Genes within 1Mb (chr12:93516484:GTACC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0513 0.0525 0.293 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0166 0.0522 0.293 B L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0735 0.0788 0.293 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 1.31e-01 0.0994 0.0655 0.293 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0215 0.0587 0.293 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0549 0.0517 0.293 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 3.92e-01 0.0501 0.0584 0.293 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 6.28e-28 0.774 0.0608 0.293 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 8.59e-01 0.0143 0.0804 0.293 B L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 4.39e-01 0.0431 0.0556 0.293 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 6.82e-01 0.0221 0.0538 0.293 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 5.31e-01 0.0354 0.0565 0.293 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.74e-01 0.00303 0.0926 0.293 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0173 0.0592 0.293 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 7.89e-01 0.0144 0.0534 0.293 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 7.49e-01 0.0159 0.0496 0.293 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.24e-34 0.896 0.0603 0.293 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.31e-01 0.0924 0.061 0.293 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 9.25e-01 0.00663 0.0704 0.293 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.44e-01 0.106 0.0722 0.293 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0609 0.0852 0.293 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0574 0.0676 0.293 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00435 0.0506 0.293 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0155 0.063 0.293 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 6.43e-20 0.746 0.0736 0.293 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.77e-01 0.0697 0.0788 0.291 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.21e-02 -0.159 0.0845 0.291 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00448 0.0963 0.291 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00719 0.0759 0.291 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 4.80e-01 0.056 0.079 0.291 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 1.39e-01 -0.118 0.0795 0.291 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.27e-04 0.346 0.0885 0.291 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.84e-01 0.0415 0.0475 0.293 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 2.16e-01 0.0673 0.0542 0.293 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0067 0.1 0.293 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0216 0.0804 0.293 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.06e-01 0.0706 0.0689 0.293 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 9.17e-01 0.00542 0.0518 0.293 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.80e-12 0.464 0.062 0.293 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0746 0.0679 0.294 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 2.73e-01 0.0698 0.0634 0.294 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.47e-01 0.0963 0.0661 0.294 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.09e-01 0.153 0.0948 0.294 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.60e-01 0.0134 0.0755 0.294 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0489 0.0616 0.294 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0392 0.061 0.294 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.14e-13 0.594 0.0771 0.294 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 3.11e-01 0.101 0.0992 0.294 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 5.33e-01 0.0532 0.0853 0.293 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0174 0.0792 0.293 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0285 0.0743 0.293 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 7.45e-02 0.16 0.0892 0.293 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0162 0.0836 0.293 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0752 0.0639 0.293 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0421 0.0594 0.293 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.07e-05 0.28 0.0677 0.293 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0297 0.104 0.286 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 5.85e-01 0.0479 0.0876 0.286 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 7.36e-01 0.0347 0.103 0.286 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.69e-02 -0.227 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.11e-01 -0.146 0.0909 0.286 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 6.21e-02 0.211 0.112 0.286 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 7.75e-01 0.0274 0.096 0.286 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.07e-02 0.279 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0685 0.107 0.286 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.37e-02 -0.196 0.079 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.04e-01 -0.129 0.0789 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0662 0.0942 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.13e-01 0.00963 0.088 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0665 0.0785 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 4.25e-03 -0.227 0.0785 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0633 0.0886 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.86e-10 0.579 0.0891 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 3.36e-01 0.0926 0.0961 0.294 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 7.75e-02 -0.141 0.0795 0.293 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.56e-01 0.0336 0.0753 0.293 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 4.11e-01 0.0811 0.0984 0.293 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.22e-01 0.00859 0.0879 0.293 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0895 0.0703 0.293 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0588 0.063 0.293 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 5.81e-01 0.0444 0.0804 0.293 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.64e-03 0.279 0.0918 0.293 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 4.53e-01 0.0704 0.0936 0.293 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 7.01e-01 0.0289 0.0752 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0348 0.0781 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 2.04e-01 -0.124 0.0977 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 1.46e-01 0.117 0.0803 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.75e-01 0.0623 0.07 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0447 0.0754 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0447 0.0833 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 9.78e-18 0.687 0.0732 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0704 0.0923 0.293 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 2.70e-01 -0.1 0.0908 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00966 0.0841 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0132 0.0947 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.57e-02 0.186 0.0878 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.22e-02 -0.195 0.0771 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 1.70e-02 -0.182 0.0756 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0175 0.0665 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.43e-11 0.63 0.0893 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0695 0.0952 0.294 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 4.20e-01 0.0755 0.0934 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 7.11e-01 0.0349 0.0942 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 3.28e-01 0.0879 0.0896 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.60e-01 0.128 0.0906 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 4.65e-01 0.0672 0.0917 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.57e-01 -0.126 0.0888 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 2.39e-01 0.107 0.0907 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 4.80e-02 0.2 0.101 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.22e-01 0.0581 0.0586 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 9.61e-01 0.00274 0.0555 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.19e-01 0.0312 0.0627 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.57e-01 -0.135 0.0953 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0348 0.0678 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 9.31e-01 0.00487 0.0563 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 4.54e-01 0.0404 0.0539 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.11e-30 0.897 0.0664 0.293 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 6.87e-01 0.0319 0.0791 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 4.69e-01 0.0446 0.0615 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 8.28e-01 0.0159 0.0732 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.74e-01 0.134 0.0983 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.95e-01 0.0103 0.078 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0586 0.0618 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0471 0.0594 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 4.41e-21 0.774 0.0736 0.293 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 5.03e-01 0.0597 0.0891 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 5.39e-01 0.0405 0.0658 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0151 0.0789 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 5.02e-01 0.0654 0.0971 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 6.84e-01 0.0362 0.0886 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.96e-01 0.099 0.0763 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0412 0.0787 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 9.56e-07 0.413 0.0817 0.293 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0149 0.0801 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0309 0.0777 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 2.58e-01 -0.108 0.0956 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00199 0.0869 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 8.55e-01 0.013 0.071 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 9.45e-01 0.00566 0.0824 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.03e-09 0.553 0.0865 0.293 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.53e-02 0.183 0.0747 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 4.31e-01 0.0588 0.0745 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 3.24e-01 0.0824 0.0833 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.63e-01 -0.135 0.0962 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0102 0.0806 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0127 0.0669 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 7.35e-01 0.0247 0.0729 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.55e-13 0.633 0.0823 0.293 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0574 0.098 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 1.66e-01 0.117 0.0838 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 5.62e-02 0.18 0.0938 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 4.07e-01 0.0829 0.0998 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 2.91e-01 0.102 0.0969 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0967 0.0792 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0123 0.0946 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.06e-04 0.369 0.0932 0.292 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 8.86e-01 0.0139 0.0972 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 5.33e-01 0.0563 0.0902 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.65e-01 0.0412 0.095 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 7.12e-01 0.0372 0.101 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.30e-02 -0.164 0.0974 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0568 0.0927 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 9.75e-01 0.00278 0.0886 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 3.87e-04 0.321 0.0889 0.299 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 5.43e-01 0.0576 0.0945 0.297 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 8.64e-01 0.0148 0.0861 0.297 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 9.91e-02 -0.131 0.0788 0.297 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 3.99e-01 0.085 0.101 0.297 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 2.29e-01 -0.109 0.0905 0.297 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.99e-02 -0.17 0.0722 0.297 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00118 0.0898 0.297 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 4.91e-03 0.256 0.0899 0.297 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.12e-01 -0.149 0.0935 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 1.42e-01 0.129 0.0874 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.62e-01 0.119 0.0851 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.74e-01 0.141 0.104 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.45e-01 0.0818 0.0865 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 9.99e-01 7.28e-05 0.0927 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 8.70e-01 0.0161 0.0984 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 3.01e-04 0.349 0.0949 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 8.47e-02 0.157 0.0907 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0122 0.0805 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 4.19e-01 0.0577 0.0712 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 9.96e-02 0.127 0.077 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.101 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 1.93e-01 0.117 0.0892 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0848 0.0713 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.01e-01 0.0463 0.0687 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 8.88e-07 0.455 0.0899 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 4.63e-01 0.0718 0.0978 0.293 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 5.64e-01 0.053 0.0917 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 8.03e-01 0.0227 0.0906 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 2.33e-01 0.0987 0.0825 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 2.24e-01 0.123 0.101 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.79e-01 0.0267 0.0951 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.93e-01 -0.11 0.0845 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0321 0.095 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.27e-04 0.399 0.102 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0151 0.0857 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 9.09e-02 -0.14 0.0824 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 8.85e-01 0.0114 0.0792 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0079 0.0803 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 1.43e-01 0.131 0.0893 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 1.06e-01 -0.149 0.0917 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 5.68e-01 0.0403 0.0705 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 8.00e-03 -0.214 0.0798 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 9.71e-04 0.306 0.0916 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 6.97e-01 0.0367 0.094 0.293 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 8.98e-01 -0.015 0.117 0.319 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 4.84e-01 0.0768 0.109 0.319 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 6.32e-01 0.0486 0.101 0.319 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 6.32e-01 0.0547 0.114 0.319 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0631 0.0943 0.319 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.09e-01 0.055 0.0831 0.319 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 8.09e-01 0.0284 0.117 0.319 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.46e-01 0.166 0.113 0.319 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 9.21e-01 -0.011 0.111 0.319 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0496 0.096 0.291 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0867 0.0879 0.291 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 9.94e-01 0.000702 0.0937 0.291 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0318 0.0915 0.291 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 1.37e-01 0.138 0.0923 0.291 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0436 0.0741 0.291 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0951 0.0681 0.291 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.33e-01 0.0512 0.0821 0.291 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 8.77e-01 0.0131 0.0851 0.293 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 9.49e-01 0.00541 0.0838 0.293 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.90e-01 0.116 0.088 0.293 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.43e-01 0.0073 0.102 0.293 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.58e-01 0.0292 0.0946 0.293 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0744 0.0721 0.293 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 7.62e-01 0.0237 0.078 0.293 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.27e-07 0.478 0.0924 0.293 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.03e-01 0.136 0.0828 0.298 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 5.29e-02 -0.165 0.0848 0.298 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0113 0.0948 0.298 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00371 0.0804 0.298 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.26e-01 0.147 0.0957 0.298 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0084 0.0838 0.298 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 3.69e-03 0.276 0.0938 0.298 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 6.78e-01 0.0229 0.0552 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 6.95e-01 0.0255 0.0649 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 6.11e-01 0.0491 0.0965 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0333 0.0885 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0216 0.0707 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0405 0.0554 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.97e-07 0.382 0.0722 0.293 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 9.69e-01 0.00275 0.0698 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.45e-01 0.097 0.0663 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0197 0.102 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0758 0.0941 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 5.19e-01 0.0518 0.0802 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.45e-01 0.0423 0.0697 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 6.52e-10 0.474 0.0732 0.293 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 4.71e-01 0.0827 0.114 0.288 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0251 0.106 0.288 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.80e-01 0.149 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 4.65e-01 0.0797 0.109 0.288 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.33e-01 -0.105 0.108 0.288 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 1.35e-01 0.154 0.103 0.288 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 3.15e-01 -0.114 0.113 0.288 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.48e-01 0.128 0.11 0.288 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.40e-01 0.0808 0.0845 0.291 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 8.05e-01 0.0203 0.0824 0.291 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.79e-01 0.00248 0.0949 0.291 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0936 0.099 0.291 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.87e-01 0.0748 0.0862 0.291 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 6.04e-01 0.0427 0.0822 0.291 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.90e-02 0.167 0.0878 0.291 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 4.20e-01 0.0595 0.0736 0.296 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 5.17e-01 0.0399 0.0614 0.296 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0642 0.0957 0.296 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 4.84e-02 0.189 0.0952 0.296 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 6.71e-01 0.0358 0.0841 0.296 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 2.08e-01 0.103 0.0817 0.296 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 3.01e-04 0.303 0.0823 0.296 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 1.67e-01 -0.14 0.101 0.299 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 2.68e-02 -0.215 0.0964 0.299 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0409 0.099 0.299 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0286 0.105 0.299 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0759 0.085 0.299 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 1.64e-01 -0.14 0.1 0.299 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 7.43e-03 0.277 0.102 0.299 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 2.42e-02 -0.151 0.0664 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0127 0.0601 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0875 0.102 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.91e-01 0.0115 0.0839 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0666 0.0603 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 5.33e-02 -0.106 0.0546 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 9.84e-01 0.00138 0.071 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.97e-12 0.593 0.08 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 2.35e-01 0.111 0.0933 0.293 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00511 0.0732 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0491 0.0714 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0936 0.0946 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 2.83e-02 0.163 0.0737 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0323 0.0692 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 7.27e-02 -0.127 0.0704 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 813641 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0687 0.0866 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 5.31e-25 0.8 0.0678 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 517266 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0739 0.0897 0.293 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.61e-01 0.0467 0.051 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 2.82e-01 0.0652 0.0604 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 7.47e-01 0.0316 0.0976 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0415 0.0825 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 6.76e-01 0.0292 0.0699 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00781 0.0527 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.33e-11 0.464 0.0656 0.293 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.71e-01 0.0607 0.0678 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 7.19e-01 0.0204 0.0568 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 2.75e-01 -0.112 0.102 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0173 0.0944 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 2.59e-01 0.0866 0.0766 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 2.35e-01 0.0912 0.0766 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 1.57e-04 0.302 0.0784 0.295 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 587153 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0668 0.0695 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -53330 sc-eQTL 5.62e-01 0.0373 0.0642 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -632093 sc-eQTL 1.21e-01 0.109 0.0698 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -160891 sc-eQTL 9.79e-02 0.164 0.0986 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -943504 sc-eQTL 8.62e-01 0.0137 0.079 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 138601 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0467 0.0629 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 74537 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0592 0.0608 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 48996 sc-eQTL 2.92e-11 0.575 0.0818 0.293 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -55284 sc-eQTL 4.17e-01 0.0811 0.0998 0.293 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 138601 eQTL 0.0172 0.0483 0.0203 0.0 0.0 0.287
ENSG00000177889 UBE2N 74537 eQTL 0.0155 -0.03 0.0124 0.0 0.0 0.287
ENSG00000198015 MRPL42 48996 eQTL 3.29e-69 0.348 0.0182 0.0 0.00912 0.287


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000177889 UBE2N 74537 9.93e-06 2.43e-05 3.08e-06 3.95e-06 1.74e-06 3.05e-06 1.17e-05 9.27e-07 7.74e-06 2.85e-06 7.68e-06 2.79e-06 1.11e-05 3.66e-06 3.71e-06 6.61e-06 1.02e-05 8.11e-06 2.2e-06 1.44e-06 5.62e-06 1e-05 8.51e-06 2.01e-06 1.31e-05 4.43e-06 3.6e-06 2.81e-06 1.21e-05 7.84e-06 3.75e-06 4.17e-07 6.66e-07 1.87e-06 3.58e-06 1.18e-06 1.21e-06 5.24e-07 9.06e-07 5.91e-07 2.11e-07 1.25e-05 1.49e-06 4.37e-07 7.72e-07 1.8e-06 2.15e-06 4.43e-07 3.9e-07
ENSG00000198015 MRPL42 48996 1.53e-05 2.99e-05 5.55e-06 4.92e-06 2.22e-06 4.14e-06 1.7e-05 9.99e-07 1.03e-05 4.22e-06 9.35e-06 4.77e-06 1.36e-05 3.7e-06 4.5e-06 9.06e-06 1.33e-05 1.19e-05 2.66e-06 2.64e-06 6.44e-06 1.27e-05 1.24e-05 3.16e-06 1.83e-05 4.94e-06 4.75e-06 3.74e-06 1.59e-05 8.74e-06 5.07e-06 8.89e-07 1.29e-06 2.54e-06 4.61e-06 1.68e-06 1.79e-06 1.83e-06 1.36e-06 7.61e-07 3.61e-07 1.58e-05 2.45e-06 4.43e-07 8.01e-07 1.82e-06 2.94e-06 7.5e-07 6.14e-07