logo

Genes within 1Mb (chr12:93458474:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0371 0.0677 0.169 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.14e-02 0.117 0.0666 0.169 B L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.30e-01 0.0351 0.102 0.169 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0998 0.0752 0.169 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.55e-02 0.122 0.0661 0.169 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 5.33e-01 -0.047 0.0751 0.169 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.26e-01 0.159 0.103 0.169 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0708 0.0511 0.169 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 5.82e-01 0.0569 0.103 0.169 B L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.71e-01 0.0394 0.0694 0.169 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.95e-01 0.0174 0.0671 0.169 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.11e-01 0.058 0.0704 0.169 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.82e-01 0.032 0.115 0.169 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0667 0.0665 0.169 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.58e-01 0.0363 0.0618 0.169 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 2.31e-01 0.129 0.107 0.169 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0434 0.0784 0.169 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00204 0.0901 0.169 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0698 0.0927 0.169 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 4.72e-01 0.0785 0.109 0.169 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.48e-02 -0.136 0.0641 0.169 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 4.10e-01 0.0664 0.0805 0.169 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.05e-02 0.292 0.113 0.169 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0182 0.101 0.171 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.55e-01 0.00625 0.11 0.171 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 8.94e-01 0.0166 0.124 0.171 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 9.78e-01 0.00287 0.102 0.171 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0682 0.103 0.171 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0225 0.118 0.171 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 2.88e-02 -0.227 0.103 0.171 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 2.22e-03 0.187 0.0603 0.169 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 2.07e-01 0.0889 0.0702 0.169 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 2.65e-01 -0.145 0.129 0.169 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.94e-01 0.0476 0.0893 0.169 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00368 0.0671 0.169 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 8.37e-01 0.0186 0.0903 0.169 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0449 0.0869 0.17 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0172 0.0812 0.17 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.89e-01 0.0012 0.0848 0.17 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 2.39e-01 0.143 0.121 0.17 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.52e-02 -0.165 0.078 0.17 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 1.98e-01 0.1 0.0777 0.17 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.18e-02 0.279 0.11 0.17 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0519 0.127 0.17 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.41e-01 0.0681 0.111 0.169 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0492 0.103 0.169 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00297 0.0969 0.169 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 4.04e-01 0.0978 0.117 0.169 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0267 0.0836 0.169 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.62e-01 -0.034 0.0775 0.169 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 3.90e-01 0.079 0.0916 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.24e-01 0.0482 0.136 0.158 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0317 0.115 0.158 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0601 0.135 0.158 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.11e-02 -0.257 0.118 0.158 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.57e-01 0.0461 0.149 0.158 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 7.49e-01 0.0403 0.126 0.158 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 2.78e-01 0.156 0.144 0.158 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0656 0.131 0.158 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 9.03e-01 -0.017 0.14 0.158 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0506 0.103 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 6.46e-01 0.0471 0.102 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0361 0.122 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.36e-01 0.0629 0.102 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 8.23e-01 0.0231 0.103 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 9.77e-01 0.00324 0.115 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0601 0.0846 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 5.02e-01 0.0835 0.124 0.17 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0211 0.106 0.17 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.55e-01 0.0747 0.0999 0.17 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0303 0.131 0.17 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 6.45e-01 0.0432 0.0937 0.17 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.98e-02 0.157 0.0831 0.17 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0783 0.107 0.17 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.51e-01 0.179 0.124 0.17 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0618 0.104 0.17 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0102 0.124 0.17 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.71e-02 -0.187 0.102 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.66e-02 0.211 0.105 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 8.15e-01 0.0313 0.133 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.43e-01 -0.14 0.0951 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.13e-02 0.185 0.102 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 2.83e-01 -0.122 0.113 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 4.99e-02 0.232 0.118 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00938 0.0691 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 5.05e-01 -0.084 0.126 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 2.15e-01 0.148 0.119 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0289 0.11 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 2.19e-01 0.153 0.124 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.103 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 2.03e-01 0.128 0.1 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0486 0.0873 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00505 0.13 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0107 0.0627 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00246 0.125 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.41e-01 0.0395 0.119 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.57e-01 0.0373 0.12 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.03e-02 0.194 0.114 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 1.65e-01 0.161 0.116 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.71e-01 -0.156 0.113 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0421 0.116 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 3.35e-01 0.125 0.13 0.173 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.22e-01 0.0469 0.0731 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 9.44e-01 0.00483 0.0691 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.12e-01 0.00864 0.0782 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 9.62e-01 0.00574 0.119 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.26e-01 0.0445 0.0701 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 2.76e-01 0.0734 0.0671 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 2.45e-01 0.131 0.113 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0299 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 5.47e-01 0.0475 0.0788 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.52e-01 0.0174 0.0936 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.37e-01 0.0425 0.126 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.57e-02 -0.14 0.0786 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.96e-01 0.0298 0.0762 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 6.75e-01 0.0487 0.116 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.03e-01 -0.078 0.116 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 4.04e-01 0.0716 0.0857 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.08e-02 0.179 0.102 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 6.41e-01 0.0591 0.127 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 6.98e-02 -0.181 0.0991 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.55e-01 0.0321 0.103 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 3.99e-01 0.0951 0.113 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0573 0.105 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.79e-01 0.0288 0.102 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 3.69e-01 0.0934 0.104 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.25e-01 0.0445 0.126 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.48e-01 -0.135 0.0931 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 9.10e-01 0.0123 0.109 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 9.34e-02 0.208 0.124 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0998 0.0957 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0425 0.0944 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0294 0.106 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 9.31e-01 0.0107 0.122 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0546 0.0846 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 2.98e-01 0.0961 0.0921 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.60e-02 0.282 0.116 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 1.80e-01 -0.144 0.107 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0485 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 6.18e-01 0.0639 0.128 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0611 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0178 0.124 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.34e-01 0.0276 0.132 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0959 0.122 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.01e-02 -0.225 0.128 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 4.69e-01 0.0989 0.136 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.12e-03 -0.335 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.82e-01 0.0332 0.12 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 3.31e-01 0.121 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.49e-01 0.0392 0.123 0.169 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.169 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000221 0.103 0.169 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 1.51e-01 0.187 0.13 0.169 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.44e-01 -0.031 0.0948 0.169 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 3.63e-01 0.106 0.116 0.169 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.12e-01 0.189 0.118 0.169 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.14e-01 0.0278 0.118 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 1.29e-01 0.166 0.109 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0121 0.107 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0128 0.13 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 2.40e-01 -0.136 0.115 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 3.45e-01 0.116 0.123 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0475 0.122 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 2.96e-01 0.119 0.114 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0484 0.104 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0528 0.092 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0153 0.1 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 4.43e-01 0.1 0.13 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.70e-01 -0.127 0.092 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.61e-01 0.039 0.0888 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.25e-02 0.305 0.121 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 9.62e-01 -0.0061 0.127 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0428 0.119 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.92e-01 0.0309 0.117 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 6.49e-01 0.0488 0.107 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 3.75e-01 0.117 0.131 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0984 0.11 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.77e-01 0.0513 0.123 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.44e-02 0.333 0.135 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 7.40e-01 0.0368 0.111 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 5.83e-01 0.0585 0.107 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00839 0.102 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.91e-01 0.0142 0.103 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.70e-01 0.0337 0.115 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.50e-02 -0.173 0.0898 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.23e-01 0.037 0.104 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.30e-01 0.182 0.12 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 3.38e-01 -0.116 0.12 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 1.88e-01 -0.221 0.167 0.152 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.87e-01 0.00254 0.157 0.152 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00267 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.31e-02 -0.242 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 4.77e-01 0.085 0.119 0.152 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 8.23e-01 0.0376 0.168 0.152 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 6.72e-01 0.0695 0.164 0.152 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 5.91e-01 0.0699 0.13 0.152 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0342 0.159 0.152 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 1.30e-01 0.191 0.126 0.167 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.42e-02 -0.207 0.115 0.167 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0264 0.124 0.167 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 8.38e-02 -0.208 0.12 0.167 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.52e-01 0.031 0.0978 0.167 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0705 0.09 0.167 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 5.78e-01 0.0603 0.108 0.167 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 4.54e-01 0.0808 0.108 0.169 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0295 0.106 0.169 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.26e-01 0.0893 0.112 0.169 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 3.36e-01 -0.124 0.129 0.169 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.90e-02 -0.173 0.0909 0.169 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 6.93e-01 0.0391 0.0989 0.169 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 4.41e-01 0.0959 0.124 0.169 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0518 0.107 0.18 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0322 0.11 0.18 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 5.44e-01 0.0739 0.122 0.18 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.68e-01 0.0706 0.124 0.18 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 2.90e-01 -0.114 0.107 0.18 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0538 0.123 0.18 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 1.72e-01 -0.103 0.0747 0.18 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 4.84e-03 0.199 0.0699 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 1.31e-01 0.127 0.0834 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 1.02e-01 -0.204 0.124 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0175 0.0913 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 7.61e-01 0.0218 0.0715 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.65e-01 0.137 0.0987 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0134 0.0925 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00455 0.0884 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0525 0.135 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 9.63e-01 0.0049 0.106 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 9.83e-01 -0.002 0.0925 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0747 0.106 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 3.54e-01 0.134 0.144 0.179 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 4.92e-01 0.0919 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.38e-02 -0.249 0.138 0.179 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 1.18e-01 -0.214 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0947 0.13 0.179 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0941 0.143 0.179 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 1.15e-02 0.349 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.22e-03 0.292 0.109 0.169 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.28e-01 0.0377 0.108 0.169 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 3.54e-01 -0.115 0.124 0.169 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 3.38e-01 -0.109 0.113 0.169 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0689 0.108 0.169 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 3.63e-01 -0.106 0.116 0.169 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 1.73e-01 0.127 0.0931 0.174 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 1.47e-01 0.113 0.0776 0.174 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 7.21e-01 0.0435 0.121 0.174 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 4.90e-01 0.0738 0.107 0.174 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 3.19e-01 0.104 0.104 0.174 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 5.17e-01 0.07 0.108 0.174 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 8.45e-01 0.0259 0.132 0.181 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 2.95e-01 0.134 0.127 0.181 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 2.79e-01 0.14 0.129 0.181 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0674 0.111 0.181 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 4.69e-01 0.0954 0.132 0.181 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 8.03e-01 0.0341 0.136 0.181 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 2.80e-02 -0.261 0.118 0.181 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0416 0.0871 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 7.90e-01 0.0208 0.0779 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 3.98e-01 -0.112 0.132 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0097 0.0784 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 1.01e-01 0.117 0.071 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0411 0.0921 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 7.97e-02 0.204 0.116 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0784 0.0808 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 7.38e-01 0.0406 0.121 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0921 0.0963 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 4.93e-02 0.185 0.0934 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 5.41e-01 0.0765 0.125 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0484 0.0912 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 4.51e-02 0.187 0.0927 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 755631 sc-eQTL 1.90e-01 -0.15 0.114 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 2.05e-01 0.146 0.115 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 992023 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0222 0.0544 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 459256 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0361 0.118 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 1.94e-02 0.153 0.0651 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 3.78e-01 0.069 0.078 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 1.03e-01 -0.205 0.125 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 9.46e-01 0.00614 0.0902 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00622 0.068 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 6.64e-01 0.041 0.0942 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.67e-03 0.23 0.0855 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 3.73e-01 0.0648 0.0726 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0142 0.131 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 7.62e-01 0.0298 0.0983 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0168 0.0984 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 8.69e-01 0.0172 0.104 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 529143 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0279 0.0895 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -111340 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0636 0.0825 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -690103 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00016 0.0903 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -218901 sc-eQTL 3.69e-01 0.115 0.127 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 80591 sc-eQTL 1.79e-02 -0.191 0.0799 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 16527 sc-eQTL 5.45e-01 0.0475 0.0783 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 sc-eQTL 5.32e-03 0.323 0.115 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -113294 sc-eQTL 3.91e-01 -0.11 0.128 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 80591 eQTL 0.000446 -0.0794 0.0225 0.0 0.0 0.202
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 eQTL 7.31e-26 0.244 0.0226 0.0484 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 80591 3.91e-06 4.7e-06 6.05e-07 2.44e-06 8.7e-07 1.05e-06 2.95e-06 9.98e-07 3.5e-06 1.68e-06 4.22e-06 3.21e-06 7.62e-06 2.3e-06 9.89e-07 2.06e-06 1.8e-06 2.37e-06 1.42e-06 9.54e-07 1.79e-06 3.73e-06 3.49e-06 1.78e-06 5.16e-06 1.24e-06 1.9e-06 1.4e-06 4e-06 4.04e-06 1.98e-06 3.82e-07 7.5e-07 1.85e-06 2.1e-06 9.6e-07 9.36e-07 4.75e-07 1.3e-06 3.79e-07 4.72e-07 5.03e-06 5.42e-07 1.68e-07 3.69e-07 3.54e-07 8.74e-07 2.26e-07 2.09e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -9014 1.6e-05 2.22e-05 4.42e-06 1.27e-05 3.82e-06 9.84e-06 2.91e-05 3.47e-06 1.94e-05 1.01e-05 2.63e-05 1.05e-05 3.69e-05 9.68e-06 5.36e-06 1.18e-05 1.2e-05 1.75e-05 6.56e-06 5.32e-06 9.81e-06 2.11e-05 2.15e-05 7.31e-06 3.29e-05 5.83e-06 8.66e-06 8.96e-06 2.36e-05 2.47e-05 1.31e-05 1.66e-06 2.35e-06 6.27e-06 9.01e-06 5.16e-06 2.83e-06 2.96e-06 4.1e-06 3.04e-06 1.7e-06 2.62e-05 2.67e-06 3.55e-07 2.03e-06 2.96e-06 3.42e-06 1.4e-06 1.36e-06