Genes within 1Mb (chr12:93457475:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0347 0.0671 0.171 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 1.07e-01 0.107 0.0662 0.171 B L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.08e-01 0.0378 0.101 0.171 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 1.61e-01 -0.105 0.0746 0.171 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.98e-02 0.112 0.0656 0.171 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 5.29e-01 -0.047 0.0745 0.171 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.65e-02 0.176 0.102 0.171 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0653 0.0507 0.171 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 4.98e-01 0.0696 0.103 0.171 B L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.06e-01 0.0461 0.0692 0.171 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.02e-01 0.0168 0.067 0.171 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 4.94e-01 0.0481 0.0703 0.171 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 8.09e-01 0.0278 0.115 0.171 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0637 0.0664 0.171 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.11e-01 0.0315 0.0617 0.171 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.63e-01 0.15 0.107 0.171 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0363 0.078 0.171 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 9.92e-01 0.00092 0.0896 0.171 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.171 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 4.79e-01 0.0768 0.108 0.171 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 3.62e-02 -0.134 0.0637 0.171 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.80e-01 0.0704 0.08 0.171 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 9.74e-03 0.293 0.112 0.171 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0329 0.101 0.173 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.08e-01 0.0126 0.109 0.173 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.48e-01 0.00798 0.123 0.173 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00913 0.101 0.173 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0914 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0228 0.118 0.173 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 2.91e-02 -0.226 0.103 0.173 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 3.45e-03 0.178 0.0603 0.171 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 2.13e-01 0.0874 0.07 0.171 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 2.51e-01 -0.148 0.129 0.171 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 6.53e-01 0.0401 0.0891 0.171 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00887 0.0669 0.171 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 7.28e-01 0.0314 0.09 0.171 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0461 0.0865 0.172 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0175 0.0809 0.172 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0844 0.172 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 1.85e-01 0.16 0.121 0.172 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 3.73e-02 -0.163 0.0776 0.172 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 2.32e-01 0.0927 0.0774 0.172 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 6.31e-03 0.301 0.109 0.172 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0745 0.126 0.172 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.55e-01 0.0651 0.11 0.171 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0535 0.102 0.171 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.24e-01 0.00916 0.096 0.171 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 2.53e-01 0.133 0.116 0.171 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0387 0.0828 0.171 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0286 0.0768 0.171 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 3.63e-01 0.0827 0.0907 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.91e-01 0.0536 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0336 0.113 0.161 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0495 0.133 0.161 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 3.92e-02 -0.243 0.117 0.161 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.62e-01 0.0644 0.147 0.161 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 7.25e-01 0.0438 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 2.34e-01 0.17 0.142 0.161 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 6.49e-01 -0.059 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 9.62e-01 0.00663 0.138 0.161 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0427 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.19e-01 0.0367 0.102 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0409 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.62e-01 0.0585 0.101 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.68e-01 0.0171 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 8.06e-01 0.0279 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 4.59e-01 0.0926 0.125 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0541 0.084 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 5.04e-01 0.0825 0.123 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0225 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 5.43e-01 0.0603 0.0989 0.172 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0394 0.129 0.172 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 6.03e-01 0.0482 0.0927 0.172 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 5.13e-02 0.161 0.0822 0.172 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0831 0.106 0.172 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.60e-01 0.173 0.123 0.172 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0499 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 8.61e-01 0.0217 0.123 0.172 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.31e-02 -0.188 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 5.95e-02 0.198 0.105 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.39e-01 0.0442 0.132 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 1.23e-01 -0.146 0.0943 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 2.19e-01 -0.138 0.112 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 3.48e-02 0.248 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0232 0.0686 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0721 0.125 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 1.99e-01 0.152 0.118 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.30e-01 -0.038 0.11 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 2.26e-01 0.149 0.123 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 3.48e-01 0.0958 0.102 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0997 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0571 0.0867 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.65e-01 0.022 0.13 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0119 0.0623 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 9.23e-01 0.0121 0.124 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.71e-01 0.0504 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 7.65e-01 0.0357 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.50e-02 0.196 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 1.52e-01 0.165 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0421 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 2.71e-01 0.142 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.86e-01 0.0398 0.0728 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0164 0.0688 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00782 0.0778 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.27e-01 0.0109 0.119 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.69e-01 0.0398 0.0698 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.78e-01 0.059 0.0669 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.97e-01 0.145 0.112 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0205 0.101 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 5.27e-01 0.0498 0.0786 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.70e-01 0.00346 0.0934 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 8.20e-01 0.0287 0.126 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 6.51e-02 -0.145 0.0784 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.29e-01 0.0368 0.0759 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 6.36e-01 0.0549 0.116 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0651 0.116 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 6.04e-01 0.0446 0.0857 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 1.29e-01 0.156 0.102 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.61e-01 0.0385 0.126 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.51e-02 -0.191 0.0989 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 5.16e-01 0.0666 0.102 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 3.99e-01 0.095 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0308 0.105 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 5.98e-01 0.0537 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 3.46e-01 0.0973 0.103 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 5.66e-01 0.072 0.125 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 1.78e-01 -0.125 0.0925 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.05e-01 0.0266 0.108 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.46e-02 0.213 0.123 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 2.98e-01 -0.099 0.0948 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0629 0.0935 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0173 0.105 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00599 0.121 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0629 0.0837 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 2.84e-01 0.0979 0.0912 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.44e-02 0.284 0.115 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 1.80e-01 -0.144 0.107 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0485 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 6.18e-01 0.0639 0.128 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0611 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0178 0.124 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.78e-01 0.037 0.131 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0848 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.33e-02 -0.221 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 5.11e-01 0.089 0.135 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.12e-03 -0.323 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.44e-01 0.0389 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 3.10e-01 0.125 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.09e-01 0.0295 0.122 0.171 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0205 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.04e-01 0.0124 0.102 0.171 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.38e-02 0.217 0.129 0.171 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0253 0.0942 0.171 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.51e-01 0.108 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.59e-01 0.166 0.118 0.171 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.73e-01 0.0187 0.117 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 1.26e-01 0.167 0.109 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.44e-01 -0.021 0.106 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.39e-01 0.0099 0.129 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.01e-01 0.127 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0522 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0708 0.103 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0517 0.0916 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.38e-01 0.00772 0.0997 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.26e-01 0.127 0.13 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 1.88e-01 -0.121 0.0917 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.74e-01 0.0372 0.0884 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.14e-02 0.308 0.121 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0254 0.126 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.30e-01 0.025 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.16e-01 0.0389 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.47e-01 0.123 0.13 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0847 0.109 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 7.54e-03 0.362 0.134 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 8.83e-01 0.0162 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0155 0.101 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.61e-01 0.0179 0.103 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.40e-01 0.00857 0.115 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.53e-02 -0.172 0.0892 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.86e-01 0.0148 0.104 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 8.50e-02 0.206 0.119 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 2.67e-01 -0.133 0.12 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 2.00e-01 -0.211 0.164 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00166 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 7.18e-02 -0.238 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 7.41e-01 0.0546 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 6.79e-01 0.0666 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 6.02e-01 0.0665 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00966 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 9.68e-02 0.208 0.125 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 6.13e-02 -0.215 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00541 0.123 0.17 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 8.20e-02 -0.208 0.119 0.17 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0099 0.097 0.17 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0671 0.0893 0.17 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 5.05e-01 0.0717 0.107 0.17 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 4.65e-01 0.0784 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0291 0.106 0.171 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 4.21e-01 0.0896 0.111 0.171 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.37e-01 -0.123 0.128 0.171 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.30e-02 -0.184 0.0902 0.171 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.22e-01 0.0351 0.0983 0.171 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.171 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0575 0.107 0.183 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.183 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 5.44e-01 0.0737 0.121 0.183 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.85e-01 0.0673 0.123 0.183 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.107 0.183 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0564 0.123 0.183 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 1.62e-01 -0.104 0.0744 0.183 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.64e-03 0.188 0.0698 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 1.17e-01 0.131 0.0831 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 1.16e-01 -0.195 0.124 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0244 0.091 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.90e-01 0.019 0.0713 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.19e-01 0.154 0.0983 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0176 0.092 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0179 0.0879 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0682 0.135 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.106 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0168 0.0921 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0698 0.106 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 3.54e-01 0.134 0.144 0.179 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 4.92e-01 0.0919 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.38e-02 -0.249 0.138 0.179 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 1.18e-01 -0.214 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0947 0.13 0.179 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0941 0.143 0.179 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.15e-02 0.349 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 8.47e-03 0.29 0.109 0.171 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.45e-01 0.0351 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.33e-01 -0.12 0.124 0.171 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 2.95e-01 -0.119 0.113 0.171 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0773 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0782 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 2.11e-01 0.116 0.0924 0.176 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 1.67e-01 0.107 0.077 0.176 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 7.86e-01 0.0327 0.121 0.176 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.89e-01 0.0733 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 3.61e-01 0.0943 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 4.96e-01 0.073 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00439 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0751 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.13e-01 0.0663 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0371 0.0866 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.82e-01 0.0115 0.0774 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 3.71e-01 -0.118 0.132 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00714 0.0779 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.04e-02 0.128 0.0704 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0311 0.0915 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 7.40e-02 0.206 0.115 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0596 0.0804 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 5.83e-01 0.0662 0.12 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0911 0.0956 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 7.02e-02 0.169 0.0929 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 4.87e-01 0.0862 0.124 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0594 0.0905 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 7.69e-02 0.164 0.0922 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 754632 sc-eQTL 1.39e-01 -0.168 0.113 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 1.33e-01 0.172 0.114 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 991024 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0246 0.054 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 458257 sc-eQTL 7.99e-01 -0.03 0.118 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 2.79e-02 0.144 0.065 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 3.78e-01 0.0688 0.0778 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 1.01e-01 -0.205 0.125 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00142 0.09 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.48e-01 -0.013 0.0678 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 5.80e-01 0.052 0.0939 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 9.09e-03 0.224 0.085 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 4.05e-01 0.0602 0.0722 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 8.13e-01 -0.031 0.131 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 8.19e-01 0.0224 0.0977 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0225 0.0978 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 7.50e-01 0.0329 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 528144 sc-eQTL 7.11e-01 -0.033 0.0891 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -112339 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0655 0.0821 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -691102 sc-eQTL 8.76e-01 0.0141 0.0899 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -219900 sc-eQTL 2.87e-01 0.135 0.127 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 79592 sc-eQTL 2.21e-02 -0.184 0.0796 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 15528 sc-eQTL 6.12e-01 0.0395 0.0779 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 sc-eQTL 2.86e-03 0.344 0.114 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -114293 sc-eQTL 2.96e-01 -0.134 0.127 0.172 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 79592 eQTL 0.00049 -0.0794 0.0227 0.0 0.0 0.2
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 eQTL 5.52e-26 0.247 0.0227 0.0175 0.0 0.2


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 79592 7.72e-06 9.04e-06 1.36e-06 4.01e-06 2.35e-06 3.28e-06 9.59e-06 1.68e-06 6.53e-06 4.42e-06 9.93e-06 4.5e-06 1.15e-05 3.58e-06 1.79e-06 5.84e-06 3.8e-06 5.6e-06 2.65e-06 2.66e-06 4.54e-06 7.96e-06 6.67e-06 2.87e-06 1.14e-05 3e-06 4.19e-06 3.11e-06 8.01e-06 7.71e-06 4.24e-06 8.39e-07 1.27e-06 2.86e-06 2.82e-06 2.22e-06 1.57e-06 1.53e-06 1.57e-06 1.01e-06 1.02e-06 9.72e-06 1.14e-06 1.88e-07 7.53e-07 1.22e-06 8.96e-07 7.58e-07 4.74e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -10013 3.39e-05 3.14e-05 6.54e-06 1.61e-05 6.55e-06 1.63e-05 4.55e-05 5.07e-06 3.23e-05 1.6e-05 3.97e-05 1.82e-05 5.27e-05 1.43e-05 7.4e-06 2.04e-05 1.86e-05 2.69e-05 9.49e-06 7.86e-06 1.76e-05 3.46e-05 3.2e-05 1.05e-05 4.78e-05 8.74e-06 1.53e-05 1.36e-05 3.49e-05 3.19e-05 2.08e-05 1.95e-06 3.8e-06 8.18e-06 1.26e-05 7.17e-06 3.67e-06 3.71e-06 6e-06 3.97e-06 1.82e-06 3.81e-05 3.68e-06 4.6e-07 2.92e-06 4.68e-06 4.52e-06 2.13e-06 1.45e-06