Genes within 1Mb (chr12:93494711:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 8.85e-01 0.0149 0.103 0.056 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.65e-01 0.0924 0.102 0.056 B L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 8.36e-02 0.267 0.153 0.056 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 3.12e-01 0.13 0.129 0.056 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0385 0.115 0.056 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.50e-01 -0.146 0.101 0.056 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 1.76e-02 -0.27 0.113 0.056 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.07e-02 -0.401 0.156 0.056 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 9.04e-01 0.019 0.157 0.056 B L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00627 0.105 0.056 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.67e-01 -0.113 0.101 0.056 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.10e-01 0.0702 0.106 0.056 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 3.79e-01 0.154 0.174 0.056 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0692 0.111 0.056 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 6.74e-02 0.184 0.0999 0.056 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0339 0.0935 0.056 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 5.74e-02 -0.308 0.161 0.056 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 2.49e-01 0.136 0.118 0.056 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 6.68e-01 0.0583 0.136 0.056 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 7.84e-02 0.246 0.139 0.056 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.25e-01 -0.252 0.164 0.056 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.18e-01 0.0134 0.131 0.056 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 8.60e-01 0.0172 0.0976 0.056 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 9.14e-01 0.0131 0.122 0.056 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 7.47e-03 -0.46 0.17 0.056 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 2.96e-02 0.336 0.153 0.059 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.76e-01 0.182 0.167 0.059 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0844 0.189 0.059 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0225 0.149 0.059 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.30e-01 0.0137 0.156 0.059 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0163 0.157 0.059 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.73e-01 -0.246 0.18 0.059 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.29e-01 0.00824 0.093 0.056 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 9.79e-01 0.00285 0.106 0.056 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0706 0.195 0.056 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00748 0.157 0.056 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 1.69e-01 -0.185 0.134 0.056 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.08e-01 0.162 0.1 0.056 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.85e-02 -0.319 0.134 0.056 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 1.74e-02 0.316 0.132 0.056 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.29e-01 0.15 0.124 0.056 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 7.23e-01 0.0462 0.13 0.056 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.31e-01 -0.224 0.187 0.056 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0757 0.148 0.056 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0471 0.121 0.056 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 7.66e-02 -0.212 0.119 0.056 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 7.33e-02 -0.306 0.17 0.056 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 2.06e-01 0.247 0.194 0.056 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0159 0.167 0.056 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.65e-01 -0.173 0.155 0.056 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.76e-01 0.104 0.145 0.056 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 9.40e-01 0.0134 0.176 0.056 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.44e-02 -0.282 0.163 0.056 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 8.91e-01 0.0173 0.126 0.056 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 8.71e-02 -0.199 0.116 0.056 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.36e-02 -0.311 0.136 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.92e-02 -0.38 0.2 0.051 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 7.00e-01 0.0657 0.17 0.051 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.02e-01 0.326 0.198 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 2.78e-01 -0.23 0.211 0.051 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.86e-01 0.0484 0.178 0.051 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 5.56e-01 -0.13 0.22 0.051 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 5.60e-01 -0.109 0.186 0.051 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 5.79e-01 -0.119 0.214 0.051 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 2.79e-01 -0.225 0.207 0.051 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 6.69e-01 0.0667 0.156 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 6.73e-01 0.0651 0.154 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0841 0.183 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0252 0.171 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.33e-01 -0.12 0.153 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 3.68e-01 -0.14 0.155 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 2.85e-01 -0.184 0.172 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 4.25e-01 -0.151 0.189 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 2.48e-01 -0.216 0.186 0.056 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 3.12e-01 0.161 0.158 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0855 0.149 0.056 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.59e-02 0.469 0.193 0.056 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0217 0.174 0.056 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.69e-01 0.102 0.14 0.056 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 2.65e-01 -0.139 0.125 0.056 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 9.82e-03 -0.409 0.157 0.056 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 3.01e-01 -0.193 0.186 0.056 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 9.71e-01 0.00687 0.186 0.056 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 3.94e-01 -0.128 0.15 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 8.98e-01 0.02 0.156 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.57e-01 0.222 0.195 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.27e-01 0.0354 0.161 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0805 0.14 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.97e-01 -0.195 0.15 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 9.75e-01 0.0053 0.167 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.01e-01 -0.223 0.174 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 9.53e-01 0.0108 0.185 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 4.28e-01 -0.145 0.183 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.48e-01 0.159 0.169 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 3.78e-01 -0.168 0.19 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0242 0.179 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 3.49e-01 0.147 0.157 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0299 0.154 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 5.01e-01 0.0901 0.134 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.44e-01 -0.292 0.199 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0152 0.192 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.42e-01 0.06 0.182 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 6.95e-01 0.072 0.184 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.33e-01 -0.137 0.175 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.24e-01 -0.142 0.177 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000492 0.179 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 8.78e-01 0.0268 0.174 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 2.95e-01 -0.186 0.177 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 8.24e-01 0.0441 0.198 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.22e-01 0.0108 0.111 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 1.11e-01 -0.166 0.104 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.30e-01 0.0934 0.118 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.37e-01 0.268 0.18 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0981 0.128 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 1.03e-01 0.173 0.105 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0672 0.102 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 9.33e-02 -0.286 0.17 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00162 0.153 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 8.43e-01 0.0236 0.119 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.52e-01 0.0842 0.142 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0994 0.191 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0732 0.151 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 5.04e-01 0.0801 0.12 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00119 0.115 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.53e-01 -0.251 0.175 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.20e-01 0.0627 0.174 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.63e-01 -0.144 0.128 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0603 0.154 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 9.98e-01 0.000512 0.19 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0232 0.173 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.42e-01 0.011 0.15 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0506 0.154 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 3.48e-01 -0.159 0.169 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00214 0.159 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 3.76e-01 -0.137 0.154 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.27e-01 0.154 0.157 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.92e-01 -0.201 0.19 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00527 0.173 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0397 0.141 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 6.97e-01 0.0639 0.164 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 3.50e-02 -0.395 0.186 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 1.03e-01 0.236 0.144 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 8.27e-01 0.0313 0.143 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.16e-01 0.198 0.16 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.94e-01 -0.073 0.185 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 5.25e-01 0.0982 0.154 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 8.99e-01 0.0163 0.128 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0656 0.14 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.69e-02 -0.424 0.176 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 3.83e-01 0.163 0.186 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 4.26e-01 0.128 0.16 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0521 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.87e-01 -0.133 0.19 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.87e-01 0.00308 0.185 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.53e-02 0.302 0.15 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 4.79e-01 0.127 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.14e-01 -0.229 0.184 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.56e-01 0.112 0.19 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0205 0.176 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 6.29e-01 0.0897 0.185 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.12e-01 0.245 0.196 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 2.62e-01 -0.215 0.191 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0647 0.181 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 9.19e-01 0.0176 0.173 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.69e-01 -0.246 0.178 0.057 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0586 0.185 0.056 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.62e-01 -0.189 0.168 0.056 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.99e-01 0.131 0.155 0.056 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 3.03e-01 -0.203 0.197 0.056 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 1.66e-01 -0.246 0.177 0.056 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 3.05e-01 0.147 0.143 0.056 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 5.81e-02 -0.332 0.174 0.056 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.20e-01 -0.279 0.178 0.056 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.96e-02 0.347 0.183 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 4.85e-01 0.121 0.172 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.16e-01 0.137 0.168 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0232 0.204 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 1.75e-01 0.231 0.17 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 2.79e-01 -0.197 0.182 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 3.70e-01 -0.173 0.193 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0989 0.192 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 1.36e-01 -0.267 0.179 0.053 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.38e-02 0.267 0.159 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 4.89e-01 0.0979 0.141 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.55e-01 0.0908 0.154 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.38e-01 -0.155 0.2 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 4.16e-01 -0.145 0.178 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 2.79e-01 0.154 0.142 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 2.92e-01 -0.144 0.136 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 5.97e-03 -0.515 0.186 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 5.58e-02 0.371 0.193 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 1.05e-01 -0.299 0.184 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 2.96e-01 -0.191 0.182 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 9.79e-01 0.00436 0.167 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.30e-01 0.161 0.204 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0107 0.191 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000843 0.171 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.72e-01 -0.261 0.19 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.88e-01 -0.227 0.213 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 5.03e-01 0.116 0.172 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 1.15e-01 0.256 0.162 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 1.51e-01 0.223 0.155 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0561 0.157 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 7.88e-01 0.0474 0.176 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0206 0.181 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0353 0.138 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0823 0.159 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0324 0.184 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 6.94e-01 0.0726 0.184 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 6.03e-01 0.0999 0.192 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 9.47e-01 0.0118 0.176 0.054 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.02e-01 -0.239 0.186 0.054 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 5.23e-01 0.117 0.183 0.054 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0487 0.185 0.054 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00289 0.148 0.054 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0293 0.137 0.054 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0249 0.164 0.054 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 2.44e-01 -0.191 0.163 0.056 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 8.77e-01 0.025 0.161 0.056 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.55e-01 0.157 0.17 0.056 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0128 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 3.25e-01 0.179 0.182 0.056 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 1.85e-02 0.326 0.137 0.056 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 7.98e-02 0.262 0.149 0.056 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.79e-01 -0.254 0.188 0.056 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 1.77e-02 0.396 0.165 0.059 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 1.75e-01 0.234 0.172 0.059 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0777 0.191 0.059 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 5.66e-01 0.0929 0.162 0.059 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 7.40e-01 0.0644 0.194 0.059 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 4.60e-01 -0.125 0.168 0.059 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 3.61e-02 -0.403 0.191 0.059 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0289 0.107 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 1.24e-01 -0.194 0.125 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.01e-01 -0.307 0.186 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0486 0.172 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.58e-01 0.102 0.137 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.108 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.21e-01 -0.231 0.148 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 3.67e-01 0.124 0.137 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.75e-01 0.144 0.131 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.62e-01 0.226 0.201 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.95e-01 0.0245 0.186 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 2.70e-02 -0.348 0.156 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.52e-02 0.332 0.136 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 5.72e-02 -0.3 0.157 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00151 0.221 0.064 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 6.21e-01 -0.101 0.205 0.064 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.41e-01 0.251 0.213 0.064 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 2.88e-01 -0.224 0.209 0.064 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 1.42e-01 -0.307 0.208 0.064 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 1.83e-01 -0.266 0.199 0.064 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 5.87e-01 -0.119 0.219 0.064 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 4.23e-02 -0.431 0.21 0.064 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.60e-01 0.0955 0.164 0.058 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 9.89e-03 0.408 0.157 0.058 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 1.68e-01 0.253 0.183 0.058 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 6.20e-01 0.0953 0.192 0.058 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 3.21e-01 -0.166 0.167 0.058 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.59e-01 0.224 0.158 0.058 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 4.99e-01 -0.116 0.171 0.058 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 2.96e-01 -0.151 0.144 0.057 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.57e-01 0.0707 0.12 0.057 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0775 0.187 0.057 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 5.48e-01 -0.113 0.188 0.057 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.80e-01 -0.116 0.164 0.057 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 5.23e-01 -0.103 0.16 0.057 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.75e-01 -0.182 0.166 0.057 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 3.84e-01 0.179 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 2.25e-01 0.24 0.197 0.056 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 5.74e-01 -0.113 0.2 0.056 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0469 0.213 0.056 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.67e-01 0.125 0.172 0.056 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 4.33e-01 0.16 0.204 0.056 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.85e-01 -0.28 0.21 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.16e-01 0.0853 0.131 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 5.25e-01 0.0746 0.117 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.44e-02 0.368 0.198 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0121 0.164 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.66e-01 0.00509 0.118 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 2.56e-01 -0.122 0.107 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 9.49e-03 -0.357 0.136 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 1.51e-01 -0.252 0.174 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 3.55e-01 -0.169 0.182 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 4.55e-01 -0.11 0.146 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.48e-01 0.109 0.143 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 6.51e-01 0.0859 0.19 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.11e-01 0.0358 0.149 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00911 0.139 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 3.56e-01 -0.131 0.142 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 791868 sc-eQTL 7.46e-01 0.0563 0.173 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 8.28e-02 -0.303 0.174 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 495493 sc-eQTL 7.68e-01 0.053 0.18 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.20e-01 0.0356 0.099 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 3.67e-01 -0.106 0.117 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.36e-01 -0.147 0.189 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0402 0.16 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 4.38e-01 -0.105 0.135 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 2.10e-01 0.128 0.102 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 5.22e-02 -0.274 0.14 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0882 0.133 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 4.18e-02 0.226 0.11 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 7.31e-01 0.0693 0.201 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0393 0.185 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 1.60e-01 -0.211 0.15 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 7.65e-01 0.0452 0.151 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 2.09e-01 -0.199 0.158 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 565380 sc-eQTL 7.98e-02 0.24 0.136 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -75103 sc-eQTL 1.97e-01 0.163 0.126 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -653866 sc-eQTL 9.29e-01 0.0124 0.138 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -182664 sc-eQTL 4.95e-01 -0.134 0.195 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -965277 sc-eQTL 3.03e-01 -0.16 0.155 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 116828 sc-eQTL 5.92e-01 0.0666 0.124 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 52764 sc-eQTL 1.19e-01 -0.187 0.119 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 27223 sc-eQTL 9.25e-02 -0.301 0.178 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -77057 sc-eQTL 8.56e-02 0.338 0.195 0.054 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000177889 UBE2N 52764 eQTL 0.0264 0.0635 0.0286 0.00133 0.0 0.0402
ENSG00000198015 MRPL42 27223 eQTL 2.22e-03 -0.151 0.0492 0.0 0.0 0.0402
ENSG00000258035 AC123567.2 -691333 eQTL 0.0486 -0.123 0.0624 0.00101 0.0 0.0402


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina