logo

Genes within 1Mb (chr12:93521727:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0534 0.0523 0.288 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0189 0.0519 0.288 B L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0709 0.0785 0.288 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 1.09e-01 0.105 0.0652 0.288 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0182 0.0585 0.288 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0418 0.0515 0.288 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 4.21e-01 0.0469 0.0581 0.288 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.45e-28 0.778 0.0601 0.288 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 8.88e-01 0.0113 0.0801 0.288 B L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 3.89e-01 0.0476 0.0552 0.288 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.66e-01 0.00902 0.0534 0.288 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 5.73e-01 0.0316 0.0561 0.288 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.68e-01 0.0153 0.0919 0.288 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0246 0.0587 0.288 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 8.52e-01 0.00988 0.053 0.288 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 7.30e-01 0.017 0.0492 0.288 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 6.10e-36 0.901 0.059 0.288 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 1.41e-01 0.0899 0.0608 0.288 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0191 0.0702 0.288 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.16e-01 0.0894 0.072 0.288 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0542 0.0849 0.288 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0628 0.0674 0.288 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 8.55e-01 -0.00926 0.0504 0.288 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00373 0.0628 0.288 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 7.52e-22 0.774 0.0718 0.288 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.58e-01 0.0585 0.0787 0.286 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.02e-01 -0.139 0.0845 0.286 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.14e-01 0.0227 0.096 0.286 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0194 0.0757 0.286 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 4.29e-01 0.0625 0.0788 0.286 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 1.32e-01 -0.12 0.0793 0.286 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 8.43e-05 0.354 0.0881 0.286 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.55e-01 0.0355 0.0474 0.288 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.80e-01 0.0727 0.054 0.288 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00813 0.0998 0.288 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0521 0.08 0.288 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.41e-01 0.0655 0.0687 0.288 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.10e-01 0.00585 0.0516 0.288 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 5.62e-13 0.472 0.0614 0.288 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0772 0.0676 0.29 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 4.99e-01 0.0429 0.0633 0.29 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.18e-01 0.103 0.0658 0.29 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.13e-01 0.151 0.0945 0.29 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00334 0.0752 0.29 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0487 0.0614 0.29 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 4.31e-01 -0.048 0.0608 0.29 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 5.95e-13 0.59 0.0768 0.29 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 2.57e-01 0.112 0.0988 0.29 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 5.29e-01 0.0537 0.0852 0.288 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 5.87e-01 -0.043 0.079 0.288 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 6.47e-01 -0.034 0.0741 0.288 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 7.49e-02 0.159 0.089 0.288 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0108 0.0834 0.288 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0798 0.0638 0.288 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0445 0.0593 0.288 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 6.20e-05 0.276 0.0676 0.288 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0162 0.104 0.281 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 6.60e-01 0.0387 0.0877 0.281 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.20e-01 0.0235 0.103 0.281 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.71e-02 -0.227 0.108 0.281 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.01e-01 -0.15 0.0909 0.281 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 7.09e-02 0.205 0.113 0.281 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 8.37e-01 0.0198 0.0961 0.281 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.30e-02 0.272 0.108 0.281 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0781 0.107 0.281 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 3.98e-02 -0.164 0.079 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.05e-01 -0.128 0.0786 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0897 0.0938 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.73e-01 0.0254 0.0876 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0498 0.0783 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 7.67e-03 -0.211 0.0785 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0434 0.0884 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 4.98e-10 0.579 0.0887 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 4.00e-01 0.0808 0.0958 0.29 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.28e-02 -0.138 0.0793 0.289 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 4.74e-01 0.0539 0.0751 0.289 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 4.33e-01 0.0771 0.0982 0.289 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.21e-01 0.0199 0.0877 0.289 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0722 0.0703 0.289 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0535 0.0629 0.289 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 6.91e-01 0.0319 0.0802 0.289 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 2.66e-03 0.279 0.0916 0.289 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 4.36e-01 0.0729 0.0934 0.289 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.34e-01 0.0157 0.075 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0299 0.0779 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 2.53e-01 -0.112 0.0975 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 1.64e-01 0.112 0.0801 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.09e-01 0.0713 0.0699 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0333 0.0753 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0647 0.0831 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 3.59e-18 0.694 0.0727 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0653 0.0921 0.288 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0984 0.0904 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 8.11e-01 -0.02 0.0837 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0147 0.0943 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.45e-02 0.186 0.0875 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.20e-02 -0.178 0.077 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 3.42e-02 -0.161 0.0755 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00794 0.0663 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.62e-11 0.633 0.0888 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0624 0.0949 0.29 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.43e-01 0.0719 0.0935 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 7.59e-01 0.029 0.0943 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 3.95e-01 0.0765 0.0897 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.14e-01 0.144 0.0906 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 5.12e-01 0.0603 0.0918 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.06e-01 -0.144 0.0888 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 2.30e-01 0.109 0.0908 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 5.06e-02 0.198 0.101 0.291 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 2.71e-01 0.0642 0.0581 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0105 0.0551 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 6.40e-01 0.0291 0.0622 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.84e-01 -0.126 0.0946 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0337 0.0673 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 9.50e-01 0.00348 0.0559 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 4.86e-01 0.0373 0.0536 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.40e-31 0.904 0.0651 0.288 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 5.92e-01 0.0422 0.0786 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 5.86e-01 0.0334 0.0613 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 8.50e-01 0.0138 0.0728 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.50e-01 0.141 0.0977 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0178 0.0776 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0636 0.0614 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0394 0.0592 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 7.11e-21 0.767 0.0734 0.288 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 6.32e-01 0.0426 0.0888 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 7.10e-01 0.0245 0.0656 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0251 0.0786 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 4.37e-01 0.0753 0.0967 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.40e-01 0.0293 0.0883 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.93e-01 0.0994 0.0761 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0409 0.0784 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 4.91e-07 0.421 0.0812 0.288 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 9.38e-01 0.00615 0.0795 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0333 0.0772 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.31e-01 0.118 0.0779 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0756 0.095 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00086 0.0863 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00961 0.0705 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00552 0.0819 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.85e-10 0.571 0.0852 0.288 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 1.94e-02 0.176 0.0747 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 5.66e-01 0.0428 0.0745 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 4.01e-01 0.0701 0.0833 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.52e-01 -0.138 0.0961 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.62e-01 -0.014 0.0805 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0211 0.0668 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.74e-01 0.0307 0.0729 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.05e-13 0.65 0.0816 0.288 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0823 0.0976 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 2.57e-01 0.0953 0.0837 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 5.80e-02 0.178 0.0935 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 2.98e-01 0.104 0.0995 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 4.37e-01 0.0754 0.0968 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0966 0.079 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00696 0.0943 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 6.07e-05 0.38 0.0927 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.65e-01 0.0165 0.0969 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 6.88e-01 0.0361 0.0899 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 6.34e-01 0.0451 0.0947 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 6.02e-01 0.0524 0.1 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.04e-02 -0.183 0.0969 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0631 0.0923 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00923 0.0883 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.38e-04 0.343 0.0881 0.295 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.44e-01 0.0724 0.0943 0.292 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.26e-01 -0.019 0.086 0.292 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 8.81e-02 -0.135 0.0786 0.292 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.89e-01 0.0868 0.1 0.292 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0992 0.0904 0.292 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.80e-02 -0.172 0.072 0.292 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0217 0.0896 0.292 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 6.18e-03 0.249 0.0898 0.292 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 1.00e-01 -0.154 0.0934 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 2.95e-01 0.092 0.0875 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.80e-01 0.115 0.0851 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.85e-01 0.138 0.103 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.97e-01 0.0733 0.0864 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 9.42e-01 0.0067 0.0926 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.01e-01 0.0122 0.0983 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 2.77e-04 0.351 0.0948 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 9.95e-02 0.15 0.0907 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.22e-01 -0.018 0.0801 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 4.83e-01 0.0498 0.0708 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.76e-02 0.169 0.0762 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.47e-01 0.0945 0.1 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 2.97e-01 0.093 0.0889 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0811 0.0709 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 5.57e-01 0.0402 0.0683 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.34e-06 0.446 0.0895 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 3.57e-01 0.0897 0.0972 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 5.88e-01 0.0497 0.0916 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.29e-01 0.0196 0.0905 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.58e-01 0.0935 0.0824 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 2.36e-01 0.12 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.47e-01 0.0307 0.0949 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.80e-01 -0.113 0.0843 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0395 0.0948 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.25e-04 0.399 0.102 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00885 0.0856 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 5.99e-02 -0.155 0.0821 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0135 0.079 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0205 0.0801 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 1.51e-01 0.128 0.0891 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.17e-02 -0.171 0.0913 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 5.76e-01 0.0394 0.0703 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 7.03e-03 -0.217 0.0796 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.03e-03 0.304 0.0914 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 7.73e-01 0.0271 0.0938 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0436 0.117 0.311 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 3.99e-01 0.0923 0.109 0.311 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 7.84e-01 0.0277 0.101 0.311 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.84e-01 0.0464 0.114 0.311 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.35e-01 -0.091 0.0939 0.311 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.31e-01 0.0399 0.083 0.311 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 8.95e-01 0.0154 0.117 0.311 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.03e-01 0.186 0.113 0.311 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0227 0.111 0.311 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0536 0.096 0.287 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0965 0.0878 0.287 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00727 0.0937 0.287 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0185 0.0915 0.287 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 9.90e-02 0.153 0.0922 0.287 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0369 0.0742 0.287 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0879 0.0681 0.287 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 4.37e-01 0.0639 0.082 0.287 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.90e-01 0.0118 0.0848 0.288 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000702 0.0836 0.288 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.62e-01 0.0988 0.0879 0.288 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.77e-01 0.0158 0.102 0.288 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.64e-01 0.0162 0.0943 0.288 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0726 0.0719 0.288 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 8.27e-01 0.017 0.0778 0.288 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 6.59e-07 0.473 0.0923 0.288 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 9.24e-02 0.139 0.0824 0.293 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 9.49e-02 -0.142 0.0847 0.293 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.58e-01 0.0169 0.0944 0.293 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0163 0.0801 0.293 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.24e-01 0.147 0.0953 0.293 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 8.57e-01 -0.015 0.0834 0.293 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 4.51e-03 0.269 0.0935 0.293 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.38e-01 0.0113 0.055 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 6.60e-01 0.0285 0.0647 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 5.70e-01 0.0547 0.0962 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0505 0.0881 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0244 0.0705 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0325 0.0552 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.32e-07 0.392 0.0717 0.288 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.40e-01 0.0141 0.0697 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.76e-01 0.09 0.0663 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0231 0.102 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0914 0.0939 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 5.18e-01 0.0518 0.08 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.58e-01 0.0309 0.0697 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 9.73e-10 0.469 0.0732 0.288 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.71e-01 0.0823 0.114 0.285 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0252 0.106 0.285 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 1.63e-01 0.154 0.11 0.285 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 4.79e-01 0.0768 0.108 0.285 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.285 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 1.40e-01 0.152 0.102 0.285 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 2.62e-01 -0.127 0.112 0.285 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 2.79e-01 0.119 0.11 0.285 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.22e-01 0.068 0.0845 0.287 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.20e-01 0.0296 0.0823 0.287 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 9.25e-01 -0.009 0.0949 0.287 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0999 0.0989 0.287 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 4.01e-01 0.0725 0.0862 0.287 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 6.28e-01 0.0399 0.0822 0.287 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 5.54e-02 0.169 0.0878 0.287 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.45e-01 0.0563 0.0736 0.292 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 3.73e-01 0.0548 0.0613 0.292 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0599 0.0956 0.292 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 1.08e-01 0.154 0.0955 0.292 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 6.77e-01 0.0351 0.084 0.292 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 2.58e-01 0.0927 0.0817 0.292 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 2.62e-04 0.306 0.0822 0.292 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 1.52e-01 -0.144 0.1 0.297 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.46e-02 -0.218 0.096 0.297 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0324 0.0987 0.297 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0314 0.105 0.297 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0821 0.0847 0.297 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 1.73e-01 -0.137 0.1 0.297 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 5.41e-03 0.286 0.102 0.297 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.14e-02 -0.136 0.0665 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0161 0.06 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0976 0.102 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 7.27e-01 0.0292 0.0838 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0654 0.0602 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 4.74e-02 -0.109 0.0545 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000916 0.0709 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 2.84e-12 0.593 0.0799 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 2.86e-01 0.0997 0.0932 0.288 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0126 0.073 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0481 0.0713 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0811 0.0945 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 3.29e-02 0.158 0.0736 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0187 0.0691 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 1.12e-01 -0.112 0.0704 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 818884 sc-eQTL 3.15e-01 -0.087 0.0863 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.13e-25 0.807 0.0672 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 522509 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0671 0.0895 0.288 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.06e-01 0.0423 0.0508 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 2.72e-01 0.0662 0.0601 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 7.20e-01 0.035 0.0972 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0655 0.0821 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 7.06e-01 0.0263 0.0696 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00447 0.0524 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.21e-11 0.468 0.0652 0.288 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 4.77e-01 0.0482 0.0678 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 4.90e-01 0.0392 0.0567 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 2.41e-01 -0.12 0.102 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0474 0.0943 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 2.81e-01 0.0828 0.0765 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 2.97e-01 0.0801 0.0766 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 1.16e-04 0.307 0.0782 0.291 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 592396 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0727 0.0692 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -48087 sc-eQTL 8.14e-01 0.0151 0.064 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -626850 sc-eQTL 7.56e-02 0.124 0.0694 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -155648 sc-eQTL 9.87e-02 0.163 0.0982 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -938261 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00672 0.0787 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 143844 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0536 0.0626 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 79780 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0675 0.0605 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 54239 sc-eQTL 4.29e-11 0.568 0.0816 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -50041 sc-eQTL 3.77e-01 0.0879 0.0993 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 143844 eQTL 0.0123 0.0511 0.0204 0.0 0.0 0.282
ENSG00000177889 UBE2N 79780 eQTL 0.0162 -0.03 0.0125 0.0 0.0 0.282
ENSG00000198015 MRPL42 54239 eQTL 1.75e-72 0.358 0.0182 0.0 0.017 0.282

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 UBE2N 79780 7.93e-06 9.98e-06 2.53e-06 5.08e-06 2.1e-06 4.19e-06 1.01e-05 1.5e-06 7.7e-06 5.09e-06 1.16e-05 3.71e-06 1.32e-05 3.9e-06 2.63e-06 6.36e-06 4.16e-06 4.76e-06 2.98e-06 2.77e-06 5.71e-06 9.62e-06 1.01e-05 3.24e-06 1.24e-05 3.36e-06 4.55e-06 3.68e-06 1.1e-05 7.93e-06 5.24e-06 7.36e-07 8.87e-07 2.63e-06 3.7e-06 2.65e-06 1.4e-06 1.68e-06 1.38e-06 8.87e-07 6.13e-07 1.68e-05 1.43e-06 1.6e-07 6.86e-07 1.85e-06 1.75e-06 6.35e-07 4.43e-07
ENSG00000198015 MRPL42 54239 1.42e-05 1.58e-05 3.55e-06 8.45e-06 2.41e-06 6.85e-06 1.88e-05 2.19e-06 1.35e-05 7.64e-06 1.8e-05 6.68e-06 2.44e-05 4.89e-06 4.47e-06 9.51e-06 7.72e-06 1.11e-05 4.21e-06 3.25e-06 7.43e-06 1.62e-05 1.77e-05 4.52e-06 2.22e-05 5.1e-06 7.19e-06 6.29e-06 1.73e-05 1.22e-05 1.01e-05 1.04e-06 1.21e-06 3.58e-06 6.38e-06 3.37e-06 1.82e-06 2.18e-06 2.11e-06 9.85e-07 1.02e-06 2.75e-05 1.98e-06 1.46e-07 1.02e-06 2.7e-06 3.07e-06 6.9e-07 1.02e-06