0784 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 149435 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0383 0.0625 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 85371 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0559 0.0604 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 59830 sc-eQTL 2.08e-10 0.548 0.082 0.287 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -44450 sc-eQTL 3.91e-01 0.085 0.099 0.287 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 149435 eQTL 0.025 0.0458 0.0204 0.0 0.0 0.287
ENSG00000177889 UBE2N 85371 eQTL 0.0207 -0.0289 0.0125 0.0 0.0 0.287
ENSG00000198015 MRPL42 59830 eQTL 5.53e-72 0.357 0.0182 0.0 0.00914 0.287

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 UBE2N 85371 7.25e-06 9.16e-06 1.3e-06 4.82e-06 2.36e-06 3.82e-06 1.01e-05 1.99e-06 8.38e-06 4.74e-06 1.08e-05 4.9e-06 1.3e-05 3.86e-06 2.24e-06 6.38e-06 4.1e-06 6.51e-06 2.65e-06 2.92e-06 5.12e-06 8.12e-06 7.06e-06 3.3e-06 1.28e-05 3.87e-06 4.74e-06 3.57e-06 9.56e-06 8.22e-06 4.82e-06 1.02e-06 1.12e-06 3.53e-06 4.27e-06 2.63e-06 1.91e-06 1.94e-06 2.14e-06 9.42e-07 1.12e-06 1.09e-05 1.34e-06 2.71e-07 7.75e-07 1.62e-06 1.39e-06 8.19e-07 4.59e-07
ENSG00000198015 MRPL42 59830 9.67e-06 1.18e-05 2.44e-06 6.7e-06 2.32e-06 5.23e-06 1.32e-05 2.18e-06 1.06e-05 5.43e-06 1.42e-05 6.05e-06 1.86e-05 4.2e-06 3.5e-06 6.93e-06 6.42e-06 9.66e-06 3.54e-06 3.13e-06 6.79e-06 1.09e-05 1.02e-05 3.88e-06 1.85e-05 4.65e-06 6.78e-06 5.03e-06 1.37e-05 1.21e-05 7e-06 9.65e-07 1.47e-06 3.99e-06 5.47e-06 3.29e-06 1.71e-06 2.13e-06 2.7e-06 1.84e-06 1.55e-06 1.39e-05 1.63e-06 3.57e-07 1.35e-06 2.08e-06 1.94e-06 8.61e-07 6.33e-07