Genes within 1Mb (chr12:93455147:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0347 0.0671 0.171 B L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 1.07e-01 0.107 0.0662 0.171 B L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.08e-01 0.0378 0.101 0.171 B L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 1.61e-01 -0.105 0.0746 0.171 B L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.98e-02 0.112 0.0656 0.171 B L1
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 5.29e-01 -0.047 0.0745 0.171 B L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.65e-02 0.176 0.102 0.171 B L1
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0653 0.0507 0.171 B L1
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 4.98e-01 0.0696 0.103 0.171 B L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.06e-01 0.0461 0.0692 0.171 CD4T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.02e-01 0.0168 0.067 0.171 CD4T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 4.94e-01 0.0481 0.0703 0.171 CD4T L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 8.09e-01 0.0278 0.115 0.171 CD4T L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0637 0.0664 0.171 CD4T L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.11e-01 0.0315 0.0617 0.171 CD4T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.63e-01 0.15 0.107 0.171 CD4T L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0363 0.078 0.171 CD8T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 9.92e-01 0.00092 0.0896 0.171 CD8T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.171 CD8T L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 4.79e-01 0.0768 0.108 0.171 CD8T L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 3.62e-02 -0.134 0.0637 0.171 CD8T L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.80e-01 0.0704 0.08 0.171 CD8T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 9.74e-03 0.293 0.112 0.171 CD8T L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0329 0.101 0.173 DC L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.08e-01 0.0126 0.109 0.173 DC L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.48e-01 0.00798 0.123 0.173 DC L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00913 0.101 0.173 DC L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0914 0.102 0.173 DC L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0228 0.118 0.173 DC L1
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 2.91e-02 -0.226 0.103 0.173 DC L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 3.45e-03 0.178 0.0603 0.171 Mono L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 2.13e-01 0.0874 0.07 0.171 Mono L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 2.51e-01 -0.148 0.129 0.171 Mono L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 6.53e-01 0.0401 0.0891 0.171 Mono L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00887 0.0669 0.171 Mono L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 7.28e-01 0.0314 0.09 0.171 Mono L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0461 0.0865 0.172 NK L1
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0175 0.0809 0.172 NK L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0844 0.172 NK L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 1.85e-01 0.16 0.121 0.172 NK L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 3.73e-02 -0.163 0.0776 0.172 NK L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 2.32e-01 0.0927 0.0774 0.172 NK L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 6.31e-03 0.301 0.109 0.172 NK L1
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0745 0.126 0.172 NK L1
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.55e-01 0.0651 0.11 0.171 Other_T L1
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0535 0.102 0.171 Other_T L1
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.24e-01 0.00916 0.096 0.171 Other_T L1
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 2.53e-01 0.133 0.116 0.171 Other_T L1
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0387 0.0828 0.171 Other_T L1
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0286 0.0768 0.171 Other_T L1
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 3.63e-01 0.0827 0.0907 0.171 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.91e-01 0.0536 0.135 0.161 B_Activated L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0336 0.113 0.161 B_Activated L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0495 0.133 0.161 B_Activated L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 3.92e-02 -0.243 0.117 0.161 B_Activated L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.62e-01 0.0644 0.147 0.161 B_Activated L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 7.25e-01 0.0438 0.124 0.161 B_Activated L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 2.34e-01 0.17 0.142 0.161 B_Activated L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 6.49e-01 -0.059 0.129 0.161 B_Activated L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 9.62e-01 0.00663 0.138 0.161 B_Activated L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0427 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.19e-01 0.0367 0.102 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0409 0.121 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.62e-01 0.0585 0.101 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.68e-01 0.0171 0.103 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 8.06e-01 0.0279 0.114 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 4.59e-01 0.0926 0.125 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0541 0.084 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 5.04e-01 0.0825 0.123 0.172 B_Intermediate L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0225 0.105 0.172 B_Memory L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 5.43e-01 0.0603 0.0989 0.172 B_Memory L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0394 0.129 0.172 B_Memory L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 6.03e-01 0.0482 0.0927 0.172 B_Memory L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 5.13e-02 0.161 0.0822 0.172 B_Memory L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0831 0.106 0.172 B_Memory L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.60e-01 0.173 0.123 0.172 B_Memory L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0499 0.103 0.172 B_Memory L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 8.61e-01 0.0217 0.123 0.172 B_Memory L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.31e-02 -0.188 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 5.95e-02 0.198 0.105 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.39e-01 0.0442 0.132 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 1.23e-01 -0.146 0.0943 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 1.23e-01 0.157 0.101 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 2.19e-01 -0.138 0.112 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 3.48e-02 0.248 0.117 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0232 0.0686 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0721 0.125 0.171 B_Naive1 L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 1.99e-01 0.152 0.118 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.30e-01 -0.038 0.11 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 2.26e-01 0.149 0.123 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 3.48e-01 0.0958 0.102 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0997 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0571 0.0867 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.65e-01 0.022 0.13 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0119 0.0623 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 9.23e-01 0.0121 0.124 0.172 B_Naive2 L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.71e-01 0.0504 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 7.65e-01 0.0357 0.119 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.50e-02 0.196 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 1.52e-01 0.165 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 1.66e-01 -0.156 0.113 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0421 0.115 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 2.71e-01 0.142 0.129 0.175 CD4_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.86e-01 0.0398 0.0728 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0164 0.0688 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00782 0.0778 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.27e-01 0.0109 0.119 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.69e-01 0.0398 0.0698 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.78e-01 0.059 0.0669 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.97e-01 0.145 0.112 0.171 CD4_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0205 0.101 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 5.27e-01 0.0498 0.0786 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.70e-01 0.00346 0.0934 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 8.20e-01 0.0287 0.126 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 6.51e-02 -0.145 0.0784 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.29e-01 0.0368 0.0759 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 6.36e-01 0.0549 0.116 0.171 CD4_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0651 0.116 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 6.04e-01 0.0446 0.0857 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 1.29e-01 0.156 0.102 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.61e-01 0.0385 0.126 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.51e-02 -0.191 0.0989 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 5.16e-01 0.0666 0.102 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 3.99e-01 0.095 0.112 0.171 CD4_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0308 0.105 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 5.98e-01 0.0537 0.102 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 3.46e-01 0.0973 0.103 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 5.66e-01 0.072 0.125 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 1.78e-01 -0.125 0.0925 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.05e-01 0.0266 0.108 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.46e-02 0.213 0.123 0.171 CD8_CTL L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 2.98e-01 -0.099 0.0948 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0629 0.0935 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0173 0.105 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00599 0.121 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0629 0.0837 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 2.84e-01 0.0979 0.0912 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.44e-02 0.284 0.115 0.171 CD8_Naive L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0114 0.125 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 1.80e-01 -0.144 0.107 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0485 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 6.18e-01 0.0639 0.128 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0611 0.102 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.121 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0178 0.124 0.169 CD8_TCM L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.78e-01 0.037 0.131 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0848 0.121 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.33e-02 -0.221 0.127 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 5.11e-01 0.089 0.135 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.12e-03 -0.323 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.44e-01 0.0389 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 3.10e-01 0.125 0.123 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.09e-01 0.0295 0.122 0.171 MAIT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0205 0.111 0.171 MAIT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.04e-01 0.0124 0.102 0.171 MAIT L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.38e-02 0.217 0.129 0.171 MAIT L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0253 0.0942 0.171 MAIT L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.51e-01 0.108 0.115 0.171 MAIT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.59e-01 0.166 0.118 0.171 MAIT L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.73e-01 0.0187 0.117 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 1.26e-01 0.167 0.109 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.44e-01 -0.021 0.106 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.39e-01 0.0099 0.129 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.01e-01 0.127 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0522 0.122 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 3.36e-01 0.109 0.113 0.176 NK_CD56bright L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0708 0.103 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0517 0.0916 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.38e-01 0.00772 0.0997 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.26e-01 0.127 0.13 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 1.88e-01 -0.121 0.0917 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.74e-01 0.0372 0.0884 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.14e-02 0.308 0.121 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0254 0.126 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.30e-01 0.025 0.117 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.16e-01 0.0389 0.107 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.47e-01 0.123 0.13 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0847 0.109 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.72e-01 0.0355 0.122 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 7.54e-03 0.362 0.134 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 8.83e-01 0.0162 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.33e-01 0.0662 0.106 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0155 0.101 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.61e-01 0.0179 0.103 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.40e-01 0.00857 0.115 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.53e-02 -0.172 0.0892 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.86e-01 0.0148 0.104 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 8.50e-02 0.206 0.119 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 2.67e-01 -0.133 0.12 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 2.00e-01 -0.211 0.164 0.156 PB L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000317 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00166 0.142 0.156 PB L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 7.18e-02 -0.238 0.131 0.156 PB L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 4.18e-01 0.0946 0.117 0.156 PB L2
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 7.41e-01 0.0546 0.165 0.156 PB L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 6.79e-01 0.0666 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 6.02e-01 0.0665 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00966 0.156 0.156 PB L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 9.68e-02 0.208 0.125 0.17 Pro_T L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 6.13e-02 -0.215 0.114 0.17 Pro_T L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00541 0.123 0.17 Pro_T L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 8.20e-02 -0.208 0.119 0.17 Pro_T L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0099 0.097 0.17 Pro_T L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0671 0.0893 0.17 Pro_T L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 5.05e-01 0.0717 0.107 0.17 Pro_T L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 4.65e-01 0.0784 0.107 0.171 Treg L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0291 0.106 0.171 Treg L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 4.21e-01 0.0896 0.111 0.171 Treg L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.37e-01 -0.123 0.128 0.171 Treg L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.30e-02 -0.184 0.0902 0.171 Treg L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.22e-01 0.0351 0.0983 0.171 Treg L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 4.04e-01 0.103 0.123 0.171 Treg L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0575 0.107 0.183 cDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0222 0.11 0.183 cDC L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 5.44e-01 0.0737 0.121 0.183 cDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.85e-01 0.0673 0.123 0.183 cDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 2.50e-01 -0.123 0.107 0.183 cDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0564 0.123 0.183 cDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 1.62e-01 -0.104 0.0744 0.183 cDC L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.64e-03 0.188 0.0698 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 1.17e-01 0.131 0.0831 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 1.16e-01 -0.195 0.124 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0244 0.091 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.90e-01 0.019 0.0713 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.19e-01 0.154 0.0983 0.171 cMono_IL1B L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0176 0.092 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0179 0.0879 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0682 0.135 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.53e-01 0.00626 0.106 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0168 0.0921 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0698 0.106 0.171 cMono_S100A L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 3.54e-01 0.134 0.144 0.179 gdT L2
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 4.92e-01 0.0919 0.133 0.179 gdT L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.38e-02 -0.249 0.138 0.179 gdT L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 1.18e-01 -0.214 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0947 0.13 0.179 gdT L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0941 0.143 0.179 gdT L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.15e-02 0.349 0.136 0.179 gdT L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 8.47e-03 0.29 0.109 0.171 intMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.45e-01 0.0351 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.33e-01 -0.12 0.124 0.171 intMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 2.95e-01 -0.119 0.113 0.171 intMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0773 0.108 0.171 intMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0782 0.116 0.171 intMono L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 2.11e-01 0.116 0.0924 0.176 ncMono L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 1.67e-01 0.107 0.077 0.176 ncMono L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 7.86e-01 0.0327 0.121 0.176 ncMono L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.89e-01 0.0733 0.106 0.176 ncMono L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 3.61e-01 0.0943 0.103 0.176 ncMono L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 4.96e-01 0.073 0.107 0.176 ncMono L2
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00439 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 2.76e-01 0.138 0.126 0.184 pDC L2
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.43e-01 0.122 0.128 0.184 pDC L2
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0751 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.13e-01 0.0663 0.131 0.184 pDC L2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 7.57e-01 0.042 0.135 0.184 pDC L2
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 2.49e-02 -0.265 0.117 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0371 0.0866 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.82e-01 0.0115 0.0774 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 3.71e-01 -0.118 0.132 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00714 0.0779 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.04e-02 0.128 0.0704 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0311 0.0915 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 7.40e-02 0.206 0.115 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0596 0.0804 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 5.83e-01 0.0662 0.12 0.171 B_Memory LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0911 0.0956 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 7.02e-02 0.169 0.0929 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 4.87e-01 0.0862 0.124 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0594 0.0905 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 7.69e-02 0.164 0.0922 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000187510 C12orf74 752304 sc-eQTL 1.39e-01 -0.168 0.113 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 1.33e-01 0.172 0.114 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000205056 LINC02397 988696 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0246 0.054 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000257345 LINC02413 455929 sc-eQTL 7.99e-01 -0.03 0.118 0.171 B_Naive LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 2.79e-02 0.144 0.065 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 3.78e-01 0.0688 0.0778 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 1.01e-01 -0.205 0.125 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00142 0.09 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.48e-01 -0.013 0.0678 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 5.80e-01 0.052 0.0939 0.171 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 9.09e-03 0.224 0.085 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 4.05e-01 0.0602 0.0722 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 8.13e-01 -0.031 0.131 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 8.19e-01 0.0224 0.0977 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0225 0.0978 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 7.50e-01 0.0329 0.103 0.172 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000102189 EEA1 525816 sc-eQTL 7.11e-01 -0.033 0.0891 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120833 SOCS2 -114667 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0655 0.0821 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136040 PLXNC1 -693430 sc-eQTL 8.76e-01 0.0141 0.0899 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000169372 CRADD -222228 sc-eQTL 2.87e-01 0.135 0.127 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000173598 NUDT4 77264 sc-eQTL 2.21e-02 -0.184 0.0796 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000177889 UBE2N 13200 sc-eQTL 6.12e-01 0.0395 0.0779 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 sc-eQTL 2.86e-03 0.344 0.114 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000246985 SOCS2-AS1 -116621 sc-eQTL 2.96e-01 -0.134 0.127 0.172 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000173598 NUDT4 77264 eQTL 0.000491 -0.0794 0.0227 0.0 0.0 0.2
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 eQTL 5.48e-26 0.247 0.0227 0.0175 0.0 0.2


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000173598 NUDT4 77264 1.2e-05 1.25e-05 2.36e-06 7.6e-06 2.47e-06 6.03e-06 1.51e-05 2.46e-06 1.18e-05 6.09e-06 1.6e-05 6.53e-06 2.09e-05 4.33e-06 4.27e-06 7.43e-06 6.74e-06 1.01e-05 3.47e-06 3.57e-06 6.48e-06 1.22e-05 1.07e-05 3.78e-06 2.04e-05 4.5e-06 7.46e-06 5.43e-06 1.43e-05 1.1e-05 7.67e-06 1.05e-06 1.47e-06 3.76e-06 5.85e-06 2.8e-06 1.76e-06 2.25e-06 2.06e-06 1.88e-06 1.28e-06 1.51e-05 1.63e-06 3.24e-07 1.29e-06 2.35e-06 2.08e-06 7.89e-07 5.67e-07
ENSG00000198015 MRPL42 -12341 5.04e-05 4.09e-05 8.39e-06 2.01e-05 9.25e-06 2.16e-05 5.89e-05 7.29e-06 4.81e-05 2.44e-05 5.89e-05 2.59e-05 7.16e-05 1.89e-05 1.06e-05 3.06e-05 2.62e-05 3.74e-05 1.27e-05 1.09e-05 2.66e-05 5.03e-05 4.31e-05 1.32e-05 6.47e-05 1.46e-05 2.29e-05 2.05e-05 4.74e-05 3.74e-05 3.09e-05 2.85e-06 5.67e-06 9.8e-06 1.66e-05 8.29e-06 4.8e-06 5.26e-06 7.12e-06 4.34e-06 2.06e-06 4.84e-05 4.99e-06 5.9e-07 4.14e-06 6.42e-06 6.69e-06 2.88e-06 2.19e-06