logo

Genes within 1Mb (chr12:93462069:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0172 0.0716 0.139 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.27e-02 0.137 0.0704 0.139 B L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.107 0.139 B L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0948 0.0894 0.139 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.49e-02 -0.142 0.0793 0.139 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 5.36e-01 0.0437 0.0704 0.139 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0138 0.0796 0.139 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 3.29e-01 0.107 0.11 0.139 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 6.45e-01 -0.025 0.0542 0.139 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 3.08e-01 0.111 0.109 0.139 B L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0355 0.0741 0.139 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 9.96e-01 0.0004 0.0717 0.139 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 4.44e-01 0.0577 0.0752 0.139 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 4.26e-01 0.0982 0.123 0.139 CD4T L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.32e-01 0.0271 0.0789 0.139 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.19e-02 -0.133 0.0706 0.139 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000625 0.0661 0.139 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.53e-01 0.0517 0.115 0.139 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0849 0.0835 0.139 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0232 0.0961 0.139 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 2.39e-01 -0.116 0.0986 0.139 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 3.73e-01 0.104 0.116 0.139 CD8T L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 5.56e-01 0.0544 0.0923 0.139 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.54e-02 -0.127 0.0685 0.139 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.02e-01 0.0449 0.0859 0.139 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 2.40e-01 0.144 0.122 0.139 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.63e-01 0.0185 0.107 0.142 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.99e-01 0.0609 0.116 0.142 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 4.41e-01 -0.101 0.131 0.142 DC L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.16e-01 0.0241 0.103 0.142 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0462 0.107 0.142 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.06e-01 -0.111 0.108 0.142 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 7.55e-01 0.039 0.125 0.142 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 4.28e-02 -0.222 0.109 0.142 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.00e-02 0.115 0.0654 0.139 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 3.44e-01 0.0712 0.075 0.139 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0336 0.138 0.139 Mono L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 1.96e-01 -0.144 0.111 0.139 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.07e-01 0.0233 0.0954 0.139 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0783 0.0714 0.139 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.39e-01 0.0453 0.0963 0.139 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 7.85e-01 0.0251 0.0918 0.139 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0623 0.0857 0.139 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0259 0.0896 0.139 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.32e-01 0.0441 0.129 0.139 NK L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0773 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 1.11e-01 -0.133 0.0827 0.139 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.08e-01 0.084 0.0822 0.139 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.51e-03 0.318 0.116 0.139 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 2.78e-01 -0.146 0.134 0.139 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 4.66e-01 0.0866 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 3.01e-01 -0.114 0.11 0.139 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0305 0.103 0.139 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 5.65e-01 -0.072 0.125 0.139 Other_T L1
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0224 0.116 0.139 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.79e-01 -0.037 0.0892 0.139 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0239 0.0827 0.139 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.06e-01 0.0505 0.0978 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 4.35e-01 0.109 0.139 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 2.66e-01 0.131 0.117 0.135 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.74e-01 0.0219 0.138 0.135 B_Activated L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 9.08e-01 0.0169 0.146 0.135 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.51e-02 -0.211 0.122 0.135 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0696 0.152 0.135 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 6.68e-01 0.0553 0.129 0.135 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 1.87e-01 0.195 0.147 0.135 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0511 0.134 0.135 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 4.73e-01 -0.103 0.143 0.135 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.62e-01 0.0188 0.108 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.63e-01 0.0324 0.107 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.27e-01 0.0278 0.127 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0496 0.119 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0379 0.106 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.34e-01 0.0515 0.108 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 4.26e-01 0.0955 0.12 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 9.40e-01 0.00988 0.132 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 8.18e-01 0.0204 0.0885 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 7.37e-01 0.0437 0.13 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.91e-01 0.0153 0.112 0.14 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 3.57e-01 0.0966 0.105 0.14 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 2.00e-01 -0.176 0.137 0.14 B_Memory L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.93e-01 0.0321 0.122 0.14 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.95e-01 0.0672 0.0983 0.14 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.42e-01 0.0837 0.0878 0.14 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 3.69e-01 -0.101 0.112 0.14 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.04e-01 0.109 0.131 0.14 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0535 0.109 0.14 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 3.91e-01 0.112 0.13 0.14 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 5.10e-02 -0.21 0.107 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 1.10e-01 0.179 0.111 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.79e-01 0.0396 0.141 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.66e-01 0.0196 0.116 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.64e-02 -0.2 0.0998 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 4.23e-01 0.0868 0.108 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000717 0.12 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 1.70e-01 0.171 0.125 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 6.89e-01 0.0292 0.0729 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 9.72e-01 0.00462 0.133 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 2.13e-01 0.158 0.126 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0274 0.117 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 6.74e-01 0.0556 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.28e-01 -0.149 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0299 0.109 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.53e-01 0.0992 0.107 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 8.97e-01 -0.012 0.0927 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.43e-01 -0.106 0.138 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 3.46e-01 0.0627 0.0664 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0378 0.133 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 6.97e-01 0.0497 0.127 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 8.45e-01 0.0251 0.128 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.13e-02 0.213 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 9.29e-01 0.0111 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0463 0.125 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 1.14e-01 -0.191 0.121 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0885 0.124 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 1.63e-01 0.193 0.138 0.141 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0229 0.078 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0341 0.0736 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0319 0.0832 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 3.45e-01 0.12 0.127 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 4.42e-01 0.0692 0.0899 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0226 0.0747 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.55e-01 0.032 0.0717 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.78e-01 0.05 0.12 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0936 0.107 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 9.00e-01 0.0106 0.0835 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 2.43e-01 0.116 0.0989 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00797 0.134 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 1.06e-01 -0.171 0.105 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.05e-02 -0.171 0.0831 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00349 0.0807 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0199 0.123 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 2.27e-01 -0.149 0.123 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 3.98e-01 0.0772 0.0911 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 3.42e-01 0.104 0.109 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.73e-01 0.0389 0.135 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0408 0.123 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.47e-03 -0.277 0.104 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00866 0.109 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0125 0.12 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00935 0.112 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 3.97e-01 0.0924 0.109 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 4.01e-01 0.0929 0.11 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 5.10e-01 0.0887 0.134 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 5.48e-02 0.233 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0978 0.0994 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0493 0.116 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.08e-01 0.11 0.132 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.08e-02 -0.178 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0702 0.101 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0246 0.113 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 6.54e-01 0.0585 0.13 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 6.91e-01 0.0433 0.109 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0738 0.0901 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.098 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 2.09e-01 0.158 0.125 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.59e-01 0.00685 0.134 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 7.72e-02 -0.202 0.114 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 4.76e-01 -0.092 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.01e-01 0.0343 0.136 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 1.11e-01 0.211 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0145 0.108 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0303 0.129 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 8.51e-01 0.0247 0.132 0.139 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 4.78e-01 0.0972 0.137 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 2.95e-01 -0.133 0.127 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 4.67e-01 0.103 0.142 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.56e-01 0.0429 0.138 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.23e-03 -0.354 0.128 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 5.30e-01 0.0785 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 9.76e-01 0.00385 0.129 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.49e-01 0.00831 0.131 0.139 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 2.92e-01 -0.126 0.119 0.139 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 6.88e-01 -0.044 0.11 0.139 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 6.66e-01 0.0603 0.139 0.139 MAIT L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.77e-01 0.0356 0.125 0.139 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0236 0.101 0.139 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.74e-01 0.11 0.124 0.139 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 1.58e-01 0.178 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.75e-01 0.11 0.124 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 5.17e-01 0.075 0.115 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 9.66e-01 0.00487 0.113 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0882 0.137 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.50e-01 -0.131 0.114 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 3.68e-01 -0.11 0.122 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.11e-01 0.131 0.129 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0909 0.129 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 8.30e-01 0.0258 0.12 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.74e-01 0.00364 0.11 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 4.91e-01 -0.067 0.097 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0356 0.106 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.25e-01 0.0305 0.138 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 4.57e-01 0.0908 0.122 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0939 0.0973 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0154 0.0936 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.44e-03 0.366 0.127 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0503 0.133 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.75e-01 0.00395 0.125 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 9.02e-01 0.0152 0.123 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.38e-01 0.023 0.113 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 6.36e-01 0.0654 0.138 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.51e-01 -0.041 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0159 0.115 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 7.85e-01 0.0353 0.129 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.76e-02 0.263 0.143 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 6.13e-01 0.059 0.116 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 1.69e-01 0.155 0.113 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0257 0.108 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0641 0.109 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00733 0.122 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.74e-01 -0.137 0.125 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 5.00e-02 -0.188 0.0952 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.59e-01 0.0489 0.11 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 3.46e-02 0.269 0.127 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 5.91e-02 -0.241 0.127 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.14e-01 -0.185 0.183 0.126 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0369 0.171 0.126 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0402 0.158 0.126 PB L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 1.16e-01 0.279 0.176 0.126 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 9.92e-02 -0.242 0.146 0.126 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0124 0.13 0.126 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 6.14e-01 0.0926 0.183 0.126 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.80e-01 0.0739 0.178 0.126 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0128 0.141 0.126 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 2.45e-01 0.201 0.172 0.126 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 7.03e-02 0.248 0.136 0.139 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 1.02e-01 -0.205 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 8.67e-01 0.0225 0.134 0.139 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.74e-02 -0.23 0.13 0.139 Pro_T L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0241 0.133 0.139 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.56e-01 0.0791 0.106 0.139 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 7.43e-01 -0.032 0.0976 0.139 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.139 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.56e-01 0.106 0.114 0.139 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0639 0.113 0.139 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.52e-01 0.0377 0.119 0.139 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0232 0.138 0.139 Treg L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 6.14e-01 0.0643 0.127 0.139 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 1.22e-01 -0.151 0.0969 0.139 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 6.68e-01 0.0451 0.105 0.139 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.67e-01 0.0569 0.132 0.139 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 2.43e-01 -0.134 0.114 0.144 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 9.68e-01 0.00472 0.118 0.144 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0879 0.13 0.144 cDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.24e-02 -0.192 0.11 0.144 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0513 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.15e-01 -0.116 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0398 0.132 0.144 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 3.77e-02 -0.166 0.0795 0.144 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.01e-02 0.163 0.0748 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 1.87e-01 0.117 0.0886 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 2.92e-01 -0.139 0.132 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.10e-01 -0.152 0.121 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.50e-01 0.0183 0.0969 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0417 0.0759 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 3.07e-01 0.107 0.105 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 9.44e-01 -0.0069 0.0984 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0268 0.094 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.92e-01 0.0196 0.144 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0263 0.133 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 6.62e-01 0.0495 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0322 0.0985 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0825 0.113 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 2.80e-01 0.166 0.153 0.139 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 6.23e-01 0.0701 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.22e-03 -0.396 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 2.47e-02 -0.326 0.144 0.139 gdT L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 4.87e-01 -0.101 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 1.78e-01 -0.187 0.138 0.139 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 5.06e-01 -0.101 0.152 0.139 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 1.80e-02 0.348 0.146 0.139 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.01e-01 0.123 0.119 0.14 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 9.68e-01 0.00464 0.116 0.14 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 4.32e-01 -0.105 0.133 0.14 intMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.56e-01 -0.159 0.139 0.14 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0995 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0758 0.116 0.14 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 8.46e-01 0.0242 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.64e-01 0.0917 0.101 0.14 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 4.44e-01 0.0646 0.0842 0.14 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.31e-01 0.0452 0.131 0.14 ncMono L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 8.46e-01 0.0257 0.132 0.14 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0129 0.115 0.14 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 8.24e-01 -0.025 0.112 0.14 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 7.91e-01 0.0309 0.117 0.14 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.51e-01 0.133 0.142 0.147 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 3.11e-01 0.139 0.137 0.147 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 3.69e-01 0.125 0.138 0.147 pDC L2
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 4.46e-01 0.113 0.147 0.147 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 3.29e-01 -0.116 0.119 0.147 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 2.24e-01 0.172 0.141 0.147 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 6.44e-01 0.0677 0.146 0.147 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 5.31e-02 -0.247 0.127 0.147 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 8.84e-01 0.0133 0.091 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.47e-01 0.049 0.0813 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0923 0.138 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.18e-01 -0.041 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0547 0.0818 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 2.54e-01 0.0851 0.0744 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0084 0.0962 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 3.05e-01 0.125 0.121 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0355 0.0845 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 6.46e-01 0.0583 0.127 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 3.16e-01 -0.102 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 7.67e-02 0.175 0.0985 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.90e-01 0.0351 0.132 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0674 0.103 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 1.81e-01 -0.128 0.0956 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 1.90e-01 0.129 0.0981 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 759226 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0689 0.12 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 5.37e-01 0.0748 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 995618 sc-eQTL 6.03e-01 0.0299 0.0573 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 462851 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0173 0.125 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 1.37e-01 0.104 0.0698 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 4.09e-01 0.0686 0.083 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 4.27e-01 -0.107 0.134 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 2.40e-01 -0.133 0.113 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.72e-01 0.0278 0.0959 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0646 0.0722 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 5.28e-01 0.0633 0.1 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 2.45e-01 0.107 0.0922 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.97e-01 0.0409 0.0773 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 7.46e-01 0.0453 0.14 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0149 0.129 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0338 0.105 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 2.89e-01 -0.111 0.104 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 7.00e-01 0.0426 0.11 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 532738 sc-eQTL 6.51e-01 0.0427 0.0943 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -107745 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0886 0.0868 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -686508 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0534 0.0951 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -215306 sc-eQTL 8.34e-01 0.0282 0.134 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173588 CEP83 -997919 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0339 0.107 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 84186 sc-eQTL 8.65e-02 -0.146 0.0848 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 20122 sc-eQTL 8.40e-01 0.0166 0.0826 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 sc-eQTL 2.51e-03 0.369 0.121 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -109699 sc-eQTL 1.28e-01 -0.206 0.135 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 84186 eQTL 7.96e-06 -0.111 0.0247 0.0 0.0 0.165
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 eQTL 4.47e-19 0.23 0.0252 0.0152 0.0 0.165
ENSG00000278916 CEP83-DT -997934 eQTL 0.0107 -0.12 0.0467 0.0 0.0 0.165

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 84186 4.57e-06 5.09e-06 7.62e-07 2.64e-06 7.76e-07 1.71e-06 4.17e-06 9.96e-07 3.56e-06 2.02e-06 4.91e-06 3.54e-06 6.97e-06 2.4e-06 1.46e-06 2.66e-06 1.97e-06 2.81e-06 1.43e-06 9.89e-07 1.98e-06 4.21e-06 3.78e-06 1.71e-06 5.39e-06 1.33e-06 2.25e-06 1.82e-06 4.26e-06 4.45e-06 1.93e-06 5.07e-07 7.75e-07 1.87e-06 2e-06 9.79e-07 9.11e-07 4.73e-07 9.86e-07 3.61e-07 2.23e-07 5.49e-06 3.77e-07 1.68e-07 3.65e-07 3.4e-07 8.67e-07 5.05e-07 2.72e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -5419 3.12e-05 3.08e-05 5.7e-06 1.51e-05 4.91e-06 1.36e-05 4.07e-05 3.9e-06 2.67e-05 1.37e-05 3.47e-05 1.48e-05 4.49e-05 1.24e-05 6.39e-06 1.61e-05 1.51e-05 2.23e-05 7.5e-06 6.5e-06 1.35e-05 2.83e-05 2.86e-05 8.57e-06 4.01e-05 6.84e-06 1.25e-05 1.13e-05 2.91e-05 2.61e-05 1.78e-05 1.63e-06 2.41e-06 6.67e-06 1.08e-05 5.68e-06 2.98e-06 3.18e-06 4.46e-06 3.3e-06 1.72e-06 3.49e-05 2.99e-06 3.62e-07 2.23e-06 3.59e-06 3.74e-06 1.45e-06 1.5e-06